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饲料VD3水平对黄颡鱼转录组差异基因表达的影响

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水产学报 2016年第9期40卷 1289-1298页

作者：冯美惠陈沛段鸣鸣王春芳华中农业大学水产学院大宗淡水鱼产业技术体系华中区养殖岗位池塘健康养殖湖北省工程实验室淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心农业部淡水生物繁育重点实验室

为研究饲料中添加维生素D对黄颡鱼基因表达的影响,实验基于RNA-Seq技术对用添加不同水平维生素D[0(VD0),1243(VD2),22700(VD20)IU/kg]的饲料喂养的黄颡鱼肾脏和小肠的转录组数据进行分析。通过对305 568982条原始reads的筛选和排除,得到... 详细信息

为研究饲料中添加维生素D对黄颡鱼基因表达的影响,实验基于RNA-Seq技术对用添加不同水平维生素D[0(VD0),1243(VD2),22700(VD20)IU/kg]的饲料喂养的黄颡鱼肾脏和小肠的转录组数据进行分析。通过对305 568982条原始reads的筛选和排除,得到了83 265条unigenes,平均长845.38 nt,N50为1620 nt。利用Blast等相关软件对数据进行深度分析,得到功能注释基因共29 224个。根据GO富集分析发现,差异表达基因主要集中在细胞过程、代谢通路、生物调控等通路中,KEGGpathway富集分析结果显示,代谢通路涉及基因最多,有1532个。相对于对照组,添加1243和22700 IU/kg的VD(VD0 vs VD2/VD0vs VD20)可得到共同上下调基因共380个,其中上调基因266个,下调基因114个;3种水平下共同上下调的基因共2 1个,其中上调基因4个,下调基因1 7个。研究表明,在饲料中添加不同浓度维生素D会对黄颡鱼的生长代谢和生物调控等相关基因表达产生影响,且不同浓度实验组,相关基因的表达存在差异。本实验通过对差异表达基因的后续分析及预测,为黄颡鱼的生长代谢及疾病预防等方面的研究提供了丰富的数据来源。

关键词：黄颡鱼维生素D3 转录组分析基因表达

种青养鱼模式下的草鱼肌肉营养成分和品质特性

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水产学报 2016年第7期40卷 1050-1059页

作者：程辉辉谢从新李大鹏肖业红田兴陈洁汤蓉亓成龙马玲巧华中农业大学水产学院大宗淡水鱼产业技术体系华中区养殖岗位池塘健康养殖湖北省工程实验室淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心农业部淡水生物繁育重点实验室洪湖市红仙喜水产养殖专业合作社

为探究种青养鱼养殖模式对草鱼肌肉营养成分和品质特性的影响,随机选取以种青喂草为主养殖模式下养殖的草鱼(生态草鱼)和投喂人工配合饲料进行养殖的草鱼(饲料草鱼)各16尾,测定其肌肉系水力和质构特性指标,以及肌肉常规营养成分、矿物... 详细信息

为探究种青养鱼养殖模式对草鱼肌肉营养成分和品质特性的影响,随机选取以种青喂草为主养殖模式下养殖的草鱼(生态草鱼)和投喂人工配合饲料进行养殖的草鱼(饲料草鱼)各16尾,测定其肌肉系水力和质构特性指标,以及肌肉常规营养成分、矿物元素、氨基酸和脂肪酸含量。结果显示,生态草鱼和饲料草鱼肝体比和空壳率无显著性差异;生态草鱼肌肉系水力指标中滴水损失显著低于饲料草鱼,冷冻渗出率不显著地低于饲料草鱼,失水率不显著地高于饲料草鱼,p H值无显著性差异;肌肉的硬度、弹性、凝聚性、胶黏性和回复性均无显著性差异;生态草鱼粗脂肪含量显著低于饲料草鱼,水分、灰分、粗蛋白含量均无显著性差异;生态草鱼P和Fe含量均显著高于饲料草鱼,Mg、Mn和Cr含量均极显著高于饲料草鱼;生态草鱼和饲料草鱼肌肉氨基酸组成基本一致,均含有17种氨基酸,其中人体必需氨基酸总量分别为6.85%和6.27%。生态草鱼必需氨基酸指数(EAAI)为76.07,而饲料草鱼为77.29,饲料草鱼略高于生态草鱼。生态草鱼和饲料草鱼肌肉均含19种脂肪酸,其中棕榈酸、花生四烯酸(ARA)、亚油酸(LA)、油酸、二十二碳六烯酸(DHA)和硬脂酸含量较高,为主要脂肪酸,而花生五烯酸(EPA)+DHA含量分别为8.95%和10.70%,且差异显著。研究表明,生态草鱼和饲料草鱼在肌肉质构特性方面无显著性差异,与饲料草鱼相比,生态草鱼具有肌肉系水力强、低脂肪和矿物元素含量高的特点。

