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辽宁省粳稻品种的遗传多样性与群体结构分析

作物杂志 2024年第1期 40-47页

作者：刘丹王嘉宇冯章丽冯博陈温福遵义师范学院生物与农业科技学院贵州遵义563006 沈阳农业大学水稻研究所/农业农村部东北水稻生物学与遗传育种重点实验室辽宁沈阳110866 遵义师范学院资源与环境学院贵州遵义563006

为阐明辽宁省育成粳稻的亲缘关系,以辽宁省9个育种单位育成的58个粳稻品种为材料,利用54对SSR分子标记对其进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明,54对SSR引物中共有48对引物存在多态性,多态性引物占比88.89%。48对多态性引物共检测到... 详细信息

为阐明辽宁省育成粳稻的亲缘关系,以辽宁省9个育种单位育成的58个粳稻品种为材料,利用54对SSR分子标记对其进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明,54对SSR引物中共有48对引物存在多态性,多态性引物占比88.89%。48对多态性引物共检测到150个等位基因,每个位点检测等位基因(Na)变异范围为2~6,平均为3.13;基因多样性指数(H)变异范围为0.03~0.78,平均为0.33;多态性信息含量(PIC)变异范围为0.03~0.74,平均为0.29。通过对不同育种单位育成品种对比分析发现,辽宁省盐碱地利用研究所育成品种的遗传多样性水平较高,平均PIC为0.30,平均H为0.34,而铁岭市农业科学院育成品种的多样性水平较低,平均PIC为0.11,平均H为0.14。NJ聚类分析表明,58个品种可以划分成3个类群,其中丹东农业科学院育成的丹粳系列与铁岭市农业科学院育成的铁粳系列分别位于类群Ⅰ和Ⅲ。基于模型的群体遗传结构分析表明,58个粳稻可以分为2个类群,其中32个材料属于类群A,26个材料属于类群B。

关键词：辽宁省粳稻 SSR 遗传多样性群体结构

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基于ferritin纳米载体的抑制素α亚基的多克隆抗体的制备

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基因组学与应用生物学 2024年第5期43卷 877-889页

作者：韩璐宋新辉徐佳寅张家宁覃朝斌羊玉凤刘庆友李志鹏广西大学动物科学技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530004 佛山科学技术学院生命科学与工程学院动物分子设计与精准育种广东省重点实验室佛山528225

为了制备高效价和多动物适用性的抑制素α(inhibinα,INH-α)多克隆抗体,通过生物信息学分析INH-α物种同源保守性,并以pET-32α为骨架,构建INH-α和INH-α-Ferritin表达载体,原核表达纯化后的重组蛋白用于免疫日本大耳兔,采用间接ELIS... 详细信息

为了制备高效价和多动物适用性的抑制素α(inhibinα,INH-α)多克隆抗体,通过生物信息学分析INH-α物种同源保守性,并以pET-32α为骨架,构建INH-α和INH-α-Ferritin表达载体,原核表达纯化后的重组蛋白用于免疫日本大耳兔,采用间接ELISA方法测定兔血清中抗体效价。结果表明,本研究成功构建了INH-α和INH-α-Ferritin原核表达载体,在0.4 mmol/L IPTG、37℃诱导6 h的条件下,分别获得了35 kDa和50 kDa包涵体形式的重组蛋白。通过免疫获得了高效价的兔抗多克隆抗体,INH-α-Ferritin抗血清效价达到1∶19531250。生物信息学分析结果显示INH-α在哺乳动物间的同源性高、保守性强。本研究成功构建INH-α和INH-α-Ferritin原核表达载体,并通过INH-α-Ferritin显著提高多克隆抗体的效价,为提高哺乳动物家畜繁殖力的研究奠定基础。

关键词：抑制素α 生物信息学原核表达多克隆抗体

柯乐猪OPN基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

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中国畜牧杂志 2024年第8期60卷 262-269页

作者：吴燕罗华伦杨红文杨齐心王春源向进丁义杰付红梅赵永张依裕贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州大学香猪研究所黔西南州农业农村局贵州省畜禽遗传资源管理站

