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新冠疫情大流行期间广州市H3N2流感病毒分子流行特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第3期58卷 351-357页

作者：曹蓝周腾飞陈艺韵马蒙蒙夏丹刘艳慧李魁彪狄飚秦鹏哲张周斌广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 广州市疾病预防控制中心传染病预防控制部广州510440 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰... 详细信息

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰(阳性率为52.23%),流行强度和持续时间均高于2019年H3N2流感流行期。2022年流行株HA基因和NA基因均属于3C.2a1b.2a.1a.1分支,与2019年冬季的H3N2流行株进化分支(Group-3 毒株3C.2a1b.1a)不同。2022年流行株抗原位点变异主要发生在C区I48T位,HA蛋白受体结合位点与疫苗株一致。大部分流行株在HA蛋白上带有13个糖基化位点,一起暴发疫情分离株发生24-NST处糖基化位点的缺失。综上,新冠疫情大流行期间,引起广州市2022年H3N2流感流行的病毒株属于新衍生进化分支,进化起源上并非由2019年广州市毒株直接传播进化而来。

关键词： H3N2流感病毒分子变异遗传特征新型冠状病毒监测

一种基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法的建立

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中华预防医学杂志 2024年第4期58卷 489-496页

作者：苏文哲李岩陆维智谢华萍李魁彪狄飚聂凯王环宇张周斌许松涛广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 山东省疾病预防控制中心传染病防制所济南250000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

目的:建立基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法。方法:通过NCBI网站检索和下载CHIKV的各基因型序列,经序列比对筛选出备选参考序列,使用Primalscheme和Geneious Prime等软件进行引物方案的设计、筛选和人工优化,并使用7份C... 详细信息

目的:建立基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法。方法:通过NCBI网站检索和下载CHIKV的各基因型序列,经序列比对筛选出备选参考序列,使用Primalscheme和Geneious Prime等软件进行引物方案的设计、筛选和人工优化,并使用7份CHIKV阳性样品对实验流程进行评估。结果:本研究所设计的引物方案可对各阳性样品进行成功扩增;在样品Ct值小于33时,可获得完整编码区序列;样品Ct值达到35时,可获得99.38%的编码区序列;使用多次迭代,逐步校正的拼接策略可将拼接成功率提高5.70%~25.43%。结论:建立的基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法操作简单,对多个浓度的基孔肯雅病毒阳性临床样品均表现良好。

关键词：基孔肯雅病毒全基因组测序多重PCR 高通量测序

2017—2022年北京市某区GⅡ.2［P16］型诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析

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疾病监测 2024年

作者：王彦波赵宇何牧杨艳辉李湛张赫贾楠靖灯节刘盛田彭涛荆红波靳淼中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京市顺义区疾病预防控制中心

目的了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2［P16］诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及标本，应用实时荧光反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）进行诺如病毒检测，阳性样本通过RT... 详细信息

目的了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2［P16］诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及标本，应用实时荧光反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）进行诺如病毒检测，阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析；并获得2022年诺如病毒的3株GII.2[P16]近全基因组序列。结果 2017年1月至2022年12月，共报告诺如病毒暴发137起，83起成功获得基因分型，其中GII.2[P16]占35.04%(48/137)，为主要基因型，其季节高峰在冬春季，主要发生在托幼机构和小学。根据基因组进化结果分析，本研究2022年3株GII.2[P16]基因组在VP1与GII.2[P16]亚群Sub（2019-2022）同属一簇；RdRp区与GII.2[P16]亚群Sub（2018-2022）同属一簇。在非结构蛋白P48出现3个氨基酸变异，包括P44S、M163T和V227I，在RdRp出现一个氨基酸位点变异，为S1645C。结论 GII.2[P16]是2017年1月至2022年12月引起北京市某区诺如病毒疫情的优势流行株，持续监测和基因组分析有助于发现流行株的变异和出现。

关键词：诺如病毒 GⅡ.2[P16] 全基因序列

2019-2020年冬春季麻城市社区季节性流感病毒感染率血清学队列研究

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第3期38卷 311-318页

作者：范津菘占建波陈悦董少波鲁健郭俊峰林小靖蓝雨秦堃周剑芳胡兵徐翠玲中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 湖北省疾病预防控制中心武汉430000 麻城市疾病预防控制中心麻城438300

