检索结果-南通市图书馆

2020-2021年上海地区分离株柯萨奇病毒A4基因型的全基因组分析

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中国病原生物学杂志 2023年第8期18卷 875-880页

作者：李云逸崔心怡费洁仲文江李淑佩陈敏上海市疾病预防控制中心上海200336 上海市嘉定区疾病预防控制中心上海市青浦区疾病预防控制中心

目的对2020-2021年上海市环境污水和健康儿童粪便标本中分离的9株柯萨奇病毒A4(Coxsackievirus A4,CVA4)进行全基因组特征分析。方法利用人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomy-osarcoma,RD)和人喉癌上皮细胞(human laryngeal carcinoma,Hep-2)对污水样品和健康儿童粪便样品进行病毒分离,抽提病毒RNA进行逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR),利用Illumina二代测序技术进行全基因组序列测定。使用BioEdit 7.2.5软件对CVA4进行序列比对和同源性分析,使用软件MEGA10.0.4运用最大似然法(Maximum likelihood,ML)构建系统进化树,建树自展值(Bootstrap)检验1000次。使用Similarity Plots3.5.1软件对CVA4代表株进行重组分析。结果2021年上海市健康儿童粪便样品共分离出5株CVA4,2020-2021年环境污水中共分离出4株CVA4。2020年1月和12月以及2021年1-2月和4-5月采集的污水浓缩液均检出CVA4。9株CVA4分离株之间VP1区核苷酸和氨基酸相似性分别为90.2%~100%和96.3%~100%,均属于C2基因亚型。其中5个CVA4代表株间全基因组核苷酸和氨基酸相似性分别为89.8%~99.3%和96.3%~100%。基因重组分析显示,5个CVA4代表株的基因组在P1区与CVA4原型呈现高度相似性,而在5'UTR区域均与CVA6有重组区域,并在P3的3C区域与CVA5和CVA6存在重组现象。结论分离自上海地区的9株CVA4均属于C2基因亚型,该亚型是国内CVA4的优势基因亚型。其中5株CVA4在5􀆳UTR和3C区存在重组现象。本研究可为了解上海流行株CVA4的遗传变异情况提供数据支撑,CVA4的疫苗研发和相关疾病的防控具有参考意义。

关键词：柯萨奇病毒A 4 环境污水监测全基因组

2021年上海市嘉定区生禽肉中沙门菌污染状况及病原学特征分析

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上海预防医学 2023年第6期35卷 542-548页

作者：陈培超黄强孙攀董玉婷彭谦上海市嘉定区疾病预防控制中心上海201800

【目的】了解上海市嘉定区2021年生禽肉中沙门菌污染状况、血清型分布及耐药性。【方法】采集鸡、鸭、鹅和鸽4类生禽肉样本进行沙门菌分离鉴定,并对分离的沙门菌进行血清型鉴定和16种常见抗生素耐药性检测。【结果】80份生禽肉样品中分... 详细信息

【目的】了解上海市嘉定区2021年生禽肉中沙门菌污染状况、血清型分布及耐药性。【方法】采集鸡、鸭、鹅和鸽4类生禽肉样本进行沙门菌分离鉴定,并对分离的沙门菌进行血清型鉴定和16种常见抗生素耐药性检测。【结果】80份生禽肉样品中分离到沙门菌60株。鸽肉、鹅肉、鸭肉和鸡肉中沙门菌的检出率分别为86.67%、81.82%、72.73%、59.38%。冷冻、冷藏和室温存储样品中,冷藏存储的样品检出率最低,为65.63%。血清型以鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌和科瓦利斯沙门菌为主。四环素、萘啶酸、氨苄西林、氯霉素4类抗生素耐药率较高,分别为60.00%、58.33%、50.00%、48.33%;头孢噻肟耐药率低,对亚胺培南完全敏感。不同类别生禽肉中检出的沙门菌及不同型别的沙门菌耐药差异明显。11.67%的沙门菌为不耐药,多重耐药菌株占比为46.67%,耐药数最多达13种。氨苄西林-四环素或氯霉素-头孢唑林耐药模式提示菌株为多重耐药菌株。【结论】上海市嘉定区生禽肉样本沙门菌的污染状况严重,耐药性升高,应加强监测并进行控制。

