应用iTRAQ技术对滩羊裘皮差异表达蛋白的研究
Study on Differentially Expressed Proteins of Tan Sheep Skin Using iTRAQ Technology作者机构:宁夏大学农学院银川750021 宁夏农林科学院银川750002 内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031 吉林省农业科学院动物营养所公主岭136100
出 版 物:《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)
年 卷 期:2017年第44卷第9期
页 面:2682-2691页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖]
基 金:宁夏农业育种专项"滩羊品系选育"项目(2013NYYZ0402)
摘 要:为了研究与滩羊羊毛纤维粗细及弯曲度和特定花穗构成相关的差异蛋白,试验应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白质组学方法,联合多维液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术对滩羊、内蒙古苏尼特羊、中卫山羊和新吉细毛羊的羊皮肤蛋白进行鉴定和筛选,并应用Proteome Discoverer 1.4软件进行定量分析,结合数据库搜索,鉴定出差异蛋白;最后应用生物信息学技术对差异蛋白进行GO分析和Pathway分析。4种羊皮肤中共鉴定到1 161个蛋白,其中内蒙古苏尼特羊与滩羊比对发现30个差异蛋白,中卫山羊与滩羊比对发现112个差异蛋白,新吉细毛羊与滩羊比对发现107个差异蛋白,对各比对组的皮肤差异蛋白进行分析,发现14-3-3蛋白σ亚型、KRT25、KRT34、KRT85、TCHH、KAP6和KAP11.1可能与滩羊羊毛纤维粗细及弯曲度和特定花穗形状的形成有关。本研究可为滩羊优质二毛裘皮选育研究提供科学依据。