检索结果-南通市图书馆

一起宋内志贺菌引起的细菌性痢疾暴发病原学检测及分子溯源

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中华预防医学杂志 2022年第4期56卷 437-442页

作者：刘江孙永张洁曾凡荣王小波朱利杰孙梦阳余寿杰淮南市疾病预防控制中心微生物检验科淮南232033 安徽省疾病预防控制中心微生物检验科合肥230601

目的对淮南市发生的一起宋内志贺菌暴发疫情进行病原学溯源分析,并对菌株毒力基因和耐药谱进行检测。方法采集2020年8月淮南市一起感染性腹泻暴发疫情相关水样、粪便,进行多重病原体核酸检测和分离培养,对分离的宋内志贺菌进行毒力基因... 详细信息

目的对淮南市发生的一起宋内志贺菌暴发疫情进行病原学溯源分析,并对菌株毒力基因和耐药谱进行检测。方法采集2020年8月淮南市一起感染性腹泻暴发疫情相关水样、粪便,进行多重病原体核酸检测和分离培养,对分离的宋内志贺菌进行毒力基因PCR检测、微量肉汤法药敏检测、脉冲场电泳和全基因组测序溯源分析。结果56份黏稀样粪便分离出38株宋内志贺菌(阳性率67.86%),血清型均为宋内志贺菌Ⅰ相;3份末梢水和井水革兰阴性菌(GN)增菌液荧光PCR检测志贺菌阳性;菌株毒力基因携带情况为侵袭性质粒抗原H(ipaH)阳性(38份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)阳性(31份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)/肠毒素2基因(sen)阳性(1份);耐药谱显示14种抗生素中9种100.00%耐药,仅亚胺培南、氯霉素、头孢他啶、环丙沙星为有效药物;36株菌XbaⅠ限制性酶切图谱带型完全一致,其中3株菌株基因组ST型分析均为ST152型;全基因组测序和分析验证了此次暴发由单一克隆群菌株引起,且揭示此次暴发分离株与数据库中3株中国菌株、1株韩国菌株聚集成一个大簇,而与其他国家的菌株距离较远。结论本起由水源污染单一宋内志贺菌克隆引起,分离株为低毒力株,呈多重耐药表型。

关键词：宋内志贺菌全基因组测序聚合酶链反应药敏试验

南通市2018—2020年流感样病例监测结果及与坏境的相关性研究

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医学动物防制 2022年第8期38卷 758-762页

作者：王海燕苏婧周洁潘玉平孙怡华南通市疾病预防控制中心微生物检验科江苏226001

目的分析南通市2018—2020年流行性感冒(流感)流行特征及与气象因素的关系,为今后流感防控工作提供依据。方法对南通市2018—2020年流感样病例(influenza like illness, ILI)进行数据分析,采集咽拭子标本,用实时荧光定量反转录PCR方... 详细信息

目的分析南通市2018—2020年流行性感冒(流感)流行特征及与气象因素的关系,为今后流感防控工作提供依据。方法对南通市2018—2020年流感样病例(influenza like illness, ILI)进行数据分析,采集咽拭子标本,用实时荧光定量反转录PCR方法检测核酸进行流感病原分析,采用Spearman法进行秩相关分析ILI与气象因素和大气污染物的关系。结果南通市2018—2020年哨点医院共报告ILI 67 351例,平均ILI就诊比(ILI%)为5.44%,2020年ILI%高达6.28%。ILI报告数和ILI%均呈明显的季节性特征,均在冬季出现高峰。报告的ILI以0~5岁组为主。2018—2020年共采集ILI样本6 746份,检出流感病毒核酸阳性805份,阳性率为11.93%,2020年流感病毒核酸阳性率为5.31%。2018年流感病毒优势毒株为甲型H1N1、乙型Yamagata, 2019年和2020年流感病毒优势毒株均为乙型Victoria。ILI发病率与平均气温和气压变化有一定相关性,即随气温、气压升高,发病率升高;与大气污染物变化也有一定相关性。结论南通市2020年流感流行强度较2018年和2019年明显降低,ILI%和发病率随气温升高而降低,随气压或污染物浓度的升高而升高。

关键词：流感样病例病毒分型儿童气温气压 PM2.5 PM10 CO O3

2017—2020年南通市水痘暴发疫情流行病学特征分析

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医学动物防制 2022年第10期38卷 1010-1013页