目的确定社区内有血清学证据的各亚型/系季节性流感病毒感染率,分析影响季节性流感病毒感染的因素。方法在2019年11月(即流感流行季节前)麻城市15个村/街道招募6~59岁居民建立队列,开展横断面基线调查,采集血清,收集人口学及儿童防护知... 详细信息

目的确定社区内有血清学证据的各亚型/系季节性流感病毒感染率,分析影响季节性流感病毒感染的因素。方法在2019年11月(即流感流行季节前)麻城市15个村/街道招募6~59岁居民建立队列,开展横断面基线调查,采集血清,收集人口学及儿童防护知识、行为、态度等信息,在次年7月(即流感流行季节后)进行横断面随访调查,再次采集血清。两次调查配对血清通过血凝抑制(haemagglutination inhibition,HI)试验或微量中和(micro-neutralisation,MN)试验,使用各亚型/系流感病毒流行代表株作为抗原,测定流感病毒特异性抗体,如果抗体有四倍或以上增高,确定为感染。运用单因素和多因素Logistic回归分析感染A(H3N2)、B/Victoria流感病毒的影响因素。结果2019年11月,队列纳入800名研究对象,包括340名6~17岁儿童和460名18~59岁成年人,2020年7月随访到605名研究对象(包括224名儿童、381名成人)并获得了流行季节前后配对血清。25.3%(153/605)的研究对象至少感染过一种亚型/系的季节性流感病毒。儿童各亚型/系流感病毒总感染率为44.2%(95%CI:37.6%~50.8%)显著高于成人的感染率14.1%(95%CI:10.7%~17.7%)。儿童的A(H3N2)流感病毒感染率最高,其次为B/Victoria。流感流行季节前A(H3N2)[OR=0.88(95%CI:0.84~0.93)]、B/Victoria[OR=0.97(95%CI:0.95~0.99)]病毒的MN或HI抗体水平与儿童是否感染该亚型/系流感病毒相关。结论2019—2020冬春季节麻城市6~59岁居民季节性流感病毒感染率较高,近50%的6~17岁儿童感染过季节性流感病毒。流行季节前较高的HI/MN抗体水平可能降低A(H3N2)和B/Victoria流感病毒的感染风险。

关键词：季节性流感队列研究血凝抑制试验抗体滴度

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成人预防接种服务专家共识(2023年版)

中华预防医学杂志 2024年第3期58卷 275-284页

作者：中国健康促进与教育协会余文周张伟燕黄卓英李力栾琳路明霞刘娜刘晓雪郑东不详中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050 山东省疾病预防控制中心免疫预防管理所济南250014 上海市疾病预防控制中心江苏省苏州市疾病预防控制中心河南省疾病预防控制中心清华大学第一附属医院(北京华信医院)

疫苗接种是预防和控制传染病最经济、有效的手段。疫苗接种从儿童拓展到成人,尤其是老年人,是实现全人群、全生命周期健康保护的重要措施之一。本共识从成人预防接种的意义和价值出发,概述国内外成人预防接种现状,总结成人预防接种的有... 详细信息

疫苗接种是预防和控制传染病最经济、有效的手段。疫苗接种从儿童拓展到成人,尤其是老年人,是实现全人群、全生命周期健康保护的重要措施之一。本共识从成人预防接种的意义和价值出发,概述国内外成人预防接种现状,总结成人预防接种的有效经验和做法,并就成人预防接种单位设置、预约管理、工作流程和服务规范,以及成人免疫策略推荐等关键问题提出建议,以期为疾控机构、接种单位及相关机构工作人员提供指导和参考。

关键词：成人预防接种单位疫苗接种专家共识

2017-2022年北京市某区GⅡ.2[P16]型诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析

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疾病监测 2024年第6期39卷 692-698页

作者：王彦波赵宇何牧杨艳辉李湛张赫贾楠靖灯节刘盛田彭涛荆红波靳淼北京市顺义区疾病预防控制中心北京101300 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2[P16]诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及样本,应用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过逆转录PCR扩增、测... 详细信息

