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The composite phenotype analysis identifies potential concerted responses of physiological systems to high altitude exposure

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National Science Review 2023年第5期10卷 109-111页

作者： Yi Li Meng Hao Zixin Hu Yanyun Ma Kun Wang Xiaoyu Liu Xianhong Yin Menghan Zhang Yi Wang Meng Liang Yuan Guo Lei Bao Shixuan Zhang Shiguan Le Chenyuan Wu Dayan Sun Yang Wei fei Wu Rui Zhang Lingxian Zhu Hui Zhang Shuai Jiang Xingdong Chen Xiaofeng Wang Yao Zhang Longli Kang Wenyuan Duan Bin Qiao Jiucun Wang Li Jin State Key Laboratory of Genetic Engineering Collaborative Innovation Center for Genetics and DevelopmentSchool of Life Sciences and Human Phenome InstituteFudan University Institute for Six-sector Economy Fudan University International Human Phenome Institutes Ministry of Education Key Laboratory of Contemporary Anthropology Department of Anthropology and Human GeneticsSchool of Life SciencesFudan University Greater Bay Area Institute of Precision Medicine(Guangzhou) School of Life SciencesFudan University Artificial Intelligence Innovation and Incubation Institute Fudan University shanghai Pudong Hospital Fudan University Pudong Medical Center fudan-Taizhou Institute of Health Sciences Key Laboratory of High-Altitude Environment and Genes Related to Diseases of Tibet Autonomous Region School of MedicineXizang Minzu University Institute of Cardiovascular Disease Shandong Provincial Western Hospital Research Unit of Dissecting the Population Genetics and Developing New Technologies for Treatment and Prevention of Skin Phenotypes and Dermatological Diseases (2019RU058) Chinese Academy of Medical Sciences

Environmental stresses,such as temperature,disease and altitude could induce systematic changes of biological systems which manifests as concerted responses across multiple systems within a certain period of time[1].High altitude acclimatization (HAA) refers to a series of adaptive physiological responses to hypoxic *** these processes,

关键词：

Microbial diversity and community structure of natural Ophiocordyceps sinensis and its microhabitats

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Microbial diversity and community structure of natural Ophio...

Metabolic Dysfunction-associated Fatty Liver Disease is Associated with Greater Impairment of lung Function than Nonalcoholic Fatty Liver Disease

中国菌物学会2015年学术年会

作者： fei Xia Yan Liu Meng-Yuan Guo Guang-Rong Shen Lian-Xian Guo Juan Lin Xuan-Wei Zhou Key Laboratory of Urban Agriculture(South) Ministry of Agriculture Plant Biotechnology Research CenterSchool of Agriculture and BiologyShanghai Jiaotong University Department of Ecology and Evolutionary Biology School of Life SciencesFudan University School of Public Health Guangdong Medical College

Background:Ophiocordyceps sinensis（DongC hong Xia Cao（DCXC） in Chinese）, a fungal parasite of caterpillars, is a traditional Chinese medicine. Bioactive components isolated from DCXC possess a wide range of pharmacological actions. Many efforts have been directed towards isolating the fungi based on culture-dependent methods for investigation of fungal diversity in order to confirm the anamorph of DCXC and find new medicinal fungi resources, and the results have been varied. Results: A total of 44,588 bacterial and 51,584 fungal sequences corresponding to 11694 and 9297 putative operational taxonomic units（OTU） were respectively identified by a Roche/454-based, high throughput sequence analysis of 16 S r RNA genes and ITS regions. The main bacterial groups were Proteobacteria, Acidobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria and Firmicutes, while the Ascomycota, Basidiomycota and Zygomycota were the main fungal phyla. Proteobacteria presented 68.4%, 49.5%, 38.9% and 35.6% of all bacteria in the sclerotia, stromata, external mycelial cortices and soil, respectively. As the main fungi phyla, Ascomycota presented 21.0%, 45.6%, 26.4% and 59.3% in the sclerotia, stromata, external mycelial cortices and soil, respectively. Bacterial and fungal communities were more diverse in the environmental sample than in the DCXC sample. The microbial communities were obviously distinct in each sample. Several novel unclassifiable bacterial（10.41%） and fungal（37.92%） species were also detected. Conclusions: This study identified numerous microorganisms associated with DCXC and its microhabitats, some of fungi have been previously identified while bacteria represent new candidates. Our analyses suggested that the diversity of bacteria and fungi makes DCXC an "integrated microecosystem". Thus, DCXC represents multiple microorganisms, not a single fungus.

