2017—2022年北京市某区GⅡ.2[P16]型诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析
作者机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 北京市顺义区疾病预防控制中心
出 版 物:《疾病监测》 (Disease Surveillance)
年 卷 期:2024年
核心收录:
学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学]
基 金:北京市顺义区卫生健康发展科研专项(No.Wsjkfzkyzx-2023-y-04) 北京市高层次公共卫生技术人才建设项目学科骨干培养项目(No.01-026)
摘 要:目的 了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2[P16]诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法 收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及标本,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析;并获得2022年诺如病毒的3株GII.2[P16]近全基因组序列。结果 2017年1月至2022年12月,共报告诺如病毒暴发137起,83起成功获得基因分型,其中GII.2[P16]占35.04%(48/137),为主要基因型,其季节高峰在冬春季,主要发生在托幼机构和小学。根据基因组进化结果分析,本研究2022年3株GII.2[P16]基因组在VP1与GII.2[P16]亚群Sub(2019-2022)同属一簇;RdRp区与GII.2[P16]亚群Sub(2018-2022)同属一簇。在非结构蛋白P48出现3个氨基酸变异,包括P44S、M163T和V227I,在RdRp出现一个氨基酸位点变异,为S1645C。结论 GII.2[P16]是2017年1月至2022年12月引起北京市某区诺如病毒疫情的优势流行株,持续监测和基因组分析有助于发现流行株的变异和出现。