检索结果-南通市图书馆

核酸检测技术对日本血吸虫病诊断价值的meta分析

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中国血吸虫病防治杂志 2020年第1期32卷 15-22页

作者：王盛琳王丽萍吴铃铃李银龙张利娟吕山许静中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所、WHO热带病合作中心、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、国家热带病研究中心上海200025

目的应用诊断试验meta分析,定量评价核酸检测中变温和等温扩增技术对日本血吸虫病的诊断价值。方法通过计算机检索1990年1月-2019年6月中国知网、万方数据知识服务平台、PubMed数据库和ScienceDirect数据库中公开发表的日本血吸虫病核... 详细信息

目的应用诊断试验meta分析,定量评价核酸检测中变温和等温扩增技术对日本血吸虫病的诊断价值。方法通过计算机检索1990年1月-2019年6月中国知网、万方数据知识服务平台、PubMed数据库和ScienceDirect数据库中公开发表的日本血吸虫病核酸检测相关文献,手工查阅《血吸虫病研究资料汇编》及论文集等纸质出版物,并以文献追溯法对相关文献引文进行追溯查找。按照纳入与排除标准对检索的文献进行筛选,提取纳入文献相关数据,采用RevMan 5.3软件对入选文献进行质量评价,采用MetaDiSc 1.4软件对数据进行meta分析。结果最终纳入19篇文献,其中中文文献5篇、英文文献14篇;共24组研究,其中17组研究涉及变温扩增技术与金标准的比较、7组研究涉及等温扩增技术与金标准的比较。文献质量评价结果表明,所纳入文献总体偏倚较小;Deek漏斗图提示变温扩增技术相关文献可能存在发表偏倚。变温扩增技术相关研究间存在非阈值效应引起的异质性,故采用随机效应模型合并效应量;合并分析结果示,其检测日本血吸虫病的综合灵敏度为0.81(0.79,0.83)、特异度为0.73(0.71,0.74)、SROC曲线下面积为0.9443。等温扩增技术相关研究间不存在异质性,故使用固定效应模型进行效应量合并;合并分析结果显示,其检测日本血吸虫病的综合灵敏度为0.96(0.94,0.98)、特异度为0.95(0.94,0.97)、SROC曲线下面积为0.9899。结论变温扩增技术和等温扩增技术对日本血吸虫病均有较高诊断价值,等温扩增技术诊断准确性相对更高。

关键词：日本血吸虫病诊断试验核酸检测 meta分析

人乳头状瘤病毒核酸检测用于宫颈癌筛查中国专家共识(2022)

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中华医学杂志 2023年第16期103卷 1184-1195页

作者：中华预防医学会肿瘤预防与控制专业委员会中国医师协会妇产科医师分会阴道镜与宫颈病变专业委员会中国优生科学协会阴道镜和子宫颈病理学分会北京医师协会医学检验专科医师(技师)分会赵方辉崔巍毕蕙不详国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院流行病学研究室北京100021 国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院检验科北京100021 北京大学第一医院妇产科北京100034

我国正处于加速消除宫颈癌的关键时期,使用高质量筛查方法提高筛查覆盖率是消除宫颈癌的主要手段之一。人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测是WHO推荐用于宫颈癌初筛的首选方法,但我国尚无将其用于宫颈癌筛查实践的指导性文件。因此,中华预防... 详细信息

我国正处于加速消除宫颈癌的关键时期,使用高质量筛查方法提高筛查覆盖率是消除宫颈癌的主要手段之一。人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测是WHO推荐用于宫颈癌初筛的首选方法,但我国尚无将其用于宫颈癌筛查实践的指导性文件。因此,中华预防医学会肿瘤预防与控制专业委员会、中国医师协会妇产科医师分会阴道镜与宫颈病变专业委员会、中国优生科学协会阴道镜和子宫颈病理学分会、北京医师协会医学检验专科医师(技师)分会与中华医学杂志编辑委员会邀请国内50余名公共卫生、妇产科、检验医学、病理学等多学科专家结合国内外指南、医学循证证据及我国实际情况形成专家共识,推荐将HPV核酸检测作为我国宫颈癌筛查的主要方法,并针对其应用于宫颈癌筛查实践前评估和准备、具体用途和适用人群、实验室操作流程以及实施后监测和评估等方面提出了科学建议,以推动我国HPV核酸检测全面、深入、规范、有序地高质量发展,为实现我国宫颈癌消除目标提供有力保障。

