FFPE中肽段样本制备的比较研究

作     者：徐耀瑜 司伟杰 马军岩 吴汉夔 

作者单位：安阳师范学院国际化学与药物科学研究室河南安阳 

会议名称：《中国生物化学与分子生物学会2020全国学术在线会议》

会议日期：2020年

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 

关 键 词：FFPE 新鲜组织 肽段制备 磷酸化肽段 质谱分析 

摘      要：经福尔马林固定的石蜡包埋组织(Formalin-fixed and paraffin-embedding,FFPE)是临床组织保存的主要形式,是肿瘤研究的重要对象。随着近十年来蛋白质组学技术和质谱检测的快速发展,正在开展基于大规模FFPE样本的研究工作。本研究中以FFPE样本和新鲜样本为比较对象,通过循环的高压高温操作,提取组织内蛋白质样本,制备后续的质谱肽段,进行质谱分析。从FFPE样本和新鲜组织样本中,提取得到的肽段情况分析后,新鲜组织的5个样本共提取肽段数目10032,包含1532个磷酸化肽段,对应3534个蛋白质;FFPE组织的5例样本共分析到8598个肽段,其中1092个磷酸化肽段,找到3299个蛋白质。经过比较,来源相同组织样本但不同保存状态下,蛋白质被识别情况相似程度为87.32%。两种样本保存状态下的蛋白质数量、肽段数量及磷酸化肽段数量均无显著性差异。FFPE样本可以较好的追溯和分析肿瘤成因,结合临床信息优化现有诊断和治疗。