基于RNA-Seq技术筛选姜曲海猪子宫和卵巢发育相关基因

作     者：朱淑斌 徐盼 周春宝 许琴瑟 吴嘉韵 ZHU Shu-bin;XU Pan;ZHOU Chun-bao;XU Qin-se;WU Jia-yun

作者机构：江苏农牧科技职业学院江苏泰州225300 姜曲海猪保种场江苏泰州225300 

出 版 物：《江苏农业学报》 (Jiangsu Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2024年第40卷第1期

页      面：130-140页

核心收录：

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：江苏农牧科技职业学院横向项目(2020321201000092) 江苏农牧科技职业学院科技服务项目(NSF2022TF02) 江苏农牧科技职业学院科技支撑项目(NSF2021TC04) 江苏省高等学校基础科学(自然科学)研究面上项目(23KJB230004) 江苏农牧科技职业学院校级科研项目(NSF2023CB01) 

主　　题：姜曲海猪 子宫 卵巢 转录组测序 

摘      要：母猪的子宫和卵巢组织发育情况直接影响母猪的繁殖性能,进而对养猪业的经济效益造成重大影响。为探究姜曲海猪子宫和卵巢发育的分子机理,本研究选取1月龄和8月龄姜曲海猪各3头,利用转录组测序技术(RNA-Seq)对子宫和卵巢组织进行测序,通过生物信息学手段筛选差异表达基因并进行基因本体(Gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto ncyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,再与猪数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)数据库比对后鉴定出重要的候选基因。结果显示,1月龄和8月龄姜曲海猪子宫组织中有1688个差异表达基因,表达上调和下调的基因各844个;卵巢组织中存在3833个差异表达基因,其中2831个表达上调,1002个表达下调。富集分析结果显示这些差异表达基因主要显著富集于动物器官发育、组织发育和细胞分化等生物学过程。本研究在子宫和卵巢组织中分别筛选出11个和31个与发育性状有关的候选基因,其中共有的候选基因有6个,分别为LHFPL1、MTUS2、LIF、RBP4、EPHB2和TESC。本研究结果为姜曲海猪子宫和卵巢发育分子层面的研究提供了参考,也为今后姜曲海猪繁殖性状的分子改良提供了新的研究方向。