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SEPT9和sdc2甲基化联合检测诊断结直肠癌的价值

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中国肛肠病杂志 2022年第9期42卷 1-3页

作者：张玉晓南阳医学高等专科学校第三附属医院河南南阳473000

目的:探讨SEPT9和sdc2甲基化联合检测诊断结直肠癌的价值。方法:选取110例结直肠癌患者为观察组,同期110名胃肠镜检查未见异常者为对照组。均行SEPT9和sdc2甲基化联合检测,癌胚抗原(CEA)、血清甲胎蛋白(AFP)、糖类抗原125(CA125)及糖类... 详细信息

目的:探讨SEPT9和sdc2甲基化联合检测诊断结直肠癌的价值。方法:选取110例结直肠癌患者为观察组,同期110名胃肠镜检查未见异常者为对照组。均行SEPT9和sdc2甲基化联合检测,癌胚抗原(CEA)、血清甲胎蛋白(AFP)、糖类抗原125(CA125)及糖类抗原19-9(CA19-9)检测,对比SEPT9和sdc2甲基化联合检测与4种血清肿瘤标志物诊断结直肠癌的效果。结果:观察组血清SEPT9和sdc2水平低于对照组,CEA、AFP、CA125及CA19-9水平高于对照组,差异均有统计学意义(P sdc2联合检测阳性率为86.36%,显著高于血清肿瘤标志物联合检测的40.00%,差异有统计学意义(P sdc2甲基化联合检测应用价值更高。

关键词：结直肠癌 SEPT9 sdc2 筛查诊断

粪便sdc2基因甲基化检测在结直肠肿瘤检测中的研究进展

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2023年第5期 176-179页

作者：李彦其梁道明昆明医科大学第二临床医学院云南昆明650500 昆明医科大学第二附属医院胃肠外科云南昆明650021

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的发病率在全世界范围内逐年升高,早期诊断能明显改善患者预后,但目前临床常用的检测方式如结肠镜、粪便潜血试验等存在诸多限制,且灵敏度和特异度并不是特别理想。因此临床急需灵敏度高、依从性更好的... 详细信息

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的发病率在全世界范围内逐年升高,早期诊断能明显改善患者预后,但目前临床常用的检测方式如结肠镜、粪便潜血试验等存在诸多限制,且灵敏度和特异度并不是特别理想。因此临床急需灵敏度高、依从性更好的检测手段,粪便基因筛查的出现为我们提供了新的思路,大量已有的研究证明syndecan-2(sdc2)有作为CRC筛查肿瘤标记物的潜能,本文就sdc2的研究进展及未来研究方向进行综述。

关键词：结直肠癌腺瘤 sdc2 甲基化

四川白鹅RPS27a和sdc2基因差异表达

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华中农业大学学报 2015年第6期34卷 89-93页

作者：何珲姜冬梅马容徐麒麟陈咨余康波四川农业大学动物科技学院四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室雅安625014

为阐明鹅不同组织和卵泡中RPS27a和sdc2基因的表达规律,明确其在卵泡发育过程中的作用,应用实时荧光定量PCR检测四川白鹅17种组织及卵泡中RPS27a和sdc2基因的相对表达量。结果表明:四川白鹅卵巢组织中RPS27a的表达量最高(P<0.05),而小... 详细信息

为阐明鹅不同组织和卵泡中RPS27a和sdc2基因的表达规律,明确其在卵泡发育过程中的作用,应用实时荧光定量PCR检测四川白鹅17种组织及卵泡中RPS27a和sdc2基因的相对表达量。结果表明:四川白鹅卵巢组织中RPS27a的表达量最高(Psdc2的表达量最高(Psdc2在腿肌和胸肌中的表达量最低。在等级卵泡中,小黄卵泡RPS27a和sdc2表达量均显著低于小白卵泡;F2卵泡中RPS27a的表达量显著高于F5和F3;F2卵泡中sdc2的表达量是小白卵泡的2.05倍,且显著高于F5、F4和F3卵泡,但与F1卵泡差异不显著;在排卵后卵泡中,RPS27a和sdc2的表达量呈显著下降趋势。RPS27a和sdc2在所检测的组织中均有表达,但具有组织特异性的特点;RPS27a和sdc2可能对维持鹅卵巢功能具有重要调控作用,且RPS27a和sdc2在排卵后卵泡中显著降低可能对排卵后卵泡的退化消失具有促进作用。

关键词：四川白鹅 RPS27a sdc2 卵泡卵巢功能

The Influence of Let-7b-5p Target Gene in Cholangiocarcinoma and its Bioinformatic Analysis