作者：苏婧季霄雷廉丽华祁贤梁如悦蔡秀丽南通市疾病预防控制中心微生物检验科江苏226007 江苏省疾病预防控制中心

目的了解2017—2020年南通市水痘暴发疫情的流行病学特征,为制定水痘防控措施提供技术支撑。方法收集2017—2020年南通市水痘暴发疫情的流行病学资料,利用Excel 2019和SPSS 23.0对资料进行统计和分析。结果 2017—2020年南通市全市上... 详细信息

目的了解2017—2020年南通市水痘暴发疫情的流行病学特征,为制定水痘防控措施提供技术支撑。方法收集2017—2020年南通市水痘暴发疫情的流行病学资料,利用Excel 2019和SPSS 23.0对资料进行统计和分析。结果 2017—2020年南通市全市上报水痘暴发疫情69起,累及病例3 346例,平均罹患率1.92%,无重症和死亡病例。暴发疫情在时间上呈双峰分布;以城镇小学为主要暴发场所,其次为幼儿园和中学;男女病例比例介于1.03~1.19;年龄中位数(median age,M)=8岁,四分位数间距(interquartile range, IQR)6~10岁。1 381例病例明确接种或未接种过疫苗,其中771例符合突破病例标准,构成比为55.83%,全部接种1剂次疫苗,97.92%的突破病例接种至发病的时间超过5年。使用Python语言提取发病原因,以卫生习惯不良、首发病例未及时隔离等多见。结论关注2017—2020年南通市水痘暴发疫情流行病学特征,加强高峰期学校的日常监测和疫情处置,建议尽早推进2剂次水痘疫苗免疫。

关键词：水痘暴发疫情水痘疫苗突破病例流行病学特征分析

南宁市新报告HIV感染者首次CD4T淋巴细胞检测结果及合并梅毒情况分析

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中国皮肤性病学杂志 2023年

作者：潘海西秦剑秋岑平王诗琼成肖阳黄秋芳南宁市疾病预防控制中心微生物检验科

目的了解南宁市新报告HIV感染者首次CD4+T淋巴细胞(简称CD4+T细胞)数检测结果和合并梅毒感染情况，为艾滋病防控提供科学依据。方法对2020—2022年在南宁市疾病预防控制中心进行HIV确证的新报告HIV感染者并完成首次CD4+T细胞检测的病例... 详细信息

目的了解南宁市新报告HIV感染者首次CD4+T淋巴细胞(简称CD4+T细胞)数检测结果和合并梅毒感染情况，为艾滋病防控提供科学依据。方法对2020—2022年在南宁市疾病预防控制中心进行HIV确证的新报告HIV感染者并完成首次CD4+T细胞检测的病例，使用ELISA和TRUST方法进行梅毒抗体检测，收集性别、年龄、婚姻、民族和文化程度等人口学特征和行为学特征，采用χ2检验对首次CD4+T细胞检测结果和HIV合并梅毒感染进行分析，采用二分类Logistics回归模型对晚发现病例进行单因素和多因素分析。结果共有1503例新报告HIV感染者纳入分析，其中男1112例(73.99%)，平均年龄52.43岁，已婚792例(52.69%)，壮族986例(65.60%)，初中及以下文化1213例(80.71%)，异性性传播1322例(87.96%)。合并梅毒共118例(7.85%)，不同年龄、婚姻状况、文化程度、传播途径等合并梅毒感染差异有统计学意义(P＜0.05)。CD4+T细胞数的均值为(270.36±226.96)个/μL，不同年龄，文化程度和传播途径对CD4+T细胞数检测的均值，≥50岁年龄段，初中及以下文化水平，异性性传播首次检测CD4+T淋巴细胞计数均值较低，差异有统计学意义(P市新报告HIV感染者，晚发现病例占比较高，合并梅毒感染率较高，应该扩大HIV检测，及早发现感染者，同时进行梅毒的检测和监测。

关键词： HIV CD4 T淋巴细胞梅毒

2020-2023年大连地区诺如病毒胃肠炎疫情分子流行特征分析

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病毒学报 2024年

作者：王越郎兴莹于蕾薄志坚栾明春大连市疾病预防控制中心微生物检验科

本研究分析了2020-2023年大连市16起急性胃肠炎疫情中诺如病毒的基因型特征。收集2020-2023年大连市16起急性胃肠炎病例的粪便标本154份。采用实时荧光定量反转录PCR方法检测诺如病毒GI/GII分型，并对阳性样本进行RNA依赖的RNA聚合酶区... 详细信息

