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机器学习预测乳腺癌新辅助治疗后炎症代谢状态改变的模型评价

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第9期44卷 1169-1181页

作者：吴其蓁刘启明柴烨子陶政宇王依楠郭欣宁姜萌卜军上海交通大学医学院附属仁济医院心内科上海200127

目的·通过机器学习方法,采用临床常见实验室指标及心脏彩色多普勒超声指标,在乳腺癌患者中探究早期识别并预测新辅助治疗后发生与代谢状态改变相关的心血管疾病高风险患者的方案。方法·连续入选2020年9月—2022年9月在上海交通大学医... 详细信息

目的·通过机器学习方法,采用临床常见实验室指标及心脏彩色多普勒超声指标,在乳腺癌患者中探究早期识别并预测新辅助治疗后发生与代谢状态改变相关的心血管疾病高风险患者的方案。方法·连续入选2020年9月—2022年9月在上海交通大学医学院附属仁济医院乳腺外科确诊的原发性浸润性乳腺癌女性患者。收集并记录患者的一般情况、实验室检查结果及心脏彩色多普勒超声结果。经过特征提取后,分别应用梯度增强(gradient boost,GB)、支持向量机(support vector machine,SVM)、决策树(decision tree,DT)、K-近邻(K-nearest neighbour,KNN)及随机森林(random forest,RF)5种机器学习方法构建新辅助治疗后患者炎症代谢状态改变预测模型,并比较5种模型的预测性能。结果·最终纳入232例有效临床数据,其中135例为新辅助治疗前,97例为完成4个周期的新辅助治疗后。特征提取筛选出白细胞计数、血红蛋白、高密度脂蛋白、白细胞介素-2受体和白细胞介素-8这5项特征。在多特征分析中,白细胞计数+血红蛋白+高密度脂蛋白的受试者操作特征曲线下面积高于白细胞介素-2受体+白细胞介素-8(RF:0.928 vs 0.772;GB:0.900 vs 0.792;SVM:0.941 vs 0.764;KNN:0.907 vs 0.762;DT:0.799 vs 0.714),并且在RF、SVM、GB模型中的曲线下面积(0.928、0.941、0.900)及准确率(0.914、0.897、0.776)较高;与RF、GB模型(P=0.122,P=0.097)相比,SVM模型在训练集数据上校准度较好(P=0.394)。结论·SVM模型可通过纳入白细胞计数、血红蛋白、高密度脂蛋白、白细胞介素-2受体、白细胞介素-8这5项临床常见指标,在乳腺癌患者中建立早期预测新辅助治疗后代谢状态改变相关心血管疾病风险的预测模型,可能有助于临床上建立基于患者炎症代谢状态的个体化筛查方案。

关键词：乳腺癌新辅助治疗机器学习支持向量机

中度与重度寻常痤疮患者非皮损区毛囊菌群分析:一项单中心横断面研究

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第9期44卷 1094-1103页

作者：梁梦晨李嘉祺吴心怡莫小辉鞠强上海交通大学医学院附属仁济医院皮肤科上海200127

目的·研究中度、重度寻常痤疮患者与健康者非皮损区毛囊菌群群落结构和载量的差异,探讨微生物与寻常痤疮及其严重程度之间的关系。方法·采用横断面研究,选取2022年8月—2023年8月在上海交通大学医学院附属仁济医院皮肤科就诊的中度、... 详细信息

