支气管肺泡灌洗液宏基因组二代测序对儿童肺部感染的病原体诊断价值

作     者：廖雄宇 邱坤银 黄科 黎阳 徐宏贵 方建培 周敦华 Liao Xiongyu;Qiu Kunyin;Huang Ke;Li Yang;Xu Honggui;Fang Jianpei;Zhou Dunhua

作者机构：中山大学孙逸仙纪念医院儿童医学中心广州510120 

出 版 物：《中华妇幼临床医学杂志（电子版）》 (Chinese Journal of Obstetrics & Gynecology and Pediatrics(Electronic Edition))

年 卷 期：2022年第18卷第5期

页      面：562-568页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515011809) 逸仙科研启航项目(YXQH202205) 

主　　题：支气管肺泡灌洗液 宏基因组 高通量核苷酸序列分析 呼吸道感染 儿童 

摘      要：目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)技术,对儿童肺部感染的病原体诊断价值。方法选择2019年2月至2020年5月,于中山大学孙逸仙纪念医院诊疗的28例疑似肺部感染患儿为研究对象。根据本研究采用的肺部感染诊断标准,将患儿分为观察组(n=22,确诊为肺部感染)和对照组(n=6,非肺部感染)。采用回顾性分析方法对患儿临床病例资料进行分析。采用mNGS与传统病原体检测方法,对患儿BALF进行病原体检测。采用秩和检验与χ^(2)检验,对2组患儿临床资料进行统计学比较;采用广义相加模型(GAM),对白细胞计数、血清C反应蛋白(CRP)水平分别与患儿BALF中mNGS病原体测序读数的关系进行分析;采用受试者工作特征(ROC)曲线,评估2种方法对儿童肺部感染的病原体诊断价值。本研究通过中山大学孙逸仙纪念医院医学伦理委员会批准(审批文号:SYSKY-2022-300-01)。所有患儿接受治疗前,由监护人签署知情同意书。结果①2组患儿年龄、男性及免疫功能缺陷患儿比例、体温、白细胞计数、中性粒细胞绝对计数、血清CRP及PCT水平、BALF mNGS及传统病原体检测阳性率、BALF mNGS及传统病原体检测报告所需时间、BALF mNGS病原体测序读数比较,差异均无统计学意义(P0.05)。②28例患儿中,mNGS检测患儿BALF的病原体阳性率为89.3%(25/28),高于传统病原体检测方法的17.9%(5/28),并且差异有统计学意义(χ^(2)=28.72,P0.001)。③GAM分析显示,28例患儿的血常规白细胞计数与其BALF中mNGS病原体测序读数之间存在负线性关系(P0.05);当血清CRP水平60 mg/L时,患儿血清CRP水平随其BALF中mNGS病原体测序读数增加而增加。④BALF mNGS诊断儿童肺部感染的ROC-AUC为0.955(95%CI:0.893~1.000,P=0.180),高于传统病原体检测方法的0.508(95%CI:0.324~0.690,P=0.010),并且差异有统计学意义(Z=4.45,P0.05)。结论BALF mNGS可为儿童肺部感染提供快速、准确的病原体诊断。患儿血常规白细胞计数和血清CRP水平,可作为评估抗感染效果的指标。