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基于mrna-seq技术分析猪瘟兔化弱毒株感染家兔后脾脏转录组学变化

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黑龙江畜牧兽医 2021年第7期 6-13页

作者：邓玲聪廖青邓吉平纪佳雨袁露露许道军湖南农业大学动物医学院湖南长沙410128 中国科学院深圳先进技术研究院生物医药与技术研究所广东深圳518055

为了探究猪瘟兔化弱毒株(Chinese strain, C株)在家兔体内的病毒清除机制,试验以新西兰兔为材料,适应性喂养7 d后随机分为3组,即1个对照组和2个试验组,每组6只。2个试验组家兔分别在感染C株后第5天和第9天耳缘静脉注射空气处死,取出脾脏... 详细信息

为了探究猪瘟兔化弱毒株(Chinese strain, C株)在家兔体内的病毒清除机制,试验以新西兰兔为材料,适应性喂养7 d后随机分为3组,即1个对照组和2个试验组,每组6只。2个试验组家兔分别在感染C株后第5天和第9天耳缘静脉注射空气处死,取出脾脏,获得T1和T2样本,采用TRIzol法提取脾脏总RNA,利用mrna-seq技术对家兔脾脏进行转录组测序与分析,以正常家兔基因组为参考,筛选出差异表达基因并进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析,并利用实时荧光定量PCR方法对部分差异基因进行验证。结果表明:与对照组相比,感染C株后T1样本获得的上调基因和下调基因分别有61个和25个,T2样本分别有22个和8个。T1样本差异基因映射到109个GO条目,T2样本差异基因映射到61个GO条目,T1和T2样本差异基因均富集到代谢过程和细胞进程。T1样本差异基因主要富集在趋化因子信号通路、细胞因子与其受体通路、细胞周期通路、RIG-Ⅰ样受体信号通路和Toll样受体信号通路,T2样本差异基因主要富集在精氨酸和脯氨酸代谢通路、维生素B6代谢通路以及钙信号通路。实时荧光定量PCR验证结果与mrna-seq技术的分析结果基本一致。说明家兔感染C株后,T1样本主要通过免疫反应抵抗、清除病毒,T2样本主要通过细胞代谢相关基因的调控来恢复机体细胞的正常功能。

关键词：猪瘟兔化弱毒株脾脏 mrna-seq 转录组分析 GO功能富集分析 KEGG信号通路分析

两种体色乌鳢感染嗜水气单胞菌后免疫指标及mrna-seq的比较分析

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两种体色乌鳢感染嗜水气单胞菌后免疫指标及mRNA-seq的比较分析

作者：孙卓琳华南农业大学

学位级别：硕士

为对比分析普通乌鳢和白甲乌鳢的免疫应答差异情况,本文对普通乌鳢(对照组(B-PBS)和处理组(B-Ah))和白甲乌鳢(对照组(W-PBS)和处理组(W-Ah))进行了嗜水气单胞菌感染试验。B-PBS和W-PBS组注射100μl PBS,B-Ah和W-Ah组注射同体积3.6×10 C... 详细信息