本研究分析了2020-2023年大连市16起急性胃肠炎疫情中诺如病毒的基因型特征。收集2020-2023年大连市16起急性胃肠炎病例的粪便标本154份。采用实时荧光定量反转录PCR方法检测诺如病毒GI/GII分型，并对阳性样本进行RNA依赖的RNA聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分序列进行RT-PCR扩增和测序，通过诺如病毒在线分型工具和人类杯状病毒分型工具进行比对确定诺如病毒分型，利用MEGA软件构建系统进化树。结果显示全部154份样品中，检测诺如病毒阳性106份，其中诺如病毒GI组检出率3.77%(4/106),GII组检出率96.23%(102/106)。16起疫情中15起由GII型引起，1起由GI型引起，无GIGII混合感染，疫情以GII型为主。2020/2021流行季和2022/2023流行季的主要流行株是GII.2[P16]，并且该基因型在不同年份变异不大。2021/2022流行季存在多种型别共存，无优势流行株。2020-2023年大连市诺如病毒胃肠炎疫情主要发生在11月至次年4月，场所主要是幼儿园和中小学。

关键词：诺如病毒基因分型分子进化

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山西省内2株艾伯特埃希菌的分离与鉴定

中华预防医学杂志 2020年第10期54卷 1121-1126页

作者：王骥涛孟德权郭建娥闫国栋张玲万姿廷李群高丽高瑞红赵利峰王红太原市疾病预防控制中心微生物检验科 030001 自贡市疾病预防控制中心微生物检验所 643000

目的:了解山西省家禽中艾伯特埃希菌的带菌情况。方法:采集山西省不同禽类定点屠宰场鸡肠内容物经EC肉汤增菌后,PCR对其进行eae基因检测,阳性增菌液接种麦康凯琼脂,挑取不发酵乳糖菌落进行三重PCR(clpX、lysP和mdh基因)、16S rRNA基因... 详细信息

目的:了解山西省家禽中艾伯特埃希菌的带菌情况。方法:采集山西省不同禽类定点屠宰场鸡肠内容物经EC肉汤增菌后,PCR对其进行eae基因检测,阳性增菌液接种麦康凯琼脂,挑取不发酵乳糖菌落进行三重PCR(clpX、lysP和mdh基因)、16S rRNA基因序列分析及多位点序列分型(Multiocus sequence typing,MLST)鉴定。结果:本研究共采集了250份样品,经eae基因检测、生化鉴定、三重PCR检测、16S rRNA及MLST聚类分析,确定2株不发酵乳糖、木糖,无动力,eae、clpX、lysP和mdh基因阳性的菌株为艾伯特埃希菌。进一步对该2株艾伯特埃希菌毒力基因分析发现,该菌株携带Ⅱ/Ⅲ/Ⅴ组亚型cdtB基因,但均不携带stx基因。结论:本研究表明山西省鸡类中存在艾伯特埃希菌带菌的情况。

关键词：序列分析艾伯特埃希菌聚合酶链反应

新冠病毒奥密克戎变异株感染者咽拭子样本全基因组测序分析

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中国公共卫生 2023年第1期39卷 113-116页

作者：刘赞赞解翠华江亚娟王小羽窦慧馨焦伯延济宁市疾病预防控制中心微生物检验科山东济宁272000

目的对一起新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)变异株引起的疫情感染者咽拭子样本进行全基因组测序分析,为新冠病毒感染疫情防控提供参考依据。方法利用高通量测序技术对2022年4月山东省某县级市4例SARS-CoV-2感染者咽拭子样本... 详细信息

目的对一起新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)变异株引起的疫情感染者咽拭子样本进行全基因组测序分析,为新冠病毒感染疫情防控提供参考依据。方法利用高通量测序技术对2022年4月山东省某县级市4例SARS-CoV-2感染者咽拭子样本进行全基因组测序,利用MEGA 7.0.14软件分析病毒同源性并构建进化树、分析变异位点等。结果4条SARS-CoV-2全基因组序列与参考株wuhan-hu-1相比同源性为99.76%~99.77%,在进化树上均位于奥密克戎BA.2进化分支;均发生多个基因位点变异和缺失,其中,A28271T变异致使N翻译起始区的-3位核苷酸由A变异为T;S蛋白LPP24-26缺失致使双色氨酸(WW)结构域的潜在结合基序PPAY25-28丢失。结论Omicron变异株出现大量变异位点,这些变异位点或与Omicron变异株传染性强、隐匿性高、引起临床严重程度低有一定关系。

关键词：新型冠状病毒奥密克戎变异株全基因组翻译起始区双色氨酸结构域

烟台233例流感样病例流感阴性的病原体分布及流行特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2023年第2期37卷 173-177页