关键词：人乳头状瘤病毒核酸检测宫颈癌筛查

感染奥密克戎变异株的2019冠状病毒病轻型和普通型患者核酸检测转阴时间影响因素分析

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浙江大学学报（医学版） 2022年第6期51卷 731-737页

作者：陈怡洁陈卓敏王笑华熊慧双峰刘秀娟江西中医药大学研究生院江西南昌330004 中国人民解放军联勤保障部队第九〇八医院肾内科江西南昌330002 中国人民解放军联勤保障部队第九〇八医院护理部江西南昌330002 中国人民解放军联勤保障部队第九〇八医院骨科江西南昌330002

目的:观察感染奥密克戎变异株的2019冠状病毒病(COVID-19)轻型和普通型患者临床特征,分析影响患者病毒核酸检测转阴时间的相关因素。方法:回顾性分析2022年4月12日至5月26日上海某方舱医院收治的1781例COVID-19患者的临床资料,包括患者... 详细信息

目的:观察感染奥密克戎变异株的2019冠状病毒病(COVID-19)轻型和普通型患者临床特征,分析影响患者病毒核酸检测转阴时间的相关因素。方法:回顾性分析2022年4月12日至5月26日上海某方舱医院收治的1781例COVID-19患者的临床资料,包括患者年龄、性别、身高、体重、临床症状、基础疾病史、COVID-19疫苗接种情况、治疗用药情况及核酸检测转阴时间等。采用单因素分析和多因素logistic回归分析患者核酸检测转阴时间的影响因素。结果:1781例患者中,男性995例,女性786例,年龄中位数为39(30,52)岁,超重偏肥胖[体质指数(BMI)为24kg/cm^(2)以上]727例(40.8%),存在基础疾病413例(23.2%);未接种COVID-19疫苗205例(11.5%),接种疫苗1576例(88.5%);有1种及以上症状1233例(69.2%),以咳嗽(60.3%)、咳痰(50.4%)、发热(36.9%)多见;接受中药治疗1444例(81.0%),西药治疗78例(4.4%),中西医结合治疗14例(0.8%),未接受药物治疗245例(13.8%),所有患者经过对症处理后均改善,全部痊愈出院,核酸检测转阴中位时间为10.3(7.4,12.4)d。单因素和多因素分析结果显示,年龄为60岁及以上(OR=1.537,95%CI:1.116~2.115,P核酸检测转阴时间延长的独立危险因素;接种COVID-19疫苗(OR=0.548,95%CI:0.398~0.755,P核酸检测转阴时间缩短。结论:奥密克戎变异株感染的COVID-19患者临床症状相对较轻,病情隐匿,患者年龄为60岁及以上、未接种COVID-19疫苗、BMI为24kg/cm^(2)以上、合并高血压是核酸检测转阴时间延长的独立影响因素。

关键词：奥密克戎变异株 2019冠状病毒病临床表现核酸检测影响因素

污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法标准(WS/T 799-2022)

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中华预防医学杂志 2022年第7期56卷 891-896页

作者： "污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法标准"起草组张岚黄霞杨敏不详中国疾病预防控制中心环境与健康相关产品安全所中国疾病预防控制中心环境与人群健康重点实验室北京100021 清华大学环境学院环境模拟与污染控制国家重点联合实验室北京100084 中国科学院生态环境研究中心中国科学院饮用水科学与技术重点实验室北京100085

新型冠状病毒肺炎疫情暴发以来,全球多个国家已建立基于污水流行病学的污水新冠病毒监测,而我国尚未建立污水中新型冠状病毒的标准检测方法。本标准给出了聚乙二醇沉淀法、铝盐混凝沉淀法和离心超滤法三种污水中新型冠状病毒富集浓缩方... 详细信息

新型冠状病毒肺炎疫情暴发以来,全球多个国家已建立基于污水流行病学的污水新冠病毒监测,而我国尚未建立污水中新型冠状病毒的标准检测方法。本标准给出了聚乙二醇沉淀法、铝盐混凝沉淀法和离心超滤法三种污水中新型冠状病毒富集浓缩方法,以用于生活污水、医疗机构污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测。本标准的制定对规范污水中新型冠状病毒检测、对保证污水中新型冠状病毒检测的科学性、有效性具有重要意义。