本文旨在研究柯乐猪骨调素（Osteopontin,OPN）基因多态性及其与繁殖性状的关系，为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据。采用PCR产物直接测序法检测200头柯乐猪OPN基因第6外显子的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorp... 详细信息

本文旨在研究柯乐猪骨调素（Osteopontin,OPN）基因多态性及其与繁殖性状的关系，为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据。采用PCR产物直接测序法检测200头柯乐猪OPN基因第6外显子的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）位点，通过RNAfold预测OPN基因突变前后的mRNA二级结构，并利用SPSS 26.0软件分析OPN基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。结果显示，在OPN基因第6外显子中筛查到5个SNPs位点，分别为g.131083657 A>G、g. 131083770 A>G、g.131083791A>C、g.131083805C>T和g.131083806G>C位点，均产生3种基因型，且均为中度多态，其中g.131083657 A>G和g.131083806G>C位点属于错义突变，分别导致丙氨酸突变为络氨酸、缬氨酸突变为丙氨酸。卡方检验结果显示，5个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡，且5个SNPs位点两两之间存在强连锁不平衡。5个SNPs联合产生4种单倍型和5种双倍型，突变后单倍型H3(GAACG)的mRNA二级结构稳定性增加，而H4(GGATC)和H1(AAACG)稳定性减弱，突变后单倍型H1、H3在三级结构第109个氨基酸前后和158个氨基酸处有明显变化。关联分析结果表明，各位点与产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重呈显著相关，g.131083657 A>G、g.131083770 A>G和g.131083791A>C位点有利基因型均为AA,g.131083805C>T、g.131083806G>C位点有利基因型分别为CC和GG。双倍型H1H1(AAAAAACCGG)个体产活仔猪数和断奶仔猪数优于双倍型H1H2(AGAGACCTCG)及H3H3个体（GGAAAACCGG）(P基因第6外显子上的5个突变位点与柯乐猪的产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重3个繁殖性能指标均存在显著关联，可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记。

关键词：柯乐猪 OPN基因 SNP 繁殖性状

来源：博看期刊

猪睾丸ACE启动子驱动的SPAG6 shRNA真核表达载体的构建

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中国畜牧杂志 2024年第3期60卷 224-230页

作者：张燕迪顾涛涛任红艳毕延震方桂杰湖北省农业科学院畜牧兽医研究所动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室湖北武汉430064 湖北工业大学生物工程与食品学院发酵工程教育部重点实验室湖北武汉430068

本文旨在研究猪睾丸ACE启动子驱动的SPAG6 shRNA在猪睾丸支持细胞(ST)中的干扰作用。利用PCR法从ST细胞基因组中扩增猪睾丸ACE启动子,构建重组质粒ACE-pIRES2-DsRed、ACE-pGL3-basic,通过红色荧光蛋白表达和双荧光素酶报告基因检测试验... 详细信息

本文旨在研究猪睾丸ACE启动子驱动的SPAG6 shRNA在猪睾丸支持细胞(ST)中的干扰作用。利用PCR法从ST细胞基因组中扩增猪睾丸ACE启动子,构建重组质粒ACE-pIRES2-DsRed、ACE-pGL3-basic,通过红色荧光蛋白表达和双荧光素酶报告基因检测试验检测猪睾丸ACE启动子在ST细胞中的转录活性;根据SPAG6 mRNA靶序列设计合成3条siRNA序列,通过脂质体转染至ST细胞,利用实时荧光定量PCR及Western Blot检测siRNA的干扰效率;基于人miR-30a结构设计SPAG6 shRNA,构建重组载体ACE-sh-SPAG6-pcDNA3.1,Western Blot检测其对SPAG6的干扰效果。结果表明,成功构建重组质粒ACEpIRES2-DsRed、ACE-pGL3-basic,并证明猪睾丸ACE启动子在ST细胞中具有较强的转录活性;各试验组均能对靶基因SPAG6 mRNA的表达产生抑制作用,以siRNA-3的作用最佳。siRNA-3转染48 h后,SPAG6蛋白表达量显著下降(P基因的最佳干扰序列;成功构建重组质粒ACE-shSPAG6-pcDNA3.1,转染ST细胞48h后SPAG6蛋白表达量较阴性对照组显著下调(P<0.001)。本研究成功构建了猪睾丸ACE启动子驱动的SPAG6 shRNA真核表达载体,并在ST细胞中验证了其具有较好的干扰效果。

