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2017-2022年北京市某区GⅡ.2[P16]型诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析

Molecular epidemiological characteristics of norovirus GⅡ.2[P16]outbreaks in a district of Beijing,2017-2022

作     者:王彦波 赵宇 何牧 杨艳辉 李湛 张赫 贾楠 靖灯节 刘盛田 彭涛 荆红波 靳淼 Wang Yanbo;Zhao Yu;He Mu;Yang Yanhui;Li Zhan;Zhang He;Jia Nan;Jing Dengjie;Liu Shengtian;Peng Tao;Jing Hongbo;Jin Miao

作者机构:北京市顺义区疾病预防控制中心北京101300 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 

出 版 物:《疾病监测》 (Disease Surveillance)

年 卷 期:2024年第39卷第6期

页      面:692-698页

核心收录:

学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基  金:北京市顺义区卫生健康发展科研专项(No.Wsjkfzkyzx-2023-y-04) 北京市高层次公共卫生技术人才建设项目学科骨干培养项目(No.01-026) 

主  题:诺如病毒 GⅡ.2[P16] 全基因序列 

摘      要:目的了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2[P16]诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及样本,应用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过逆转录PCR扩增、测序和序列分析;并获得2022年诺如病毒的3株GⅡ.2[P16]全基因组序列。结果2017年1月至2022年12月,共报告诺如病毒暴发137起,83起成功获得基因分型,其中GⅡ.2[P16]占35.04%(48/137),为主要基因型,其季节高峰在冬春季,主要发生在托幼机构和小学。根据基因组进化结果分析,本研究2022年3株GⅡ.2[P16]基因组在VP1与GⅡ.2[P16]亚群(2019—2022)同属一簇;RdRp区与GⅡ.2[P16]亚群(2018—2022)同属一簇。在非结构蛋白P48出现3个氨基酸变异,包括P44S、M163 T和V227I,在RdRp区出现一个氨基酸位点变异,为S1645C。结论GⅡ.2[P16]是2017年1月至2022年12月引起北京市某区诺如病毒疫情的优势流行株,持续监测和基因组分析有助于全面了解流行株变异和进化机制。

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