检索结果-南通市图书馆

基于COⅠ与18S rRNA基因序列的4种肉食螨DNA条形码研究

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中国血吸虫病防治杂志 2021年第1期33卷 66-70,78页

作者：詹雨娟张兰香孙梦涛李心玫王严李梦珠陶东东孙恩涛皖南医学院医学卫生检验与检疫学教研室芜湖241002

目的基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)与核糖体18S小亚基(18S rRNA)基因序列,分析确定4种肉食螨合适的DNA条形码,从而进一步完善肉食螨DNA条形码数据库。方法2018年5月—2019年7月于安徽省阜阳、芜湖、铜陵等3市小型面粉作坊采集... 详细信息

目的基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)与核糖体18S小亚基(18S rRNA)基因序列,分析确定4种肉食螨合适的DNA条形码,从而进一步完善肉食螨DNA条形码数据库。方法2018年5月—2019年7月于安徽省阜阳、芜湖、铜陵等3市小型面粉作坊采集分离肉食螨样本,经形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA,经PCR扩增、克隆和测序获得COⅠ与18S rRNA基因序列,所获序列进行BLAST比对。结合已报道肉食螨序列,用Clustal X 1.83软件进行多序列比对,基于MEGA X软件进行序列分析并计算遗传距离,采用最大似然法构建系统发育树。结果马六甲肉食螨、转开肉食螨、鳞翅触足螨分子鉴定结果与形态学一致,而Gen Bank中缺少网真扇毛螨相关序列。4种肉食螨COI与18S r RNA基因序列(A+T)分别为69.6%和55.1%,碱基替换数分别为137对和46对。基于COⅠ与18S rRNA基因序列变异位点分析,发现4种肉食螨种间变异位点分别为154~321个和58~99个。4种肉食螨COⅠ与18S r RNA基因序列种内遗传距离均≤0.020,种间遗传距离分别为0.235~0.583和0.078~0.114。基于COⅠ与18S rRNA基因序列的系统发育树显示,4种肉食螨均能各自聚为一支,支持率均达100%,与形态学鉴定结果一致。结论线粒体COⅠ基因序列作为4种肉食螨DNA条形码优于18S rRNA基因序列,更适用于探索肉食螨的属、种低阶元亲缘关系。

关键词：肉食螨分子鉴定 COⅠ基因 18S rRNA基因

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范张食酪螨和腐食酪螨的形态与分子鉴定

中国媒介生物学及控制杂志 2022年

作者：范笑忱刘璐瑶方瑜褚凌渺冯蕊李飞燕潘若兮王少圣孙恩涛皖南医学院卫生检验与检疫学教研室

目的对范张食酪螨与腐食酪螨进行形态学和分子生物学鉴定。方法采集房舍和储藏物样本，从样本中挑取单个成螨，进行纯培养。从培养标本中挑取成螨制成玻片标本。根据无气门亚目螨类检索表，进行形态学鉴定。然后，提取单只螨基因组DN... 详细信息

目的对范张食酪螨与腐食酪螨进行形态学和分子生物学鉴定。方法采集房舍和储藏物样本，从样本中挑取单个成螨，进行纯培养。从培养标本中挑取成螨制成玻片标本。根据无气门亚目螨类检索表，进行形态学鉴定。然后，提取单只螨基因组DNA，通过PCR扩增、克隆和测序获得线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因（COXⅠ）序列；将所获序列在美国国家生物技术信息中心中用BLAST进行同源性比对。使用ClustalⅩ1.83软件对2种螨的COXⅠ序列进行比对，基于MEGAⅩ软件进行序列分析，并以最大似然法构建系统发育树。结果范张食酪螨足Ⅱ基节板后缘1/3处明显向内凹陷，下缘曲线近似“S”形，足Ⅰ跗节感棒ω;在远端2/3处明显增宽；而腐食酪螨足Ⅱ基节板呈三角形，下缘平直或略凹，足I跗节感棒ω;在远端1/4处增宽。所测得的范张食酪螨和腐食酪螨COXⅠ基因序列经BLAST比对显示，分别与GenBank中收录的腐食酪螨和范张食酪螨COXⅠ基因序列相似性在99.00%以上。基于COXⅠ基因构建的最大似然法系统进化树显示，范张食酪螨和腐食酪螨均独立聚为一支，且支持率均达100%。结论范张食酪螨和腐食酪螨既可以利用外部特征进行形态学鉴定，也可以基于COXⅠ基因进行分子生物学鉴定；形态和分子鉴定方法相结合，可以提高螨类近缘种鉴定的准确性。