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Journal of Clinical and Nursing Research 2021年第2期5卷 33-37页

作者： Xibing Zhang Jianghua Ran Fang Liu Yingpeng Zhao Zongqiang Hu Department of Hepatopancreatobiliary Surgery The First Hospital of KunmingOrgan Transplantation Institute of Yunnan ProvinceYunnan ProvinceChina Department of Endocrine The First Hospital of KunmingKunming 650000Yunnan ProvinceChina

Objective:To analyze the biological functions and its clinical significance of let-7b-5p target gene in cholangiocarcinoma utilizing bioinformatics.Methods:The paper focuses on the let-7b-5p target gene,and predicts its biological functions as well as related signal pathways through GO biological function and KEGG signal pathway enrichment analysis.The STRING database and Cytoscape are used to construct a protein-protein interaction network to screen core genes.Results:The results of GO analysis showed that let-7b-5p target gene was mainly enriched in biological processes such as Small GTPase binding,Rho GTPase binding,and Rac GTPase binding.The results of KEGG analysis showed that let-7b-5p target gene was significantly enriched in key signaling pathways including Focal adhesion and ECM-receptor interaction.Through protein-protein interaction network and module analysis,CXCL8 and sdc2 were screened as the core site.Conclusion:let-7b-5p can participate in the regulation of biological functions of tumor cells in cholangiocarcinoma,suggesting that it may play an important role as a tumor suppressor gene and biomarker in the occurrence and development of cholangiocarcinoma,which provides new ideas for its diagnosis and treatment.

关键词： Let-7b-5p Cholangiocarcinoma Bioinformatics CXCL8 sdc2

粪便基因sdc2与BMP3联合检测在结直肠癌筛查中的价值

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粪便基因SDC2与BMP3联合检测在结直肠癌筛查中的价值

作者：潘辉广州医科大学

学位级别：硕士

背景在我国,结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,发病率和死亡率分别位居恶性肿瘤的第三位和第五位,迫切需要采取有效措施（例如结直肠癌筛查）来遏制结直肠癌的高发状况。当前,结肠镜检查是结直肠癌筛查的金标准,但结肠镜检查需繁琐的肠... 详细信息

背景在我国,结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,发病率和死亡率分别位居恶性肿瘤的第三位和第五位,迫切需要采取有效措施（例如结直肠癌筛查）来遏制结直肠癌的高发状况。当前,结肠镜检查是结直肠癌筛查的金标准,但结肠镜检查需繁琐的肠道准备、有出血和穿孔的风险、检查过程的痛苦等不足,致使结直肠癌一般风险人群进行结肠镜检查的依从性低。现阶段,简便、无创、诊断性能高、依从性高成为结直肠癌筛查的研究热点。随着对结直肠癌的深入研究,表观遗传学,特别是DNA甲基化,在结直肠癌的发生发展中显示越来越重要的作用,利用生物信息学和分子生物学技术,已经发现部分DNA甲基化适合用于结直肠癌的筛查、诊断、治疗、预后。目的探讨粪便基因黏结蛋白聚糖2（sdc2）甲基化检测和骨形态发生蛋白3（BMP3）甲基化检测在结直肠癌和腺瘤的诊断性能,探讨两基因联合检测是否优于单一基因检测。方法收集广州医科大学附属市十二人民医院和中山大学附属肿瘤医院2019年5月至2019年9月收治的64例病人的粪便样本,其中结直肠癌组病人29例、腺瘤组病人9例、对照组病人（无结直肠癌、无腺瘤患者）26例,提取粪便DNA,经亚硫酸氢盐修饰,使用甲基化特异性PCR技术（Methylation specific polymerase chain reaction,MSP）,检测三组病人粪便基因sdc2、BMP3启动子的甲基化情况,比较诊断结直肠癌、腺瘤的灵敏度和特异度;同时,探讨联合两基因检测是否优于单一基因检测。结果1.结直肠癌患者粪便DNA中sdc2及BMP3基因甲基化阳性率分别为65.5%（19/29）和44.8%（13/29）,均显著高于对照组的15.4%（4/26）和7.7%（2/26）,差异均有统计学意义（P＜0.05）。2.粪便基因sdc2与BMP3联合检测结直肠癌的灵敏度高于单独BMP3基因检测（82.8%vs 44.8%）,差异有统计学意义（P＜0.01）;高于单独sdc2基因检测（82.8%vs 65.5%）,但差异无统计学意义（P＞0.05）。粪便基因sdc2与BMP3联合检测腺瘤的灵敏度与单独sdc2基因检测、单独BMP3基因检测相比较,差异均无统计学意义（P＞0.05）。粪便基因sdc2与BMP3联合检测结直肠癌或腺瘤的特异度低于单独sdc2基因检测（80.8%vs 84.6%）,也低于单独BMP3基因检测（80.8%vs 92.3%）,差异均无统计学意义（P＞0.05）。3.sdc2基因检测、BMP3基因检测和联合检测在不同年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤分期、肿瘤分化之间的检出率差异均无统计学意义（P＞0.05）。BMP3基因检测、联合检测能发现更多远端的结直肠癌（P＜0.05）,而sdc2基因检测在近端和远端结直肠癌的检出率差异并无统计学意义（P＞0.05）。结论1.粪便基因sdc2检测和粪便基因BMP3检测利用MSP方法均能区分结直肠癌患者与对照组患者,是潜在的理想的结直肠癌筛查方式。2.粪便基因sdc2与BMP3联合检测结直肠癌的诊断性能优于单独BMP3基因检测,但与单独sdc2基因检测相比无明显改善;粪便基因联合检测有待优化。