关键词：污水新型冠状病毒富集浓缩核酸检测标准

CRISPR/Cas系统在病原体核酸检测中的应用进展

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中国血吸虫病防治杂志 2023年第1期35卷 98-103,110页

作者：李梦茹秦志强殷堃郑彬中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、WHO热带病合作中心、科技部国家级热带病国际研究中心、上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院上海200025 上海交通大学医学院

快速、灵敏、特异的检测方法对于传染病防控至关重要。聚合酶链式反应、等温扩增等体外核酸扩增技术已广泛应用于病原体检测。近年来,基于规则成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白(CRISPR/Cas)系统的核酸检测方法显示出快速、高灵敏... 详细信息

快速、灵敏、特异的检测方法对于传染病防控至关重要。聚合酶链式反应、等温扩增等体外核酸扩增技术已广泛应用于病原体检测。近年来,基于规则成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白(CRISPR/Cas)系统的核酸检测方法显示出快速、高灵敏度、高特异性与便携性等优点。本文对CRISPR/Cas系统类型、原理及其在病原体检测中的应用进展进行综述,并对其应用前景进行展望。

关键词： CRISPR/Cas系统核酸检测病毒细菌寄生虫

全国新型冠状病毒德尔塔变异株核酸检测室间质量评价

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中华医学杂志 2022年第3期102卷 216-221页

作者：韩彦熙陈玉清李金明张瑞北京医院国家老年医学中心国家卫生健康委临床检验中心中国医学科学院老年医学研究院北京100730 中国医学科学院北京协和医学院研究生院北京100730

目的明确我国现有核酸检测试剂对新型冠状病毒德尔塔变异株的适用性,了解全国临床实验室对德尔塔变异株的检测能力。方法采用基因工程方法制备无生物传染危险性的噬菌体病毒样颗粒模拟样本,发放到全国8488家实验室,开展全国新型冠状病... 详细信息

目的明确我国现有核酸检测试剂对新型冠状病毒德尔塔变异株的适用性,了解全国临床实验室对德尔塔变异株的检测能力。方法采用基因工程方法制备无生物传染危险性的噬菌体病毒样颗粒模拟样本,发放到全国8488家实验室,开展全国新型冠状病毒德尔塔变异株核酸检测室间质量评价。样本盘包括3支不同浓度的德尔塔变异株样本(7.5×10^(2)、1.5×10^(3)、6.0×10^(3)拷贝/ml)、1支非变异株弱阳性样本(7.5×10^(2)拷贝/ml)和1支阴性样本。计算实验室检测不同浓度德尔塔变异株样本的符合率、同等浓度水平的德尔塔变异株和非变异株样本的符合率,以及使用实验室数≥100家的各检测试剂对不同浓度德尔塔变异株样本的检测符合率、同等浓度水平的德尔塔变异株和非变异株样本的检测符合率。结果本次室间质量评价共计收到8127份回报结果,成绩合格的实验室占98.77%(8027/8127)。样本的总符合率为99.64%(40490/40635),阴性符合率为99.73%(8105/8127),阳性符合率为99.62%(32385/32508)。德尔塔变异株阳性样本符合率随浓度减少相应降低。同浓度(7.5×10^(2)拷贝/ml)水平的德尔塔变异株和非变异株样本符合率分别为99.41%(8079/8127)、99.51%(8087/8127),差异无统计学意义(P=0.392)。使用实验室数≥100家的各检测试剂的样本总符合率、阴性符合率和阳性符合率均>98%,对7.5×10^(2)拷贝/ml的德尔塔变异株和非变异株样本检测的符合率差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论德尔塔变异株未影响我国现有核酸检测试剂的适用性。临床实验室对德尔塔变异株和非变异株具有同等检测能力,但少部分实验室对弱阳性样本的检测能力需进一步提高。

关键词：质量保证,卫生保健新型冠状病毒德尔塔变异株核酸检测室间质量评价

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规模化鹅场主要病毒核酸检测结果与分析

中国农业科学 2023年第10期56卷 2021-2034页

作者：邵震刁有祥山东农业大学动物科技学院

【目的】经长期对中国国内各省市的规模化鹅场常见病毒性疫病核酸检出率进行调查，发现国内许多规模化鹅场均可同时检出多种病毒核酸，并且这种现象非常普遍，鉴于目前国内关于规模化鹅场多种病毒性疫病核酸同时检出的相关数据较为匮乏... 详细信息

