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环形泰勒虫SHERLOCK-LF检测方法的建立与初步应用

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中国兽医科学 2024年

作者：苏书晓赵帅阳刘军龙张楚晗朱浩瀚关贵全殷宏罗建勋中国农业科学院兰州兽医研究所动物疫病防控全国重点实验室甘肃省动物寄生虫病重点实验室江苏高校动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心扬州大学

为快速、准确、简便的对环形泰勒虫感染进行检测，选取环形泰勒虫子孢子表面抗原基因作为靶标分子，设计特异性RPA引物及crRNA（CRISPR RNA）序列，建立环形泰勒虫的特异性高灵敏酶报告基因解锁（specific high-sensitive enzymatic rep... 详细信息

为快速、准确、简便的对环形泰勒虫感染进行检测，选取环形泰勒虫子孢子表面抗原基因作为靶标分子，设计特异性RPA引物及crRNA（CRISPR RNA）序列，建立环形泰勒虫的特异性高灵敏酶报告基因解锁（specific high-sensitive enzymatic reporter unlocking， SHERLOCK）-LF检测方法，并分析该方法的特异性、敏感性和符合率。结果显示：该方法可特异性检测环形泰勒虫基因组，与中华泰勒虫、东方泰勒虫、牛巴贝斯虫和双芽巴贝斯虫基因组均无交叉反应，且检测灵敏度达到1.42 copies/μL；与行业标准PCR方法检测结果相比，其符合率达到86.96%。本研究建立的SHERLOCK-LF检测方法可在1.5h内完成对环形泰勒虫的检测，为该病的现场诊断及防控提供了技术支撑。

关键词：环形泰勒虫 RPA Cas13a crRNA 侧向流试纸条

高中地理教材知识描述差异比较研究——以高中地理必修第一册“莫霍界面和地壳”相关知识为例

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中学地理教学参考 2024年第8期 19-23页

作者：赵帅阳赖海成宋波北京市第八十中学北京福建省厦门双十中学福建厦门北京市朝阳区教育科学研究院北京

教材是课程标准的图文化呈现。以《普通高中地理课程标准(2017年版)》为依据编写的2019版地理教材在知识呈现方面更加专业和科学,体现出与时代接轨、与世界接轨的前沿性。文章以高中地理必修第一册“地球的圈层结构”中“莫霍界面和地... 详细信息

教材是课程标准的图文化呈现。以《普通高中地理课程标准(2017年版)》为依据编写的2019版地理教材在知识呈现方面更加专业和科学,体现出与时代接轨、与世界接轨的前沿性。文章以高中地理必修第一册“地球的圈层结构”中“莫霍界面和地壳”相关内容为例,并结合国外地理教材中的有关内容,深入分析和研究了不同版本地理教材在知识描述上的差异,进而可实现教学内容的优化。

关键词：高中地理教材教材知识描述教材比较研究莫霍界面地壳地球圈层结构

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在科学探究中实施高中地理问题式教学

长角血蜱Ykt6蛋白抗东方泰勒虫感染的生物学效应

中学历史、地理教与学 2024年第4期

作者：赖海成赵帅阳

全球气候变暖持续且深刻地影响着全人类。在这样的严峻挑战下，党的二十大对“双碳”的认识提高到了新的高度。因此，“全球气候变化与国家安全”一课具有重要的意义。文章以人教版教材为例，基于问题式教学，结合科学探究的思路，构建... 详细信息

全球气候变暖持续且深刻地影响着全人类。在这样的严峻挑战下，党的二十大对“双碳”的认识提高到了新的高度。因此，“全球气候变化与国家安全”一课具有重要的意义。文章以人教版教材为例，基于问题式教学，结合科学探究的思路，构建高中地理问题式教学实施路径，在此基础上渗透“双碳”思政教育。