关键词： SPAG6 ACE siRNA shRNA 基因表达

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家禽骨骼肌肌纤维类型影响因素及其转化的研究进展

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中国畜牧兽医 2024年第4期51卷 1561-1572页

作者：谢兵红单艳菊范晨宇薛夫光吴红翔巨晓军束婧婷刘一帆江苏省家禽科学研究所江苏省家禽遗传育种重点实验室扬州225125 江西农业大学动物科学技术学院动物健康安全生产南昌重点实验室南昌330000 江苏省家禽科学研究所科技创新有限公司扬州211412

肌纤维是构成肌肉组织的基本单位。肌肉的肌纤维类型组成与肉品质密切相关,并可在机体生长发育、营养和饲养环境等外界刺激下发生变化。近年来,由于消费者和育种学家对肉品质的关注,家禽肌纤维类型及其转换规律已成为本领域的研究热点... 详细信息

肌纤维是构成肌肉组织的基本单位。肌肉的肌纤维类型组成与肉品质密切相关,并可在机体生长发育、营养和饲养环境等外界刺激下发生变化。近年来,由于消费者和育种学家对肉品质的关注,家禽肌纤维类型及其转换规律已成为本领域的研究热点之一。随着组学研究技术的发展,转录组学、蛋白组学等技术已广泛应用于家禽肌纤维类型调控机理的研究,极大地推动了相关研究的进展。充分了解目前有关肌纤维类型转化的研究,是后续开展相关肉品质与调控机制研究的重要理论基础。在此背景下,作者介绍了肌纤维的结构组成及不同类型的分类方法,简述了肌纤维类型与家禽肌肉品质特征相关性状如肉色、pH、系水力和嫩度之间的关系,并总结了生长、品种、环境和饲养方式等因素对肌纤维类型的影响,重点讨论了现有的分子调控研究进展,旨在为家禽肌纤维类型转换机理的研究提供参考。最后,对未来优质肉鸡的育种方向提出了展望,希望随着现代分子生物技术的发展,单细胞/空间组学技术、基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑技术等前沿技术能在肌纤维类型研究领域广泛运用,肌纤维类型转换的机制研究将不断完善,并建立家禽肉质性状的分子选育方法。

关键词：家禽肉品质肌纤维类型肌纤维类型转换

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斑石鲷irf3基因鉴定及其在虹彩病毒感染下的表达模式

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水产学报 2024年第4期48卷 202-213页

作者：李开敏王磊巩志宏王清滨李华杨桂文黄友华陈松林中国水产科学研究院黄海水产研究所海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室农业农村部海洋渔业与可持续发展重点实验室崂山实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室莱州明波水产有限公司山东师范大学华南农业大学海洋学院海洋生物资源保护与利用粤港澳高校联合实验室广东省水产免疫与健康养殖工程技术研究中心

干扰素调节因子(irf3)是干扰素调节因子(IRF)家族的一员，是I型干扰素依赖性免疫反应的主要转录调节因子，在针对DNA和RNA病毒的先天免疫反应中发挥重要作用。本研究中，斑石鲷irf3基因(Oplegnathus punctatus interferon regulatory fa... 详细信息