为对比分析普通乌鳢和白甲乌鳢的免疫应答差异情况,本文对普通乌鳢(对照组(B-PBS)和处理组(B-Ah))和白甲乌鳢(对照组(W-PBS)和处理组(W-Ah))进行了嗜水气单胞菌感染试验。B-PBS和W-PBS组注射100μl PBS,B-Ah和W-Ah组注射同体积3.6×10 CFU/ml的嗜水气单胞菌菌液,分别统计各组死亡率,分析了血浆生化指标和肠道的组织形态变化,以及免疫相关基因的表达情况;并且利用转录组技术,分析了两种体色乌鳢免疫应答差异。试验结果如下:(1)注射3.6×10CFU/m L的嗜水气单胞菌后,B-PBS和W-PBS组均未出现死亡,W-Ah和B-Ah组死亡率表现出先上升后下降的趋势,在24 h死亡率最大,且W-Ah组的死亡率高于B-Ah组。(2)血浆中丙二醛(MDA)含量在B-Ah和W-Ah组表现出先升高后下降的趋势,而超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)则相反。与W-PBS组相比,W-Ah组MDA在3 h、12 h、24 h差异显著(P<0.05),W-Ah组SOD含量在6 h至96 h差异显著(P<0.05),W-Ah组血浆中T-AOC含量在6 h至48 h差异显著(P<0.05)。与B-PBS组相比,B-Ah组血浆中MDA和T-AOC含量在12 h差异显著(P<0.05),B-Ah组血浆中SOD含量在24 h至96 h差异显著(P<0.05)。(3)B-PBS和W-PBS组肠道绒毛结构完整。B-Ah和W-Ah组第24 h时肠道绒毛均出现破溃、脱落现象。在24 h和96 h,W-Ah组较B-Ah组肠道绒毛长度和密度较小。(4)B-Ah和W-Ah组IL-1β,IL-8表达呈现上调的趋势,而IL-10表达呈下调的趋势。肠道变化趋势同肝脏变化趋势基本一致。与W-PBS组相比,肝脏中IL-1β和IL-8在W-Ah组3 h至48 h均显著增加(P<0.05),IL-10在W-Ah组6 h至48 h均差异显著(P<0.05),W-Ah组皮肤中IL-1β在3 h显著增加(P<0.05),IL-8和IL-10在3 h、6 h差异显著(P<0.05)。与B-PBS组相比,B-Ah组肝脏中IL-1β和IL-8和IL-10的表达量12 h和24 h差异显著(P<0.05),B-Ah组皮肤中IL-1β、IL-8和IL-10在3 h差异显著(P<0.05)。(5)通过对白甲乌鳢和普通乌鳢肝脏转录组数据分析,发现感染嗜水气单胞菌感染后白甲乌鳢和普通乌鳢的差异基因在免疫系统中主要富集在“补体和凝血级联”。综上所述:嗜水气单胞菌感染后,白甲乌鳢受到的氧化应激、肠道损伤和炎性反应均比普通乌鳢严重,且抗氧化能力较低。猜测白甲乌鳢和普通乌鳢免疫应答的差异是由于细胞过程中的补体系统控制的。研究结果可为鳢类的健康养殖和疾病防控提供一定的理论参考,也为我国优良珍稀品种的保育、开发利用提供技术支持。

关键词：乌鳢嗜水气单胞菌免疫指标基因表达 mrna-seq

利用mrna-seq和Ribo-seq技术研究低氧条件下SW620细胞的基因表达特征

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湖北师范大学学报（自然科学版） 2021年第4期41卷 30-37页

作者：梅勇梁绮华邓载安汪劲松湖北师范大学生命科学学院食用野生植物保育与利用湖北省重点实验室湖北黄石435002 深圳技术大学健康与环境工程学院深圳坪山518118

低氧是结直肠癌肿瘤组织的重要特征和结直肠癌预后不良的重要因素。然而,低氧如何调控直肠癌细胞的基因表达机制仍待深入分析。通过转录组学和翻译组学联合分析揭示了低氧条件下基因表达特征。首先利用化合物CoCl 2处理SW620细胞成功模... 详细信息

低氧是结直肠癌肿瘤组织的重要特征和结直肠癌预后不良的重要因素。然而,低氧如何调控直肠癌细胞的基因表达机制仍待深入分析。通过转录组学和翻译组学联合分析揭示了低氧条件下基因表达特征。首先利用化合物CoCl 2处理SW620细胞成功模拟了低氧条件。然后利用mrna-seq和Ribo-seq分析发现,许多基因的转录和翻译会受低氧条件影响,且多个肿瘤相关的信号通路中的基因翻译效率也受低氧调控。另外,利用real-time PCR和Western blot技术对部分低氧调控的基因表达进行了验证。从新的角度阐明低氧调控肿瘤相关基因表达特征,有助于弄清直结肠癌的发生机制。

关键词： SW620 低氧 HIF1-α mrna-seq Ribo-seq

Forebrain excitatory neuron-specific loss of Brpf1 attenuates excitatory synaptic transmission and impairs spatial and fear memory

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Neural Regeneration Research 2024年第5期19卷 1133-1141页

作者： Baicheng Zhao Hang Zhang Ying Liu Gaoyu Zu Yuxiao Zhang Jiayi Hu Shuai Liu Linya You Department of Human Anatomy&Histoembryology School of Basic Medical SciencesFudan UniversityShanghaiChina Shanghai Key Laboratory of Brain Functional Genomics(Ministry of Education) Affiliated Mental Health Center(ECNU)School of Psychology and Cognitive ScienceEast China Normal UniversityShanghaiChina Shanghai Changning Mental Health Center ShanghaiChina NYU-ECNU Institute of Brain and Cognitive Science at NYU Shanghai ShanghaiChina Key Laboratory of Medical Imaging Computing and Computer Assisted Intervention of Shanghai ShanghaiChina