关键词：范张食酪螨腐食酪螨形态学鉴定分子生物学鉴定线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因

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基于高通量测序的粉尘螨体内细菌多样性研究

中国血吸虫病防治杂志 2022年第6期34卷 630-634页

作者：周小倩马杰王睿怡王若航吴毅强杨欣宴陈玉娟唐小牛孙恩涛皖南医学院医学寄生虫学教研室安徽芜湖241002 皖南医学院卫生检验与检疫学教研室安徽芜湖241002 皖南医学院公共卫生学院环境卫生学与职业卫生学教研室

目的探讨粉尘螨(Dermatophagoides farinae)体内细菌多样性。方法取实验室人工饲养的粉尘螨,采用Illumina PE250高通量测序平台扩增测序细菌16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)基因V4区,获得的原始序列经质控过滤后得到有效序列... 详细信息

目的探讨粉尘螨(Dermatophagoides farinae)体内细菌多样性。方法取实验室人工饲养的粉尘螨,采用Illumina PE250高通量测序平台扩增测序细菌16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)基因V4区,获得的原始序列经质控过滤后得到有效序列。采用Usearch软件、Silva数据库、Mothur软件对有效序列进行操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)聚类并分析细菌群落组成与alpha多样性指数。结果共获得187616条有效序列,根据序列相似性>97%进行聚类,得到469个OTUs。OTU注释结果表明,粉尘螨体内细菌分属于26个门、43个纲、100个目、167个科、284个属。在门分类阶元水平,粉尘螨体内细菌主要注释到变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和酸杆菌门,其中变形菌门为优势菌门;在属分类阶元水平,罗尔斯通氏菌属、立克次体目未确定属、葡萄球菌属和鞘氨醇单胞菌属为优势菌属。在非优势菌属中,发现沃尔巴克氏体。结论粉尘螨体内细菌群落组成具有较高多样性,个体间细菌群落多样性与丰度存在差异。

关键词：粉尘螨细菌多样性 16S核糖体RNA 高通量测序

范张食酪螨和腐食酪螨的形态学与分子生物学鉴定

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中国媒介生物学及控制杂志 2022年第2期33卷 277-280页

作者：范笑忱刘璐瑶方瑜褚凌渺冯蕊李飞燕潘若兮王少圣孙恩涛皖南医学院卫生检验与检疫学教研室安徽芜湖241002

目的对范张食酪螨与腐食酪螨进行形态学和分子生物学鉴定。方法采集房舍和储藏物样本,从样本中挑取单个成螨,进行纯培养。从培养标本中挑取成螨制成玻片标本。根据无气门亚目螨类检索表,进行形态学鉴定。然后,提取单只螨基因组DNA,通过... 详细信息

目的对范张食酪螨与腐食酪螨进行形态学和分子生物学鉴定。方法采集房舍和储藏物样本,从样本中挑取单个成螨,进行纯培养。从培养标本中挑取成螨制成玻片标本。根据无气门亚目螨类检索表,进行形态学鉴定。然后,提取单只螨基因组DNA,通过PCR扩增、测序获得线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)序列;将所获序列在美国国立生物技术信息中心中用BLAST进行同源性比对。使用ClustalⅩ1.83软件对2种螨的COⅠ序列进行比对,基于MEGAⅩ软件进行序列分析,并以最大似然法构建系统发育树。结果范张食酪螨足Ⅱ基节板后缘1/3处明显向内凹陷,下缘曲线近似“S”形,足Ⅰ跗节感棒ω1在远端2/3处明显增宽;而腐食酪螨足Ⅱ基节板呈三角形,下缘平直或略凹,足Ⅰ跗节感棒ω1在远端1/4处增宽。所测得的范张食酪螨和腐食酪螨COⅠ基因序列经BLAST比对显示,分别与GenBank中收录的范张食酪螨和腐食酪螨COⅠ基因序列相似性在99.00%以上。基于COⅠ基因构建的最大似然法系统进化树显示,范张食酪螨和腐食酪螨均独立聚为一支,且支持率均达100%。结论范张食酪螨和腐食酪螨既可以利用外部特征进行形态学鉴定,也可以基于COⅠ基因进行分子生物学鉴定;形态学和分子生物学鉴定方法相结合,可以提高螨类近缘种鉴定的准确性。