干扰素调节因子(irf3)是干扰素调节因子(IRF)家族的一员，是I型干扰素依赖性免疫反应的主要转录调节因子，在针对DNA和RNA病毒的先天免疫反应中发挥重要作用。本研究中，斑石鲷irf3基因(Oplegnathus punctatus interferon regulatory factors 3,Opirf3)来自实验室斑石鲷基因组数据库，经分析鉴定Opirf3的CDS序列全长1 362 bp，可编码453个氨基酸，预测其蛋白分子量为50.0 ku，理论等电点为4.97，有一个IRF结构域和一个IRF-3结构域。荧光定量分析结果显示，Opirf3在斑石鲷肝脏、鳃、心脏、皮肤、脾脏、肠、脑、肾脏、胃和头肾组织均有表达；虹彩病毒感染7 d时，免疫组织肝脏、脾脏和肾脏中Opirf3的表达水平显著上调。斑石鲷肾细胞系体外刺激实验显示，不同浓度poly I:C刺激后，Opirf3的表达量较对照组均显著升高，poly I:C浓度为100μg/mL时，肾脏细胞中Opirf3的相对表达水平升高，为对照组的86.8倍。siRNA干扰后，斑石鲷肾细胞系中Opirf3表达水平显著下调30%，下游基因IFN-α、CD40、CD80和IL-1β显著下调，IL-6显著上调。以上结果可能表明Opirf3基因参与了I型IFN在斑石鲷抗虹彩病毒过程中的先天免疫反应。本研究可为斑石鲷抗病分子育种提供理论依据。

关键词：斑石鲷 irf3 基因表达 siRNA

转录因子在水稻干旱胁迫响应中的功能研究进展

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广东农业科学 2024年第6期51卷 128-144页

作者：韩明珍周炼王静周和赵均良周玲艳马雅美仲恺农业工程学院农业与生物学院广东广州510225 广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室/农业农村部华南优质稻遗传育种实验室(部省共建) 广东广州510640 广东海洋大学滨海农业学院广东湛江524088 华南农业大学生命科学学院广东广州510640

水稻(Oryza sativa L.)是世界主要粮食作物之一,随着全球气候变暖和人口不断增长,以及农业用水的增加和可利用淡水资源的减少,干旱胁迫已成为影响水稻生长发育和产量最重要的非生物逆境胁迫。选育抗旱品种是应对干旱胁迫最有效且相对经... 详细信息

水稻(Oryza sativa L.)是世界主要粮食作物之一,随着全球气候变暖和人口不断增长,以及农业用水的增加和可利用淡水资源的减少,干旱胁迫已成为影响水稻生长发育和产量最重要的非生物逆境胁迫。选育抗旱品种是应对干旱胁迫最有效且相对经济的措施,而挖掘抗旱基因是进行水稻抗旱育种的基础。研究表明,水稻的抗旱性是由众多基因共同调控的复杂数量性状,涉及的基因网络错综复杂。在这一调控网络中,转录因子扮演着至关重要的角色。转录因子是指能够特异性结合某基因启动子区域顺式作用元件的蛋白质,它在调节植物的生长发育、代谢过程及生物、非生物胁迫过程中发挥重要作用。目前,已在水稻中鉴定出多种参与干旱胁迫响应的转录因子,包括bZIP、MYB、NAC、DREB、WRKY、锌指蛋白、SPL、bHLH、MADS、热激蛋白和GRAS等家族成员。当水稻遭受干旱等逆境胁迫时,这些转录因子通过特异性调控一系列下游靶标基因的表达,进而调节水稻对干旱胁迫的适应性。该文就近年来转录因子在水稻响应干旱胁迫中的功能进行综述,通过深入分析转录因子的生物学功能和作用机制,有助于加强人们对水稻抗旱性分子基础的认识,同时为培育具有更强抗旱能力的水稻新品种提供重要的理论依据。

关键词：水稻干旱胁迫转录因子表达调控功能机制抗旱育种

植物维生素B_(1)生物合成及生物强化的研究进展

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安徽农业科学 2024年第2期52卷 5-9,14页

作者：孙亚丽唐家琪毛馨晨王子瑞张超于恒秀扬州大学农学院/江苏省作物遗传生理重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心江苏扬州225009