关键词： Ophiocordyceps sinensis microbial community bioresource diversity

来源： cnki会议评论

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Journal of Clinical and Translational Hepatology 2022年第2期10卷 230-237页

作者： Lei Miao Li Yang Li-Sha Guo Qiang-Qiang Shi Teng-fei Zhou Yang Chen Huai Zhang Hui Cai Zhi-Wei Xu Shuan-Ying Yang Hai Lin Zhe Cheng Ming-Yang Zhu Xu Nan Shuai Huang Ya-Wen Zheng Giovanni Targher Christopher D Byrne Yu-Ping Li Ming-Hua Zheng Cheng-Shui Chen Department of Pulmonary and Critical Care Medicine The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical UniversityWenzhouZhejiangChina Department of Gastroenterology The Second Affiliated Hospital of Wenzhou Medical UniversityWenzhouZhejiangChina The Interventional Pulmonary Key Laboratory of Zhejiang Province WenzhouZhejiangChina NAFLD Research center Department of HepatologyThe First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical UniversityWenzhouZheji-angChina Department of Biostatistics and Records Room Medical Quality Management OfficeThe First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical UniversityWenzhouZhejiangChina Department of Respiratory Medicine Zhong Shan Hospital Affiliated to Shanghai Fudan UniversityShanghaiChina Clinical Research Service center People’s Hospital of Henan ProvincialZhengzhouHenanChina Department of Respiratory and Critical Care Medicine The Second Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong UniversityXi’anShanxiChina Department of Pulmonary and Critical Care Medicine The Second Affili-ated Hospital of Fujian Medical UniversityQuanzhouFujianChina Department of Pulmonary and Critical Care Medicine The First Affiliated Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhouHenanChina Section of Endocrinology Diabetes and MetabolismDepartment of MedicineUniversity and Azienda Ospedaliera Universitaria Integrata of VeronaVeronaItaly Southampton National Institute for Health Research Biomedical Research center University Hospital SouthamptonSouth-ampton General HospitalSouthamptonUK Key Laboratory of Diagnosis and Treatment for The Development of Chronic Liver Disease in Zhejiang Province WenzhouZhejiangChina

Background and Aims:We compared lung function parameters in nonalcoholic fatty liver disease(NAFLD)and metabolic dysfunction-associated fatty liver disease(MAFLD),and examined the association between lung function parameters and fibrosis severity in ***:In this cross-sectional study,we randomly recruited 2,543 middle-aged individuals from 25 communities across four cities in China during 2016 and *** participants received a health check-up including measurement of anthropometric parameters,biochemical variables,liver ultrasonography,and *** severity of liver disease was assessed by the fibrosis(FIB)-4 ***:The prevalence of MAFLD was 20.4%(n=519)and that of NAFLD was 18.4%(n=469).After adjusting for age,sex,adiposity measures,smoking status,and significant alco-hol intake,subjects with MAFLD had a significantly lower predicted forced vital capacity(FVC,88.27±17.60%vs.90.82±16.85%,plung *** each 1-point increase in FIB-4,FVC was diminished by 0.507(95%CI:-0.840,-0.173,p=0.003),and FEV1 was diminished by 0.439(95%CI:-0.739,-0.140,p=0.004).The results remained unchanged when the statistical analyses was performed separately for men and ***:MAFLD was significantly asso-ciated with a greater impairment of lung function param-eters than NAFLD.

关键词： MAFLD NAFLD lung function Liver fibrosis score

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异质信息网络中元路径感知的评分协同过滤

计算机学报 2020年第12期43卷 2385-2397页

作者：何云飞张以文吕智慧颜登程何强安徽大学计算机科学与技术学院合肥230601 复旦大学计算机科学技术学院上海200433 安徽大学物质科学与信息技术学院合肥230601 澳大利亚斯威本科技大学电子信息及软件工程学院墨尔本3122澳大利亚网络信息安全审计与监控教育部工程研究中心上海200433

基于邻域的协同过滤(Neighborhood-Based Collaboration Filtering,NBCF)具有简单、可解释等优点一直备受关注且被广泛使用.然而,仅利用用户-项目的历史交互信息使得NBCF并不能获得很好的推荐性能.随着网络的快速发展,信息网络中包含了... 详细信息

基于邻域的协同过滤(Neighborhood-Based Collaboration Filtering,NBCF)具有简单、可解释等优点一直备受关注且被广泛使用.然而,仅利用用户-项目的历史交互信息使得NBCF并不能获得很好的推荐性能.随着网络的快速发展,信息网络中包含了大量不同类型的对象和关系,越来越多丰富的语义信息可以被进一步挖掘和利用,自然构成了异质信息网络(Heterogeneous Information Network,HIN).基于HIN的推荐模型受到了研究者们的高度关注.相比于传统的推荐模型,基于HIN的推荐模型不仅能有效提高推荐性能,还能缓解冷启动和数据稀疏等问题.然而,现有基于HIN的推荐模型在保证模型有效性的同时往往需要学习较多的参数,参数的设定对模型性能有重要的影响.因此,本文提出一种无参数的HIN中元路径感知的评分协同过滤推荐模型HRCF,其主要思想是通过HIN中的元路径寻找评分的邻居,然后对邻居进行加权来估计该评分.首先,在不同的元路径上产生用户(项目)之间的交换矩阵;其次,将不同元路径上的交换矩阵进行整合计算用户(项目)之间的相似矩阵;最后将用户之间的相似矩阵、用户-项目的历史评分矩阵、项目之间的相似矩阵依次相乘并归一化从而一次性估计所有的评分.为验证HRCF模型的有效性,本文在公开的Douban Book和Yelp数据集上进行了实验.实验结果表明,HRCF模型的推荐精度优于目前存在的方法,且能很好地克服冷启动问题.

