基于线粒体COI基因5′端区段粉螨DNA条形码研究

作     者：张兰香 詹雨娟 李梦珠 王严 李心玫 褚凌渺 孙恩涛 ZHANG Lanxiang;ZHAN Yujuan;LI Mengzhu;WANG Yan;LI Xinmei;CHU Lingmiao;SUN Entao

作者机构：皖南医学院卫生检验与检疫学教研室安徽芜湖241002 

出 版 物：《皖南医学院学报》 (Journal of Wannan Medical College)

年 卷 期：2021年第40卷第1期

页      面：9-12页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 071007[理学-遗传学] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31870352) 皖南医学院青年卓越人才资助项目(Wyqnyx201902) 安徽省大学生创新创业教育训练计划项目(S201910368114)。 

主　　题：线粒体COI基因 5′端区段 粉螨 DNA条形码 

摘      要：目的:基于线粒体COI基因5′端区段对常见储藏物粉螨进行分子鉴定,为粉螨鉴定方法的探讨提供依据。方法:采集储藏物样本,分离粉螨,形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA、PCR扩增、克隆测序,所获序列在Blast中进行同源性比对。结合GenBank已知粉螨COI基因序列,用ClustalX 1.83软件进行多序列比对,基于MEGA X软件进行序列分析并计算遗传距离,构建Maximum Likelihood系统发育树。结果:经形态学鉴定出7种粉螨,其中腐食酪螨Tyrophagus putrescentiae、范张食酪螨T.fanetzhangorum、粉尘螨Dermatophagoides farinae、棕脊足螨Gohieria fusca和害嗜鳞螨Lepidoglyphus destructor分子鉴定与形态学鉴定相一致,拱殖嗜渣螨Chortoglyphus arcuatus和纳氏皱皮螨Suidasia nesbitti分子鉴定与形态学鉴定并非一致,共检测到261个变异位点,400个保守位点,247个简约信息位点。种内遗传距离为0.00~0.01,种间遗传距离为0.171~0.262。构建ML系统进化树显示,7种粉螨均独立聚为一支,且支持率均达100%,与形态学鉴定一致。结论:线粒体COI基因5′端区段可用于7种常见储藏物粉螨的物种鉴定,为构建DNA条形码数据库提供基础资料。