Bromodomain and plant homeodomain(PHD)finger containing protein 1(Brpf1)is an activator and scaffold protein of a multiunit complex that includes other components involving lysine acetyltransferase(KAT)6A/6B/***1,KAT6A,and KAT6B mutations were identified as the causal genes of neurodevelopmental disorders leading to intellectual *** previous work revealed strong and specific expression of Brpf1 in both the postnatal and adult forebrain,especially the hippocampus,which has essential roles in learning and ***,we hypothesized that Brpf1 plays critical roles in the function of forebrain excitatory neurons,and that its deficiency leads to learning and memory *** test this,we knocked out Brpf1 in forebrain excitatory neurons using *** found that Brpf1 deficiency reduced the frequency of miniature excitatory postsynaptic currents and downregulated the expression of genes Pcdhgb1,Slc16a7,Robo3,and Rho,which are related to neural development,synapse function,and memory,thereby damaging spatial and fear memory in *** findings help explain the mechanisms of intellectual impairment in patients with BRPF1 mutation.

关键词： behavioral test Brpf1 CAMKIIa-Cre intellectual disability miniature excitatory postsynaptic current mrna-seq

Hunt for the tipping point during endocrine resistance process in breast cancer by dynamic network biomarkers

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Journal of Molecular Cell Biology 2019年第8期11卷 649-664页

作者： Rui Liu Jinzeng Wang Masao Ukai Ki Sewon Pei Chen Yutaka Suzuki Haiyun Wang Kazuyuki Aihara Mariko Okada-Hatakeyama Luonan Chen School of Mathematics South China University of Science and Technology Guangzhou 510640 China Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics Chinese Academy of Sciences Kunming 650223 China School of Life Science and Technology ShanghaiTech University Shanghai 200031 China Shanghai Research Center for Brain Science and Brain-Inspired Intelligence Shanghai 201210 China School of Life Sciences and Technology Tongji University Shanghai 200092 China National Research Center for Translational Medicine (Shanghai) Rui Jin Hospital Shanghai Jiao Tong University School of Medicine Shanghai 200025 China Graduate School of Medical Life Science Yokohama City University Yokohama 230-0045 Japan Laboratory for Integrated Cellular Systems RIKEN Center for Integrative Medical Sciences (IMS) Yokohama 230-0045 Japan Key Laboratory of Systems Biology Center for Excellence in Molecular Cell Science Shanghai Institute of Biochemistry and Cell Biology Chinese Academy of Sciences Shanghai 200031 China Department of Medical Genome Sciences Graduate School of Frontier Sciences The University of Tokyo Chiba 277-8562 Japan Institute of Industrial Science The University of Tokyo Tokyo 153-8505 Japan Laboratory of Cell Systems Osaka University Osaka 565-0871 Japan

Acquired drug resistance is the major reason why patients fail to respond to cancer *** is a challenging task to *** the tipping point of endocrine resistance and detect the associated *** from new systems biology theory, the dynamic network biomarker (DNB) method is designed to quantitatively identify the tipping point of a drastic system transition and can theoretically identify DNB genes that play key roles in acquiring drug *** analyzed time-course mrna sequence data generated from the tamoxifen-treated estrogen receptor (ER)-positive MCF-7 cell line, and identified the tipping point of endocrine resistance with its leading *** results show that there is interplay between gene mutations and DNB genes, in which the accumulated mutations eventually affect the DNB genes that subsequently cause the change of transcriptional landscape, enabling full-blown drug resistance. Survival analyses based on clinical datasets validated that the DNB genes were associated with the poor survival of breast cancer *** results provided the detection for the pre-resistance state or early signs of endocrine *** predictive method may greatly benefit the scheduling of treatments for complex diseases in which patients are exposed to considerably different drugs and may become drug resistant.

关键词： drug resistance breast cancer tipping point dynamic network biomarker (DNB) molecular network mrna-seq

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FH/Wjd大鼠与SD大鼠焦虑易感性比较

中国药理学通报 2020年第5期36卷 722-726页

作者：熊庭旺吴芹刘杰刘波徐云燕王丽娜张玮张成宸石京山遵义医科大学基础药理教育部重点实验室特色民族药国际合作联合实验室贵州遵义563099

目的以SD大鼠为对照,观察FH/Wjd大鼠是否具有焦虑易感性。方法高架十字迷宫、旷场实验检测SD大鼠、FH/Wjd大鼠焦虑行为;高效液相色谱电化学技术检测皮层DA、5-HT及其代谢产物的含量,并计算DA、5-HT的代谢率;ELISA检测皮层COMT、MAO活性... 详细信息

