基于改进Attention U-Net的胆囊自动分割模型研究
Research on gallbladder automatic segmentation model based on improved Attention U-Net作者机构:上海理工大学医疗器械与食品学院上海200093 上海交通大学医学院附属新华医院普外科上海200092 上海交通大学医学院附属仁济医院胆胰外科上海200127 上海市胆道疾病研究重点实验室上海200092 癌基因及相关基因国家重点实验室上海200127 吉林大学白求恩第一医院肝胆胰外一科长春130021 吉林大学中日联谊医院普外科长春130033
出 版 物:《北京生物医学工程》 (Beijing Biomedical Engineering)
年 卷 期:2021年第40卷第4期
页 面:346-353,376页
学科分类:0831[工学-生物医学工程(可授工学、理学、医学学位)] 081203[工学-计算机应用技术] 08[工学] 0835[工学-软件工程] 0836[工学-生物工程] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)]
基 金:国家自然科学基金(31701108、81701749) 上海市2020年度“科技创新行动计划”医学创新研究专项(XHEC-STCSM-2020-040) 上海市人工智能创新发展专项(2019-RGZN-01096)资助
摘 要:目的基于多尺度融合注意力机制,提出改进Attention U-Net的胆囊自动分割模型,提高胆囊自动分割模型的性能,以辅助医生进行临床诊断。方法首先选取2017年1月—2019年12月上海交通大学医学院附属新华医院普外科、吉林大学白求恩第一医院肝胆胰外一科和吉林大学中日联谊医院普外科收治的88例病理诊断明确的胆囊癌患者、28例慢性胆囊炎胆囊结石患者和29例健康对照,构建胆囊分割数据集,然后通过对医学常用深度学习图像分割方法U-Net和Attention U-Net进行分析,提出基于多尺度融合注意力机制改进的Attention U-Net方法,并设计实验对3种方法进行对比评估。结果提出的改进Attention U-Net方法在验证集上的交并比阈值(IoU)分数、Dice系数、检测精度(Precision)和召回率(Recall)分别为0.72、0.84、0.92、0.79,全部优于传统U-Net和Attention U-Net方法。结论本文提出了基于多尺度融合注意力机制改进的Attention U-Net模型,其性能优于U-Net和Attention U-Net,证明了本方法中改进的注意力机制可以很好地改善U-Net模型在胆囊影像上的分割结果。