刺五加内生青霉鲨烯合酶基因的克隆与序列分析
Cloning and sequence analyzing of squalene synthase gene from Eleutherococcus senticosus endogenetic Penicillium minioluteum P116-1a作者机构:河北联合大学生命科学学院河北唐山063000
出 版 物:《微生物学通报》 (Microbiology China)
年 卷 期:2012年第39卷第8期
页 面:1136-1144页
核心收录:
学科分类:1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 10[医学]
基 金:河北省自然科学基金项目(No.C2009001252) 河北省自然科学基金-石药集团医药联合研究基金项目(No.H2012401006)
主 题:Penicillium minioluteum P116-1a 鲨烯合酶 克隆 5’RACE技术
摘 要:【目的】克隆刺五加内生青霉Penicillium minioluteum P116-1a的鲨烯合酶(Squalene synthase,SS)基因。【方法】采用cDNA 5末端快速扩增(Rapid Amplification ofcDNA 5 Ends,5 RACE)技术扩增*** P116-1a SS基因的全长cDNA序列和DNA序列;运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构与功能;并通过RT-PCR法和SDS-PAGE法检测SS的表达情况。【结果】*** P116-1a的SS基因含有4个外显子和3个内含子,开放阅读框长1 416 bp,编码471个氨基酸,预测蛋白含67.73%的α螺旋,5.31%的延伸链,2.97%的β折叠,23.99%的无规则卷曲,含有鲨烯合酶和八氢番茄红素合成酶的特异性识别区域,定位于内质网膜。与***和Talaromyces stipitatus中SS蛋白的氨基酸同源性达90%以上。不同温度下SS的表达情况不同。【结论】首次在刺五加内生青霉*** P116-1a中克隆到SS基因,为进一步研究*** P116-1a提高刺五加皂苷含量的机制奠定基础。