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广州地区人巨细胞病毒临床低传代株UL140基因的多态性

Human cytomegalovirus UL140 gene polymorphisms in low-passage clinical isolates in Guangzhou

作     者:蔡丽君 胡兢晶 王波 苏海浩 颜斐斐 伍苑宾 郭梦杰 谭琪琪 

作者机构:广东省妇幼保健院广东广州511442 

出 版 物:《热带医学杂志》 (Journal of Tropical Medicine)

年 卷 期:2016年第16卷第2期

页      面:153-157页

学科分类:1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基  金:广东省自然科学基金(9151008901000085) 

主  题:人巨细胞病毒 临床病毒株 UL140 多态性 

摘      要:目的研究广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代分离株UL140基因的多态性。方法对3株经多重PCR鉴定的HCMV临床低传代分离株UL140基因进行全序列扩增、克隆、鉴定、测序及呈报Genbank,应用生物信息学方法分析UL140基因翻译后修饰位点、二级结构及等电点。结果成功分离3株HCMV临床病毒株(D2、D3、D52),经鉴定后被Gen Bank收录。序列号分别为:DQ180373、DQ180385和DQ180357。分析显示HCMV临床低传代D2、D3和D52病毒株的UL140基因全长576 bp,其DNA序列比较保守,编码蛋白由191个氨基酸残基组成,HCMV UL140蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均比较保守;所有株外,其余分离株UL140蛋白的等电点均在4.88-5.12之间。结论广州地区人巨细胞病毒UL140基因及其编码的氨基酸序列相对保守,但仍存在一定的多态性,与Toledo相比,本地区分离得到病毒株具有其明显差异,这一差异可能对HCMV临床感染与致病机制研究具有重要影响。

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