关键词：沙门菌血清型耐药生禽肉

2018—2021年上海某医院环境及患者金黄色葡萄球菌肠毒素基因携带状况

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上海预防医学 2023年第4期35卷 343-348页

作者：陈培超黄强谢丽君毛育华孙攀彭谦上海市嘉定区疾病预防控制中心上海201800

【目的】了解上海市嘉定区某医院环境中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的污染状况,研究医院环境和患者中SAU肠毒素基因携带情况及差异。【方法】采集某医院2018—2021年环境样品进行SAU分离鉴定,收集医院患者中分离的SAU,并对菌... 详细信息

【目的】了解上海市嘉定区某医院环境中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的污染状况,研究医院环境和患者中SAU肠毒素基因携带情况及差异。【方法】采集某医院2018—2021年环境样品进行SAU分离鉴定,收集医院患者中分离的SAU,并对菌株SEA~SEE肠毒素基因进行检测。【结果】780件医院环境样品中54件样品检出金黄色葡萄球菌,阳性率为6.92%。医院环境中病区扶手、患者的枕头被褥和床头柜是阳性率较高的部位,分别为20.00%、20.00%和16.67%。医务人员的环境中鼠标键盘和工作服阳性率较高,分别为17.42%和16.67%。2018—2021年收集患者菌株75株,其中重症监护室(ICU)、神经外科、骨科患者菌株分别占36.00%、14.67%、14.67%。环境与患者的SAU中肠毒素基因携带率分别为48.15%和61.33%,患者SAU中,SEA、SEB、SEC、SED和SEE肠毒素基因携带率依次为14.67%、41.33%、9.33%、1.33%、1.33%,而环境依次为20.37%、25.93%、1.85%、1.85%和0%。环境中综合ICU肠毒素基因携带率为77.27%。患者源的菌株中,痰液菌株数量最多,呼吸内科、ICU、骨科的SAU肠毒素携带率较高。【结论】某医院环境中SAU检出率处于中等水平。SAU肠毒素基因携带率较高,以SEB基因为主,其次为SEA。需加强院内特别是ICU中金黄色葡萄球的消毒与控制。

关键词：金黄色葡萄球菌肠毒素医院环境患者

新型冠状病毒肺炎疫情防控措施对上海市嘉定区法定传染病发病率的影响

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疾病监测 2023年第2期38卷 177-180页

作者：朱也凡张书志段春梅袁红上海市嘉定区疾病预防控制中心上海201800

目的了解新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)疫情防控措施对上海市嘉定区法定传染病流行的影响。方法收集嘉定区2017—2021年法定传染病报告数据,分析比较新冠肺炎防控措施前后法定传染病发病率的变化。结果在实施新冠肺炎防控措施下,2020年嘉... 详细信息

目的了解新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)疫情防控措施对上海市嘉定区法定传染病流行的影响。方法收集嘉定区2017—2021年法定传染病报告数据,分析比较新冠肺炎防控措施前后法定传染病发病率的变化。结果在实施新冠肺炎防控措施下,2020年嘉定区法定传染病发病率为167.59/10万,较前3年平均发病率(421.04/10万)降低了60.20%(χ^(2)=2424.369,P嘉定区肠道传染病、呼吸道传染病、经血液和性传播传染病发病率均低于2017—2019年平均发病率,其中2020年分别降低了59.27%、68.02%和36.52%,2021年分别降低了37.96%,56.37%和30.51%。2020年和2021年发病率最高的仍为手足口病,发病率分别为39.01/10万和75.87/10万。结论新冠肺炎防控措施对上海市嘉定区不同传播途径法定传染病发病率均有影响,其中对呼吸道传染病发病率影响最大,对乙类、丙类传染病发病率亦有影响,对发病率前5位法定传染病的排序影响不明显,新冠肺炎防控措施能够降低法定传染病的流行水平。

关键词：新型冠状病毒肺炎传染病发病率

上海市嘉定区社区老年人的失能现状及其影响因素

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中华疾病控制杂志 2022年第7期26卷 784-789页

