检索结果-南通市图书馆

Chinese Science Bulletin 2000年第11期45卷 1011-1015页

作者： ZHONG Yang SHI Suhua TANG Xianhua HUANG Yelin TAN Fengxiao ZHANG Xiaoyan Wuhan Institute of Botany Chinese Academy of SciencesWuhan 430074China School of Life Sciences Zhongshan UniversityGuangzhou 510275China

The molecular phylogenetic trees of 10 species representing 6 genera of the family Rhizophoraceae have been constructed using the sequences of chloroplast genes ma/K and rbcL as well as the ITS regions of nuclear ribosomal DMA. Relative-rate tests between lineages in these phylogenetic trees have been performed. On the basis of the results of the relative-rate tests and related molecular evolutionary rate data, the divergence times between the lineages are estimated as follows: ( i) the first divergence time in these genera is 132.25 million years ago (mya); (ii) the average divergence time between two tribes, i.e. inland Legnotideae (except Carallia brachiata) and mangrove Rhizophoreae, is 64.13 mya; and (iii) the average divergence time between two inland species, C. garciniaefolia and C. pectinifolia, is 19.92 mya.

关键词： Rhizophoraceae cpdna nrDNA matK rbcL ITS regions relative-rate test divergence time.

羌活不同地理种群cpdna trnT-trnL多态性分析

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中草药 2015年第22期46卷 3390-3395页

作者：杨路存刘何春周学丽徐文华周国英中国科学院西北高原生物研究所青海西宁810008 中国科学院藏药研究重点实验室青海西宁810008 中国科学院大学北京100049 青海省铁卜加草原改良试验站青海共和813000

目的对245份不同产地羌活Notopterygium incisum样品的遗传多样性和遗传结构进行研究。方法采用叶绿体cpdna trnT-trnL直接测序的方法和邻接法（NJ）对245份羌活样品进行遗传多样性和遗传结构分析。结果物种水平上单倍型多样性（Hd）指... 详细信息

目的对245份不同产地羌活Notopterygium incisum样品的遗传多样性和遗传结构进行研究。方法采用叶绿体cpdna trnT-trnL直接测序的方法和邻接法（NJ）对245份羌活样品进行遗传多样性和遗传结构分析。结果物种水平上单倍型多样性（Hd）指数为0.873,核苷酸多样性（Pi）指数为0.004 07;种群水平上Hd介于0～0.900,Pi指数介于0～0.054 4,与同属的宽叶羌活Notopterygium franchetii相比,遗传多样性水平居中;分子方差分析表明,羌活大部分遗传变异（77.55%）发生在居群间,居群间的基因流（Nm=0.145）较低,群体间变异是羌活的主要变异来源;NJ树表明,受试的31个野生种群可分为2大类群。结论羌活的遗传多样性处于中等水平,居群间遗传分化较大。

关键词：羌活 cpdna trnT-trnL 遗传多样性遗传结构种群

基于nSSR和cpdna序列的城步峒茶群体遗传多样性和结构研究

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茶叶科学 2020年第2期40卷 250-258页

作者：刘振成杨杨培迪赵洋宁静杨阳湖南省农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心湖南分中心农业部湖南茶树及茶叶观测实验站湖南长沙410125

采用简单重复序列标记(nSSR)与叶绿体DNA序列(cpdna)分析技术,对城步峒茶群体进行了遗传多样性、遗传结构和遗传分化等研究。结果表明,15对nSSR引物在参试81份资源中共获得142个等位位点,平均每对引物9.47个,城步峒茶群体的观测杂合度(... 详细信息

