南通地区腺病毒41型遗传变异及进化特征分析

作     者：季霄雷 郭陈 孙怡华 陈雨佳 陈璐 蔡秀丽 JI Xiaolei;GUO Chen;SUN Yihua;CHEN Yujia;CHEN Lu;CAI Xiuli

作者机构：南通市疾病预防控制中心微生物检验科南通226001 南通市崇川区疾病预防控制中心微生物检验科南通226001 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2023年第39卷第6期

页      面：1596-1606页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：南通市科技局基础科学研究项目(项目号:JCZ2022117) 题目:南通市幼儿病毒性急性胃肠炎病原谱构建及变异趋势研究。 

主　　题：肠道腺病毒 全基因组 HAdV-41 分子进化速率 tMRCA 

摘      要：F亚属的人类腺病毒(Human adenovirus,HAdV)与急性胃肠炎相关,是儿童急性胃肠炎住院的常见病因。本研究收集了712份5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本,检出HAdV-F阳性52例,阳性检出率为7.30%。对Ct值30的样本进行文库构建及测序,经Blast比对,得到的21条全基因组序列均为HAdV-41。与HAdV-41原型株相比较,Long fiber和Short fiber的核苷酸一致性低于全基因组核苷酸一致性。对HAdV-41全基因组的遗传进化分析显示,其分子进化速率为7.882×10^(-5)替换/位点/年(95%HPD,3.885×10^(-5)~1.234×10^(-4))。本课题研究对南通地区流行的HAdV-41进行了流行病学特征及基因进化特征分析,为南通地区HAdV-41所致疾病防控及病原溯源奠定了基础。