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同源性骨肉瘤新细胞系Zos和Zos-M的生物学比较研究

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中华骨科杂志 2011年第1期31卷 71-78页

作者：王晋邹昌业沈靖南黄纲尹军强张萌中山大学附属第一医院骨肿瘤科广州510080

目的对来源于同一患者原发灶和跳跃转移灶的两株新建骨肉瘤细胞系-Zos和Zos-M的特性和生物学行为进行鉴定和比较研究.方法用组织培养块法从1例骨肉瘤患者原发灶和跳跃转移灶骨肉瘤组织,分离并分别建立两株新的骨肉瘤细胞系-Zos和Zos-M... 详细信息

目的对来源于同一患者原发灶和跳跃转移灶的两株新建骨肉瘤细胞系-Zos和Zos-M的特性和生物学行为进行鉴定和比较研究.方法用组织培养块法从1例骨肉瘤患者原发灶和跳跃转移灶骨肉瘤组织,分离并分别建立两株新的骨肉瘤细胞系-Zos和Zos-M;利用形态学观察、核型和细胞周期分析、生长曲线和倍增时间检测、成骨性标志检测和基质胶侵袭试验对两株细胞系进行体外鉴定.通过皮下、原位移植和实验性转移检测细胞系的体内成瘤和转移能力.应用MTT法检测Zos和Zos-M对传统化疗药物的敏感性;RT-PCR方法检测并比较二者转移相关基因的表达.结果 Zos和Zos-M体外连续培养100代后仍保持稳定,形态学检测、RT-PCR检测碱性磷酸酶、骨钙蛋白和骨桥蛋白等成骨系标志提示均符合骨肉瘤特征.Zos和Zos-M倍增时间分别为33.65 h和31.58 h.核型分析表现为非整倍体和多种染色体结构异常.Zos、Zos-M皮下和原位成瘤率均为100%,Zos-M实验性转移率为37.5%（3/8）,Zos无实验性转移（0/8）.转移相关基因表达检测表明cadherin-11在Zos-M的低表达可能与其高转移能力相关.并且Zos和Zos-M与传统骨肉瘤细胞系相比,对常用化疗药物的敏感性差.结论人骨肉瘤细胞系Zos和Zos-M及相关动物模型的建立为治疗骨肉瘤的药物筛选提供新的模型,其具有相同的遗传背景和不同的侵袭转移能力,为骨肉瘤转移的研究提供良好的模型.

关键词：骨肉瘤细胞系生物学行为 RT-PCR方法同源性相关动物模型形态学检测相关基因表达检测染色体结构异常

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同源性检测矩阵法的建立及应用

计算机应用研究 2012年第2期29卷 542-545,560页

作者：吴艳朱平江南大学理学院江苏无锡214122

矩阵理论是一门在各个领域运用广泛的学科,将其运用于同源性的检测。首先从氨基酸的同义密码子角度定义了一个反映两序列间同源性的公式,然后建立矩阵并在矩阵上定义运算来检测S的任一非空子集与T的任一非空子集的同源性,命名这种方法... 详细信息

矩阵理论是一门在各个领域运用广泛的学科,将其运用于同源性的检测。首先从氨基酸的同义密码子角度定义了一个反映两序列间同源性的公式,然后建立矩阵并在矩阵上定义运算来检测S的任一非空子集与T的任一非空子集的同源性,命名这种方法为矩阵法,在此基础上进行逐步搜索。通过选取GenBank中的具体序列进行数值实验,与MEGA软件的分析结果对比,证明了矩阵法在逐步搜索过程中的科学性和合理性。

关键词：同源性子集合矩阵法 MEGA软件

PFGE和质粒图谱分析人和猪来源德尔卑沙门菌多重耐药株的同源性

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中国抗生素杂志 2014年第10期39卷 758-763页

作者：郭仲辉陈冬雅黎毓光林晓晖严智敏广州市番禺区中心医院广州511400

目的分析人和猪来源的德尔卑沙门菌的分子同源性，为研究多重耐药性在人畜之间传播提供分子生物学技术依据。方法药敏试验检测人和猪来源的德尔卑沙门菌多重耐药株对10种抗菌药物的敏感性；用脉冲凝胶电泳方法（PFGE）检测菌株间的分子... 详细信息