关键词：草鱼肌肉系水力质构特性营养成分矿物元素氨基酸脂肪酸

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草鱼野生与选育群体遗传变异微卫星分析

水产学报 2018年第8期42卷 1273-1284页

作者：王沈同沈玉帮孟新展王荣泉李家乐上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室苏州市申航生态科技发展股份有限公司农业部大宗淡水鱼类繁育与健康养殖技术重点实验室

为探究经过2个选育世代后选育群体遗传多样性和遗传结构的变化,实验采用多重PCR技术对4个野生草鱼群体(邗江、九江、石首、吴江)和2个选育群体(F1和F2)进行了微卫星序列遗传变异分析。结果显示,6个草鱼群体遗传多样性水平较高,2个选育... 详细信息

为探究经过2个选育世代后选育群体遗传多样性和遗传结构的变化,实验采用多重PCR技术对4个野生草鱼群体(邗江、九江、石首、吴江)和2个选育群体(F1和F2)进行了微卫星序列遗传变异分析。结果显示,6个草鱼群体遗传多样性水平较高,2个选育群体除了平均等位基因数外,其他遗传多样性参数均小于4个野生群体。哈迪—温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)检测显示,在120个群体—位点组合中有62个位点显著偏离哈迪—温伯格平衡,62个群体—位点组合中只有11个组合其近交系数值为负值,其余的51个组合的Fis均为正值。6个草鱼群体AMOVA分析结果显示,3.75%的变异来自于群体间,96.25%的变异来自于群体内,整体的遗传分化指数值为0.038。进一步分析各个群体间Fst,只有石首群体与F1、F2群体之间的Fst大于0.05,处于中等分化,其余群体间分化程度较低,且F2群体与4个野生群体之间Fst比F1群体与4个野生群体之间的Fst大。奈氏标准遗传距离分析结果显示,2个选育群体与野生群体之间的遗传距离大于野生群体之间的遗传距离。基于Dn建立的UPGMA系统发育树得出了相同的结果,即2个选育群体与野生群体之间的亲缘关系比4个野生群体之间的亲缘关系要远。研究表明,经过2个世代选育后,相比4个野生群体,2个选育群体遗传多样性虽有部分下降,但仍处于较高的水平,2个选育群体的遗传结构已发生变化,但其遗传分化程度尚不明显。本研究结果为制定出更加完善有效的选育方案提供了重要参考。

关键词：草鱼选育群体野生群体微卫星遗传变异

浅谈工业化养殖池塘病害发生的原因及防治对策

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水产养殖 2017年第11期38卷 47-49页

作者：杜兴伟王荣泉农业部大宗淡水鱼繁育与养殖技术重点实验室苏州市申航生态科技发展股份有限公司江苏苏州215221

2014年，高效、低碳、循环流水养殖系统被正式定名为池塘工业化养殖模式后，随即被江苏省海洋与渔业局确定为重点项目之一，并在全省范围内进行推广。该模式旨在解决传统养殖过程中出现的养殖效益低、水环境污染严重、病害防治困难等问... 详细信息

2014年，高效、低碳、循环流水养殖系统被正式定名为池塘工业化养殖模式后，随即被江苏省海洋与渔业局确定为重点项目之一，并在全省范围内进行推广。该模式旨在解决传统养殖过程中出现的养殖效益低、水环境污染严重、病害防治困难等问题翻。

关键词：养殖池塘病害防治工业化病害发生原因水环境污染养殖模式养殖系统

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青鱼野生与养殖群体遗传变异的微卫星分析

水生生物学报 2019年第5期43卷 939-944页

作者：王丰张家华沈玉帮徐晓雁王荣泉李家乐上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 苏州市申航生态科技发展股份有限公司农业部大宗淡水鱼类繁育与健康养殖技术重点实验室苏州215221