作者：张妍袁红金亚清于宏杰上海市嘉定区疾病预防控制中心综合办上海201899

目的了解上海市嘉定区老年人的失能现状并分析其影响因素,为老年人失能防控和健康老龄化建设提供科学依据。方法采用多阶段随机抽样方法,选取≥60岁的嘉定区户籍老年人群作为调查对象,采用世界卫生组织研发的自报健康调查量表测量老年... 详细信息

目的了解上海市嘉定区老年人的失能现状并分析其影响因素,为老年人失能防控和健康老龄化建设提供科学依据。方法采用多阶段随机抽样方法,选取≥60岁的嘉定区户籍老年人群作为调查对象,采用世界卫生组织研发的自报健康调查量表测量老年人失能情况;应用多因素Logistic回归分析模型及列线图分析老年人失能的影响因素。结果共调查老年人4773人,其中失能老人495人,失能率为11.4%,女性的失能率(13.6%)高于男性(8.9%)。老年人自我评价在认知记忆、视力辨认、疼痛不适、睡眠及活动行走这五方面存在更多的失能,失能率分别为31.7%、23.0%、21.6%、20.4%和13.6%。多因素分析结果显示,年龄大、自评健康较差、患2种及以上慢性病的老年人失能率较高(均有P嘉定区社区老年人失能率较高。应加强慢性病管理,关注老年人的不同照护需求,开展针对性的早期预防和干预。

关键词：失能老年人影响因素列线图

生活饮用水中新兴污染物高分辨质谱技术的非靶向筛查

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上海预防医学 2023年

作者：吴琳媖冯超汪国权宣栋樑金玉娥彭谦卢大胜上海市嘉定区疾病预防控制中心上海市疾病预防控制中心

【目的】建立一种基于高分辨质谱技术的生活饮用水中新兴污染物的非靶向筛查方法并运用于实际水样。【方法】采集上海市3个水源地水库共9个生活饮用水样，经HLB固相萃取柱净化浓缩，用液相色谱高分辨质谱仪和气相色谱高分辨质谱仪分离... 详细信息

【目的】建立一种基于高分辨质谱技术的生活饮用水中新兴污染物的非靶向筛查方法并运用于实际水样。【方法】采集上海市3个水源地水库共9个生活饮用水样，经HLB固相萃取柱净化浓缩，用液相色谱高分辨质谱仪和气相色谱高分辨质谱仪分离检测。结合mzCloud、NIST等数据库，使用Thermo Tracefinder、Excel等软件进行数据分析，用代表性化合物标准品进行方法学验证，并以农药和全氟化合物为例，分析其污染现状。【结果】建立了一种基于液相色谱和气相色谱串接高分辨质谱技术的非靶向分析策略，在9个生活饮用水中共筛查鉴定出20种农药和4种全氟化合物。上海市黄浦江水源的农药和全氟化合物污染程度高于长江口水源。【结论】建立的高分辨质谱非靶向筛查方法，能够不依赖标准品而检测出生活饮用水中潜在新兴污染物，为水质监管和风险评估提供了有力的技术手段。

关键词：高分辨质谱非靶向筛查生活饮用水新兴污染物农药全氟化合物

嘉定区60岁以上老年人接种23价肺炎疫苗临床效果前瞻性研究及成本效益分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2018年第2期38卷 149-155页

作者：潘黎钟培松李伟张伟费洁上海市嘉定区疾病预防控制中心 201800

目的评估23价肺炎疫苗预防上海市嘉定区60岁以上户籍老年人下呼吸道感染（lower respiratory tract infections,LRTIs）的临床效果及成本效益.方法采用前瞻性队列研究,对接种组和未接种组开展为期3年的追踪调查,比较两组LRTIs发病情... 详细信息

目的评估23价肺炎疫苗预防上海市嘉定区60岁以上户籍老年人下呼吸道感染（lower respiratory tract infections,LRTIs）的临床效果及成本效益.方法采用前瞻性队列研究,对接种组和未接种组开展为期3年的追踪调查,比较两组LRTIs发病情况和经济负担.结果接种23价肺炎疫苗后LRTIs的发生率下降明显且效果稳定,约接种10名老人就可预防1次 LRTIs发生,对LRTIs、抗生素使用和住院的保护效率分别为59.5%、63.5%和89.0%.随着LRTIs发生频率的增加,疫苗的保护效益也呈增加趋势.亚组分析,疫苗可减少高血压患者LRTIs、抗生素使用和住院次数;减少糖尿病患者和健康老年人LRTIs、抗生素使用.接种疫苗的成本效益比为1 ： 1.64,净效益58544元.接种后不良反应多为局部反应,无1例因接种后不适而就诊.结论 23价肺炎疫苗可有效降低60岁以上老年人LRTIs的发生率,并且效果稳定,疫苗使用安全,有一定的成本效益.