目的·研究中度、重度寻常痤疮患者与健康者非皮损区毛囊菌群群落结构和载量的差异,探讨微生物与寻常痤疮及其严重程度之间的关系。方法·采用横断面研究,选取2022年8月—2023年8月在上海交通大学医学院附属仁济医院皮肤科就诊的中度、重度寻常痤疮(简称痤疮)患者和健康志愿者。取中度、重度痤疮患者及健康志愿者面部非皮损区毛囊内容物进行16S rRNA高通量测序以及实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qPCR)检测,分析不同严重程度痤疮患者毛囊细菌菌群多样性、物种组成差异和菌群载量差异。结果·纳入10例中度痤疮患者、11例重度痤疮患者及11例健康志愿者,3组间年龄、性别等一般资料差异均无统计学意义。中度痤疮组和重度痤疮组相对于健康组细菌α多样性均显著下降(P=0.020,P=0.013)。主坐标分析(principal coordinates analysis,PCoA)图表明健康组人群样本分布较为集中,组内差异较小,而中度痤疮组及重度痤疮组人群样本分布有一定的趋势但较为离散,组内之间存在较大差异。3组样本趋势分布差异明显,组间微生物群落结构差异较大。相似性分析结果显示健康组与中度痤疮组(P=0.027)、健康组与重度痤疮组(P=0.017)组间β多样性有显著差异,物种组成相似度低。中度痤疮组与重度痤疮组(P=0.160)组间物种相似度较高。门水平上3组的优势菌群均为放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)以及拟杆菌门(Bacteroidetes)。属水平上健康组优势菌为丙酸杆菌属(Propionibacterium)、未分类的放线菌属(unclassified Actinomycetales),2组痤疮组优势菌均为葡萄球菌属(Staphylococcus)、丙酸杆菌属。相对于健康组,中度痤疮组和重度痤疮组非皮损区毛囊中的葡萄球菌属相对丰度均显著增加(P=0.010,P=0.019),毛囊菌群载量均显著增加(均P=0.001)。与中度痤疮组相比,重度痤疮组毛囊样本中细菌载量显著升高(P=0.017)。结论·中度、重度痤疮患者与健康者非皮损区毛囊微生物群落结构不同,痤疮组微生物多样性明显下降。中度痤疮组及重度痤疮组非皮损区毛囊中的葡萄球菌属相对丰度较健康组均显著增加。随着痤疮严重程度的增加,非皮损区毛囊内细菌载量显著增加。研究提示痤疮的发生以及严重程度可能与毛囊菌群的群落结构和载量有关。

关键词：寻常痤疮毛囊菌群葡萄球菌属细菌载量

一起重症监护病房疑似耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌医院感染暴发调查

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上海预防医学 2024年第5期36卷 435-438页

作者：黄妹桂晓波杨亚陆峰秦娟秀厉燕张舒宜周文琴傅小芳班海群上海交通大学医学院附属仁济医院上海200127

【目的】对重症监护病房(ICU)发生的一起疑似耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)医院感染暴发事件进行分析,为多重耐药菌医院感染防控提供参考。【方法】收集2021年11月仁济医院综合ICU发生的4例CRAB感染患者的临床资料、流行病学史、环境... 详细信息

【目的】对重症监护病房(ICU)发生的一起疑似耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)医院感染暴发事件进行分析,为多重耐药菌医院感染防控提供参考。【方法】收集2021年11月仁济医院综合ICU发生的4例CRAB感染患者的临床资料、流行病学史、环境卫生学监测和多位点序列分型(MLST)数据,进行回顾性分析。【结果】共发生4例CRAB肺部感染,其中1例病例为社区获得性感染,3例为医院获得性感染,分离的菌株耐药性相同,且均属于ST368型。40个物体表面和医务人员手样本中,在首发病例的输液架和床旁的回风口滤网检出CRAB共2株,检出率为5%。在采取集中隔离CRAB感染患者、改进环境清洁消毒流程、加强手卫生、加强人员管理和培训及督导等措施后,未再发生同类CRAB感染病例。【结论】此次疑似CRAB医院感染暴发可能与环境清洁消毒不彻底及手卫生执行不到位有关。及时识别和调查,采取有针对性的整改措施是控制医院感染暴发的关键。

关键词：重症监护病房耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌暴发控制

建立腰椎动静力不稳山羊模型用于椎间盘退变研究

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重庆医科大学学报 2024年第4期49卷 376-383页

作者：陈致介周志田子扬王震炜李展春上海交通大学医学院附属仁济医院骨科上海200127 上海交通大学医学院附属仁济医院检验科上海200127

目的:建立有应用价值的腰椎动静力不稳的山羊模型,模拟人体局部因素的影响和病理生理的应力负荷对椎间盘退变(intervertebral disc degeneration,IVDD)的作用。方法:通过腰椎动静力不稳手术(lumbar dynamic and static instability,LDSI... 详细信息