【目的】经长期对中国国内各省市的规模化鹅场常见病毒性疫病核酸检出率进行调查，发现国内许多规模化鹅场均可同时检出多种病毒核酸，并且这种现象非常普遍，鉴于目前国内关于规模化鹅场多种病毒性疫病核酸同时检出的相关数据较为匮乏，论文旨在了解规模化鹅场多种病毒性疫病核酸同时检出的情况并进行分析，为规模化鹅场病毒性疫病的防控提供理论指导和科学依据。【方法】2021年5—10月，自山东、黑龙江、四川、吉林、广西、河南、安徽、辽宁、河北、贵州、湖南及内蒙古等省市的47个规模化鹅场采集737份病料，对其采用普通PCR及RT-PCR方法进行番鸭呼肠孤病毒（muscovy duck reovirus, MDRV）、鸭呼肠孤病毒（duck reovirus, DRV）、鹅星状病毒(goose astroviruses, GAstV)、禽腺病毒（fowl adenovirus, FAdV）、禽网状内皮增生病毒（reticuloendotheliosis virus, REV）、新城疫病毒（newcastle disease, ND）、鹅细小病毒(goose parvovirus, GPV)、鹅圆环病毒(goose circovirus, GoCV)、鹅出血性多瘤病毒(goose hemorrhagic polyomavirus, GHPV)、坦布苏病毒（tembusu virus, TMUV）及H9亚型禽流感病毒（avian influenza virus H9, H9-AIV）等11种规模化鹅场常见病毒性疫病的检测。每份病料剖取完整的肝脏、脾脏、肺脏及肾脏，利用Trizol法提取总RNA；以总RNA为模板逆转录合成cDNA的一条链，而后以cDNA为模板继续扩增获得完整的cDNA，随后以该cDNA为模板利用番鸭呼肠孤病毒、鸭呼肠孤病毒、鹅星状病毒、禽腺病毒、禽网状内皮增生性病毒、新城疫病毒、鹅细小病毒、鹅圆环病毒、鹅出血性多瘤病毒、坦布苏病毒及H9亚型禽流感病毒的特异性引物，通过普通PCR反应扩增目的片段；所有扩增片段均进行琼脂糖凝胶电泳，对部分阳性样品进行测序；将所获得的测序结果与GenBank上发表的相应病毒基因序列进行比较，应用MEGA 6.0软件中的邻接法（neighbor-joining, NJ）绘制系统发育进化树进行分析。【结果】番鸭呼肠孤病毒、鸭呼肠孤病毒、鹅星状病毒、禽腺病毒、禽网状内皮增生性病毒、新城疫病毒、鹅细小病毒、鹅圆环病毒、鹅出血性多瘤病毒、坦布苏病毒及H9亚型禽流感病毒感染情况检测结果显示，GAstV核酸检出率最高，为58.21%;REV及NDV核酸检出率最低，分别为1.36%及1.50%；鹅群不同程度上均可同时检出多种病毒核酸，尤其以2种或3种病毒核酸同时检出的情况较为普遍，占样品总数的67.44%。两种病毒核酸同时检出率中GAstV与GoCV同时检出所占比例最大，为18.44%;3种病毒核酸同时检出率中MDRV、GAstV及GPV同时检出所占比例最大，为36.28%。【结论】明确了我国规模化鹅场可以同时检测到多种病毒核酸这一特征，这可能是我国规模化鹅场病毒性疫病复杂化和防控难度加大的重要原因之一。

关键词：规模化鹅场核酸检测遗传进化分析

原料血浆中HBV/HCV/HIV-1核酸检测方法的建立及验证

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中国新药杂志 2022年第21期31卷 2128-2135页