维生素B_(1)是所有生物所必需的微量元素,其作为多个酶的辅因子,参与重要的细胞代谢途径。人体缺乏维生素B_(1)会增加罹患心血管及神经失调性疾病的风险。与植物和微生物不同,人类和其他动物不能从头合成维生素B_(1),必须从饮食中获取... 详细信息

维生素B_(1)是所有生物所必需的微量元素,其作为多个酶的辅因子,参与重要的细胞代谢途径。人体缺乏维生素B_(1)会增加罹患心血管及神经失调性疾病的风险。与植物和微生物不同,人类和其他动物不能从头合成维生素B_(1),必须从饮食中获取。因此,研究植物中维生素的生物合成途径,并在此基础上对植物中的维生素B_(1)含量进行生物强化具有重要意义。维生素B_(1)合成途径中有许多酶的参与,如嘧啶合成酶(THIC)、噻唑合成酶(THI1)、硫胺素磷酸合成酶(TH1)、硫胺素单磷酸酶(TH2)和硫胺素焦磷酸激酶(TPK)等。结合相关研究,对维生素B_(1)在植物中的生物学功能、生物合成途径及合成相关基因的功能进行总结,并介绍了通过代谢工程实现生物强化的研究进展,以期为进一步提高植物中维生素B_(1)含量提供参考。

关键词：维生素B_(1) 硫胺素生物合成生物强化植物

CSBV的分离鉴定及其感染幼虫后的应答反应

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中国动物传染病学报 2024年第2期32卷 89-96页

作者：费世港刘合永王叶元冯敏王子龙孙京臣华南农业大学动物科学学院广州510642 江西农业大学蜜蜂研究所南昌330045

本研究旨在为了解江西某蜂场蜜蜂是否感染中蜂囊状幼虫病病毒(CSBV)并探究CSBV感染中蜂幼虫后的应答反应。采集该蜂场疑似感染CSBV的蜜蜂,采用RT-PCR的方法检测CSBV核酸,取阳性的蜜蜂样品进行病毒分离纯化、电镜观察及测序。将纯化鉴定... 详细信息

本研究旨在为了解江西某蜂场蜜蜂是否感染中蜂囊状幼虫病病毒(CSBV)并探究CSBV感染中蜂幼虫后的应答反应。采集该蜂场疑似感染CSBV的蜜蜂,采用RT-PCR的方法检测CSBV核酸,取阳性的蜜蜂样品进行病毒分离纯化、电镜观察及测序。将纯化鉴定后的CSBV对3日龄的中蜂幼虫进行人工感染,进行转录组测序,分析中蜂幼虫感染CSBV的应答反应。通过RT-PCR验证和电镜观察成功鉴定CSBV,并命名为CSBV-JX。CSBV-JX电镜观察直径为25~30 nm。对其进行分段扩增测序,发现基因组序列为8781 bp,对其进行系统发育分析,表明东方蜜蜂的SBV(AcSBV)与西方蜜蜂的SBV(AmSBV)明显分为两个分支,具有较强的地域分化性。转录组测序分析发现,中蜂幼虫在感染CSBV-JX后2 h有59个基因上调表达,83个基因下调表达;感染后12 h有68个基因上调表达,86个基因下调表达。本研究成功分离鉴定一株中蜂囊状幼虫病毒并命名为CSBV-JX。同时对CSBV-JX感染中蜂幼虫的转录组学分析发现,CSBV-JX感染2 h和12 h引起宿主的响应较小,这可能是CSBV-JX感染的2 h和12 h为病毒增殖的早期阶段病毒载量低,引起的宿主免疫响应小所导致。在CSBV-JX感染中蜂幼虫的2 h和12 h期间引起的差异基因与代谢通路关联较大,研究结果为阐明解析CSBV感染中蜂的分子机制提供了基础。

关键词：中蜂囊状幼虫病毒分离鉴定系统发育分析转录组学

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