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应用生物信息学数据挖掘探究胱硫醚β-合成酶和胱硫醚γ-裂解酶基因表达在肝癌不良预后中的预测价值

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中华肝脏病杂志 2023年第11期31卷 1169-1175页

作者：刘子衿马亚楠首都医科大学宣武医院消化内科北京100053 首都医科大学附属北京佑安医院肝病消化科北京100069

目的探究肝癌和胱硫醚β-合成酶(cystathionineβ-synthase,CBS)基因及胱硫醚γ-裂解酶(cystathionine-γ-lyase,CTH)基因的关系。方法通过挖掘GEO(gene expression omnibus)与TCGA(the cancer genome atlas)数据库,对肝癌的临床特征与CBS及CTH基因表达进行了相关性分析。并通过对肝癌细胞系进行免疫印迹验证。结果CBS及CTH在肿瘤中的表达较非肿瘤明显降低(P<0.05)。Cox回归结果显示CBS是肝细胞癌不良预后的独立危险因素(HR=0.65,P=0.02)。针对CBS基因对不同肿瘤分期进行单因素logistics回归分析,发现肝癌TNM分期II期比I期(P=0.01,OR=0.50)、III期比I期(P=0.03,OR=0.56)、T分期T2期比T1期(P<0.01,OR=0.43)、T3期比T1期(P=0.02,OR=0.54)CBS基因显著降低。肝癌TNM分期III期比I期(P=0.01,OR=0.50),Edmondson分期II期比I期(P=0.03,OR=0.48),III期比I期(P<0.01,OR=0.30),IV期比I期(P=0.03,OR=0.22)CTH基因表达显著降低。GSEA富集分析结果显示,与肝癌细胞CTH与CBS基因表达相关性最高的信号通路为细胞色素P450(FDR Q<0.01,FWER P<0.01)。免疫印迹结果显示,与人肝永生化细胞系HL-7702相比,HLE和Hep3B细胞等肝细胞癌细胞系中CTH下游蛋白CSE表达降低。结论肿瘤组织中的CBS及CTH基因表达低于正常组织。CBS基因是肝细胞癌不良预后的独立危险因素。与CBS及CTH基因关系最为密切的是信号通路为细胞色素P450通路。

关键词：肝癌生物信息学数据挖掘胱硫醚β-合成酶胱硫醚γ-裂解酶

截短人胱硫醚β-合成酶的可溶性表达、纯化及活性鉴定

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华中科技大学学报（医学版） 2012年第6期41卷 697-703页

作者：王利群顾雅平曹利民汪庆于海燕奚学志孙培培沈关心常州大学制药与生命科学学院常州213164 常州二十一世纪生物技术研究所有限公司常州213164 华中科技大学同济医学院基础医学院免疫学系武汉430030

目的构建截短人胱硫醚β-合成酶(T-hCBS)基因原核表达载体,得到可溶性的T-hCBS蛋白,为同型半胱氨酸检测试剂盒的开发打下基础。方法通过优化T-hCBS基因,克隆并构建重组表达质粒pET15b/T-hCBS,转化大肠埃希菌BL21。使用Ni 2+亲和层析柱... 详细信息

目的构建截短人胱硫醚β-合成酶(T-hCBS)基因原核表达载体,得到可溶性的T-hCBS蛋白,为同型半胱氨酸检测试剂盒的开发打下基础。方法通过优化T-hCBS基因,克隆并构建重组表达质粒pET15b/T-hCBS,转化大肠埃希菌BL21。使用Ni 2+亲和层析柱对重组蛋白进行纯化,再通过HiTrap脱盐柱脱盐,采用比色法检测目的蛋白活性。结果重组蛋白在大肠埃希菌中可以高效表达,产量为44mg/L,比活约1 100U/mg。15%SDS-PAGE显示其相对分子质量为45kD,与预计大小一致。表达菌体超声破碎后上清及纯化的蛋白溶液均呈现红色。结论成功克隆和表达了T-hCBS蛋白,并得到高产高酶活性的可溶性蛋白,对同型半胱氨酸检测试剂盒的开发有一定的潜在应用价值。

关键词：胱硫醚β-合成酶重组可溶性蛋白表达

新疆维吾尔族、汉族胱硫醚β-合成酶基因多态性及血浆同型半胱氨酸与原发性高血压的相关性

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中华医学遗传学杂志 2015年第1期32卷 94-100页