作者：邓琨张林林喻剑虹杨玲陈鄂湘童剑啸程郁菁刘莹彭干郑宵蓓李璞赵传波彭丹张金王月国药集团武汉血液制品有限公司武汉430207

目的:建立原料血浆中乙型肝炎病毒(HBV)/丙型肝炎病毒(HCV)/人类免疫缺陷病毒(HIV-1)核酸检测方法,并进行系统性验证。方法:分别从灵敏度、精密度、线性、特异性及抗干扰因素等方面,对核酸检测系统进行系统性验证,并筛查1 140 601份原... 详细信息

目的:建立原料血浆中乙型肝炎病毒(HBV)/丙型肝炎病毒(HCV)/人类免疫缺陷病毒(HIV-1)核酸检测方法,并进行系统性验证。方法:分别从灵敏度、精密度、线性、特异性及抗干扰因素等方面,对核酸检测系统进行系统性验证,并筛查1 140 601份原料血浆。结果:分析灵敏度验证盘中HBV(3 IU·mL^(-1))样本、HCV(20 IU·mL^(-1))样本及HIV-1(40 IU·mL^(-1))样本各20份进行单人份检测,样本检出率为100%,高于95%。重复性:实验员A重复检测HBV(3 IU·mL^(-1))样本、HCV(20 IU·mL^(-1))样本及HIV-1(40 IU·mL^(-1))样本各20次,CT值CV分别为2.08%,1.82%,4.70%,均≤5%,实验员B重复检测样本各20次,各项目CT值CV分别为1.33%,2.08%,4.70%,均≤5%;中间精密度:2名实验员各项目CT值CV分别为2.80%,2.26%,3.80%,均≤10%。线性验证:HBV/HCV/HIV-1企业工作参考品10~5, 10~4, 10~3, 10~2浓度水平扩增线性梯度明显,重复性好。特异性验证:将系统性能验证盘作为供试品进行检测,检测结果应与系统性能验证盘预期结果一致。干扰因素验证:当样本中分别含0.19%~1.52%的枸橼酸钠、48~431 mg·dL的溶血血红蛋白及141~1 269福尔马肼浊度的乳糜均对检测无影响。1 140 601份原料血浆中有175份反应性样本,NAT反应性样本:HIV-1样本3份,HCV样本11份,HBV样本132份;ELISA反应性样本:HIV样本0份,HCV样本15份,HBV样本14份。男性样本(100份)高于女性样本(75份)。血型占比O型(37.71%)>A型(29.71%)>B型(21.14%)>AB型(11.43%)。45~55岁年龄段占比最高达64.57%,18~30岁年龄段占比最少仅为4.57%。结论:该方法稳定准确、精密度高、特异性强、抗干扰能力强,适用于原料血浆中HBV/HCV/HIV-1核酸检测。核酸检测与血清学检测有机结合可有效降低输血感染风险,必要的献血浆者追踪随访和更进一步的实验室确证分析有助于血清学检测和核酸检测不一致结果的解释和分析。

关键词：核酸检测原料血浆人类免疫缺陷病毒丙型肝炎病毒乙型肝炎病毒

CRISPR-Cas系统在病原核酸检测中的研究进展

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合成生物学 2024年第1期5卷 202-216页

作者：杜瑶高宏丹刘家坤刘孝荣邢志浩张涛马东礼蚌埠医学院检验医学院安徽蚌埠233030 深圳市儿童医院儿科研究所广东深圳518034 中国科学院深圳先进技术研究所深圳合成生物研究所广东深圳518055 深圳市海微生物科技有限公司广东深圳518057 蚌埠医学院病原生物学教研室安徽蚌埠233030

CRISPR-Cas系统作为原核生物获得性免疫系统,由簇状规则间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)和CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated proteins,Cas)构成,因其识别和切割特定DNA或RNA序列,而成为分子诊断领域研究的热点。研究人员利用Cas蛋白(Cas12、Cas13、Cas14、Cas3等)结合信号放大和转化技术(荧光法、电位法、比色法、侧向流动技术等),开发了许多高灵敏度、高特异性、低成本的诊断平台,为病原核酸检测提供了新途径。本文介绍了CRISPR-Cas系统的生物学机制及分类,总结现有的基于Cas蛋白反式切割活性开发的病原核酸检测技术,描述其特点、功能和应用场景,并对该系统的未来应用前景进行展望,期望CRISPR-Cas系统成为包括核酸检测在内的多靶标的理想检测平台。

关键词： CRISPR-Cas系统 Cas12和Cas13 病原体核酸检测生物传感