目的:建立有应用价值的腰椎动静力不稳的山羊模型,模拟人体局部因素的影响和病理生理的应力负荷对椎间盘退变(intervertebral disc degeneration,IVDD)的作用。方法:通过腰椎动静力不稳手术(lumbar dynamic and static instability,LDSI)破坏山羊脊柱的后柱结构,包括离断竖脊肌、背阔肌、腰最长肌、棘肌等破坏腰椎动态力学稳定,离断腰椎棘突、棘上韧带、棘间韧带等破坏腰椎静态力学稳定,使腰椎产生动态力和静态力的失衡,造成脊柱后柱稳定性的丧失。以生物力学稳定性为突破点,而不破坏椎间盘结构的完整性,建立腰椎动静力不稳的山羊模型,并通过52周的术后随访,利用腰椎X线片、磁共振以及组织病理学变化等技术手术评估山羊的椎间盘高度指数(disc height index,DHI),Pfirrmann MRI分级和Masuda组织学评分等。结果:LDSI组山羊腰椎的DHI在术前0周(0.184±0.015),术后26周(0.105±0.006)和术后52周(0.075±0.007)存在差异(0周vs.26周,P<0.05;26周vs.52周,P<0.05)。LDSI组山羊腰椎的Pfirrmann分级在术前0周(1.167±0.408),术后26周(2.333±0.516)和术后52周(3.667±0.817)存在差异(0周vs.26周,P<0.05;26周vs.52周,P<0.05)。LDSI组山羊腰椎的Masuda组织学评分在术前0周(3.500±0.577),术后26周(6.250±0.957)和术后52周(8.000±0.816)存在差异(0周vs.26周,P<0.05;26周vs.52周,P<0.05)。结论:LDSI能够造成山羊椎间盘高度降低、终板边界模糊和含水量降低,在不破坏椎间盘结构完整的基础上模拟了人体长期反复劳损而导致的IVDD,更符合人体实际,有助于其发病机制的研究。

关键词：椎间盘退变山羊模型腰椎动静力不稳

低氧诱导的长链非编码RNA 68在肝癌中的功能及其作用机制

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第6期44卷 702-712页

作者：谭露沈少明何平上海交通大学基础医学院病理生理学系上海200025 上海交通大学医学院附属仁济医院衰老与组织修复研究院上海200240 上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所上海200240

目的·探究肝癌细胞系中受低氧诱导的长链非编码RNA 68(hypoxia-induced long non-coding RNA 68,HILRNA68)的功能以及其相关机制。方法·利用长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)芯片研究低氧(hypoxia)与常氧(normoxia)分别处理12 h的肝癌细胞系SMMC-7721中表达变化的lncRNA,通过R语言DEseq2程序包分析低氧下表达显著变化的lncRNA,并利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)验证差异lncRNA。通过短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)稳定敲除细胞内的低氧诱导因子(hypoxia inducible factors,HIFs)用以研究低氧下HILRNA68转录是否受HIFs的调控。通过细胞核浆分离,结合qRT-PCR检测以及RNA荧光原位杂交技术(RNA fluorescence in situ hybridization,RNA-FISH)实验研究HILRNA68的亚细胞定位。通过小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)分别在SMMC-7721和MHCC-97H细胞中敲低HILRNA68以研究其在低氧下的细胞功能。通过细胞生长计数实验以及Transwell细胞侵袭实验分别探究低氧下HILRNA68对肝癌细胞的生长增殖以及侵袭转移能力的影响。此外,通过双荧光素酶报告基因实验研究敲低HILRNA68后是否抑制HIF1α的转录活性。结果·通过对lncRNA芯片的结果进行差异基因分析,共得到247个升高和17个降低的lncRNA[定义为倍数变化(fold change)≥4,伪发现率(false discovery rate,FDR)≤0.05]。在差异基因中发现HILRNA68在多个经低氧处理的细胞系中均稳定升高约10倍。低氧下敲低HIF1α、HIF2α、HIF1β均显著抑制HILRNA68的升高(均P<0.05),荧光素酶报告基因实验表明其转录受到HIFs的调控。亚细胞定位研究表明HILRNA68主要定位于细胞核。细胞功能实验结果表明敲低HILRNA68显著抑制肝癌细胞SMMC-7721与MHCC-97H在低氧下的增殖以及侵袭能力(均P<0.05)。机制研究表明,敲低HILRNA68显著抑制低氧下HIF1α的转录活性(P<0.05);HIF1α靶基因在低氧下的升高在敲低HILRNA68后被显著抑制(P<0.05)。结论·研究鉴定出一批低氧下表达显著变化的lncRNA,并功能注释了其中升高的HILRNA68。HILRNA68受HIFs调控而升高,升高后促进细胞低氧下的增殖以及侵袭转移能力;机制上,HILRNA68低氧下表达升高后促进HIF1α的转录活性。

关键词：低氧低氧诱导因子长链非编码RNA 细胞增殖细胞侵袭 TCONS_00027424

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儿童及青少年甲状腺癌远处转移诊治策略

中国实用外科杂志 2024年第6期44卷 669-673页

作者：王卓颖邱茗钱凯上海交通大学医学院附属仁济医院头颈外科上海200127

儿童及青少年甲状腺癌发病率近年来呈上升趋势。与成人相比,儿童及青少年甲状腺癌具有更高的恶性程度、远处转移和复发风险。远处转移的诊断和治疗是临床医疗中至关重要的环节。儿童及青少年甲状腺癌远处转移的危险因素包括放射线暴露... 详细信息

