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SEQUENCE CONSERVATION OF HUMAN CYTOMEGALOVIRUS UL140 OPEN READING FRAME IN CLINICAL STRAINS

Chinese Medical Sciences Journal 2008年第1期23卷 23-27页

作者： Ying Qi Yan-ping Ma Rong He Zheng-rong Sun Yao-hua Ji Yu-jing Huang Qiang Ruan Virus Laboratory Shengjing Hospital China Medical University Shenyang 110004

Objective To investigate the variability of human cytomegalovirus(HCMV)UL140 open reading frame(ORF)in clinical strains,and to explore the relationship between the variability of UL140 ORF and different symptoms of HCMV infection.Methods HCMV UL140 ORF was amplified by polymerase chain reaction and sequenced selectedly in 30 clinical strains.Results UL140 ORF of all clinical strains was amplified successfully.Compared with that of Toledo strain,the nucleotide and amino acid sequence identities among all strains were 96.5%-100.0% and 95.2%-100.0%,respectively.All of the nucleotide changes were substitutions.The post-translational modification sites were conserved.The result of phylogenetic tree showed that the strains did not cluster according to different clinical symptoms.Conclusion HCMV UL140 ORF in clinical strains is highly conserved,which may play an important role in HCMV infection.

关键词：细胞巨化病毒 UL140 序列分析临床研究

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广州地区人巨细胞病毒临床低传代株UL140基因的多态性

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热带医学杂志 2016年第2期16卷 153-157页

作者：蔡丽君胡兢晶王波苏海浩颜斐斐伍苑宾郭梦杰谭琪琪广东省妇幼保健院广东广州511442

目的研究广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代分离株UL140基因的多态性。方法对3株经多重PCR鉴定的HCMV临床低传代分离株UL140基因进行全序列扩增、克隆、鉴定、测序及呈报Genbank,应用生物信息学方法分析UL140基因翻译后修饰位点、... 详细信息

目的研究广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代分离株UL140基因的多态性。方法对3株经多重PCR鉴定的HCMV临床低传代分离株UL140基因进行全序列扩增、克隆、鉴定、测序及呈报Genbank,应用生物信息学方法分析UL140基因翻译后修饰位点、二级结构及等电点。结果成功分离3株HCMV临床病毒株(D2、D3、D52),经鉴定后被Gen Bank收录。序列号分别为:DQ180373、DQ180385和DQ180357。分析显示HCMV临床低传代D2、D3和D52病毒株的UL140基因全长576 bp,其DNA序列比较保守,编码蛋白由191个氨基酸残基组成,HCMV UL140蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均比较保守;所有株外,其余分离株UL140蛋白的等电点均在4.88-5.12之间。结论广州地区人巨细胞病毒UL140基因及其编码的氨基酸序列相对保守,但仍存在一定的多态性,与Toledo相比,本地区分离得到病毒株具有其明显差异,这一差异可能对HCMV临床感染与致病机制研究具有重要影响。

关键词：人巨细胞病毒临床病毒株 UL140 多态性

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HCMV ul138、ul139和UL140基因在低传代临床分离株中表达和功能的初步研究

HCMV UL138、UL139和UL140基因在低传代临床分离株中表达和功能的...

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作者：何智强暨南大学

学位级别：硕士

目的：通过构建人巨细胞病毒（HCMV）组装的调控转录元件pcDNA-pp71与含有人巨细胞病毒（HCMV）基因组的人工染色体质粒（BAC-HCMV）共转染细胞后获得重组病毒，并通过RT-PCR技术检测HCMV ul138、ul139和UL140基因的mRNA表达，揭示此类... 详细信息

目的：通过构建人巨细胞病毒（HCMV）组装的调控转录元件pcDNA-pp71与含有人巨细胞病毒（HCMV）基因组的人工染色体质粒（BAC-HCMV）共转染细胞后获得重组病毒，并通过RT-PCR技术检测HCMV ul138、ul139和UL140基因的mRNA表达，揭示此类临床低传代分离HCMV特有基因编码产物的功能和先天性HCMV感染的致病机理，为研究临床低传代分离HCMV与其先天性感染后致病性差异之间的关系奠定基础。方法：抽提和纯化BAC-HCMV，与调控该病毒转录的元件pcDNA-pp71共转生长良好的人胚肺成纤维细胞（HELF）;收集病变细胞;抽提病毒RNA，根据GeneBank公布的Toledo株ul138、ul139和UL140基因序列及有关文献设计引物，通过RT-PCR检测ul138、ul139和UL140基因mRNA表达;应用生物信息学方法分析ul138、ul139和UL140基因编码产物的结构与功能。结果：成功构建HCMV的调控转录元件pcDNA-pp71，从病毒基因组的BAC-HCMV与pcDNA-pp71共转的细胞中获得低传代HCMV临床分离株;成功地从病毒的细胞培养物中检测到ul138、ul139和UL140基因mRNA的表达;将ul138、ul139和UL140基因的RT-PCR产物克隆到pMD18-T载体，经测序，结果与GeneBank公布的序列相吻合;运用生物信息学方法分析了ul138、ul139和UL140基因编码产物的结构与功能。

关键词：人巨细胞病毒 ul138 ul139 UL140 pcDNA-pp71 BAC-HCMV RT-PCR 表达

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