广西扇棘单睾吸虫5.8S rRNA序列及二级结构的研究

作     者：杨益超 黎学铭 赵同领 李树林 许洪波 吴钦华 商少明 谢祖英 区方奇 黄铿凌 麦富珍 

作者机构：广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530021 广西医科大学南宁530021 

出 版 物：《应用预防医学》 (Applied Preventive Medicine)

年 卷 期：2007年第13卷第4期

页      面：193-196页

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：广西科学研究与技术开发计划项目(桂科攻0719006-1) 

主　　题：扇棘单睾吸虫 5.8S rRNA 二级结构 

摘      要：目的比较分析广西人体扇棘单睾吸虫、扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫5.8SrRNA序列及二级结构,探讨他们的进化关系。方法提取广西扇棘单睾吸虫DNA,PCR扩增并测定5.8SrDNA序列;登录GenBank获取扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫5.8SrDNA序列。应用相关软件将5.8SrDNA基因转换成5.8SrRNA。采用Zuker算法,构建5.8SrRNA分子二级结构;计算3种吸虫间的遗传距离和同源性,分析5.8SrRNA序列及其二级结构特征。结果广西人体扇棘单睾吸虫与扇棘单睾吸虫5.8SrRNA分子序列比较显示第81、83、84、129和143位共5个碱基发生变异,这些突变碱基均位于5.8SrRNA分子二级结构未配对碱基区,未引起5.8SrRNA二级结构的明显变化;与钩棘单睾吸虫比较,显示第13、27、49、66、99、152、157位共7个碱基发生变异,其中3个碱基发生在配对区,4个替代发生在未配对区,碱基变异引起两种吸虫5.8SrRNA二级结构的明显不同;广西扇棘单睾吸虫与扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫的遗传距离分别为0.031和0.044,同源性分别为96.9%和95.6%。结论广西人体扇棘单睾吸虫5.8SrRNA序列与扇棘单睾吸虫高度同源,二级结构无明显不同,与钩棘单睾吸虫同源性较低,二级结构明显不同。