儿童及青少年甲状腺癌发病率近年来呈上升趋势。与成人相比,儿童及青少年甲状腺癌具有更高的恶性程度、远处转移和复发风险。远处转移的诊断和治疗是临床医疗中至关重要的环节。儿童及青少年甲状腺癌远处转移的危险因素包括放射线暴露、年龄、基因改变和病理学类型。诊断远处转移需要准确诊断原发病,包括临床分期、病理学类型和分子学诊断等。对于有放射线暴露史、家族史、遗传易感性和基因改变的高风险病人,应重点筛查远处转移情况。甲状腺球蛋白(Tg)检测和放射性核素扫描检查是评估肿瘤持续存在或复发的重要辅助检查。其治疗策略包括外科治疗、放射性碘(RAI)治疗、促甲状腺激素(TSH)抑制治疗及Tg水平监测、靶向治疗以及长期管理。与成人相比,儿童及青少年甲状腺癌病人的长期预后更好,即使发生远处转移,生存期也较长。因此,完善儿童及青少年甲状腺癌的诊治策略以提高病人生活质量显得尤为重要。动态风险分层对该病的长期管理和预后评估具有重要意义。此外,术后甲状旁腺功能减退的防治、病人的心理健康和生活质量也需要得到关注。

关键词：儿童青少年甲状腺癌远处转移

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慢性肾脏病患者不良妊娠结局的危险因素分析

上海交通大学学报（医学版） 2024年第5期44卷 560-566页

作者：李玉张羽上海交通大学医学院附属仁济医院妇产科上海200127 苏州大学附属第一医院妇产科苏州215000

目的·通过对妊娠合并慢性肾脏病患者临床资料和不良妊娠结局的相关性分析,寻找导致不良妊娠结局的危险因素。方法·纳入2017年1月1日-2021年12月31日在上海交通大学医学院附属仁济医院规范产检、在该院分娩且出院诊断为妊娠合并慢性肾... 详细信息

目的·通过对妊娠合并慢性肾脏病患者临床资料和不良妊娠结局的相关性分析,寻找导致不良妊娠结局的危险因素。方法·纳入2017年1月1日-2021年12月31日在上海交通大学医学院附属仁济医院规范产检、在该院分娩且出院诊断为妊娠合并慢性肾脏病的单胎孕产妇,采集孕20周前的临床资料。根据妊娠结局将研究对象分为不良妊娠结局组(研究组)和良好妊娠结局组(对照组)。比较2组孕产妇的临床资料、实验室检验结果、妊娠结局,分析导致不良妊娠结局的危险因素。结果·共收集了359例孕产妇的临床资料,排除双胎妊娠6例,余353例患者纳入研究。其中230例妊娠未出现相关母婴并发症,纳入对照组;123例妊娠发生了不良母婴结局,纳入研究组。研究组(1次妊娠可发生多种不良妊娠结局)包括子痫前期69例(含重度子痫前期43例)、急性肾损伤29例、早产69例、小于孕龄儿34例、低出生体质量儿46例、新生儿入住重症监护病房41例、孕20周后胎儿丢失或新生儿死亡7例。2组孕产妇在年龄、体质量指数、孕次、产次间差异均无统计学意义。慢性肾脏病患者中,妊娠20周前合并慢性高血压(OR=3.385,95%CI 1.115~10.726,P=0.031)、血肌酐超过60μmol/L(OR=2.828,95%CI 1.439~5.557,P=0.003)、24 h蛋白尿≥0.3 g(OR=2.234,95%CI 1.122~4.448,P=0.022)、狼疮肾炎(OR=4.917,95%CI=1.967~12.290,P=0.001)患者发生不良妊娠结局的风险显著升高。联合4项指标预测慢性肾脏病孕妇发生不良妊娠结局的ROC曲线下面积为0.759,敏感度为52.8%,特异度为84.2%。结论·孕20周前合并慢性高血压、24 h尿蛋白超过0.3 g、血肌酐超过60μmol/L、肾炎类型为狼疮肾炎是慢性肾脏病患者发生不良妊娠结局的独立危险因素,4项指标联合对不良妊娠结局有较好的预测价值。

