2017—2022年北京市某区GⅡ.2［P16］型诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析

作     者：王彦波 赵宇 何牧 杨艳辉 李湛 张赫 贾楠 靖灯节 刘盛田 彭涛 荆红波 靳淼 

作者机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 北京市顺义区疾病预防控制中心 

出 版 物：《疾病监测》 (Disease Surveillance)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：北京市顺义区卫生健康发展科研专项(No.Wsjkfzkyzx-2023-y-04) 北京市高层次公共卫生技术人才建设项目学科骨干培养项目(No.01-026) 

主　　题：诺如病毒 GⅡ.2[P16] 全基因序列 

摘      要：目的 了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2［P16］诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法 收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及标本，应用实时荧光反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）进行诺如病毒检测，阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析；并获得2022年诺如病毒的3株GII.2[P16]近全基因组序列。结果 2017年1月至2022年12月，共报告诺如病毒暴发137起，83起成功获得基因分型，其中GII.2[P16]占35.04%(48/137)，为主要基因型，其季节高峰在冬春季，主要发生在托幼机构和小学。根据基因组进化结果分析，本研究2022年3株GII.2[P16]基因组在VP1与GII.2[P16]亚群Sub（2019-2022）同属一簇；RdRp区与GII.2[P16]亚群Sub（2018-2022）同属一簇。在非结构蛋白P48出现3个氨基酸变异，包括P44S、M163T和V227I，在RdRp出现一个氨基酸位点变异，为S1645C。结论 GII.2[P16]是2017年1月至2022年12月引起北京市某区诺如病毒疫情的优势流行株，持续监测和基因组分析有助于发现流行株的变异和出现。