目的分析人和猪来源的德尔卑沙门菌的分子同源性，为研究多重耐药性在人畜之间传播提供分子生物学技术依据。方法药敏试验检测人和猪来源的德尔卑沙门菌多重耐药株对10种抗菌药物的敏感性；用脉冲凝胶电泳方法（PFGE）检测菌株间的分子同源性；结合实验或电转移试验获得目标质粒，质粒酶切图谱检测质粒的同源性。PCR分析染色体介导喹诺酮耐药基NgyrA~@arC，质粒可介导的喹诺酮耐药基因qnrA／qnrB／qnrC／qnrS、aac（6）-I b—cr、qepA和oqxAB。结果共收集48株德尔卑沙门菌，经药敏试验筛选获得11株多重耐药株（MDR），人源性8株，猪源性3株。11株菌除对氨苄青霉素、氯霉素、链霉素、磺胺和四环素（R型：ACSSuT）耐药外，所有菌株也对萘啶酸和环丙沙星耐药，6株对左氧氟沙星耐药，5株对头孢曲松耐药。PFGE分析，11株菌共分为6个克隆，3株动物源性菌株与8株人源性菌株无克隆相关性。喹诺酮耐药基因分析显示，有5株和3株动物源株检NNgyrA的Ser83Leu或／和Asp87Asn突变，6株人源株和3株动物源株检测到parC的Ser80Ile或／和Thr57Ser突变。质粒电泳分析显示，所有菌株都存在1．4条质粒条带，大小介于2～180kb，其中3株人源性菌株和l株动物源性株都存在4kb左右大小的质粒；2株动物源性菌株仅存在20kb大小质粒。用结合实验和电转移方法，分析4kb质粒结构，证实4个质粒的酶切图谱完全一致，质粒中均存在介导外排基NoqxAB~l喹诺酮耐药基因aac（6’）-Ib-cr。结论人和猪来源的德尔卑沙门菌多重耐药株中质粒介导的外排因oqxAB和诺酮耐药基因Naac（6）-Ib-c是喹诺酮重要的耐药机制，可能在沙门菌间传递，导致对喹诺酮类高耐药性。通过人和猪的接触或间接途径，沙门菌有传播喹诺酮耐药性的风险，同一种质粒可在人和动物中转移而传播该耐药机制。

关键词：德尔卑沙门菌脉冲凝胶电泳质粒同源性喹诺酮药物

球形芽孢杆菌C3-41菌株杀蚊毒素的提取及其同源性研究

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微生物学报 1993年第5期33卷 354-360页

作者：周志宏张用梅刘娥英中国科学院武汉病毒研究所

从球形芽孢杆菌 C_3-41菌株芽孢-晶体复合物中分别提取孢壁蛋白(S 蛋白)和孢晶毒素。采用 SDS-PAGE 证明孢晶毒素具有43和40kD 两种多肽,但 S 蛋白只有一条104kD 的蛋白带。后者经 NaOH 处理迅速降解成43和40kD 的多肽。S 蛋白和用 Seph... 详细信息

从球形芽孢杆菌 C_3-41菌株芽孢-晶体复合物中分别提取孢壁蛋白(S 蛋白)和孢晶毒素。采用 SDS-PAGE 证明孢晶毒素具有43和40kD 两种多肽,但 S 蛋白只有一条104kD 的蛋白带。后者经 NaOH 处理迅速降解成43和40kD 的多肽。S 蛋白和用 Sephadex G-75提纯的孢晶毒素对三龄致倦库蚊幼虫的 LC_(50)值(48h)分别为267和10ng/ml。免疫双扩散试验证明2362、1593、Bs-10(H_(5a5b))和2297(H_(25))菌株的孢晶毒素能与 C_3-41菌株的孢晶毒素抗血清发生交叉反应,但K(H_1)、SSII-1、1404(H_2)和2315(H_(26))菌株的孢晶毒素与此抗血清不发生交叉反应。同时还证明 C_3-41菌株的 S 蛋白和孢晶毒素具有抗原同源性。

关键词：球形芽孢杆菌毒素同源性

新疆地区鲍曼不动杆菌多重耐药菌株同源性分析

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中国感染与化疗杂志 2019年第2期19卷 160-165页

作者：李娟姚新宝郭淑丽杨丽玮罗斌王昌敏马慧霞西丽娜依.买买提新疆维吾尔自治区人民医院临床检验中心乌鲁木齐830001 新疆维吾尔自治区人民医院感染管理科乌鲁木齐830001

