蒙古扁桃nrDNA ITS和cpDNA trnH-psbA序列分子进化特点研究
Research of Molecular Evolution Characteristics of nrDNA ITS and cpDNA trnH-psbA Sequences in Prunus mongolica作者机构:榆林学院生命科学学院榆林719000 陕西省陕北生态修复重点实验室榆林719000
出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)
年 卷 期:2018年第37卷第7期
页 面:3035-3041页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:国家自然科学基金(41601059) 榆林学院高学历项目(11GK06)共同资助
主 题:蒙古扁桃 cpDNA trnH-psbA序列 nrDNA ITS序列 进化特点
摘 要:通过对蒙古扁桃16个居群的叶绿体DNA(cpDNA)的trnH-psbA及nrDNAITS序列进行测序,对两种序列进化速率、核苷酸多样性及单倍型系统发育关系进行了初步研究。结果表明:蒙古扁桃cpDNAtrnH-psbA序列总长度为306bp,共得到52处变异位点,变异率达到17.05%,共检测到11种单倍型;nrDNAITS序列总长度为662bp,共得到6处变异位点,变异率达为0.91%,共检测到9种单倍型。经比较发现,蒙古扁桃nrDNAITS序列较cpDNAtrnH-psbA序列保守,变异速率较慢。cpDNAtrnH-psbA及nrDNAITS序列单倍型系统发育关系的各支系的支持率均较高。