关键词：问题式教学科学探究全球气候变化国家安全

来源：人大复印报刊资料评论

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中国兽医科学 2024年第3期54卷 386-392页

作者：罗金赵帅阳车丽妍严若锋宋小凯任巧云关贵全殷宏刘光远李祥瑞南京农业大学动物医学院、教育部动物健康与食品安全国际合作联合实验室江苏南京210095 中国农业科学院、兰州兽医研究所、动物疫病防控全国重点实验室、甘肃省动物寄生虫病重点实验室、农业部草食动物疫病重点开放实验室甘肃兰州730046

为了解Ykt6基因在蜱体中影响东方泰勒虫感染的生物学效果,通过长角血蜱实验室培养株和野外株,评估Ykt6蛋白对东方泰勒虫侵染长角血蜱过程中蜱的存活率、繁殖率以及对东方泰勒虫感染率等指标的生物学效果。结果显示,Ykt6基因参与了东方... 详细信息

为了解Ykt6基因在蜱体中影响东方泰勒虫感染的生物学效果,通过长角血蜱实验室培养株和野外株,评估Ykt6蛋白对东方泰勒虫侵染长角血蜱过程中蜱的存活率、繁殖率以及对东方泰勒虫感染率等指标的生物学效果。结果显示,Ykt6基因参与了东方泰勒虫与长角血蜱之间的宿主-寄生虫相互作用。Ykt6基因的表达水平与东方泰勒虫在长角血蜱体内的存活和繁殖能力密切相关,当该基因表达水平降低时,东方泰勒虫的存活率和繁殖能力显著下降。进一步的研究发现,Ykt6基因的变异可能影响东方泰勒虫与长角血蜱之间的相互作用。一些野外长角血蜱个体具有Ykt6基因的突变,导致东方泰勒虫在长角血蜱体内的存活和繁殖能力显著下降。这一发现提示,Ykt6基因的变异可能是东方泰勒虫入侵长角血蜱的一个关键因素。总之,Ykt6基因对东方泰勒虫入侵长角血蜱具有重要影响。通过研究Ykt6基因的功能和变异,可以深入了解东方泰勒虫与长角血蜱之间的相互作用,为控制东方泰勒虫入侵提供新的思路和方法。这将有助于保护人畜健康和生态环境的平衡。

关键词：长角血蜱东方泰勒虫 Ykt6蛋白感染生物学效果

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在科学探究中实施高中地理问题式教学——以“全球气候变化与国家安全”为例

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地理教学 2023年第16期 17-20页

作者：赖海成赵帅阳福建省厦门双十中学福建厦门361009 北京市第八十中学北京100102

全球气候变暖持续且深刻地影响着全人类。在这样的严峻挑战下,党的二十大对“双碳”的认识提高到了新的高度。因此,“全球气候变化与国家安全”一课具有重要的意义。本文以人教版教材为例,基于问题式教学,结合科学探究的思路,构建高中... 详细信息

全球气候变暖持续且深刻地影响着全人类。在这样的严峻挑战下,党的二十大对“双碳”的认识提高到了新的高度。因此,“全球气候变化与国家安全”一课具有重要的意义。本文以人教版教材为例,基于问题式教学,结合科学探究的思路,构建高中地理问题式教学实施路径,在此基础上渗透“双碳”思政教育。

关键词：问题式教学科学探究全球气候变化国家安全

基于多粒度通讯的Dijkstra并行算法优化

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中国矿业大学学报 2014年第5期43卷 938-943页

作者：孙文彬谭正龙王江赵帅阳中国矿业大学(北京)地球科学与测绘工程学院北京100083

串行算法的并行化是提高算法效率的一种有效途径,在分析最短路径算法特点的基础上,采用带重叠区的网络分割策略,提出了基于双向搜索的并行Dijkstra最短路径搜索算法.采用多粒度通讯方式进行进程间消息传递,能降低算法的通讯时间,并应用... 详细信息

串行算法的并行化是提高算法效率的一种有效途径,在分析最短路径算法特点的基础上,采用带重叠区的网络分割策略,提出了基于双向搜索的并行Dijkstra最短路径搜索算法.采用多粒度通讯方式进行进程间消息传递,能降低算法的通讯时间,并应用离散数学与理论计算研究中心(DIMAS)提供的美国路网数据进行试验.结果表明:采用带重叠区的数据分割策略适用于并行最短路径算法的求解;应用大粒度的多点接口(MPI)通讯方式能减少并行算法进程间的通讯时间;当通讯粒度为50时,MPI通讯所需时间是单粒度通讯模式的1/10左右.