目的了解全疆各地(州)医院多重耐药鲍曼不动杆菌克隆株分布情况,为全疆各级医院院感管理监控部门进行监控、切断流行株的来源及传播途径,防止交叉感染,提供重要的实验室依据。方法收集新疆9地(州)医院ICU多重耐药鲍曼不动杆菌72株,经VIT... 详细信息

目的了解全疆各地(州)医院多重耐药鲍曼不动杆菌克隆株分布情况,为全疆各级医院院感管理监控部门进行监控、切断流行株的来源及传播途径,防止交叉感染,提供重要的实验室依据。方法收集新疆9地(州)医院ICU多重耐药鲍曼不动杆菌72株,经VITEK 2-Compact微生物分析系统初步鉴定为鲍曼不动杆菌复合群,再参照全国临床检验操作规程鉴定确定菌株,药敏试验采用VITEK-GNS药敏卡及纸片扩散法。分型方法采用DiversiLab系统,使用Agilent 2100操作软件,生成分析报告。结果 72株碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌均为多重耐药菌;该菌对多黏菌素B(1.3%)、替加环素(1.7%)耐药率较低。3型基因型为乌鲁木齐独有;4型主要分布于昌吉、和田地区,呈现特有的显著条带;2型出现在乌鲁木齐、和田地区;1型全疆流行株,各地区均有分布,相似性系数达99%。结论多重耐药鲍曼不动杆菌检出菌株在全疆不同地区、医院、病房或同一地区、医院、病房中发生克隆株扩散传播、散在传播及交叉感染。

关键词：鲍曼不动杆菌多重耐药同源性克隆株传播

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基于量子神经网络的网络攻击同源性判定方法

成都理工大学学报（自然科学版） 2017年第4期44卷 506-512页

作者：唐彰国李焕洲张健四川师范大学网络与通信技术研究所成都610101

探讨大数据背景下网络攻击同源性的分析方法,为攻击场景还原、攻击定性及攻击者溯源提供依据。提出了一种基于证据链的攻击描述方法,并归纳出各环节代表特异性的关键指纹,进一步构建了相应的网络攻击同源性判定模型,使用编辑距离计算攻... 详细信息

探讨大数据背景下网络攻击同源性的分析方法,为攻击场景还原、攻击定性及攻击者溯源提供依据。提出了一种基于证据链的攻击描述方法,并归纳出各环节代表特异性的关键指纹,进一步构建了相应的网络攻击同源性判定模型,使用编辑距离计算攻击链单一环节之间的特征相似度,通过量子神经网络方法对多个攻击环节的相似性进行算法综合,进而实现网络攻击的同源判定。测试结果表明,该方法能够有效地对网络攻击进行同源性判定,相比基于样本的方法更加准确、可靠。该工作为大数据下提高网络攻击溯源能力及自动化水平探索了一条有效途径。

关键词：网络攻击量子神经网络同源性编辑距离

内科、外科、重症监护病房患者鲍氏不动杆菌耐药性分析和同源性研究

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中国抗生素杂志 2003年第7期28卷 407-411页

作者：马越苗佳王霞李景云胡昌勤金少鸿中国药品生物制品检定所国家细菌耐药性监测中心北京100050 四川大学华西医院临床药理研究所成都610041

目的　调查鲍氏不动杆菌临床分离株的耐药性 ,并通过对鲍氏不动杆菌耐药表型的聚类分析 ,探讨临床分离株的同源性。方法　鲍氏不动杆菌药物敏感性分析采用纸片扩散法 (K B法 ) ,用WHONET5软件分析结果 ;聚类分析使用SPSS10 0统计学分... 详细信息

目的　调查鲍氏不动杆菌临床分离株的耐药性 ,并通过对鲍氏不动杆菌耐药表型的聚类分析 ,探讨临床分离株的同源性。方法　鲍氏不动杆菌药物敏感性分析采用纸片扩散法 (K B法 ) ,用WHONET5软件分析结果 ;聚类分析使用SPSS10 0统计学分析软件进行 ;耐药率的显著性检验用 χ2 检验。结果　四川大学华西医院 82株鲍氏不动杆菌临床分离株的主要标本来源为痰 ,占 91 5 % ;从内科、外科和重症监护病房患者分离的菌株分别为 3 7株、15株和 2 4株 ,分别占 45 1%、18 3 %和 2 9 3 %。 82株鲍氏不动杆菌对亚胺培南、环丙沙星、头孢他啶和阿米卡星的耐药率分别为 12 5 %、3 7 8%、40 7%和 42 0 %。重症监护病房和外科分离的菌株对头孢噻肟、阿米卡星、庆大霉素、氨曲南和磺胺甲口恶唑 /甲氧苄啶的耐药率明显高于从内科分离的菌株(P 同源菌株 ,其中多数为多重耐药株。结论　重症监护病房和外科分离的菌株对头孢噻?

