基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析

作     者：李娅翔 路东晔 郝蕾 张国盛 宁静 乌兰娜日 阿拉腾苏和 LI Yaxiang;LU Dongye;HAO Lei;ZHANG Guosheng;NING Jing;WULAN Nari;ALATENG Suhe

作者机构：内蒙古农业大学林学院呼和浩特010019 内蒙古财经大学呼和浩特010070 内蒙古林业科学研究院呼和浩特010010 鄂尔多斯乌审旗林业局内蒙古达布察克017300 鄂尔多斯造林总场内蒙古树林召014300 

出 版 物：《西北植物学报》 (Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica)

年 卷 期：2020年第40卷第3期

页      面：413-424页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 0713[理学-生态学] 

基　　金：内蒙古自治区自然科学基金(2018MS03013) 

主　　题：北沙柳 cpDNA 遗传多样性 单倍型 遗传结构 

摘      要：为揭示北沙柳(Salix psammophila)的遗传多样性、遗传结构及分化特征,利用叶绿体非编码区序列(trnL-trnF和trnD-trnT)对分布于毛乌素沙地和库布齐沙漠的16个北沙柳居群(339个个体)进行了遗传研究,为北沙柳种子资源库遗传管理、遗传改良、遗传育种及品种选育提供理论依据。结果表明:(1)经trnL-trnF和trnD-trnT片段联合比对获得了1811 bp序列,共有12个核苷酸变异位点(8个简约信息位点,4个变异位点),得到16个单倍型。(2)单倍型多样性指数(Hd)为0.737,核苷酸多样性指数(π)为0.00107;且单倍型H3的分布在所有居群中位于单倍型网络图中心,其余单倍型随机分布于各个居群。(3)AMOVA分析表明,北沙柳cpDNA的变异主要来源于居群内(91.16%),居群间遗传分化程度中等(FST=0.08837),各居群间的基因交流非常频繁(Nm=2.58);遗传分化系数NST(0.085)显著大于GST(0.056,0.01P0.05),表明北沙柳居群具有明显的分子谱系地理结构。(4)中性检验及失配分析表明,北沙柳居群分布范围没有发生明显扩张的痕迹。