采用简单重复序列标记(nSSR)与叶绿体DNA序列(cpdna)分析技术,对城步峒茶群体进行了遗传多样性、遗传结构和遗传分化等研究。结果表明,15对nSSR引物在参试81份资源中共获得142个等位位点,平均每对引物9.47个,城步峒茶群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和Nei期望杂合度(Nei)分别为0.49、0.62和0.62,具有较高的遗传多样性。Structure分析将79份峒茶资源分成3个类群,但各类群的遗传背景较为复杂,没有明显的群体结构。F检验表明,城步峒茶群体的近交系数FIS为正值(FIS=0.1775),群体间的遗传分化系数FST较小(FST=0.0345),分化程度较低,基因流Nm较高(Nm=7.01)。3对cpdna引物分别获得了473 bp(rbc L)、704 bp(mat K)和320 bp(psb H-trn A)的片段序列,变异位点占总位点的比例分别为0.42%、0.71%和1.25%。将3个序列依次拼接,共产生了9个单倍型,单倍型数由多到少的居群依次为TXZ(6)、DZC(4)、DPS(4)、TYS(3)、HJZ(2),群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.732和0.00139。9个单倍型中,单倍型H1和H5处于进化网络图的中心节点上,并且包含资源数量最多,属于比较原始的单倍型。同时,nSSR和cpdna的AMOVA分析结果基本一致,居群内的变异百分比分别达到96.69%和80.54%,城步峒茶的遗传变异主要存在于居群内。

关键词：茶树城步峒茶 nSSR cpdna 遗传多样性群体结构

基于cpdna非编码序列的北沙柳遗传多样性分析

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西北植物学报 2020年第3期40卷 413-424页

作者：李娅翔路东晔郝蕾张国盛宁静乌兰娜日阿拉腾苏和内蒙古农业大学林学院呼和浩特010019 内蒙古财经大学呼和浩特010070 内蒙古林业科学研究院呼和浩特010010 鄂尔多斯乌审旗林业局内蒙古达布察克017300 鄂尔多斯造林总场内蒙古树林召014300

为揭示北沙柳(Salix psammophila)的遗传多样性、遗传结构及分化特征,利用叶绿体非编码区序列(trnL-trnF和trnD-trnT)对分布于毛乌素沙地和库布齐沙漠的16个北沙柳居群(339个个体)进行了遗传研究,为北沙柳种子资源库遗传管理、遗传改良... 详细信息

为揭示北沙柳(Salix psammophila)的遗传多样性、遗传结构及分化特征,利用叶绿体非编码区序列(trnL-trnF和trnD-trnT)对分布于毛乌素沙地和库布齐沙漠的16个北沙柳居群(339个个体)进行了遗传研究,为北沙柳种子资源库遗传管理、遗传改良、遗传育种及品种选育提供理论依据。结果表明:(1)经trnL-trnF和trnD-trnT片段联合比对获得了1811 bp序列,共有12个核苷酸变异位点(8个简约信息位点,4个变异位点),得到16个单倍型。(2)单倍型多样性指数(Hd)为0.737,核苷酸多样性指数(π)为0.00107;且单倍型H3的分布在所有居群中位于单倍型网络图中心,其余单倍型随机分布于各个居群。(3)AMOVA分析表明,北沙柳cpdna的变异主要来源于居群内(91.16%),居群间遗传分化程度中等(FST=0.08837),各居群间的基因交流非常频繁(Nm=2.58);遗传分化系数NST(0.085)显著大于GST(0.056,0.01

关键词：北沙柳 cpdna 遗传多样性单倍型遗传结构

根据cpdna trnL-F非编码区序列变异分析黑桫椤海南和广东种群的遗传结构与系统地理

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生态学报 2004年第5期24卷 914-919页

作者：苏应娟王艇郑博江宇欧阳蒲月陈国培王伯荪中山大学生命科学学院广州510275

以黑桫椤分布在海南和广东 9个种群为材料 ,通过 PCR产物直接测序和克隆后再测序的方法测定了叶绿体 DNA(cp DNA) trn L- F非编码区序列。序列长度介于 10 17bp至 10 2 1bp;碱基组成 A+T含量较高 ,百分比值为 6 0 .4 3%～ 6 2 .2 6 %。... 详细信息