研究利用自主开发的12个微卫星标记,对来自于长江水系4个野生群体(湖北石首、湖南湘江、江苏邗江、浙江嘉兴)和1个养殖群体(江苏吴江)青鱼(Mylopharyngodon piceus)进行遗传多样性和遗传结构分析。遗传多样性分析结果显示这12个位点多... 详细信息

研究利用自主开发的12个微卫星标记,对来自于长江水系4个野生群体(湖北石首、湖南湘江、江苏邗江、浙江嘉兴)和1个养殖群体(江苏吴江)青鱼(Mylopharyngodon piceus)进行遗传多样性和遗传结构分析。遗传多样性分析结果显示这12个位点多态信息含量(PIC)介于0.660—0.923,表明这12个位点均具有高度多态性(PIC>0.5)。5个群体的平均等位基因数(Na)介于7.917—11.667,平均有效等位基因数(Ne)介于4.837—6.035;平均观测杂合度介于0.713—0.861;平均期望杂合度介于0.749—0.819;平均多态信息含量介于0.711—0.788,表明这5个群体均具有较高的遗传多样性。遗传距离分析结果表明4个野生群体之间遗传距离较近,养殖群体与这4个野生群体遗传距离均较远。UPGMA系统进化树显示,湘江群体和石首群体首先聚为一支,然后与邗江群体和嘉兴群体聚为一支,最后与吴江养殖群体聚为一支。这12个微卫星位点具有较为丰富的遗传多样性特征,可以用于青鱼不同群体的种质资源的评估和遗传多样性的分析。

关键词：青鱼遗传多样性遗传结构微卫星

浅谈工业化养殖池塘病害发生的原因及防治对策

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科学养鱼 2017年第8期39卷 65-66页

作者：杜兴伟王荣泉农业部大宗淡水鱼繁育与养殖技术重点实验室苏州市申航生态科技发展股份有限公司江苏苏州215221

2014年,高效、低碳、循环流水养殖系统被正式定名为池塘工业化养殖模式后,随即被江苏省海洋与渔业局确定为重点项目之一,并在全省范围内推广。该模式旨在解决传统养殖过程中出现的养殖效益低下、水环境污染、病害防治困难等问题。作为... 详细信息

2014年,高效、低碳、循环流水养殖系统被正式定名为池塘工业化养殖模式后,随即被江苏省海洋与渔业局确定为重点项目之一,并在全省范围内推广。该模式旨在解决传统养殖过程中出现的养殖效益低下、水环境污染、病害防治困难等问题。作为国内首家引进并升级该养殖模式的公司,于2016年底,苏州市申航生态科技发展股份有限公司在吴江区同里镇北联村国家农业示范园水产核心区内的320亩水面中承建了29条流水槽养殖系统,将320亩水面分割成两部分,60亩的水面建设6条流水槽（东面）,260亩的水面建设23条流水槽（西面）,并于当年即开展斑点叉尾鯝、草鱼等养殖实验。

关键词：养殖池塘病害防治工业化病害发生原因养殖模式养殖系统水环境污染

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刀鲚肌间骨新类型的发现

水生生物学报 2020年第1期44卷 104-111页

作者：常永杰周佳佳张丽红孟佑廉高泽霞华中农业大学水产学院农业部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心武汉430070 池塘健康养殖湖北省工程实验室武汉430070

文章对刀鲚(Coilia nasus)的肌间骨数目、形态、分布特征及组织学结构进行了系统研究。结果表明刀鲚肌间骨的形态种类与普通鲤科鱼类没有显著差别,但其分布类别却有很大不同,刀鲚不仅有髓弓小骨、椎体小骨和脉弓小骨,且在其背部上方和... 详细信息

文章对刀鲚(Coilia nasus)的肌间骨数目、形态、分布特征及组织学结构进行了系统研究。结果表明刀鲚肌间骨的形态种类与普通鲤科鱼类没有显著差别,但其分布类别却有很大不同,刀鲚不仅有髓弓小骨、椎体小骨和脉弓小骨,且在其背部上方和腹部下方仍存在大量肌间骨,这两类肌间骨的形态为简单的“1”形和“(”形,分别位于背部上方和腹部下方肌膈的皱褶部;在短颌鲚(C.brachygnathus)背部上方和腹部下方也发现这两类肌间骨的存在,统称为肌骨杆(Myorhabdoi)。刀鲚个体肌间骨数目范围为492-543,其中髓弓小骨为114-142(=133),椎体小骨为28-51(=42),脉弓小骨为138-153(=142),背上肌骨杆为92-135(=114),腹下肌骨杆为66-98(=89)。采用茜素红与阿利新蓝组织染色观察不同类型肌间骨的组织结构特征,结果显示肌间骨由肌膈结缔组织包被,在髓弓小骨和脉弓小骨两种类型中,肌间骨之间通过结缔组织相互连接。研究在鱼类背上肌骨杆和腹下肌骨杆的发现,是对我国鱼类肌间骨系统进化研究的进一步补充。

