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大黄鱼(Larimichthys crocea)白细胞介素10(IL-10)基因克隆及溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)侵染后表达变化分析

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海洋与湖沼 2018年第6期49卷 1334-1340页

作者：侯红红苗亮李明云郭晓飞杜静雅陈炯宁波大学海洋学院宁波315211

白细胞介素10(interleukin10,IL-10)是鱼类先天性免疫因子之一,在炎症反应和免疫调节中有着重要作用。本研究获得大黄鱼(Larimichthys crocea)IL-10基因cDNA序列,由899个核苷酸组成,含1个555bp的开放阅读框、编码184个氨基酸,预测编码... 详细信息

白细胞介素10(interleukin10,IL-10)是鱼类先天性免疫因子之一,在炎症反应和免疫调节中有着重要作用。本研究获得大黄鱼(Larimichthys crocea)IL-10基因cDNA序列,由899个核苷酸组成,含1个555bp的开放阅读框、编码184个氨基酸,预测编码蛋白分子量为21.24kDa、N端有22个氨基酸组成的信号肽序列。氨基酸序列多重比对表明大黄鱼IL-10具有IL-10家族特征性序列和构成2对二硫键的4个保守性半胱氨酸,与欧洲鲈(Dicentrarchuslabrax)IL-10序列相似性最高(78.5%);系统进化树分析显示大黄鱼IL-10和其他鱼类IL-10形成一个大簇,与欧洲鲈进化关系最近。荧光定量PCR(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)检测结果显示健康大黄鱼IL-10基因在鳃和肠中高表达,肝和头肾中低表达;溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)侵染后大黄鱼肠、脑、脾、肝和头肾中IL-10基因表达量均显著上调(P大黄鱼IL-10基因表达与病原菌感染密切相关,为深入研究大黄鱼IL-10的生物学功能及免疫机制提供了基础资料。

关键词：大黄鱼白细胞介素10(IL-10)基因溶藻弧菌表达分析

基于GC-TOF-MS的大黄鱼鱼卵鱼露快速发酵过程中代谢产物分析

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食品科学 2022年第24期43卷 129-137页

作者：周静张华丹火玉明雷彩玲杜希萍梁鹏程文健陈丽娇福建农林大学食品科学学院福建福州350002 闽台特色海洋食品加工及营养健康教育部工程研究中心福建福州350002 福建省食品微生物与酶工程重点实验室福建厦门361021

为了解大黄鱼鱼卵鱼露快速发酵过程中代谢产物的差异及变化,采用气相色谱-飞行时间质谱技术对发酵30 d的大黄鱼鱼卵鱼露进行监测。对所得的数据进行多元统计分析,根据统计学上显著差异P值不大于0.05,且正交偏最小二乘判别分析第1主成分... 详细信息

为了解大黄鱼鱼卵鱼露快速发酵过程中代谢产物的差异及变化,采用气相色谱-飞行时间质谱技术对发酵30 d的大黄鱼鱼卵鱼露进行监测。对所得的数据进行多元统计分析,根据统计学上显著差异P值不大于0.05,且正交偏最小二乘判别分析第1主成分变量重要性值投影值不小于1的条件对差异代谢物进行筛选并进行凝聚层次聚类。结果表明:大黄鱼鱼卵鱼露发酵过程中的显著差异代谢产物共有46种,其中包括10种糖、9种醇、7种氨基酸、6种有机酸、4种酯、3种醛、1种脂肪酸以及6种其他化合物。差异代谢产物主要参与的代谢通路为缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成,蛋白质消化吸收,半乳糖代谢,氨酰-tRNA生物合成,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,硫代葡萄糖苷生物合成,三羧酸循环,氨基酸的生物合成,莽草酸类生物碱的生物合成,磷酸肌醇代谢,不饱和脂肪酸的生物合成。所映射出的15种极显著差异代谢物中氨基酸类代谢物参与了多条代谢通路。本研究结果为大黄鱼鱼卵鱼露的工业化提供一定理论依据。

关键词：气相色谱-飞行时间质谱大黄鱼鱼露差异代谢产物

冷链与断链流通对冰藏大黄鱼品质与微生物多样性的影响

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中国食品学报 2019年第9期19卷 221-229页

作者：王倩蓝蔚青张墨言孙晓红杨晓慧谢晶上海海洋大学食品学院上海201306 上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心上海冷链装备性能与节能评价专业技术服务平台食品科学与工程国家级实验教学示范中心(上海海洋大学)上海201306