关键词：异质信息网络协同过滤推荐系统元路径评分预测

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复合式离心泵汽蚀特性的数值模拟与试验分析

中国空间科学技术 2019年第3期39卷 64-70页

作者：晁文雄王均儒王飞臧华兵史宝鲁中国航发西安动力控制科技有限公司西安710077 复旦大学上海200433 中国航天员中心北京100094

为研究某型航天离心泵汽蚀特性,基于Mixture多相流模型与汽蚀模型相结合对长短复合叶轮离心泵内乙二醇水溶液进行不同的进口负压下汽液两相定常数值模拟并进行不同进口压力下的汽蚀性能特性试验,结果表明汽化区域随进口负压的增大而扩大... 详细信息

为研究某型航天离心泵汽蚀特性,基于Mixture多相流模型与汽蚀模型相结合对长短复合叶轮离心泵内乙二醇水溶液进行不同的进口负压下汽液两相定常数值模拟并进行不同进口压力下的汽蚀性能特性试验,结果表明汽化区域随进口负压的增大而扩大.当进口负压在-50kPa,泵进出口压差在155kPa,已经接近额定压差的3%限制范围,此时离心泵的出口压力105kPa为临界汽蚀出口压力;进口负压到-60kPa时,出口流量突变为300L/h,该泵产生临界汽蚀状态,小于技术要求的最小进口压力10kPa,因此该泵在其工作范围内不会发生汽蚀现象,并证得本文数值模拟的可靠性.

关键词：复合式离心泵汽蚀特性乙二醇水溶液数值模拟特性试验

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基于CORS的地籍图精度分析

现代测绘 2019年第5期42卷 32-35页

作者：郭飞飞姚连璧张邵华上海市徐汇区房产交易管理事务中心上海200031 同济大学测绘与地理信息学院上海200092

为对比电子化地籍图与数字化实测图之间的差异,评定街坊边线的精度,实施地籍图校准,介绍了利用CORS技术、导线测量、全站仪坐标测量等对上海市徐汇区8个街道典型地物点进行测量,通过与原有地籍图对应点的匹配来分析地籍图的精度。首先利... 详细信息

为对比电子化地籍图与数字化实测图之间的差异,评定街坊边线的精度,实施地籍图校准,介绍了利用CORS技术、导线测量、全站仪坐标测量等对上海市徐汇区8个街道典型地物点进行测量,通过与原有地籍图对应点的匹配来分析地籍图的精度。首先利用CORS技术建立控制网,并对RTK控制点进行测距检核;在此基础上布设导线,在导线点上利用全站仪对典型地物点进行数据采集;经过对不同街道的各街坊点进行细部测量,并与原地籍图同名点进行匹配,计算转换参数和坐标转换的残差,实现对地籍图的校准工作。经校准分析各街道点位残差均方根误差为30 cm,能满足现时情况下城市地籍测量的精度要求。

关键词：地籍 CORS 控制测量街坊点同名点匹配

南昌市老年人类免疫缺陷病毒感染者/艾滋病患者社会资本与生存质量的关系

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第二军医大学学报 2019年第1期40卷 99-103页

作者：黄凌陈飞宇蓝桂莲袁兆康南昌大学公共卫生学院江西省预防医学重点实验室南昌330006 上海市浦东新区疾病预防控制中心复旦大学浦东预防医学研究院上海200136 江西省东乡县疾病预防控制中心抚州331800 南昌大学第一附属医院消化科南昌330006

目的了解南昌市老年人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者/艾滋病患者社会资本和生存质量的现况,并探索社会资本及其各维度与生存质量的关系。方法纳入2015年1月至6月南昌市东湖区和青云谱区疾病预防控制中心确证的65例老年HIV感染者/艾滋病患... 详细信息

