SICU胸部创伤患者革兰氏阴性菌的耐药性及同源性分析

作     者：吕浩北 

作者单位：承德医学院 

学位级别：硕士

导师姓名：刘建伟

授予年度：2022年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100210[医学-外科学(含：普外、骨外、泌尿外、胸心外、神外、整形、烧伤、野战外)] 1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

主      题：SICU 胸部创伤 革兰氏阴性菌 耐药性 同源性分析 

摘      要：目的:分析我院SICU胸部创伤患者分离的革兰氏阴性病原菌的耐药性及同源性,旨在对我院SICU胸部创伤患者合理应用抗菌药物及深入开展院感防控提供科学有效的指导。方法:收集2020年1月-2021年12月入住我院SICU48小时的住院患者临床分离的病原菌332株（已剔除同一患者同种临床标本分离的同种病原菌菌株）,其中胸部创伤患者162株,其他住院患者170株。采用MALDI-TOF MS技术对所有收集到的病原菌进行菌种鉴定,并采用MALDI-TOF MS技术分别检测69株肺炎克雷伯菌的同源性、80株铜绿假单胞菌的同源性以及50株鲍曼不动杆菌的同源性,将输出的质谱结果用SARAMIS数据库软件进行聚类分析,得到菌株同源性关系树状图和菌株间的同源性相似度,然后对菌株间的同源性结果进行分析。采用VITEK 2Compact药敏分析系统对我院SICU胸部创伤患者感染的肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌以及鲍曼不动杆菌进行药敏试验,将得到的药敏结果导入WHONET5.6药敏数据统计分析软件,分别对我院SICU胸部创伤患者感染的肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌以及鲍曼不动杆菌的耐药率进行统计分析。采用mCIM试验对CRPA菌株逐一进行检测,判断其是否为产碳青霉烯酶菌株,采用mCIM联合e CIM试验对CRKP菌株逐一进行检测,对其产何种类型的碳青霉烯酶做出鉴别。最后,将得到的数据应用SPSS26.0软件进行统计分析,并采用χ2检验比较胸部创伤患者与其他住院患者CRKP、CRPA、CRAB的检出率是否存在差异,并以P0.05来表示差异有统计学意义。结果:1.病原菌分布1.1 SICU胸部创伤患者共检出病原菌162株,其中革兰氏阴性病原菌134株,革兰氏阳性病原菌26株,真菌2株。1.2 SICU胸部创伤患者感染的革兰氏阴性病原菌数量分别为39株铜绿假单胞菌,其中包含21株CRPA;34株肺炎克雷伯菌,其中包含18株CRKP;26株鲍曼不动杆菌,其中包含20株CRAB,另外还有10株大肠埃希菌、9株阴沟肠杆菌以及少量其他细菌。1.3 SICU其他住院患者感染的主要革兰氏阴性病原菌数量分别为41株铜绿假单胞菌,其中包含22株CRPA;29株肺炎克雷伯菌,其中包含14株CRKP;22株鲍曼不动杆菌,其中包含16株CRAB,另外还有9株产酸克雷伯菌,9株嗜麦芽窄食单胞菌以及少量其他细菌。1.4 SICU十次环境采样共检出革兰氏阴性病原菌8株,其中肺炎克雷伯菌6株,分别检自心电图机、监护仪、听诊器、被褥、氯己定瓶壁、鼠标;鲍曼不动杆菌2株,检自心电图机和治疗车。2.病原菌耐药性情况2.1肺炎克雷伯菌的耐药情况2020-2021年我院SICU胸部创伤患者感染的肺炎克雷伯菌常用的抗菌药物中耐药率较低的有替加环素（4.0%）、阿米卡星（14.1%）、庆大霉素（23.2%）、复方新诺明（28.1%）。2.2铜绿假单胞菌的耐药情况2020-2021年我院SICU胸部创伤患者感染的铜绿假单胞菌常用的抗菌药物中耐药率较低的有阿米卡星（2.6%）、哌拉西林-他唑巴坦（7.4%）、头孢吡肟（8.3%）、环丙沙星（8.3%）、左氧氟沙星（16.7%）、头孢哌酮-舒巴坦（18.2%）、头孢他啶（19.4%）。2.3鲍曼不动杆菌的耐药情况2020-2021年我院SICU胸部创伤患者感染的鲍曼不动杆菌常用的抗菌药物中耐药率较低的仅有替加环素（8.9%）和米诺环素（10.1%）。3.病原菌耐药表型3.1 CRKP的耐药表型mCIM实验阳性率为88.8%,e CIM实验显示,CRKP菌株中产金属β-内酰胺酶的有13株,产丝氨酸型碳青霉烯酶的有3株,不产碳青霉烯酶的只有2株。3.2 CRPA的耐药表型mCIM实验阳性率为42.9%,因铜绿假单胞菌不属于肠杆菌科,所以无法进行e CIM实验。4.同源性分析根据生物梅里埃公司VITEK MS质谱仪建库标准,质谱相似度需达到70%以上,因此本实验以聚类分析结果中纵坐标0.7为差异水平。4.1肺炎克雷伯菌的同源性分析VITEK MS鉴定结果显示本研究留存的69株菌株均为肺炎克雷伯菌,然后使用SARAMIS质谱分析软件对VITEK MS导出的质谱结果进行聚类分析,得到显示69株肺炎克雷伯菌菌株间同源性关系的树状图,图示同源性相似度在75%以上的共有58株,其中相似度在75%-80%之间的有14株;相似度在80%-85%之间的有23株;相似度在85%-90%之间的有19株,相似度在90%以上有2株。根据本研究参照的标准,同源性相似度在85%以上的菌株可以被认为具有高度同源性,在本研究中,肺炎克雷伯菌同源性相似度在85%以上共有21株（30.4%）。4.2铜绿假单胞菌的同源性分析VITEK MS鉴定结果显示本研究留存的80株菌株均为铜绿假单胞菌,然后使用SAR