研究了冷链和断链流通对冰藏大黄鱼品质及微生物多样性的影响。模拟了冰藏大黄鱼冷链与断链两种流通方式,采用多点温度采集仪实时监测不同流通过程中的温度变化,以感官评定、总挥发性盐基氮(TVB-N)、菌落总数(TVC)与嗜冷菌数(PBC)等指... 详细信息

研究了冷链和断链流通对冰藏大黄鱼品质及微生物多样性的影响。模拟了冰藏大黄鱼冷链与断链两种流通方式,采用多点温度采集仪实时监测不同流通过程中的温度变化,以感官评定、总挥发性盐基氮(TVB-N)、菌落总数(TVC)与嗜冷菌数(PBC)等指标来评价两种流通方式对大黄鱼品质及微生物数量变化的影响,并应用聚合酶链式反应(PCR)-变性梯度凝胶电泳(DGGE)指纹技术对冰藏大黄鱼冷链与断链流通中的微生物种群多样性进行研究。结果表明,温度波动加速大黄鱼的品质劣变,流通时间与其感官分值、TVB-N值、微生物数正相关,冷链组与断链组样品分别在347h与275h时超出货架期终点,货架期分别为275~347h与203~275h。样品经PCR-DGGE割胶回收测序,腐生葡萄球菌、假交替单胞菌和副溶血性弧菌在大黄鱼流通后期逐渐减少,假单胞菌与嗜冷杆菌开始出现并逐渐增多,同时还有不动杆菌与希瓦氏菌。经综合评价,假单胞菌与嗜冷杆菌为大黄鱼冷链与断链流通过程中贮藏末期的主要优势菌。

关键词：大黄鱼冰藏流通聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE) 微生物多样性

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影响大黄鱼的水中声指标

爆炸与冲击 2017年第4期37卷 734-740页

作者：周在明杨燕明牛富强黄跃坤国家海洋局第三海洋研究所海洋声学与遥感实验室福建厦门361005

为了明确有效地评价声波对大黄鱼影响的指标,以水下爆破和滨海山体爆破两种作业方式产生的水中声波数据为基础,进行声波信号的声压峰值和声暴露级分析,并结合现场大黄鱼的行为响应进行研究。结果表明:水下爆破产生的水中声波瞬态声压幅... 详细信息

为了明确有效地评价声波对大黄鱼影响的指标,以水下爆破和滨海山体爆破两种作业方式产生的水中声波数据为基础,进行声波信号的声压峰值和声暴露级分析,并结合现场大黄鱼的行为响应进行研究。结果表明:水下爆破产生的水中声波瞬态声压幅值较高,能量在瞬间累积到最大值并影响大黄鱼的行为和安全;而滨海山体爆破水中声波的声压幅值小,声暴露时间长,能量的连续累积造成了大黄鱼行为的改变。由于两种爆破方式作用下的水中声波在不同的声暴露时间内的声暴露级较接近,且超过150dB会造成大黄鱼的行为异常,因此认为声暴露级是评价水中声波对大黄鱼影响的一个重要指标。

关键词：工程爆破水中声波大黄鱼声暴露级指标

植物源复合保鲜冰对大黄鱼流通期间品质与抗氧化性的影响

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中国食品学报 2019年第11期19卷 179-185页

作者：王倩蓝蔚青张楠楠孙晓红谢晶上海海洋大学食品学院上海201306 海水产品加工及贮藏工程技术研究中心/上海冷链装备性能与节能评价专业技术服务平台食品科学与工程国家级实验教学示范中心(上海海洋大学) 上海201306

本文研究了植物源复合保鲜冰对大黄鱼流通期间品质与抗氧化性的影响。通过模拟流通过程,在搬运、运输、配送和销售环节,测定样品在流通期间的感官、微生物(菌落总数、嗜冷菌数)、TVB-N值与抗氧化性(总抗氧化能力、超氧化物歧化酶与丙二... 详细信息