目的以SD大鼠为对照,观察FH/Wjd大鼠是否具有焦虑易感性。方法高架十字迷宫、旷场实验检测SD大鼠、FH/Wjd大鼠焦虑行为;高效液相色谱电化学技术检测皮层DA、5-HT及其代谢产物的含量,并计算DA、5-HT的代谢率;ELISA检测皮层COMT、MAO活性及CORT、ACTH含量;PCR检测不同部位COMT mrna的表达,mrna-seq检测海马组织中所有基因的表达。结果与SD大鼠比较,FH/Wjd大鼠在高架十字迷宫闭合臂中运动距离及活动总距离均显著提高;旷场中央区域活动路程明显较低,活动总路程显著较高;DA、5-HT、DOPAC含量较低,HVA、5-HIAA含量无明显差异;FH/Wjd大鼠HVA/DA、5-HIAA/5-HT比值,COMT、MAO活性,CORT、ACTH含量,COMT mrna的表达均显著高于SD大鼠;FH/Wjd大鼠与SD大鼠的差异基因主要富集在神经活性受体配体途。结论与SD大鼠比较,FH/Wjd大鼠中枢DA、5-HT含量低下、其代谢亢进,HPA轴亢进,COMT表达异常,神经精神系统可能存在异常。FH/Wjd大鼠较之SD大鼠,具有明显的焦虑特性。

关键词： FH/Wjd大鼠 SD大鼠焦虑多巴胺 5-羟色胺 HPA轴 COMT mrna-seq

基于生物信息学对形觉剥夺性近视差异基因的分析和探讨

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基于生物信息学对形觉剥夺性近视差异基因的分析和探讨

作者：陈春文苏州大学

学位级别：硕士

目的:通过生物信息学方法分析形觉剥夺性近视(Form deprivation myopia,FDM)视网膜组织的差异表达的mrna,试图寻找FDM治疗的潜在靶点。方法:首先,在高通量基因表达数据库中获得雏鸡FDM模型mrna测序数据集(GSE80327)。然后,根据FDM去除... 详细信息

目的:通过生物信息学方法分析形觉剥夺性近视(Form deprivation myopia,FDM)视网膜组织的差异表达的mrna,试图寻找FDM治疗的潜在靶点。方法:首先,在高通量基因表达数据库中获得雏鸡FDM模型mrna测序数据集(GSE80327)。然后,根据FDM去除诱导后不同时间节点(0hr,6hr,24hr),进行组间和组内比较。选取差异表达基因(Differential expressed genes,DEGs)和mrna。利用DAVID数据库和BioMart软件包对hub基因行基因本体论(Gene ontology,GO)、KEGG以及蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)分析。统计分析使用R软件。所有的统计分析都是双边的,|log FC|>2且p0.05)。七组之间的比较发现13个hub基因,包括ACVR1,ACVR2A,ACVR2B,RGMB,BMPR2,BMPR1A,BMP2,BMPR1B,CHRRD,PTHR,PTHR1R,PTHRLHR,WNT9A。GO和KEGG分析富集到表达显著上调的3个活化受体蛋白和4个通路蛋白信号通路。PPI分析发现骨形态发生蛋白-2(Bone morphology proteins-2,BMP-2)在FDM中表达显著上调。结论:本研究发现FDM受13个共同差异表达的基因通过对hub基因的上调或下调调控影响,多个细胞因子-细胞因子信号通路,离子受体激活信号通路或生物过程被显著地干扰。BMP-2是FDM关键的差异表达基因。抑制BMP-2的表达及促进人巩膜成纤维细胞的合成可能是延缓近视进展,降低高度近视发生风险的有效手段。

关键词：形觉剥夺性近视生物信息学差异基因 mrna-seq 骨形态发生蛋白-2

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精子mrna高通量测序及检测结果评估

精子mRNA高通量测序及检测结果评估

作者：陈才扬州大学

学位级别：硕士

传统胚胎发育调控理论认为,变形后的成熟精子是高度分化的细胞,基因组高度浓缩,停止转录。细胞质被大量丢弃,精子细胞已不再含有RNA,是微配子(Microgamete),提供给合子的仅仅是雄性个体的基因组,从而在早期胚胎发育调控理论中认为只有... 详细信息