作者：徐迎春高巧宫连凤丁学斌宫月华李霞刘娟烟台市疾病预防控制中心微生物检验科烟台264003

目的了解烟台市流感阴性的流感样病例中呼吸道病原谱及其流行特征,为疾病防控和临床诊疗提供参考依据。方法于2020年3月至2021年2月在烟台市国家流感网络实验室监测的所有哨点医院采集了233例流感阴性的流感样病例的鼻咽拭子样本,使用... 详细信息

目的了解烟台市流感阴性的流感样病例中呼吸道病原谱及其流行特征,为疾病防控和临床诊疗提供参考依据。方法于2020年3月至2021年2月在烟台市国家流感网络实验室监测的所有哨点医院采集了233例流感阴性的流感样病例的鼻咽拭子样本,使用多重荧光定量聚合酶链式反应法检测22种呼吸道病原体,分析流行病学特征。结果233份标本中总病原学检出率为69.96%(163/233),共检出17种呼吸道病原体,检测率前三位的病原体是冠状病毒(human coronavirus,HCoV)(32.62%)、鼻/肠病毒(rhinovirus,RhV)/(enterovirus,EV)(17.17%)和嗜肺军团杆菌(legionella pneumophila,LP)(16.74%)。不同年龄组检出率分别为0~15岁组80.28%(57/71)、16~30岁组62.65%(52/83)、31~45岁组68.18%(30/44)、46~60岁组64.28%(9/14)、>60岁组71.43%(15/21),差异无统计学意义。呼吸道病原体全年均有检出,以单一病原体携带模式为主(44.21%),各季节呼吸道病原体检出率差异无统计学意义。多种病原体的季节流行规律具有差异,HCoV 229E型春季检出率最高(68.75%);RhV/EV在秋季(26.98%)和冬季(23.08%)的检出率较高;LP在春季(19.05%)和夏季(27.27%)的检出率较高;副流感病毒(human parainfluenza virus,HPIV)在春季的检出率(22.22%)显著高于夏季(3.64%)。且HPIV和百日咳鲍特菌(bordetella pertussis,BP)均以0~15岁组的检出数量最多,检出率在不同年龄组之间差异有统计学意义。结论应加强HCoV、RhV、EV、LP、HPIV等呼吸道病原体的持续性监测,了解其流行特征及致病力的标化,为对可能由其他病原体引起的疫情暴发提供了数据支持和流行病学调查提供参考依据。

关键词：流感样病例病原谱流行特征冠状病毒

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苏州市沙门氏菌血清型、耐药及分子分型分析

微生物学通报 2024年

作者：王小龙邹文燕朱莉勤张梦寒沈强苏州市疾病预防控制中心病原微生物与生物检验科

【背景】沙门氏菌是一种人兽共患病病原菌，是引起人类感染性腹泻最常见的病原菌之一。【目的】分析苏州市2023年分离的176株沙门氏菌的血清型、耐药情况和分子分型。【方法】血清型鉴定采用玻片凝集法；药敏试验采用微量肉汤法；MLST... 详细信息

【背景】沙门氏菌是一种人兽共患病病原菌，是引起人类感染性腹泻最常见的病原菌之一。【目的】分析苏州市2023年分离的176株沙门氏菌的血清型、耐药情况和分子分型。【方法】血清型鉴定采用玻片凝集法；药敏试验采用微量肉汤法；MLST分型采用全基因组测序，测序结果与PubMLST数据库进行比对得出菌株的ST型别。【结果】176株沙门氏菌共鉴定出了42种血清型分属于9个血清群。血清型以肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis，26.70%）和鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium，18.75%），为优势血清型。176株菌对氨苄西林的耐药率最高(60.23%)，其次是链霉素(47.16%)。所有菌株均对头孢他啶/阿维巴坦、美罗培南、厄他培南和阿米卡星敏感。多重耐药率达到57.39%，多重耐药模式达到51种，其中包含青霉素类+β-内酰胺/β-内酰胺抑制剂复合物+头孢类的多重耐药模式有18种。176株菌共检出43种ST型别，检出率前三的ST型别分别为ST11、ST34和ST19，检出率分别为27.27%、10.80%和7.95%。【结论】苏州市沙门氏菌的血清型和ST型别种类多，血清型以肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌为优势型别，ST型以ST11为优势型别。多重耐药现象严重，应加强监测。

关键词：沙门氏菌血清型耐药 ST型别