本文研究了植物源复合保鲜冰对大黄鱼流通期间品质与抗氧化性的影响。通过模拟流通过程,在搬运、运输、配送和销售环节,测定样品在流通期间的感官、微生物(菌落总数、嗜冷菌数)、TVB-N值与抗氧化性(总抗氧化能力、超氧化物歧化酶与丙二醛含量)等指标,研究植物源复合保鲜冰对流通中冰鲜大黄鱼品质的影响。结果:随着流通时间的延长,普通冰对照组和保鲜冰处理组的大黄鱼样品感官分值上升,微生物数和TVB-N值明显升高,且对照组的增长速率大于处理组。对照组样品在流通至347 h时,感官分值和菌落总数分别为(2.34±0.09)lg(CFU/g)与(6.24±0.13)lg(CFU/g),TVB-N值为(30.87±1.56) mgN/100 g,均超出可接受范围,而保鲜冰处理组样品在395 h时各指标均未达到货架期限值。对照组货架期为275~347 h,而保鲜冰处理组可延长货架期48 h以上。对照组样品的T-AOC、SOD值明显下降,MDA值显著上升。由此证明,保鲜冰处理可充分发挥复合保鲜剂的抑菌和抗氧化作用,抑制微生物生长,提高鱼肉抗氧化能力,延长其货架期。

关键词：植物源复合保鲜冰大黄鱼流通品质抗氧化性

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冰鲜大黄鱼肠腔细菌类群鉴定及菌群结构分析

中国食品学报 2013年第12期13卷 188-196页

作者：张雯倪莉黄志清郑朝栋叶秀云福州大学化学化工学院福州350108 福州大学生物科学与工程学院食品科学技术研究所福州350108

采用多重培养基分离培养,结合16SrDNA鉴定以及PCR-变性凝胶梯度电泳(PCR-DGGE),对新鲜和冰鲜贮藏6 d的大黄鱼肠腔细菌类型和菌群结构进行鉴定。大黄鱼肠腔细菌有希瓦氏菌、假单胞菌、气单胞菌、普罗威登斯菌、摩根氏菌、环丝菌、嗜冷菌... 详细信息

采用多重培养基分离培养,结合16SrDNA鉴定以及PCR-变性凝胶梯度电泳(PCR-DGGE),对新鲜和冰鲜贮藏6 d的大黄鱼肠腔细菌类型和菌群结构进行鉴定。大黄鱼肠腔细菌有希瓦氏菌、假单胞菌、气单胞菌、普罗威登斯菌、摩根氏菌、环丝菌、嗜冷菌、不动杆菌、大肠杆菌、屎肠球菌、硬壁菌门的成员,其中希瓦氏菌和假单胞菌是鱼肠腔的优势细菌和重要的致腐细菌。PCR-DGGE图谱主成分分析(PCA)显示,假单胞菌是该菌群的特征菌落,冰鲜贮藏后期希瓦氏菌比例显著上升。多重培养基分离检测和PCR-DGGE都可检测出鱼肠道中普遍存在的细菌类群。PCR-DGGE培养基具有快速、较全面分析菌群结构的优点,可作为冰鲜鱼质量安全检测的方法。

关键词：大黄鱼肠腔细菌类群 PCR-变性梯度凝胶电泳

大黄鱼生长速率差异个体肌肉组织的转录组比较分析

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水产学报 2023年第3期47卷 87-100页

作者：张波姜丹张东玲王志勇方铭集美大学水产学院农业农村部东海海水健康养殖重点实验室

为了探究大黄鱼生长性状的分子调控机制，实验从同一个网箱内养殖的大黄鱼中选取生长速率较快的体重均值为(527.1±83.6) g的个体182尾、生长速率较慢的体重均值为(238.4±52.3) g的个体230尾，共412尾进行研究。对其肌肉组织进行总RNA... 详细信息

为了探究大黄鱼生长性状的分子调控机制，实验从同一个网箱内养殖的大黄鱼中选取生长速率较快的体重均值为(527.1±83.6) g的个体182尾、生长速率较慢的体重均值为(238.4±52.3) g的个体230尾，共412尾进行研究。对其肌肉组织进行总RNA提取和转录组测序，并对2组进行基因差异表达分析。以Padj 1为标准，共筛选到227个差异表达基因，包括125个上调基因、102个下调基因。差异表达基因在NCBI-nr和Uniprot (Swiss-Prot)数据库的注释率分别为99.12%、81.94%。通过差异表达基因的功能注释结果，初步筛选出了可能与肌肉生长相关的候选功能基因，如gdf9、ckm、tnni2和des等。GO和KEGG分析预测出部分与肌肉生长相关的信息，如GO term有肌动蛋白丝组织、肌动蛋白细胞骨架组织、肌动蛋白丝基过程、微管组织中心和发育生长等，KEGG通路有细胞和生长因子、脂肪酸生物合成、转化生长因子-β信号通路(TGF-β信号通路)、胰岛素信号通路和肌动蛋白细胞骨架的调控等。加权基因共表达网络分析(WGCNA)分析发现，purple模块与体重性状相关性较强，其核心基因myoz1、tpm1和tnni2可能与肌肉生长相关。本研究结果可以为后续相关基因功能的深度挖掘验证以及大黄鱼生长性状的分子调控机制解析提供参考。