目的了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2[P16]诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及样本,应用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过逆转录PCR扩增、测序和序列分析;并获得2022年诺如病毒的3株GⅡ.2[P16]全基因组序列。结果2017年1月至2022年12月,共报告诺如病毒暴发137起,83起成功获得基因分型,其中GⅡ.2[P16]占35.04%(48/137),为主要基因型,其季节高峰在冬春季,主要发生在托幼机构和小学。根据基因组进化结果分析,本研究2022年3株GⅡ.2[P16]基因组在VP1与GⅡ.2[P16]亚群(2019—2022)同属一簇;RdRp区与GⅡ.2[P16]亚群(2018—2022)同属一簇。在非结构蛋白P48出现3个氨基酸变异,包括P44S、M163 T和V227I,在RdRp区出现一个氨基酸位点变异,为S1645C。结论GⅡ.2[P16]是2017年1月至2022年12月引起北京市某区诺如病毒疫情的优势流行株,持续监测和基因组分析有助于全面了解流行株变异和进化机制。

关键词：诺如病毒 GⅡ.2[P16] 全基因序列

江苏省滨海县3~5月龄婴儿接种吸附无细胞百白破联合疫苗后局部不良反应主动监测分析

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中国公共卫生 2024年第2期40卷 139-142页

作者：张鹏梅茂冬于佳魏明伟王小山潘红星吴中区疾病预防控制中心苏州215000 滨海县疾病预防控制中心盐城224500 江苏省疾病预防控制中心南京210000

目的通过对婴儿接种吸附无细胞百白破联合疫苗(diphtheria,tetanus and acellular pertussis combined vaccine,DTaP)后局部不良反应的主动监测,评价婴儿接种DTaP的安全性。方法于2020年7月—2021年3月,对在江苏省滨海县东坎镇、陈涛... 详细信息

目的通过对婴儿接种吸附无细胞百白破联合疫苗(diphtheria,tetanus and acellular pertussis combined vaccine,DTaP)后局部不良反应的主动监测,评价婴儿接种DTaP的安全性。方法于2020年7月—2021年3月,对在江苏省滨海县东坎镇、陈涛镇、界牌镇、滨海现代农业产业园4个乡镇卫生院接种DTaP的3~5月龄婴儿局部不良反应进行主动监测,并按照《预防用疫苗临床试验研究不良事件分级标准指导原则》(2019年第102号)对发生的局部不良反应进行分级,用描述流行病学方法进行局部不良反应分析。结果共有2 490人次纳入至本次DTaP接种后局部不良反应主动监测分析中。DTaP接种后,局部不良反应1 009例次,总发生率为40.52%,其中局部硬结和红晕发生率最高,分别为14.4%和17.0%。1级局部不良反应发生率为35.9%(893/2 490),其中硬结和红晕占比最高,分别占38.18%(341/893)和42.89%(383/893);2级局部不良反应发生率为4.66%(116/2 490),其中红晕和触痛占比最高,分别占34.48%(40/116)和26.72%(31/116);未见3级及以上局部不良反应。局部不良反应多发生在DTaP接种后3d内,占总发生率的98.0%(988/1 009)。硬结和红晕的发生率在3个不同厂家(A、B、C厂家)DTaP受种儿间差异有统计学意义(P 0.05)。结论硬结、红晕和肿胀为3~5月龄婴儿DTaP接种后发生的主要局部不良反应。

关键词：吸附无细胞百白破联合疫苗不良反应主动监测婴儿

福建省南部九龙江漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺及蟹种群多样性调查

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第1期36卷 44-51页

作者：吴文勇罗鋆黄明松蔡茂荣程由注福建省云霄县疾病预防控制中心福建云霄363300 福建省漳州市疾病预防控制中心福建漳州363000 福建省漳州市龙海区疾病预防控制中心福建省疾病预防控制中心

目的调查福建省南部博平岭山脉九龙江、漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺及蟹种群分布,为寄生虫病防治研究和寄生虫资源库样本扩充提供基础资料。方法2020年11月—2023年3月,选择福建省漳州市境内九龙江、漳江和东溪流域8个县(区)23个... 详细信息