关键词：最短路径算法 MPI通讯带重叠区的网路分割

牛的三种泰勒虫MPSP基因的克隆表达及牛泰勒虫病通用ELISA方法的建立

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牛的三种泰勒虫MPSP基因的克隆表达及牛泰勒虫病通用ELISA方法的...

作者：赵帅阳中国农业科学院

学位级别：硕士

牛泰勒虫病是由泰勒虫属的原虫寄生于牛的网状内皮细胞和红细胞内所引起的蜱传性血液原虫病,以发热、贫血、黄疸及体表淋巴结肿大为典型特征,呈全球性分布,其中小泰勒虫和环形泰勒虫是致病性最强的两种病原。在我国,已报道的有环形泰勒... 详细信息

牛泰勒虫病是由泰勒虫属的原虫寄生于牛的网状内皮细胞和红细胞内所引起的蜱传性血液原虫病,以发热、贫血、黄疸及体表淋巴结肿大为典型特征,呈全球性分布,其中小泰勒虫和环形泰勒虫是致病性最强的两种病原。在我国,已报道的有环形泰勒虫、瑟氏泰勒虫和中华泰勒虫三种病原。环形泰勒虫的媒介蜱为残缘璃眼蜱、小亚璃眼蜱和盾糙璃眼蜱,瑟氏泰勒虫的媒介蜱主要是长角血蜱,中华泰勒虫的媒介蜱为青海血蜱。本研究以主要梨浆虫表面膜蛋白（Major Piroplasm Surface Protein, MPSP）为研究对象,以原核表达系统对环形泰勒虫、瑟氏泰勒虫和中华泰勒的MPSP分别进行表达,对其重组蛋白的反应原性和特异性进行分析,并通过优化表达条件提高重组蛋白的表达量,最后选择中华泰勒虫MPSP重组蛋白为抗原建立了牛泰勒虫病的通用ELISA诊断方法,并对我国部分地区1936份血清进行流行病学调查。研究内容如下： 1.下载Gene Bank中已有的泰勒虫MPSP基因序列,对其抗原表位进行生物信息学分析发现,三种病原抗原表位分布非常相似,很难通过截断表达实现特异性诊断的目标;根据已报道的序列,分别设计针对环形泰勒虫、瑟氏泰勒虫和中华泰勒虫的特异性引物,以其各自的基因组DNA为模版,扩增3种泰勒虫的MPSP基因,经测序验证后,用原核表达系统进行表达,实验发现,这3种泰勒虫的重组蛋白均能与其他两种牛泰勒虫阳性血清反应,但与牛和羊的巴贝斯虫以及羊无形体阳性血清没有交叉反应,说明该蛋白表现为泰勒虫属特异性 2.以纯化的中华泰勒虫MPSP重组蛋白为抗原建立了牛泰勒虫间接ELISA方法,对其反应条件进行了优化,敏感性和特异性分别达到100%和95.7%,对来自新疆、辽宁和吉林共242份野外样品进行评估,其阳性率分别为23.1%（25/108）、56.1%（46/82）和67.3%（35/52）。 3.以所建立的间接ELISA方法对我国陕西、青海、新疆、西藏、甘肃、河北、河南、辽宁、吉林和内蒙古10个省份的1936血清进行了检测,抗体阳性率在23.1%-67.3%之间,并结合媒介蜱的自然地理分布情况,对这些地区牛泰勒虫病的流行情况进行了讨论。