关键词：老年人肺炎链球菌疫苗下呼吸道感染队列研究临床效果评估

2005-2015年上海市输入性血吸虫病疫情风险分析

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中国血吸虫病防治杂志 2017年第6期29卷 700-703页

作者：靳艳军蔡黎张耀光何艳燕孙彩英俞瑞芳方伟於雪琴张海兵上海市疾病预防控制中心上海200336 上海市松江区疾病预防控制中心上海市金山区疾病预防控制中心上海市嘉定区疾病预防控制中心上海市青浦区疾病预防控制中心上海市奉贤区疾病预防控制中心

目的了解2005-2015年上海市输入性血吸虫病疫情动态及其主要影响因素。方法采用回顾性调查方法,收集2005-2015年上海市输入性血吸虫病疫情、螺情、流动人口等数据,建立数据库并分析。结果 11年间,上海市流动人口增长了123.92%,达981.65... 详细信息

目的了解2005-2015年上海市输入性血吸虫病疫情动态及其主要影响因素。方法采用回顾性调查方法,收集2005-2015年上海市输入性血吸虫病疫情、螺情、流动人口等数据,建立数据库并分析。结果 11年间,上海市流动人口增长了123.92%,达981.65万,其中54.70%的流动人口分布在近郊。上海市累计在4个远郊区(不含崇明区)的16个镇查出有螺面积7.13 hm^2;共发现23例输入性血吸虫病病例,输入性血吸虫病疫情呈下降趋势(rs=-0.782,P=0.004)。2005-2009年,84.62%(11/13)的输入性血吸虫病病例分布在同期无钉螺发现的近郊区;2010-2015年,90%(9/10)输入性血吸虫病病例分布在同期有钉螺查出的远郊区。结论上海市输入性血吸虫病疫情总体呈下降趋势,但其对血吸虫病防治成果巩固的威胁仍不容忽视。

关键词：血吸虫病流动人口风险分析钉螺上海市

2021—2023年上海市嘉定区市售食品中金黄色葡萄球菌污染情况

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上海预防医学 2024年

作者：陈培超程芳洲黄强陈慧娟孙攀董玉婷彭谦上海市嘉定区疾病预防控制中心

目的了解上海市嘉定区食品中金黄色葡萄球菌的污染状况和食品菌株中肠毒素基因携带情况。方法 2021—2023年采集嘉定区15类食品进行金黄色葡萄球菌检验，并对菌株5种肠毒素sea～see基因进行检测。结果 705件食品样品中88件样品检出金... 详细信息

目的了解上海市嘉定区食品中金黄色葡萄球菌的污染状况和食品菌株中肠毒素基因携带情况。方法 2021—2023年采集嘉定区15类食品进行金黄色葡萄球菌检验，并对菌株5种肠毒素sea～see基因进行检测。结果 705件食品样品中88件样品检出金黄色葡萄球菌，阳性率为12.48%。15类食品中有12类食品检出金黄色葡萄球菌，阳性率最高的3种食物类别分别是冷面（45.00%）、生禽肉（26.25%）、蔬菜沙拉（20.00%）。食品菌株中肠毒素基因携带率为32.95%，sea、seb、sec携带率分别为7.95%、12.50%、14.77%，sed和see均未检出，同时携带2种肠毒基因的菌株检出率为2.27%。生菜、饮品、生肉中菌株肠毒素携带率分别为57.14%、40.00%、30.00%。结论嘉定区食品中金黄色葡萄球菌检出率较高；肠毒素基因携带率较高，食品菌株中携带sea、seb和sec 3种基因，并以sec为主。须加强面制品、蔬菜、非包装饮料等高风险食品中金黄色葡萄球菌和肠毒素的监测。

关键词：金黄色葡萄球菌肠毒素食品上海