作者：时庆平张颖王红欧阳菊艳陈芳许梦新疆医科大学第一附属医院干部内三科乌鲁木齐830054

目的探讨胱硫醚β-合成酶（cystathionebetasynthase，CBS）基因T833C、G919A、844ins68多态性以及血浆同型半胱氨酸（homocysteine，Hcy）水平与新疆维吾尔族、汉族原发性高血压（essentialhypertension，EH）的相关性。方法收集EH患者429例，其中维吾尔族211例，汉族218例；健康对照组共410名，其中维吾尔族210名，汉族200名。应用扩增阻滞实变体系（amplification refractorv mutationsystem，ARMS）检测CBS基因T833C、G919A、844ins68多态性，并用酶标免疫吸附检测法检测血浆Hcy水平，用化学发光法检测血浆叶酸、维生素B12水平。结果维吾尔族、汉族EH组血浆Hcy水平均高于对照组（P〈0．05）。维吾尔族、汉族CBS基因T833C、G919A突变基因型血浆Hcy水平高于未突变基因型（野生型），且差异有统计学意义（P〈0．05）。CBS基因G919A多态的频率在维吾尔族及汉族EH组与对照组之间差异有统计学意义（维吾尔族：χ2=10．264，P〈0．01；汉族：χ2=23．075，P〈0．01）；CBS基因T833CSNP分布频率在维吾尔族EH组和对照组有统计学意义（χ2=40．254，P〈0．01）。通过Logistic多元回归去除混杂因素后显示。年龄（OR=1．151，P=0．047，95％CI=1．002-1．323）、T833C（CC）（OR=1．078，=0．003，95％CI=1.043～1．114）、肥胖（OR=1．284，P=0．02l，95％CI=1．038～1．590）、高同型半胱氨酸血症（OR=3．296，P=0．016，95％CI=1．244—8．733）是维吾尔族EH的独立危险因素。年龄（OR=1．162，P=0．007，95％CI=1．042～1．297）、肥胖（OR=3．501，P=0．003，95％CI=1．521～8．060）、高同型半胱氨酸水平（OR=1．046，P=0．03l，95％CI：1．011—1．459）是汉族EH独立危险因素。结论血浆Hcy水平与新疆维吾尔族、汉族EH相关。CBS基因T833CCC基因型可能与新疆维吾尔族EH相关。

关键词：胱硫醚β-合成酶基因多态性同型半胱氨酸原发性高血压维吾尔族

胱硫醚β-合成酶833T/C、919G/A基因多态性与原发性高血压的相关性研究

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农垦医学 2009年第3期31卷 256-259页

作者：张春军郎健勇何芳石河子大学石河子大学医学院石河子大学医学院病理生理学教研室新疆石河子832002

胱硫醚β-合成酶(CBS)基因多态性与原发性高血压(EH)之间存在着一定的关系,本文从CBS的生物学特性,CBS的基因多态性位点,CBS的基因多态性与CBS表型的关系,CBS的基因多态性与高血压的相关性研究等方面阐述了近年来CBS 833T/C、919G/A基... 详细信息

胱硫醚β-合成酶(CBS)基因多态性与原发性高血压(EH)之间存在着一定的关系,本文从CBS的生物学特性,CBS的基因多态性位点,CBS的基因多态性与CBS表型的关系,CBS的基因多态性与高血压的相关性研究等方面阐述了近年来CBS 833T/C、919G/A基因多态性与EH的相关性研究。

关键词：胱硫醚β-合成酶基因多态性原发性高血压

胱硫醚β-合成酶基因844ins68多态性的检测

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现代临床医学生物工程学杂志 2003年第5期9卷 415-417页

作者：钟永根张惠文陈盛强广东省河源市人民医院河源517000 广东省中医院广州医学院广州510180

目的　了解广东汉族人胱硫醚 β-合成酶基因 84 4ins6 8的分布特点 .方法　PCR扩增 12 4例广东正常人的CBS 84 4ins 6 8基因突变点 ,直接行聚琼脂糖凝胶电泳确定其基因型 .结果　广东汉族人CBS 84 4ins 6 8基因表型频率 :野生型 (D/D) 0... 详细信息

目的　了解广东汉族人胱硫醚 β-合成酶基因 84 4ins6 8的分布特点 .方法　PCR扩增 12 4例广东正常人的CBS 84 4ins 6 8基因突变点 ,直接行聚琼脂糖凝胶电泳确定其基因型 .结果　广东汉族人CBS 84 4ins 6 8基因表型频率 :野生型 (D/D) 0 .782 0 ,纯合子突变型 (I/I) 0 .1930 ,杂合子突变型 (D/I) 0 .0 2 5 0 ,CBS 84 4ins 6 8基因频率 :D 0 .8790 ;I0 .12 10 .结论　CBS84 4ins 6 8基因突变存在一定的人种或地域差异 .