关键词：牛泰勒虫 MPSP Western-blot ELISA 血清学调查

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PC集群环境下的并行地理网络车辆路径算法

测绘学报 2014年第7期43卷 753-760页

作者：闫志远孙文彬陈宗娟赵帅阳中国矿业大学(北京)地球科学与测绘工程学院北京100083

针对PC集群计算节点内存小、进程间通信速度慢的问题,设计了分布式的数据存储机制;提出了用同步变换规则代替解编码传输的进程间通信方式;基于邻域分解策略实现了禁忌搜索过程的并行化,发展了一种适用于PC集群环境的并行地理网络VRP算... 详细信息

针对PC集群计算节点内存小、进程间通信速度慢的问题,设计了分布式的数据存储机制;提出了用同步变换规则代替解编码传输的进程间通信方式;基于邻域分解策略实现了禁忌搜索过程的并行化,发展了一种适用于PC集群环境的并行地理网络VRP算法。应用模拟路网数据进行了相关试验,结果表明,本文算法的计算结果与ArcGIS基本一致,二者平均偏差率在2.11%~2.87%之间;分布式数据存储策略有效地降低了各进程对内存的需求量,保证了算法的稳健性和扩展性;通过算法的并行化提高了VRP算法的求解效率;该算法具有良好的加速性能,8进程时在各测试数据集中的加速比均在4.46~6.32之间。

关键词：地理网络分析车辆路径问题禁忌搜索并行算法

肺表面活性物质联合布地奈德对新生儿急性呼吸窘迫综合征氧合及临床结局的影响

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解放军医学杂志 2024年第3期49卷 259-264页

作者：刘忆阳章容赵帅康兰雷小平董文斌西南医科大学附属医院新生儿科/四川省出生缺陷临床研究中心四川泸州646000

目的探讨肺表面活性物质(PS)联合布地奈德对新生儿急性呼吸窘迫综合征(ARDS)氧合和临床结局的改善作用。方法本研究为一项历史对照试验。纳入西南医科大学附属医院新生儿科收治的生后3d内转入科室,且需要有创呼吸机辅助通气和PS替代治疗... 详细信息

目的探讨肺表面活性物质(PS)联合布地奈德对新生儿急性呼吸窘迫综合征(ARDS)氧合和临床结局的改善作用。方法本研究为一项历史对照试验。纳入西南医科大学附属医院新生儿科收治的生后3d内转入科室,且需要有创呼吸机辅助通气和PS替代治疗的ARDS患儿,将2022年1-11月采用0.25mg/kg布地奈德联合200mg/kgPS混合后气管内滴注,并雾化布地奈德(0.25mg/kg,2次/d)至撤机的患儿作为干预组(PS+布地奈德组,n=35),与仅接受200mg/kgPS气管内滴注的历史队列(2020年1月-2021年12月,PS组,n=35)进行比较。记录两组患儿的性别、分娩方式、1min及5minApgar评分、出生体重、胎龄、发病时间、发病原因等基线资料;比较两组患儿的氧合功能和临床结局,包括:(1)动脉血气分析指标,如治疗前和治疗6、12、24h后动脉血氧分压(PaO2)和氧合指数(OI);(2)临床观察评价指标,如撤机时间、总用氧时间、住院时间、治疗72h后肺部影像学改善情况、是否反复使用PS;(3)实验室检测指标,如治疗前和治疗3、7d后外周血白细胞计数(WBC)、中性粒细胞计数(NEU)、降钙素原(PCT);(4)并发症[如颅内出血、消化道出血、新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)、高血糖]发生情况、体重增长情况及病死率。结果两组患儿的基线资料比较差异无统计学意义(P>0.05)。与治疗前比较,两组患儿治疗6、12、24h后PaO2逐渐升高,且PS+布地奈德组明显高于PS组,差异均有统计学意义(P0.05)。治疗3、7d后PS+布地奈德组外周血NEU明显高于PS组,差异有统计学意义(P0.05)。结论PS联合布地奈德能更好地改善ARDS新生儿的氧合,促进肺部炎症吸收,缩短撤机时间、总用氧时间及住院时间,且无布地奈德使用相关的短期并发症。

关键词：肺表面活性物质布地奈德急性呼吸窘迫综合征新生儿