关键词：刀鲚肌间骨形态学肌骨杆

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青鱼微卫星标记的开发与特性分析

动物学杂志 2019年第1期54卷 57-65页

作者：王丰张猛沈玉帮徐晓雁王荣泉李家乐上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 苏州市申航生态科技发展股份有限公司农业部大宗淡水鱼类繁育与健康养殖技术重点实验室苏州215221

青鱼(Mylopharyngodon piceus)是中国最为重要的淡水养殖鱼类。开发青鱼的微卫星标记能为青鱼的遗传多样性分析提供更多工具。本研究使用磁珠富集法,利用生物素探针(CA)10和(GACA)6,富集得到青鱼基因组微卫星片段,进一步通过设计微卫星... 详细信息

青鱼(Mylopharyngodon piceus)是中国最为重要的淡水养殖鱼类。开发青鱼的微卫星标记能为青鱼的遗传多样性分析提供更多工具。本研究使用磁珠富集法,利用生物素探针(CA)10和(GACA)6,富集得到青鱼基因组微卫星片段,进一步通过设计微卫星引物检验其在青鱼原种群体中的有效性和多态性水平。结果显示,所构建文库中849个克隆含有微卫星序列,通过利用PCR技术在吴江原种青鱼36个个体中进行多态性筛选,获得了25个多态性微卫星位点。其平均等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为7.08和3.526,平均观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.602和0.619,平均多态信息含量(PIC)为0.568。其中,Mp23、Mp27和Mp35这3个位点极显著偏离哈迪-温伯格平衡(P <0.01)。本研究开发的微卫星标记能为青鱼种质资源的评价和保护等研究提供工具。

关键词：青鱼磁珠富集微卫星引物开发多态性

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团头鲂骨组织细胞系的建立及其生物学特性

水产学报 2018年第4期42卷 513-521页

作者：关柠楠兰天陈宇龙刘莉芳周芬高泽霞华中农业大学水产学院农业部淡水生物繁育重点实验室农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心华中农业大学水产养殖国家级实验教学示范中心池塘健康养殖湖北省工程实验室

为研究鱼类骨组织细胞的特征,实验建立了团头鲂骨组织细胞的体外分离培养方法,并对其生物特性进行了鉴定。以3月龄团头鲂尾椎骨及肋骨为实验材料,利用组织块培养法和胰蛋白消化法分别进行骨组织细胞培养,确定最佳培养条件:采用组织块培... 详细信息

为研究鱼类骨组织细胞的特征,实验建立了团头鲂骨组织细胞的体外分离培养方法,并对其生物特性进行了鉴定。以3月龄团头鲂尾椎骨及肋骨为实验材料,利用组织块培养法和胰蛋白消化法分别进行骨组织细胞培养,确定最佳培养条件:采用组织块培养法,28°C培养,M-199培养基中加入体积分数为20%的胎牛血清、25 ng/m L表皮生长因子EGF和25 ng/m L碱性成纤维生长因子b FGF。细胞生物学特性鉴定结果显示:细胞碱性磷酸酶、钙化结节茜素红染色及矿化结节von Kossa氏法染色均呈阳性,表明所培养的细胞具有典型成骨细胞的生物学活性;鱼骨钙素ELISA试剂盒检测培养细胞中骨钙素含量为997.25 ng/L;荧光定量PCR结果显示特异性调节成骨细胞分化的转录因子runx2a、runx2b和osterix基因在团头鲂骨组织细胞系中均有表达,且runx2b和osterix的表达量显著高于团头鲂肌肉细胞系。利用本方法可获得增殖活性良好,生长速率快,且细胞生物学特性稳定的团头鲂骨组织细胞系(MBCs),为日后鱼类骨组织体外实验研究奠定了基础。

关键词：团头鲂骨组织细胞细胞系基因表达生物学特性