目的了解南昌市老年人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者/艾滋病患者社会资本和生存质量的现况,并探索社会资本及其各维度与生存质量的关系。方法纳入2015年1月至6月南昌市东湖区和青云谱区疾病预防控制中心确证的65例老年HIV感染者/艾滋病患者进行现况调查。问卷包括一般情况调查表、个人社会资本量表和简体中文版MOS-HIV量表。采用统计描述评价老年HIV感染者/艾滋病患者的社会资本和生存质量现况,采用多元线性逐步回归分析探索社会资本与生存质量的关系。结果共收集有效问卷63份。南昌市老年HIV感染者/艾滋病患者结合型社会资本得分、桥梁型社会资本得分和社会资本总得分分别为10.83±1.99、7.60±2.94、18.43±3.47,生理领域和心理领域得分分别为44.25±5.10、42.93±5.08。结合型社会资本、CD4+T淋巴细胞计数、年龄、文化程度、婚姻状况是生存质量的影响因素(P<0.05)。结论南昌市老年HIV感染者/艾滋病患者的社会资本和生存质量较低;加强家庭成员、朋友、邻里等的关怀帮助是提高其生存质量的关键,而桥梁型社会资本与生存质量的关系有待进一步探索。

关键词：获得性免疫缺陷综合征老年人社会资本生存质量影响因素

促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤的临床特征及预后因素分析

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上海交通大学学报（医学版） 2018年第3期38卷 281-287页

作者：朱容萱王坚朱莉菲王红霞上海交通大学附属第一人民医院肿瘤中心上海201600 复旦大学附属肿瘤医院病理科上海200032

目的·分析促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤(desmoplastic small round cell tumor,DSRCT)的临床特征及预后因素。方法·通过检索Medline和Embase数据库,收集2003年11月—2012年7月发表的140例DSRCT患者临床资料并进行回顾性分析,观察指... 详细信息

目的·分析促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤(desmoplastic small round cell tumor,DSRCT)的临床特征及预后因素。方法·通过检索Medline和Embase数据库,收集2003年11月—2012年7月发表的140例DSRCT患者临床资料并进行回顾性分析,观察指标为无进展生存期(progression-free survival,PFS)或总生存期(overall survival,OS)。采用Kaplan-Meier法计算生存率,并使用对数秩检验进行组间比较;采用Cox模型进行多变量分析,确定影响预后的因素。结果·患者中位年龄为(23.2±12.7)岁(4~74岁),男女比例3.12:1;最常见的症状是腹痛(35.7%)和腹部包块(20.0%);腹腔或盆腔肿瘤106例,其余34例为腹腔外肿瘤;接受常规化学治疗(简称化疗)、减瘤手术、新辅助化疗、辅助化疗或一线化疗的患者分别占76.4%、52.1%、17.1%、47.9%和38.6%,部分患者接受辅助放射治疗(17.1%)、高温腹腔化疗(4.1%)和骨髓移植(7.3%)。单因素分析结果显示男性、无转移、有效减瘤术、化疗和多模式治疗与OS延长相关(均P<0.05);原发肿瘤部位、腹腔外肿瘤、无转移和有效减瘤手术与PFS改善相关(均P<0.05);Cox回归分析结果显示,有效减瘤手术和化疗是独立的良性预后因素。结论·可通过手术、辅助治疗清除肿瘤的多模式治疗方式来提高DSRCT患者生存水平。

关键词：促结缔组织增生性小圆细胞瘤手术化学治疗预后因素

中国和亚洲部分其他国家疫苗配送管理的比较分析

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上海预防医学 2021年第3期33卷 243-247,253页

作者：臧召燕王伟严非阿克忠付朝伟复旦大学公共卫生学院国家卫生健康委员会卫生技术评估重点实验室上海200032 青海省疾病控制中心免疫规划所青海西宁810007

【目的】比较日本、泰国、越南和我国的免疫框架和配送管理状况,分析我国疫苗管理中存在的不足,探索完善我国免疫规划的政策。【方法】通过对文献、政府文件等相关资料的梳理和评阅,对我国和日本、泰国、越南从免疫规划和疫苗配送管理... 详细信息

【目的】比较日本、泰国、越南和我国的免疫框架和配送管理状况,分析我国疫苗管理中存在的不足,探索完善我国免疫规划的政策。【方法】通过对文献、政府文件等相关资料的梳理和评阅,对我国和日本、泰国、越南从免疫规划和疫苗配送管理实践的现状进行比较。【结果】日本是信息化技术在疫苗配送管理中应用比较好的国家之一,泰国在将疫苗供应管理外包给政府制药组织(government pharmaceutical organization,GPO)并引进供应商管理库存(vendor-managed inventory,VMI)系统后也形成了高效完备的冷链配送模式,越南疫苗配送管理的特点是疫苗储存和服务区域较集中。【结论】我国可参考日本、泰国的免疫框架和先进的配送管理经验,将信息化技术充分应用于疫苗配送管理,部分地区可合理引入第三方机构承担疫苗配送的外包服务。

关键词：疫苗招标采购配送部分亚洲国家