关键词：妊娠慢性肾脏病不良妊娠结局危险因素

上海市浦东新区三甲医院出院老年患者医院-家庭过渡期护理服务需求及支付意愿研究

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医学与社会 2024年第6期37卷 23-29页

作者：张呈蕊栾伟上海交通大学护理学院上海200025 上海中医药大学附属曙光医院护理部上海201203

目的:调查上海市浦东新区三甲医院出院老年患者医院-家庭过渡期护理服务需求及支付意愿,为今后制定医院-家庭过渡期护理服务的收费、报销方式提供参考。方法:采用分层随机抽样法对上海市浦东新区三甲医院380名出院老年患者进行问卷调查... 详细信息

目的:调查上海市浦东新区三甲医院出院老年患者医院-家庭过渡期护理服务需求及支付意愿,为今后制定医院-家庭过渡期护理服务的收费、报销方式提供参考。方法:采用分层随机抽样法对上海市浦东新区三甲医院380名出院老年患者进行问卷调查,统计描述医院-家庭过渡期护理服务需求和支付意愿、可接受的支付金额及报销比例,运用logistic回归对可接受的支付金额进行影响因素分析。结果:出院老年患者对医院-家庭过渡期护理服务需求高,大多(95.3%)有支付意愿,可接受的支付金额为251.89元/月、37.30元/项,可接受的报销比例为每月24.79%、每项33.75%。可接受的支付金额主要受到慢性病患病情况、医疗资源空间距离、家庭对医疗决策的影响程度等因素的影响。结论:上海市浦东新区三甲医院的多数出院老年患者存在医院-家庭过渡期护理服务需求。出院老年患者可接受的支付金额偏低,应进一步深入卫生经济学研究来为日后医院-家庭过渡期护理服务的收费提供标准。

关键词：过渡期护理服务需求支付意愿浦东新区

不孕(育)症夫妻二元应对异质性研究及相关因素分析

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第6期44卷 746-754页

作者：奚慧琴田梅梅谢雷徐于睿黄欣徐颖章雅青上海交通大学医学院附属仁济医院护理部上海200127 上海交通大学护理学院上海200025

目的·采用潜在剖面分析法探索辅助生殖技术(assisted reproductive technology,ART)治疗前不孕(育)症夫妻二元应对水平的潜在剖面,并探讨不同剖面间的差异及相关因素。方法·招募2023年9月至11月在上海交通大学医学院附属仁济医院生殖... 详细信息

目的·采用潜在剖面分析法探索辅助生殖技术(assisted reproductive technology,ART)治疗前不孕(育)症夫妻二元应对水平的潜在剖面,并探讨不同剖面间的差异及相关因素。方法·招募2023年9月至11月在上海交通大学医学院附属仁济医院生殖医学中心接受ART治疗的不孕(育)症初诊夫妇,应用一般资料问卷、生育压力量表(Fertility Problem Inventory,FPI)、二元应对评估工具(Dyadic Coping Inventory,DCI)、生育生活质量量表(Fertility Quality of Life Tool,FertiQoL量表)进行评估。采用潜在剖面分析探索不孕(育)症夫妻治疗前二元应对的剖面类型,比较不同剖面之间的一般特征,及FPI和FertiQoL量表得分;采用多元Logistic回归分析不同二元应对剖面的相关因素。结果·共纳入257对不孕(育)症夫妻,女性平均年龄(30.15±3.07)岁,男性平均年龄(31.82±3.82)岁,平均婚龄(3.75±2.16)年,平均不孕(2.90±1.92)年;男方导致不孕118对、女方导致不孕109对、男女共患不孕(育)症30对;男性DCI平均得分(128.25±19.15)分,女性(129.91±18.32)分。根据二元应对水平,257对夫妻可分为4个潜在剖面:共同积极组(153对,59.5%)、共同消极组(85对,33.1%)、男方积极组(12对,4.7%)及男方消极组(7对,2.7%);不同剖面不孕(育)症夫妻的年龄、FPI得分、FertiQoL量表得分、再婚比例间差异均具有统计学意义(均P<0.05)。多元Logistic回归分析结果显示,以共同积极组为参照,共同消极组的男方年龄更大(OR=1.122,95%CI 1.004~1.254,P=0.036)、男女双方FPI得分更高(男:OR=1.019,95%CI 1.003~1.035,P=0.018;女:OR=1.020,95%CI 1.004~1.036,P=0.015)、男方FertiQoL量表得分更低(OR=0.966,95%CI 0.937~0.996,P=0.029)。结论·接受ART治疗前不孕(育)症夫妻的二元应对水平可分为4个剖面类型;与共同积极应对夫妻相比,男性生育压力大、年龄大、感知的生育生活质量低,以及女性生育压力大均是夫妻共同消极应对的危险因素。

关键词：二元应对不孕(育)症潜在剖面分析生育压力量表生育生活质量量表