传统胚胎发育调控理论认为,变形后的成熟精子是高度分化的细胞,基因组高度浓缩,停止转录。细胞质被大量丢弃,精子细胞已不再含有RNA,是微配子(Microgamete),提供给合子的仅仅是雄性个体的基因组,从而在早期胚胎发育调控理论中认为只有母源因子在发挥作用。随着技术的进步以及研究的不断深入,精子中含有RNA的事实已逐渐证实,引发了人们对父源因子的重视,但目前对猪精子RNA的研究较少。本实验以猪的射出精子为研究对象,通过上浮、双层梯度离心纯化等步骤获得高纯度射出精子样品,并进行纯度验证。然后使用Illumina 2500进行高通量测序,获得高质量序列数据。对此数据,使用FastQC进行质量检测,并使用Tophat与基因组进行比对注释,借助Tophat比对结果,使用Cufflinks软件进行转录本组装和基因定量。然后筛选高表达基因使用DAVID软件进行功能注释分析。最后利用RT-PCR实验验证部分基因的表达。实验的成功完成,为进一步研究精子RNA的起源以及筛选关键基因打下了研究基础,为深入进行精子RNA研究提供方法支撑,同时为揭示精子RNA在父源表观遗传中的重要作用提供理论依据。结果表明：1、高纯度射出精子样品的收集方案可行。通过显微镜观察,所收集样品未看到精子之外的细胞存在,并且精子细胞形态正常。提取RNA后经RT-PCR检测,作为血淋巴细胞和生殖细胞的标记基因CD4及c-kit基因未被检测到。说明没有淋巴细胞及生殖细胞污染。2、射出精子样品提取RNA后进行mrna建库,并使用Illumina 2500进行高通量测序,经测序共获得Total reads 54860218条,质控过滤后最终获得Clean reads 54001227条。3、对Clean reads进行基因组比对、组装及表达定量等数据分析。得到与基因组的比对率为63%,符合实验要求。获得FPKM不小于1的基因12073个,其中分析结果中genehortame项有official gene symbol注释的基因有10372个,且FPKM值不小于50的基因有1025个。对这1025个基因使用DAVID进行功能分析,获得249个基因在猪的功能数据库中有较好的功能注释,对这些基因进行GO分类,每个term富集不少于10个基因的term共22个。KEGG Pathway分析共找到120个基因在已知通路中发挥作用,占功能注释基因的48.2%,其中基因数不少于5个的通路有8条。4、通过RT-PCR对AQN-1, AQN-3, AWN, PSP-Ⅰ, PSP-Ⅱ基因进行表达验证,检测结果与测序结果相符。通过利用精子上浮及梯度离心的方法,我们成功的建立了一套完整有效的精子样品收集和纯化方案。通过采用改进的精子RNA提取方法验证了精子RNA提取方法的有效性。通过对精子mrna进行高通量测序,掌握了精子RNA高通量测序的实验方案。通过对测序数据的质量检测以及整理分析,熟悉和初步掌握了mrna测序数据分析流程,为下一步深入研究精子RNA的起源和功能打下了基础。

关键词：猪射出精子 PureSperm梯度离心 mrna-seq 数据分析

4'-叠氮-2'-脱氧-2'-氟阿拉伯胞苷对结外NK/T细胞淋巴瘤的抑制作用及机制研究

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4'-叠氮-2'-脱氧-2'-氟阿拉伯胞苷对结外NK/T细胞淋巴瘤的抑制作...

作者：梁毅郑州大学

学位级别：硕士

目的:结外NK/T细胞淋巴瘤(Extranodal NK/T-cell lymphoma,ENKTL)是一种从NK细胞或细胞毒性T细胞衍生而来的侵袭性淋巴瘤,与EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)感染高度相关,预后差。虽然以L-门冬酰胺酶为基础的化疗可有效提高反应率,然而... 详细信息