关键词：范张食酪螨腐食酪螨形态学鉴定分子生物学鉴定细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因

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新型营养指数与颈动脉病变的相关性

重庆医科大学学报 2023年第2期48卷 205-209页

作者：江明菲吴欢张惠萍周玉梅付雨晗苏繁曹蕾文育锋皖南医学院临床医学院诊断学教研室芜湖241002 皖南医学院检验学院卫生检验与检疫教研室芜湖241002 马鞍山市人民医院超声科脑卒中研究中心马鞍山243000 皖南医学院公共卫生学院预防医学教研室芜湖241002

目的:探究甘油三酯(triglycerides,TG)-总胆固醇(total cholesterol,TC)-体质量(body weight,BW)指数(TG×TC×BW index,TCBI)与颈动脉病变的相关性。方法:以2016年11月至2019年10月安徽省马鞍山市某医院住院、疑似稳定性颈动脉病变、满足纳入标准的患者2 290人为研究对象。根据彩色多普勒检测结果将研究对象分为颈动脉病变组(n=1 352)和对照组(n=938)。收集所有患者的一般人口学特征、临床特征、彩色多普勒检查指标和血生化检测指标。建立回归模型分析TCBI与颈动脉病变的关系。结果:颈动脉病变组的TCBI(χ^(2)=34.018,P1 800是颈动脉病变的独立危险因素。结论:TCBI对颈动脉病变的筛查和临床诊断具有潜在应用价值。

关键词：营养指数颈动脉病变血流动力学危险因素

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变应原体外检测技术研究进展

热带病与寄生虫学 2021年第4期19卷 236-239页

作者：周小倩井刚王睿怡张文远王文静唐小牛孙恩涛皖南医学院卫生检验与检疫学教研室安徽芜湖241002 皖南医学院医学寄生虫学教研室

变应原的准确检测对过敏性疾病的预防和诊疗至关重要。体外检测是当前变应原检测的主要研究方向。本文主要对检测血清sIgE的放射变应原吸附试验、酶联免疫吸附试验、荧光酶免疫分析、纳米磁微粒化学发光法、免疫印迹法、液相芯片法,以... 详细信息

变应原的准确检测对过敏性疾病的预防和诊疗至关重要。体外检测是当前变应原检测的主要研究方向。本文主要对检测血清sIgE的放射变应原吸附试验、酶联免疫吸附试验、荧光酶免疫分析、纳米磁微粒化学发光法、免疫印迹法、液相芯片法,以及直接检测变应原的生物共振法进行了概述,并对各种体外检测技术的优缺点进行了比较,以期为临床上选择合适的变应原体外检测方法提供参考。

关键词：变应原特异性IgE 体外检测

基于线粒体COI基因5′端区段粉螨DNA条形码研究

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皖南医学院学报 2021年第1期40卷 9-12页

作者：张兰香詹雨娟李梦珠王严李心玫褚凌渺孙恩涛皖南医学院卫生检验与检疫学教研室安徽芜湖241002

目的:基于线粒体COI基因5′端区段对常见储藏物粉螨进行分子鉴定,为粉螨鉴定方法的探讨提供依据。方法:采集储藏物样本,分离粉螨,形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA、PCR扩增、克隆测序,所获序列在Blast中进行同源性比对。结合GenBank... 详细信息

