柯乐猪PRLR基因多态性与繁殖性状的关联性

作     者：杨酸 郭小江 杨红文 熊力 李晨 谭元成 王春源 张依裕 YANG Suan;GUO Xiaojiang;YANG Hongwen;XIONG Li;LI Chen;TAN Yuancheng;WANG Chunyuan;ZHANG Yiyu

作者机构：贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州省农业农村厅贵州贵阳550001 

出 版 物：《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期：2023年第35卷第3期

页      面：556-564页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：贵州省科技支撑计划(黔科合支撑〔2021〕一般147号) 贵州省优秀青年科技人才培养计划(黔科合平台人才〔2021〕5630号) 贵州省生猪产业发展项目(2021)。 

主　　题：PRLR基因 柯乐猪 多态性 繁殖性状 

摘      要：本研究旨在探究催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因的单核苷酸突变位点(single nucleotide polymorphism,SNP)及其对柯乐猪繁殖性状的遗传效应,以期为提高柯乐猪的繁殖性能研究提供基因标记。采用PCR产物直接测序法对204头柯乐猪PRLR基因外显子区的SNP位点进行筛查鉴定,同时利用SPSS软件中单因子方差法分析各SNPs不同基因型和双倍型与7个繁殖性状的相关性,并通过在线软件分析碱基变异对mRNA二级结构的影响。结果显示,在柯乐猪PRLR基因第8外显子检测到g.20655220 CT突变,其导致丝氨酸变成脯氨酸,为错义突变;在第4内含子检测到2个同义突变位点g.20648859 CT和g.20648931 CT,3个SNPs均存在3种基因型,g.20648931 CT属于低度多态,其余2个位点属于中度多态;经卡方χ^(2)检验,g.20655220 CT位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05),g.20648859 CT和g.20648931 CT位点的基因型分布极显著(PT位点导致PRLR基因mRNA序列二级结构发生改变,致使mRNA二级结构稳定性降低;3个SNPs共组成5种单倍型和9种双倍型,优势单倍型H1(CCC)频率为0.610,优势双倍型H1H1(CCCCCC)频率为0.382。关联性分析结果显示,g.20655220 CT位点CC基因型母猪的初生个体重、断奶窝重和断奶个体重均显著(PT位点CT基因型母猪的初生个体重、初生窝重和断奶窝重均显著(P0.05)高于CC基因型和TT基因型,且该位点在初生个体重上,CC基因型显著(P0.05)高于TT基因型;双倍型H1H5(CTCTCT)在产仔数和活仔数上为优势双倍型,H2H3(CCTTCT)在断奶窝重和断奶个体重上为较优双倍型。综上,PRLR基因可作为候选基因参与柯乐猪繁殖性状的分子标记辅助选择。