关键词：胱硫醚β-合成酶基因多态性检测基因突变 844ins68

胱硫醚β-合成酶G919A基因多态性与原发性高血压关系的meta分析

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心脑血管病防治 2016年第6期16卷 422-426页

作者：李丹丹乔木王喜冰梁学清赵昕吉林大学第一医院 130000

目的综合评估胱硫醚β-合成酶（CBS）基因 G919A 多态性与原发性高血压（EH）发生风险的关系。方法全面检索 PubMed 、Embase 、Medline 、万方数据库、中国知网（CNKI）、维普资讯，收集 CBS 基因 G919A 多态性与 EH 发生关系的病例对... 详细信息

目的综合评估胱硫醚β-合成酶（CBS）基因 G919A 多态性与原发性高血压（EH）发生风险的关系。方法全面检索 PubMed 、Embase 、Medline 、万方数据库、中国知网（CNKI）、维普资讯，收集 CBS 基因 G919A 多态性与 EH 发生关系的病例对照研究，优势比（OR）及95％可信区间（CI）评估关联强度，应用 RevMan5.3软件对纳入研究进行异质性检验和效应值 OR 合并，漏斗图评价发表性偏倚；敏感度分析过程，分别以固定效应模型和随机效应模型合并 OR 值，以评估结果的稳定性。结果共纳入4篇文献6组病例－对照研究，共累计 EH 组患者1147例，健康对照组1138例，根据异质性检验结果选取固定效应模型或随机效应模型合并数据。 Meta 分析结果显示：CBS 基因919纯合子模型（AA vs GG）、杂合子模型（GA vs GG）、显性模型（AA ＋ GA vs GG）、隐性模型（AA vs GG ＋ GA）和基因频率（A vs G）与 EH 关系的合并 OR（95％ CI）分别为3.03（1.95～4.72）、1.49（1.10～2.02）、1.61（1.23～2.10）、2.65（1.26～5.57）和1.55（1.35～1.79），均 P＜0.01。漏斗图未检测出显著的发表性偏倚。结论目前 Meta 分析表明 CBS 基因 G919A 多态性与 EH 发病相关联，尤其是在中国人群。

关键词：胱硫醚β-合成酶原发性高血压基因多态性 Meta分析

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胱硫醚β-合成酶基因表达调控研究进展

医学分子生物学杂志 2004年第3期1卷 165-167,181页

作者：吴淑庆钱令嘉军事医学科学院卫生学环境医学研究所天津市300050

高同型半胱氨酸血症是心血管疾病独立而重要的危险因子,催化同型半胱氨酸(homocysteine,HCY)转硫代谢的胱硫醚β-合成酶(cystathionine beta-synthase,CBS)基因表达或结构异常是其主要诱因。文章综述了cbs基因的结构特点、调控cbs基因... 详细信息

高同型半胱氨酸血症是心血管疾病独立而重要的危险因子,催化同型半胱氨酸(homocysteine,HCY)转硫代谢的胱硫醚β-合成酶(cystathionine beta-synthase,CBS)基因表达或结构异常是其主要诱因。文章综述了cbs基因的结构特点、调控cbs基因表达的上游顺式反应元件和反式作用因子、CBS蛋白的结构及缺失、突变等方面的研究进展。

关键词：同型半胱氨酸胱硫醚β-合成酶基因表达心血管疾病

胱硫醚β-合成酶基因多态性及血浆同型半胱氨酸与新疆哈萨克族原发性高血压的关系

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新疆医科大学学报 2014年第12期37卷 1595-1599页