目的调查福建省南部博平岭山脉九龙江、漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺及蟹种群分布,为寄生虫病防治研究和寄生虫资源库样本扩充提供基础资料。方法2020年11月—2023年3月,选择福建省漳州市境内九龙江、漳江和东溪流域8个县(区)23个村作为调查点,在每个村居民区附近选择1~3条山涧水沟采集螺、溪蟹标本。根据所采集标本螺壳外部形态特征进行形态学鉴定,并对采集自漳州市云霄县卫氏并殖吸虫病自然疫源地的待定螺种进行线粒体细胞色素氧化酶1(cytochrome oxidase 1,CO1)基因序列分析。观察雄蟹第一腹肢末节形态特征并进行蟹种分类,检测部分调查点螺并殖吸虫尾蚴、蟹并殖吸虫囊蚴感染情况。结果采集自云霄县卫氏并殖吸虫病自然疫源地的待定螺种壳高逾50 mm、壳宽18 mm,壳质厚、坚固,外形呈长塔锥形,有8~10个螺层,经CO1基因序列分析鉴定为海南沟蜷螺。在23个调查点共查见淡水螺6种,隶属3科5属,包括黑贝螺科短沟蜷属放逸短沟蜷、沼蜷属漳州沼蜷、沟蜷属海南沟蜷,盖口螺科拟钉螺亚科拟钉螺属福建拟钉螺和华安拟钉螺,蜷科拟黑螺属瘤拟黑螺。共查见淡水蟹类11种,隶属两科5属,包括溪蟹科华溪属将乐华溪蟹、平和华溪蟹和漳州华溪蟹,华南溪蟹属平肢华南溪蟹和漳州华南溪蟹,南海溪蟹属华安南海溪蟹和龙海南海溪蟹,闽溪蟹属鼻肢闽溪蟹和耳肢闽溪蟹;束腹蟹科束腰蟹属华安束腰蟹和漳浦束腰蟹。漳州市长泰区丹岩村漳州沼蜷和云霄县金坑村海南沟蜷卫氏并殖吸虫尾蚴感染率分别为0.08%(2/2317)和0.09%(1/1039),长泰区丹岩村将乐华溪蟹和云霄县金坑村漳州华溪蟹卫氏并殖吸虫囊蚴感染率分别为25.81%(8/31)和26.31%(5/19)。结论福建省南部九龙江、漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺、蟹具有种群多样性,首次证实漳州沼蜷和海南沟蜷可作为卫氏并殖吸虫第一中间宿主。

关键词：并殖吸虫卫氏并殖吸虫中间宿主淡水螺溪蟹种群多样性福建省

2010—2020年中国大陆副溶血性弧菌引发食源性疾病暴发调查

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中国食品卫生杂志 2024年第1期36卷 73-78页

作者：吴鹏刘继开戴月陈莉莉黄峥梁骏华付萍马洁郭云昌李宁恩施州疾病预防控制中心湖北恩施445000 国家食品安全风险评估中心北京100022 江苏省疾病预防控制中心江苏南京210009 浙江省疾病预防控制中心浙江杭州310051 福建省疾病预防控制中心福建福州350001 广东省疾病预防控制中心广东广州511400 天津市疾病预防控制中心天津300011

目的分析2010—2020年中国大陆副溶血性弧菌引起的食源性疾病暴发事件的流行病学特征,获得其发生时间和地区的分布特点以及引发事件的场所、高危食品和危险因素。方法对我国食源性疾病暴发监测系统收集的2010—2020年副溶血性弧菌引起... 详细信息

目的分析2010—2020年中国大陆副溶血性弧菌引起的食源性疾病暴发事件的流行病学特征,获得其发生时间和地区的分布特点以及引发事件的场所、高危食品和危险因素。方法对我国食源性疾病暴发监测系统收集的2010—2020年副溶血性弧菌引起的食源性疾病暴发资料进行统计分析。结果2010—2020年共上报副溶血性弧菌引起的食源性疾病暴发事件1772起,累计发病27212人,住院5944人,死亡2人。发生高峰时间是7~9月。发达地区发病率(28.8例/百万人)高于不发达地区(8.2例/百万人),沿海地区发病率(31.7例/百万人)高于内陆地区(9.2例/百万人)。病因食品以水产食品(61.2%)、肉类食品(25.3%)为主。发生场所以宾馆饭店占比最高,占49.6%。污染环节主要是烹饪水产食品时未充分烧熟煮透,加工即食肉类食品和蔬菜类食品时生熟交叉污染。结论应重点加强餐饮服务场所中水产食品和肉类食品的加工、储存等环节监管,降低副溶血性弧菌导致食源性疾病发病的风险。

关键词：食源性疾病暴发副溶血性弧菌归因分析