关键词：结直肠癌粪便基因 DNA甲基化 sdc2 BMP3

THBS1、sdc2和CYR61在食管鳞癌中的异常表达及其预后意义

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THBS1、SDC2和CYR61在食管鳞癌中的异常表达及其预后意义

作者：黄鑫汕头大学

学位级别：硕士

目的:转化生长因子β(transforming growth factor beta,TGF-β)信号通路在生长和发育过程中发挥着重要作用,与肿瘤的发生发展密切相关。凝血酶敏感素1(Thrombospondin-1, THBS1)、硫酸类肝素蛋白多糖(syndecan-2,sdc2)和富含半胱氨酸61... 详细信息

目的:转化生长因子β(transforming growth factor beta,TGF-β)信号通路在生长和发育过程中发挥着重要作用,与肿瘤的发生发展密切相关。凝血酶敏感素1(Thrombospondin-1, THBS1)、硫酸类肝素蛋白多糖(syndecan-2,sdc2)和富含半胱氨酸61(cysteine-rich 61, CYR61)是TGF-β信号通路相关基因。研究显示,THBS1能明显地活化TGF-β1因子并且激活TGF-β信号途径;sdc2即能通过硫酸肝素蛋白聚糖链与TGF-β1因子相互作用,把TGF-β1因子运输到TGF受体(TGFR)上,又可以直接与TGFR形成三元复合物共同影响TGF-β信号通路,是TGF-β信号通路的重要上游调节基因;而CYR61是TGF-β信号通路直接激活的下游靶基因。但是目前对THBS1、sdc2和CYR61等TGF-β信号通路相关基因在食管鳞癌发生发展中的作用知之甚少。本研究的目的就是探讨THBS1、sdc2和CYR61在食管鳞癌中的表达特点,并评价三者的表达与食管鳞癌各临床病理指标及其预后的关系。方法:收集2004年9月-2007年8月汕头大学第一附属医院胸外科手术切除的食管鳞癌标本77例,包括鳞癌组织及其配对切缘相对正常食管粘膜组织;TRIzol试剂提取总RNA,反转录后,以β-actin为内参照,荧光定量RT-PCR检测上述配对组织中THBS1、sdc2和CYR61基因的mRNA水平;采用配对t检验分析食管鳞癌组织与配对相对正常食管粘膜组织中THBS1、sdc2和CYR61的mRNA表达水平的异常性;采用卡方检验评价THBS1、sdc2和CYR61基因在食管鳞癌组织中的异常表达与临床病理特征之间的相关性,而与食管癌患者生存率与预后的关系则采用Kaplan-Meier检验与Cox回归模型进行统计分析。结果:荧光定量RT-PCR结果显示THBS1(Psdc2(P=0.009)和CYR61(P=0.023)基因在食管鳞癌组织中的mRNA水平均存在异常表达,其中sdc2的异常表达与瘤块的大小(P=0.024)相关;而CYR61的异常表达不仅与瘤块的大小相关(P=0.03),而且与淋巴结转移也相关(P =0.034)。相关性分析结果显示,sdc2和CYR61(r=0.770;Psdc2/CYR61的共同异常表达与淋巴结转移(P=0.009)和病理分期(P=0.033)相关;THBS1(P=0.007)、CYR61(P=0.005)异常表达以及sdc2/CYR61(P=0.026),THBS1/CYR61(P=0.006)共同异常表达均与患者的生存率密切相关。Cox回归模型显示,THBS1的异常表达与食管鳞癌的不良预后密切相关(危险度=0.391;P=0.005),同样sdc2(危险度=0.489;P=0.013)和CYR61(危险度=0.539;P=0.031)的异常表达与食管鳞癌的不良预后也有密切相关且具有独立的预警意义。结论:,THBS1、sdc2和CYR61基因在食管鳞癌组织中的mRNA水平均呈异常表达并且THBS1、sdc2与CYR61表达与食管鳞癌的不良预后密切相关,是重要的食管鳞癌独立预后因子。