目的:结外NK/T细胞淋巴瘤(Extranodal NK/T-cell lymphoma,ENKTL)是一种从NK细胞或细胞毒性T细胞衍生而来的侵袭性淋巴瘤,与EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)感染高度相关,预后差。虽然以L-门冬酰胺酶为基础的化疗可有效提高反应率,然而仍有约50%的患者在治疗后复发,因此迫切需要开发新的治疗药物。4’-叠氮-2’-脱氧-2’-氟阿拉伯胞苷(4’-azid-2’-deoxy-2’-fluorarabinoside,FNC)是有自主知识产权的新型核苷类似物。课题组前期的研究结果显示FNC对某种类型B细胞淋巴瘤具有抑制作用,但FNC对ENKTL是否有效还是未知。本课题选用人ENKTL细胞(YT细胞),研究FNC对ENKTL的抑制作用及其机制,为将FNC开发成抗淋巴瘤药物提供理论基础和实验依据。方法:(1)通过CCK-8法检测FNC对YT细胞的增殖抑制率,计算半数抑制浓度(IC);(2)分别使用Annexin V-FITC/PI双荧光染色法和PI单染法,通过流式细胞术检测FNC对YT细胞凋亡率和细胞周期分布的影响;(3)使用AO/EB双荧光染色法,通过荧光显微镜观察FNC对YT细胞凋亡形态的影响;(4)使用Transwell小室检测FNC对YT细胞侵袭的影响;(5)使用透射电镜观察FNC对YT细胞结构的影响;(6)利用m RNA-seq检测FNC对YT细胞基因表达谱的影响,筛选差异基因,并进行生物信息学分析;(7)采用q PCR检测FNC对YT细胞中HSPA8、HSP90AB1、PLK1、PLK2、TP53INP2和TP53INP1 m RNA表达量的影响;(8)采用Western Blot检测FNC对YT细胞中HSPA8、HSP90AB1、PLK1和TP53蛋白表达量的影响;(9)采用q PCR检测FNC对自噬通路中TP53、m TOR、LC3和Beclin-1 m RNA表达量的影响;(10)使用人ENKTL细胞(YT细胞)构建异种移植瘤BALB/c nude小鼠模型,进行药物干预,测量并记录小鼠体重和肿瘤体积。给药结束后,取肿瘤组织、称重、固定;取肝脏、脾脏、肾脏及肿瘤组织做病理检查;免疫组化法检测肿瘤组织中m TOR、LC3-Ⅱ和Beclin-1蛋白的表达量。结果:(1)FNC显著抑制YT细胞增殖(P<0.01),具有剂量和时间依赖性。24、48、72 h的IC值分别为10.70±0.11、1.95±0.03、0.38±0.01μM;(2)FNC可阻滞YT细胞周期于G0/G1期(P<0.01);(3)FNC可诱导YT细胞凋亡(P<0.01),并具有剂量依赖性;(4)FNC显著抑制YT细胞侵袭能力(P<0.01),具有剂量依赖性;(5)透射电镜观察发现FNC可诱导自噬溶酶体形成并造成YT细胞线粒体损伤;(6)FNC处理组共筛选出1573个差异基因,其中1364个上调基因,209个下调基因。差异基因涉及细胞增殖、细胞周期、细胞自噬、细胞骨架等生物学过程和粘附途径、PI3K-Akt、MAPK信号通路等。差异可变剪接基因涉及细胞周期、细胞自噬、细胞增殖等生物学过程和细胞周期、AMPK信号通路等。(7)FNC显著下调YT细胞中HSPA8、HSP90AB1和PLK1基因表达,上调PLK2、TP53INP2和TP53INP1基因表达(P<0.01),具有剂量依赖性;(8)FNC显著下调YT细胞中HSPA8、HSP90AB1和PLK1蛋白表达,上调TP53蛋白表达(P<0.01),具有剂量依赖性;(9)FNC下调YT细胞中m TOR基因表达,上调TP53、Beclin-1和LC3基因表达(P<0.01);(10)阳性对照顺铂组、FNC(3 mg/kg)和FNC(6 mg/kg)组肿瘤抑制率分别为57.67%、28.47%和68.21%。与阴性对照组相比,FNC(3 mg/kg)组小鼠体重缓慢增长,FNC(6 mg/kg)组小鼠体重略有减轻但无统计学差异,而阳性药顺铂(2 mg/kg)组小鼠体重明显减轻,具有显著性差异(P<0.01)。FNC(6 mg/kg)组肝脏、脾脏和肾脏病理检查结果未见异常。免疫组化结果显示,与阴性对照组相比,FNC(6 mg/kg)组肿瘤组织中m TOR蛋白表达量减少,LC3-Ⅱ和Beclin-1蛋白表达量增加(P<0.01)。结论:(1)FNC显著抑制ENKTL细胞系YT细胞的增殖和侵袭。(2)FNC可通过调节细胞周期、诱导细胞凋亡抑制细胞增殖。(3)FNC通过多途径多靶点发挥抗ENKTL作用。(4)诱导细胞自噬可能是FNC发挥抗ENKTL作用的机制之一。

关键词： FNC ENKTL mrna-seq 增殖自噬