目的:基于线粒体COI基因5′端区段对常见储藏物粉螨进行分子鉴定,为粉螨鉴定方法的探讨提供依据。方法:采集储藏物样本,分离粉螨,形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA、PCR扩增、克隆测序,所获序列在Blast中进行同源性比对。结合GenBank已知粉螨COI基因序列,用ClustalX 1.83软件进行多序列比对,基于MEGA X软件进行序列分析并计算遗传距离,构建Maximum Likelihood系统发育树。结果:经形态学鉴定出7种粉螨,其中腐食酪螨Tyrophagus putrescentiae、范张食酪螨T.fanetzhangorum、粉尘螨Dermatophagoides farinae、棕脊足螨Gohieria fusca和害嗜鳞螨Lepidoglyphus destructor分子鉴定与形态学鉴定相一致,拱殖嗜渣螨Chortoglyphus arcuatus和纳氏皱皮螨Suidasia nesbitti分子鉴定与形态学鉴定并非一致,共检测到261个变异位点,400个保守位点,247个简约信息位点。种内遗传距离为0.00~0.01,种间遗传距离为0.171~0.262。构建ML系统进化树显示,7种粉螨均独立聚为一支,且支持率均达100%,与形态学鉴定一致。结论:线粒体COI基因5′端区段可用于7种常见储藏物粉螨的物种鉴定,为构建DNA条形码数据库提供基础资料。

关键词：线粒体COI基因 5′端区段粉螨 DNA条形码

分子生物学检验教学中PBL教学法的应用探讨

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教育教学论坛 2019年第38期 198-200页

作者：杨邦和文育锋孙恩涛刘飞叶长江陶香林蒋平皖南医学院卫生检验与检疫教研室

作为卫生检验与检疫专业主干课程的分子生物学检验,其课程内容覆盖广、应用性强,其教学具有很强的操作性和技术性.单纯依靠传统课堂理论课讲授,容易让学生产生消极学习的态度.而"以问题为导向"的PBL教学模式,因其教育理念、教学方法和... 详细信息

作为卫生检验与检疫专业主干课程的分子生物学检验,其课程内容覆盖广、应用性强,其教学具有很强的操作性和技术性.单纯依靠传统课堂理论课讲授,容易让学生产生消极学习的态度.而"以问题为导向"的PBL教学模式,因其教育理念、教学方法和能力培养效果等方面具有优势,使其在教育教学中不断得到青睐和应用.就PBL教学模式在卫生检验与检疫专业的分子生物学检验教学应用中做一些初探,以期为提高该专业课程的教学质量提供参考.

关键词： PBL 分子生物学检验教学模式

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B(A)亚型2例的血清学及分子生物学鉴定

国际输血及血液学杂志 2023年第4期46卷 352-357页

作者：杜振军邹陆辰孙恩涛聊城市中心血站聊城252000 皖南医学院检验学院卫生检验与检疫学教研室芜湖241002

目的探讨B(A)亚型个体的血型血清学及分子生物学鉴定方法。方法选择2012年12月15日和2023年2月16日,因血型分型困难,送聊城市中心血站进行血型鉴定的2例受试者为研究对象。受试者1为女性、27岁;受试者2为男性,40岁。采用试管法对受试者... 详细信息

目的探讨B(A)亚型个体的血型血清学及分子生物学鉴定方法。方法选择2012年12月15日和2023年2月16日,因血型分型困难,送聊城市中心血站进行血型鉴定的2例受试者为研究对象。受试者1为女性、27岁;受试者2为男性,40岁。采用试管法对受试者的ABO血型进行血型血清学鉴定;采用PCR-序列特异性引物(SSP)法对受试者的ABO基因进行分型;采用Sanger测序法对受试者ABO基因的第6、7外显子进行测序。本研究遵循的程序符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求。结果①受试者1血清学表型符合AwB或B(A)亚型,受试者2血清学表型符合A2B或B(A)亚型。②受试者1的ABO基因为B(A)02和O杂合,第7外显子存在关键核苷酸杂合突变c.700C>G,其ABO基因分型为B(A).02/O.01.01。受试者2的ABO基因为B(A)04和O杂合,第7外显子存在关键核苷酸杂合突变c.640A>G,其ABO基因分型为B(A).04/O.01.01。结论仅采用血型血清学试验鉴定B(A)亚型困难,ABO基因测序可以为血清血清学试验结果提供分子生物学依据。

关键词： ABO血型系统血清学试验序列分析,DNA 血型鉴定和交叉配血 B(A)亚型分子生物学