关键词： THBS1 sdc2 CYR61 TGF-β信号通路食管鳞癌荧光定量RT-PCR

Mir-20a-5p调控sdc2基因的表达提高耐药骨肉瘤细胞的化疗敏感性的研究

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Mir-20a-5p调控SDC2基因的表达提高耐药骨肉瘤细胞的化疗敏感性的...

作者：崔明达新乡医学院

学位级别：硕士

背景骨肉瘤是最常见的原发性恶性骨肿瘤,化疗耐药是其治疗失败主要原因之一。阐明化疗耐药机制对骨肉瘤疗效的提升具有重要意义。微小RNA（miRNA）不仅与多种肿瘤的发生和发展密切相关,还与肿瘤化疗耐药的形成有关,但miRNA在骨肉瘤耐药... 详细信息

背景骨肉瘤是最常见的原发性恶性骨肿瘤,化疗耐药是其治疗失败主要原因之一。阐明化疗耐药机制对骨肉瘤疗效的提升具有重要意义。微小RNA（miRNA）不仅与多种肿瘤的发生和发展密切相关,还与肿瘤化疗耐药的形成有关,但miRNA在骨肉瘤耐药中的作用与机制尚不清楚。目的分析mir-20a-5p在骨肉瘤化疗药物耐受中的作用及分子机制。方法1.依据RNA-Seq以及miR-omic组学分析,结合miRBase、CHIPBase和Targetscan三个数据库对mir-20a-5p的下游基因进行预测,寻找可能受到mir-20a-5p调控的靶向基因。2.采用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）、免疫印迹试验（western blot）技术检测骨肉瘤化疗敏感型细胞株G-292与骨肉瘤化疗耐受型细胞株SJSA-1细胞中mir-20a-5p和人多配体聚糖2（sdc2）的表达水平。3.双荧光素酶报告检测mir-20a-5p可否与sdc2的3’-UTR结合,证明sdc2是否为mir-20a-5p的直接靶基因。4.在SJSA-1细胞株中转染mir-20a-5p的mimic和si-sdc2,并在G292细胞株中转染mir-20a-5p的antagomir和GFP-sdc2。应用qRT-PCR验证,分析sdc2在细胞水平的表达是否受到mir-20a-5p mimic以及antagomir转染的影响。5.通过骨肉瘤细胞化疗敏感性检测（CCK8）、细胞增殖、细胞凋亡和裸鼠成瘤实验验证mir-20a-5p在骨肉瘤细胞在化疗耐受中的作用机制。结果1.RNA-Seq与miR-omic组学数据表明mir-20a-5p在G292细胞中的表达水平显著高于SJSA-1细胞中的表达水平,而sdc2的表达水平相反,提示sdc2可能是mir-20a-5p靶向基因之一。2.qRT-PCR、western blot实验结果表明,mir-20a-5p在G292细胞中的表达水平显著高于SJSA-1细胞中的表达水平,而sdc2的表达水平相反,在敏感细胞株G-292细胞中的表达水平明显低于耐受细胞株SJSA-1中的表达水平。3.双荧光素酶报告检测发现,mir-20a-5p可与sdc2的3’-UTR序列结合,降低了细胞内的荧光活性,证明了sdc2是mir-20a-5p的靶基因。4.在SJSA-1细胞中转染mir-20a-5p的mimic,si-sdc2,发现sdc2的mRNA和蛋白表达均下调;在G-292细胞中转染mir-20a-5p的antagomir,发现GFP-sdc2sdc2的mRNA和蛋白均表达上调。结果表明mir-20a-5p负向调控靶基因sdc2。5.骨肉瘤化疗敏感性检测（CCK8）结果表明,mir-20a-5p的过表达能够抑制骨肉瘤细胞的对化疗药物的抗性,而mir-20a-5p的低表达能够促进骨肉瘤细胞对化疗药物的抗性。当敲除sdc2基因表达后,化疗耐受性SJSA-1细胞的CCK8检测结果与mir-20a-5p的过表达时结果一致,能提高骨肉瘤细胞的化疗敏感性;而过表达sdc2基因时,化疗敏感性G292细胞的CCK8检测结果与mir-20a-5p的低表达时结果一致,能增加骨肉瘤的化疗耐药性。此结果与细胞凋亡实验结果及裸鼠成瘤实验结果保持一致。结论研究结果表明miR-20a-5p通过调控sdc2基因作用于骨肉瘤化疗药物耐药性。miR-20a-5p/sdc2调节通路可能是骨肉瘤患者的耐药标志物和治疗靶点。