关键词：鲍氏不动杆菌 K-B纸片扩散法聚类分析同源性耐药性

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人源和猪源猪链球菌的同源性研究

中华流行病学杂志 2000年第6期21卷 427-429页

作者：朱凤才杨华富胡晓抒汪华王广和宋亚军杨瑞馥江苏省疾病预防控制中心南京210009 海安县卫生防疫站军事医学科学院微生物流行病研究所

目的　进一步鉴定菌种 ;评价人源株与猪源株猪链球菌的同源性。方法　对分离自猪无菌部位、患者血液和脑脊液的 7株猪链球菌Ⅱ型和标准猪链球菌Ⅱ型 ,用菌体脂肪酸分析和随机引物基因扩增技术进行菌种的表现型和基因型分类。对其结果进... 详细信息

目的　进一步鉴定菌种 ;评价人源株与猪源株猪链球菌的同源性。方法　对分离自猪无菌部位、患者血液和脑脊液的 7株猪链球菌Ⅱ型和标准猪链球菌Ⅱ型 ,用菌体脂肪酸分析和随机引物基因扩增技术进行菌种的表现型和基因型分类。对其结果进行聚类分析和主成分分析。结果　随机引物基因扩增技术分析提示 ,被检的 7株猪链球菌Ⅱ型与标准株一致 ,均为猪链球菌Ⅱ型 ;人源株与猪源株同源 ;分离自病人血液和脑脊液的菌株同源。这些结果在菌体脂肪酸分析中得到了进一步的确认。即基因型与表现型结果一致。结论　被检的

关键词：猪链球菌菌体脂肪酸基因型 RAPD 同源性

山东省间日疟原虫MSP-1和CSP等位基因型及同源性分析

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中国血吸虫病防治杂志 2017年第1期29卷 38-43,47页

作者：徐超魏庆宽孔祥礼李瑾王用斌肖婷尹昆贾凤菊孙慧黄炳成陈延平山东省医学科学院山东省寄生虫病防治研究所济宁272033

目的分析山东省间日疟原虫MSP-1和CSP基因类型及其同源性,为病例溯源提供科学依据。方法采集2011年山东省报告的12例间日疟患者血样,提取疟原虫基因组DNA;分别根据间日疟原虫MSP-1和CSP基因序列设计引物,进行巢式PCR扩增、酶切、测序、... 详细信息

目的分析山东省间日疟原虫MSP-1和CSP基因类型及其同源性,为病例溯源提供科学依据。方法采集2011年山东省报告的12例间日疟患者血样,提取疟原虫基因组DNA;分别根据间日疟原虫MSP-1和CSP基因序列设计引物,进行巢式PCR扩增、酶切、测序、序列比对及同源性分析。结果 12份间日疟患者血样MSP-1基因全部出现470bp扩增条带以及350、120 bp酶切片段,均为Sal-1型;MSP-1进化树分析显示,9份省内感染者样品序列同属一个分枝,1份印度感染者样品序列与印度分离株位于同一分枝。12份间日疟患者样品CSP基因均包含GDRA(D/A)GQPA序列,为PV-Ⅰ型,其中10份省内感染者和1份广东感染者样品CSP基因出现560~840 bp和150~230 bp两种扩增条带,为PV-Ⅰ型温带族,1份在印度感染者样品CSP基因仅出现560~840 bp条带,为PV-Ⅰ型热带族。CSP进化树表明,10份省内感染者及1份广东感染者样品序列同属一个分枝,1份在印度感染者样品序列与印度和印度尼西亚分离株位于同一分枝。结论山东省本地感染间日疟原虫MSP-1基因型均为Sal-1型,CSP基因型均为PV-Ⅰ型温带族,本地虫株具有较强的基因同源性。

关键词：间日疟原虫 MSP-1基因 CSP基因基因分型同源性山东省