天祝白牦牛OXGR1基因多态性与体尺性状的关联性分析

作     者：王琪 张全伟 张勇 马友记 赵兴绪 WANG Qi ZHANG Quanwei ZHANG Yong MA Youji ZHAO Xingxu

作者机构：甘肃农业大学动物医学院兰州730070 甘肃农业大学生命科学技术学院兰州730070 甘肃农业大学动物科技学院兰州730070 

出 版 物：《兽类学报》 (Acta Theriologica Sinica)

年 卷 期：2017年第37卷第4期

页      面：379-388页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金："十二五"农村领域国家科技计划课题"牦牛抗逆性状功能基因组学研究"(2013AA102505-3) 

主　　题：牦牛 OXGR1基因 多态性 HRM 体尺性状 

摘      要：为了研究牦牛α-酮戊二酸(盐)受体1(Oxoglutarate receptor 1,OXGR1)基因多态性与其体尺性状的相关性,本文以4-8岁天祝雄性(阉)白牦牛的血液DNA(n=192)为实验材料并构建DNA混合池。通过DNA直接测序法检测OXGR1的核苷酸序列潜在的多态位点;利用高分辨率熔解曲线分析技术(High Resolution Melting,HRM)进行分型。采用SHESIS软件对OXGR1基因多态位点进行连锁不平衡分析;运用PIC-Calc 0.6软件分析多态信息含量;采用卡方检验检测Hardy-Weinberg平衡;运用SPSS20.0软件对多态位点与体尺性状进行关联分析;运用RNAFOLD、ExPASy和Swiss-model软件对OXGR1基因突变前后的蛋白结构进行预测分析。结果表明:天祝白牦牛OXGR1基因有两个多态位点,分别为347(A/G)和678(G/A),每个位点均有3种基因型(AA、AG和GG),其优势基因型分别为GG和AA。两个SNPs均达到Hardy-Weinberg平衡(P0.05),存在强连锁不平衡(D’0.75,R^20.33),且均表现为中度多态(0.25PIC0.5)。上述位点不同基因型在体斜长、体高、胸围和管围存在显著差异(P0.05)。分子结构预测显示:347位点处突变为错义突变,其编码的氨基酸由天冬酰胺变为丝氨酸。突变后OXGR1 mRNA二级结构、蛋白质二级结构及三级结构均发生改变。上述结果表明:OXGR1基因可作为牦牛分子育种的候选分子标记,为今后牦牛遗传资源的保护、开发以及新品种的选育提供依据。