关键词：骨肉瘤化疗耐药 miR-20a-5p sdc2

粪便sdc2和NDRG4基因甲基化检测在结直肠癌筛查中的应用分析

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湖南师范大学学报（医学版） 2021年第6期18卷 88-92页

作者：金文文张晓刘龙周琼毛玉环谭咸操谭黎明湖南师范大学附属第一医院/湖南省人民医院长沙410000

目的:有效的筛查能显著降低结直肠癌的发病率和死亡率。本研究通过sdc2和NDRG4基因粪便甲基化水平与结直肠癌的关联性分析,评价其在结直肠癌筛查中的临床价值。方法:收集2019年1月1日~2020年12月31日湖南省人民医院就诊的49例样本,其中... 详细信息

目的:有效的筛查能显著降低结直肠癌的发病率和死亡率。本研究通过sdc2和NDRG4基因粪便甲基化水平与结直肠癌的关联性分析,评价其在结直肠癌筛查中的临床价值。方法:收集2019年1月1日~2020年12月31日湖南省人民医院就诊的49例样本,其中结直肠癌患者16例,结直肠癌术后化疗患21例,结直肠息肉患者12例,采用荧光定量PCR法检测粪便中sdc2和NDRG4基因甲基化状态,同时采用化学发光法检测血清肿瘤标志物癌胚抗原(carcinoembryonicantigen,CEA)和糖类抗原19-9(carbohydrateantigen199,CA19-9),分析检测结果与临床病症的关联性。结果:结直肠癌患者组sdc2基因甲基化阳性率为75%,结直肠癌术后化疗组阳性率为9,52%,直肠息肉组阳性率为0%,3组间比较,差异有统计学意义。结直肠癌组sdc2基因甲基化阳性率高于结直肠癌术后化疗组阳性率,差异有统计学意义。sdc2联合NDRG4基因甲基化检测阳性检出率最高。sdc2/NDRG4基因甲基化检测灵敏度分别为75%、25%、75%,特异度为93.94%、100%、93.94%,CEA、CA19-9、CEA/CA19-9检测灵敏度62.5%、37.5%、68.75%,特异度为84.85%、87.88%、78.79,NDRG4特异度高于sdc2、sdc2/NDRG4、CEA、CA19-9、CEA/CA19-9,sdc2联合NDRG4基因甲基化检测阳性预测值(85.71%)及阴性预测值最高(88.57%),受试者工作曲线(ROC)分析显示,sdc2联合NDRG4基因甲基化检测最高(0.905)。结论:sdc2基因甲基化检测对结直肠癌的阳性检出率优于NDRG4基因甲基化检测,sdc2和NDRG4甲基化联合检测诊断性能最高,sdc2和NDRG4可作为结直肠癌筛查和预后判断的有效指标。

关键词： sdc2 NDRG4 肿瘤标志物结直肠癌筛查

sdc2智慧双循环节能空调为上海电信带来节能新体验

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电信网技术 2015年第10期 95-96页

目前,数据中心能耗日趋严重,尤其是制冷能耗在总能耗中高达30%。在如此严峻的形势下,充分利用室外自然冷源正成为降低制冷能耗的有效途径。中国电信股份有限公司上海分公司（简称上海电信）通过试用艾默生网络能源sdc2智慧双循环节能空... 详细信息

目前,数据中心能耗日趋严重,尤其是制冷能耗在总能耗中高达30%。在如此严峻的形势下,充分利用室外自然冷源正成为降低制冷能耗的有效途径。中国电信股份有限公司上海分公司（简称上海电信）通过试用艾默生网络能源sdc2智慧双循环节能空调,为数据中心运行找到了高效节能的制冷方案,并满足了对于节能、可靠、易于建设和维护的多重需求。

关键词：上海电信 sdc2 节能空调数据中心中国电信艾默生网络双循环冷源节能率精密空调