以黑桫椤分布在海南和广东 9个种群为材料 ,通过 PCR产物直接测序和克隆后再测序的方法测定了叶绿体 DNA(cp DNA) trn L- F非编码区序列。序列长度介于 10 17bp至 10 2 1bp;碱基组成 A+T含量较高 ,百分比值为 6 0 .4 3%～ 6 2 .2 6 %。根据序列的核苷酸变异共鉴定出 15个单倍型。黑桫椤具高水平单倍型多样性 (h=0 .880 )和较高水平核苷酸多样性 (Dij=0 .0 0 342 ) ,其悠长的进化历史可能增加了遗传变异在谱系内的积累。单倍型最小生成网图和邻接树、种群间分化度 (FST=0 .12 6 4 5 )和基因流 (N m=3.4 9)、AMOVA分析 (地区间遗传变异占 11.91% ,p>0 .0 5 )以及 DNA歧义度结果一致显示 ,黑桫椤分布在海南和广东的种群彼此间不存在遗传分化。黑桫椤单倍型的系统发育地理式样具“星状”特征 ,提示种群在历史上曾经发生过扩张。

关键词：黑桫椤 cpdna trnL—F非编码区单倍型遗传结构地理分化

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基于cpdna条形码鉴定铁皮石斛种质资源

核农学报 2017年第2期31卷 255-262页

作者：付涛胡仲义何月秋周亚美毛阳正宁波城市职业技术学院浙江宁波315502

为选择适合鉴定铁皮石斛的条形码,以5份铁皮石斛种质资源和1份串珠石斛(外类群)为试验材料,采用cpdna条形码技术进行分子鉴定。结果表明,5个条形码序列(matK、rbcL、trnH-psbA、petApsbJ和rpl32-trnL)种间遗传距离均远高于种内遗传距离... 详细信息

为选择适合鉴定铁皮石斛的条形码,以5份铁皮石斛种质资源和1份串珠石斛(外类群)为试验材料,采用cpdna条形码技术进行分子鉴定。结果表明,5个条形码序列(matK、rbcL、trnH-psbA、petApsbJ和rpl32-trnL)种间遗传距离均远高于种内遗传距离,符合作为条形码的基本要求,其中petA-psbJ变异位点最多(8.03%),说明其进化速率亦最快,petA-psbJ可作为石斛属候选条形码之一;单个条形码鉴定率均较低(cpdna条形码技术,可将不同种质资源的铁皮石斛区分开,基本上可将不同采集地的铁皮石斛聚类;同时,建议matK+rbcL+petA-psbJ作为铁皮石斛种质资源鉴定的DNA条形码。本研究结果为铁皮石斛种质资源的快速鉴定提供了一定的参考。

关键词：铁皮石斛 cpdna 条形码种质鉴定

蒙古扁桃nrDNA ITS和cpdna trnH-psbA序列分子进化特点研究

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基因组学与应用生物学 2018年第7期37卷 3035-3041页

作者：段义忠王建武亢福仁李娟榆林学院生命科学学院榆林719000 陕西省陕北生态修复重点实验室榆林719000

通过对蒙古扁桃16个居群的叶绿体DNA（cpdna）的trnH-psbA及nrDNAITS序列进行测序,对两种序列进化速率、核苷酸多样性及单倍型系统发育关系进行了初步研究。结果表明：蒙古扁桃cpdnatrnH-psbA序列总长度为306bp,共得到52处变异位点,变... 详细信息

通过对蒙古扁桃16个居群的叶绿体DNA（cpdna）的trnH-psbA及nrDNAITS序列进行测序,对两种序列进化速率、核苷酸多样性及单倍型系统发育关系进行了初步研究。结果表明：蒙古扁桃cpdnatrnH-psbA序列总长度为306bp,共得到52处变异位点,变异率达到17.05%,共检测到11种单倍型;nrDNAITS序列总长度为662bp,共得到6处变异位点,变异率达为0.91%,共检测到9种单倍型。经比较发现,蒙古扁桃nrDNAITS序列较cpdnatrnH-psbA序列保守,变异速率较慢。cpdnatrnH-psbA及nrDNAITS序列单倍型系统发育关系的各支系的支持率均较高。

关键词：蒙古扁桃 cpdna trnH-psbA序列 nrDNA ITS序列进化特点

基于形态和cpdna序列探讨柽柳和甘蒙柽柳的亲缘关系

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基因组学与应用生物学 2019年第5期38卷 2238-2246页