关键词：大黄鱼肌肉生长转录组差异表达基因加权基因共表达网络分析(WGCNA)

大黄鱼共生菌Bacillus coagulans LL1103的代谢产物研究

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微生物学报 2020年第2期60卷 387-396页

作者：郭庆丰陈林尹震花张娟娟王彦波尹文兵黄河科技学院河南省小分子新药研发国际联合实验室郑州市药用资源研究重点实验室河南郑州450063 浙江工商大学浙江杭州310018 中国科学院微生物研究所北京100101

[目的]研究大黄鱼共生菌Bacillus coagulans LL1103的次生代谢产物及其抑菌活性。[方法]利用色谱层析技术对*** LL1103发酵液乙酸乙酯和正丁醇提取物进行分离纯化;运用波谱技术鉴定化合物的结构;采用微量肉汤稀释法对化合物进行抗菌活... 详细信息

[目的]研究大黄鱼共生菌Bacillus coagulans LL1103的次生代谢产物及其抑菌活性。[方法]利用色谱层析技术对*** LL1103发酵液乙酸乙酯和正丁醇提取物进行分离纯化;运用波谱技术鉴定化合物的结构;采用微量肉汤稀释法对化合物进行抗菌活性测定。[结果]从大黄鱼内生菌*** LL1103发酵液中分离并鉴定9个环二肽类化合物,分别为:(1)环(4-羟基-脯氨酸-亮氨酸)、(2)环(异亮氨酸-丙氨酸)、(3)环(脯氨酸-缬氨酸)、(4)环(脯氨酸-苯丙氨酸)、(5)环(脯氨酸-亮氨酸)、(6)环(甘氨酸-丙氨酸)、(7)环(脯氨酸-甘氨酸)、(8)环(脯氨酸-丙氨酸)和(9)环(络氨酸-甘氨酸)。活性评价显示化合物3、7和9对大肠埃希菌(Escherichia coli)具有较强抑制作用,最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)分别为8.0、4.0和16.0μg/mL。[结论]从大黄鱼共生菌*** LL1103的发酵液中分离得到3个对大肠埃希菌(***)具有较好抑制活性的化合物。

关键词：大黄鱼抑菌活性环二肽凝结芽孢杆菌

大黄鱼cGPDH和mGPDH基因克隆及低温胁迫下的表达差异分析

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中国水产科学 2021年第3期28卷 253-264页

作者：张东玲徐浩张震西王志勇集美大学水产学院农业农村部东海海水健康养殖重点实验室

为探究cGPDH和mGPDH在大黄鱼(Larimichthyscrocea)适应低水温过程中所起的调控作用,本研究采用RACE-PCR技术克隆了大黄鱼cGPDH和mGPDH基因全长cDNA序列,cGPDH和mGPDH基因序列全长分别为1577 bp和2319 bp,包含长度为1050 bp和2193 bp的开放阅读框,分别编码349和730个氨基酸;氨基酸比对分析发现大黄鱼cGPDH和mGPDH与其他硬骨鱼类同源性较高, cGPDH包含一个特征性序列GXGXXG, mGPDH包含2个EF-hand功能结构域;进化树分析表明大黄鱼cGPDH和mGPDH与其他硬骨鱼类聚为一枝,与棘头梅童鱼(Collichthyslucidus)亲缘关系最近。生物信息学分析发现大黄鱼cGPDH和mGPDH均不含跨膜结构域,cGPDH亚细胞定位于细胞质可能性最大,三维结构包含一个C端α螺旋底物结合结构, 8个N端β折叠结构和一个单体结构,mGPDH定位于线粒体的可能性最大。qRT-PCR分析显示cGPDH和mGPDH在所检测的12个组织中均有表达,cGPDHmRNA主要表达在血液,其次为鳃、头肾和肠道,肌肉组织中表达量最低;而mGPDHmRNA在头肾表达量最高,肌肉组织表达量最低。在持续的冷胁迫下,水温15℃到9℃每天降温2℃, 9℃到7℃每天降温1℃,7℃保持5d,大黄鱼cGPDH和mGPDH在脑和肌肉表达趋势均显著上调。研究结果表明,cGPDH和mGPDH基因可能在大黄鱼适应冬季低水温过程中发挥重要作用。

关键词：大黄鱼 cGPDH mGPDH 低温基因调控基因表达