一株新型鹅星状病毒HNxy2111株全基因组测序分析
作者机构:信阳农林学院动物科技学院 河南丰源和普农牧股份有限公司 河南牧业经济学院
出 版 物:《中国家禽》 (China Poultry)
年 卷 期:2024年
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:2023年度河南省重点研发与推广专项(科技攻关)资助项目(232102111043) 信阳农林学院青年教师基金项目(QN2021010) 信阳农林学院家禽重大疫病防控科技创新团队资助项目(2022CXTD06)
摘 要:为分析信阳地区鹅星状病毒(GAstV)的遗传变异情况,研究从信阳某鹅场痛风病鹅采集病料,进行病原分离鉴定和全基因组扩增测序,获得GAstV基因组,随后进行遗传进化和同源性分析。结果显示:分离一株GAstV,命名为HNxy2111,基因组全长7 175 bp;HNxy2111基因组及ORF2基因均与参考毒株G519亲缘关系最近,处于同一分支,属于GAstV-Ⅱ型;HNxy2111基因组、ORF1a、ORF1b编码氨基酸序列与GAstV-Ⅱ型中的G519同源性最高,均为99.2%。ORF1b编码的氨基酸序列与GD AHAU2同源性最高,为100%。与G519相比,HNxy2111 ORF1a、ORF1b和ORF2编码的蛋白质分别发生了8处、3处和5处突变。综上所述,HNxy2111属于GAstV-Ⅱ型,与国内经典鹅星状病毒有较近的遗传关系,ORF1a、ORF1b和ORF2编码的蛋白有一定的突变。