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草鱼野生与选育群体遗传变异微卫星分析

Genetic variability in wild and selected populations of Ctenopharyngodon idella using microsatellite markers

作     者:王沈同 沈玉帮 孟新展 王荣泉 李家乐 WANG Shentong;SHEN Yubang;MENG Xinzhan;WANG Rongquan;LI Jiale

作者机构:上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室 苏州市申航生态科技发展股份有限公司农业部大宗淡水鱼类繁育与健康养殖技术重点实验室 

出 版 物:《水产学报》 (Journal of Fisheries of China)

年 卷 期:2018年第42卷第8期

页      面:1273-1284页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 0830[工学-环境科学与工程(可授工学、理学、农学学位)] 0908[农学-水产] 0707[理学-海洋科学] 09[农学] 0713[理学-生态学] 

基  金:现代农业产业技术体系专项(CARS-45-03) 上海市工程中心提升项目(16DZ2281200)~~ 

主  题:草鱼 选育群体 野生群体 微卫星 遗传变异 

摘      要:为探究经过2个选育世代后选育群体遗传多样性和遗传结构的变化,实验采用多重PCR技术对4个野生草鱼群体(邗江、九江、石首、吴江)和2个选育群体(F1和F2)进行了微卫星序列遗传变异分析。结果显示,6个草鱼群体遗传多样性水平较高,2个选育群体除了平均等位基因数外,其他遗传多样性参数均小于4个野生群体。哈迪—温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)检测显示,在120个群体—位点组合中有62个位点显著偏离哈迪—温伯格平衡,62个群体—位点组合中只有11个组合其近交系数值为负值,其余的51个组合的Fis均为正值。6个草鱼群体AMOVA分析结果显示,3.75%的变异来自于群体间,96.25%的变异来自于群体内,整体的遗传分化指数值为0.038。进一步分析各个群体间Fst,只有石首群体与F1、F2群体之间的Fst大于0.05,处于中等分化,其余群体间分化程度较低,且F2群体与4个野生群体之间Fst比F1群体与4个野生群体之间的Fst大。奈氏标准遗传距离分析结果显示,2个选育群体与野生群体之间的遗传距离大于野生群体之间的遗传距离。基于Dn建立的UPGMA系统发育树得出了相同的结果,即2个选育群体与野生群体之间的亲缘关系比4个野生群体之间的亲缘关系要远。研究表明,经过2个世代选育后,相比4个野生群体,2个选育群体遗传多样性虽有部分下降,但仍处于较高的水平,2个选育群体的遗传结构已发生变化,但其遗传分化程度尚不明显。本研究结果为制定出更加完善有效的选育方案提供了重要参考。

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