作者：王红时庆平张颖欧阳菊艳木尼拉.艾尼瓦尔卡丽比努尔.雅克甫新疆医科大学第一附属医院干部内三科乌鲁木齐830054

目的：探讨胱硫醚β-合成酶（Cystathione beta synthase，CBS）基因 T833C、G919A、844ins68多态性及血浆同型半胱氨酸（Homocysteine，Hcy）水平与新疆哈萨克族原发性高血压（Essential Hypertension，EH）的关系。方法选择新疆哈萨克... 详细信息

目的：探讨胱硫醚β-合成酶（Cystathione beta synthase，CBS）基因 T833C、G919A、844ins68多态性及血浆同型半胱氨酸（Homocysteine，Hcy）水平与新疆哈萨克族原发性高血压（Essential Hypertension，EH）的关系。方法选择新疆哈萨克族 EH 患者118例（EH 组）和住院体检者108例（对照组），使用扩增阻滞实变体系法检测 CBS T833C、G919A、844ins68多态性，并采用酶标免疫吸附检测法检测血浆 Hcy 水平，化学发光法检测血浆叶酸、维生素 B12（VitB12）水平。结果EH 组血浆 Hcy 水平均高于对照组（P ＜0．05）。CBS T833C、G919A 纯合型、杂合型血浆 Hcy 水平高于野生型，且差异有统计学意义（P ＜0．05）。EH 组 CBS 基因第833位点 C 等位基因频率、第919位点 A 等位基因频率高于对照组，差异有统计学意义（CBS 833位点 C 等位基因：χ^2＝5．917，P ＝0．015；CBS 919位点 A 等位基因：χ^2＝5．917，P ＝0．020）。通过 Logistic 多元回归去除混杂因素后显示：年龄（OR＝1．120，P ＝0．000，95％ CI 1．077～1．165）、肥胖（OR ＝1．086，P ＝0．040，95％ CI 1．004～1．174）、高同型半胱氨酸血症（OR ＝1．099，P ＝0．039，95％ CI 1．005～1．203）是新疆哈萨克族 EH 的独立危险因素。结论血浆 Hcy水平与新疆哈萨克族 EH 相关。CBS T833C、G919A、844ins68基因多态性可能与新疆哈萨克族 EH 无关。

关键词：胱硫醚β-合成酶基因多态性同型半胱氨酸原发性高血压哈萨克族

同型半胱氨酸及胱硫醚β-合成酶844ins68基因多态性与急性脑梗死的关系

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广东医学 2014年第18期35卷 2852-2855页

作者：李艾帆崔传举袁树华李强敏贺颖郑红许予明河南省郑州市第一人民医院神经内科 450004 郑州大学基础医学院细胞生物学与医学遗传学教研室郑州450052 郑州大学第一附属医院神经内科郑州450052

目的探讨同型半胱氨酸(Hcy)水平及胱硫醚β-合成酶(CBS)844ins68基因多态性与急性脑梗死的相关性。方法运用循环酶法和PCR方法检测300例急性脑梗死患者(病例组)及261例健康对照者(对照组)Hcy水平及CBS 844ins68基因型,并进行测序验证。... 详细信息

目的探讨同型半胱氨酸(Hcy)水平及胱硫醚β-合成酶(CBS)844ins68基因多态性与急性脑梗死的相关性。方法运用循环酶法和PCR方法检测300例急性脑梗死患者(病例组)及261例健康对照者(对照组)Hcy水平及CBS 844ins68基因型,并进行测序验证。结果病例组和对照组空腹血浆Hcy水平分别为(19.3±7.2)μmol/L和(15.1±4.9)μmol/L,差异有统计学意义(P0.05);病例组CBS 844ins68 D/D基因型频率为98.7%,I/D型频率为1.3%,对照组分别为97.7%和2.3%,病例组和对照组I等位基因频率分别为0.7%和1.1%,两组基因型和等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);病例组D/D和I/D基因型相应的Hcy水平分别为(17.3±6.4)、(20.0±13.4)μmol/L,差异无统计学意义(P>0.05)。logistic回归分析结果显示:在调整传统危险因素后,升高的Hcy水平与急性脑梗死发病有关,CBS 844ins68基因突变与脑梗死无关。结论血浆Hcy水平升高是急性脑梗死的独立危险因素;CBS 844ins68基因突变不影响Hcy水平,可能不足以构成急性脑梗死发病中的独立危险因素。

关键词：脑梗死同型半胱氨酸胱硫醚β-合成酶基因多态性