作者：梁红艳权金娥冯志培王迎春杨喜田河南农业大学林学院郑州450002 三门峡职业技术学院三门峡472000 内蒙古大学生命科学学院呼和浩特010021

柽柳科植物的系统学关系已初步明确,但部分种间的系统进化关系仍有待澄清。为明确中国黄河流域广泛分布的柽柳(Tamarix chinensis)和甘蒙柽柳(T. austromongolica)的亲缘关系,利用13个稳定的形态学性状和3个cpdna间隔区片段(rpl20-5′-r... 详细信息

柽柳科植物的系统学关系已初步明确,但部分种间的系统进化关系仍有待澄清。为明确中国黄河流域广泛分布的柽柳(Tamarix chinensis)和甘蒙柽柳(T. austromongolica)的亲缘关系,利用13个稳定的形态学性状和3个cpdna间隔区片段(rpl20-5′-rps12, rps16, trn L-trn F)对柽柳科3属9种植物进行研究,结果表明3条序列的位点变异程度依次为trn L-trn F>rps16>rpl20-5′-rps12,柽柳和甘蒙柽柳群体共享有同一单倍型,表型和分子数据均支持柽柳和甘蒙柽柳为单系分支的近缘种,推测柽柳和甘蒙柽柳的分化大致发生在0.69Ma (0-1.93) Ma,与同属内其它物种相比,分化时间相对较晚。

关键词：柽柳甘蒙柽柳亲缘关系形态 cpdna

红树科6属cpdna和nrDNA序列相对速率检验及分歧时间估计

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科学通报 2000年第1期45卷 40-44页

作者：钟扬施苏华唐先华黄椰林谈凤笑张晓艳中国科学院武汉植物研究所武汉430074 中山大学生命科学学院广州510275

基于红树科６属１０种及外类群的ｃｐＤＮＡｍａｔＫ基因和ｒｂｃＬ基因序列以及ｎｒＤＮＡＩＴＳ区序列，分别构建了分子系统发育树．对不同系统发育树中有关分支间的核苷酸序列置换速率进行了差异显著性检验．根据相对速率检验... 详细信息

基于红树科６属１０种及外类群的ｃｐＤＮＡｍａｔＫ基因和ｒｂｃＬ基因序列以及ｎｒＤＮＡＩＴＳ区序列，分别构建了分子系统发育树．对不同系统发育树中有关分支间的核苷酸序列置换速率进行了差异显著性检验．根据相对速率检验结果，结合现有分子进化资料，推算这些属间的首次分歧时间为１３２．２５Ｍａ前，分布于内陆的竹节树族（除竹节树外）与分布于海岸的红树族间的平均分歧时间为６４．１３Ｍａ前，而陆生的大叶竹节树和旁札木间的平均分歧时间为１９．９２Ｍａ前。

关键词：红树科 cpdna nrDNA 相对速度检验分歧时间

根据cpdna trnT-trnF序列变异分析中国互花米草种群的遗传结构

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草业学报 2012年第4期21卷 134-140页

作者：吴娟子王强钟小仙陈建群南京大学生命科学学院江苏南京210093 江苏省农业科学院畜牧所江苏南京210014

采用直接测序法,测定了中国沿海互花米草8个种群80个样本的叶绿体trnT-trnF序列。结果显示,2个单碱基的插入/缺失将80个序列分为3种单倍型,3种单倍型在美国东海岸均有分布,且属于美国分布最广泛的C单倍型;中国种群的单倍型多样性Hd为0.3... 详细信息

采用直接测序法,测定了中国沿海互花米草8个种群80个样本的叶绿体trnT-trnF序列。结果显示,2个单碱基的插入/缺失将80个序列分为3种单倍型,3种单倍型在美国东海岸均有分布,且属于美国分布最广泛的C单倍型;中国种群的单倍型多样性Hd为0.379,远低于美国原产地;种群间基因分化系数Gst为0.103、固定指数Fst为0.092;AMOVA分析揭示种群间仅有9%的遗传差异。研究结果表明,中国互花米草种群受瓶颈效应影响明显,种群间遗传变异较低,种群内多样性相对较高。

关键词：互花米草 cpdna trnT-trnF 单倍型遗传结构