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外周血非编码rna在乳腺癌诊断中的研究进展

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中华检验医学杂志 2019年第9期42卷 803-806页

作者：何咏茵肖斌雷婷曲璟李林海孙朝晖中国人民解放军南部战区总医院检验科广州510010

真核生物转录组中含有大量非编码rna(non-coding rna,ncrna),ncrna在基因表达调控和各种细胞生理、病理进程中发挥着重要作用。近年来,ncrna在肿瘤早期诊断领域的研究是热点。本文将以ncrna中的微小rna(microrna,mirna)、长链非编码rna(... 详细信息

真核生物转录组中含有大量非编码rna(non-coding rna,ncrna),ncrna在基因表达调控和各种细胞生理、病理进程中发挥着重要作用。近年来,ncrna在肿瘤早期诊断领域的研究是热点。本文将以ncrna中的微小rna(microrna,mirna)、长链非编码rna(long non-coding rna,lncrna)和环状rna(circular rna,circrna)为代表,阐述3种ncrnas作为乳腺癌外周血诊断标志物的研究进展,展望ncrna在乳腺癌临床研究及临床转化中的前景,以期为乳腺癌早期诊断标志物的发现及诊治过程的监控提供思路。

关键词：乳腺肿瘤 rna,未翻译微rnas rna,长链非编码循环微rna 生物标记,肿瘤

lncrna-AC013472.3对脂多糖刺激大鼠肺泡巨噬细胞分泌肿瘤坏死因子α的影响

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中华医学杂志 2020年第12期100卷 899-903页

作者：李世吉王飞王永杰刘晟邱乐陈旭林安徽医科大学第一附属医院烧伤科合肥230022

目的探讨长链非编码rna(lncrna)-AC013472.3对脂多糖(LPS)刺激大鼠肺泡巨噬细胞(NR8383细胞)分泌肿瘤坏死因子(TNF)-α的影响。方法以NR8383细胞分别建立lncrna-AC013472.3沉默及过表达模型,沉默模型分为乱序无意义阴性小干扰rna序列(si... 详细信息

目的探讨长链非编码rna(lncrna)-AC013472.3对脂多糖(LPS)刺激大鼠肺泡巨噬细胞(NR8383细胞)分泌肿瘤坏死因子(TNF)-α的影响。方法以NR8383细胞分别建立lncrna-AC013472.3沉默及过表达模型,沉默模型分为乱序无意义阴性小干扰rna序列(si-con)组(转染si-con的NR8383细胞)、LPS+si-con组(10μg/L的LPS处理转染si-con的NR8383细胞24 h)、小干扰rna(sirna)组(转染sirna的NR8383细胞)和LPS+sirna组(10μg/L的LPS处理转染sirna的NR8383细胞24 h);过表达模型分为空质粒(p-con)组(转染p-con的NR8383细胞)、LPS+p-con组(10μg/L的LPS处理转染p-con的NR8383细胞24 h)、lncrna过表达质粒(plncrna)组(转染plncrna的NR8383细胞)和LPS+plncrna组(10μg/L的LPS处理转染plncrna的NR8383细胞24 h),实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测各组细胞中TNF-αmrna相对表达量;Western印迹法检测TNF受体相关因子-6(TRAF-6)和磷酸化的核因子-κB(NF-κB)p65蛋白相对表达量。结果在沉默模型中,LPS+si-con组TNF-αmrna相对表达量、TRAF-6和NF-κB p65蛋白相对表达量均显著高于si-con组(2.040±0.195比1.048±0.207、0.473±0.022比0.293±0.076和0.469±0.062比0.252±0.038)(均Prna组TNF-αmrna相对表达量、TRAF-6和NF-κB p65蛋白相对表达量均显著高于sirna组(4.158±0.119比1.028±0.019、0.700±0.104比0.231±0.023和0.771±0.095比0.258±0.050)(均Prna组各指标相对表达量显著高于LPS+si-con组(均Prna相对表达量、TRAF-6和NF-κB p65蛋白相对表达量均显著高于p-con组(1.961±0.169比0.999±0.143、0.533±0.047比0.247±0.020和0.565±0.108比0.276±0.048)(均Prna组TNF-αmrna、TRAF-6和NF-κB p65蛋白相对表达量均显著高于plncrna组(1.322±0.110比1.043±0.093、0.347±0.035比0.232±0.023和0.405±0.072比0.268±0.031)(均Prna组各指标相对表达量显著低于LPS+p-con组(均Prna-AC013472.3可能通过抑制NF-κB信号通路的激活,从而抑制LPS刺激NR8383细胞分泌TNF-α。

关键词：巨噬细胞,肺泡 rna,未翻译肿瘤坏死因子a 脂多糖类

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非编码rna在心力衰竭诊疗中的应用及展望

中华检验医学杂志 2019年第8期42卷 613-616,617页

作者：宋贵波段勇昆明医科大学第一附属医院医学检验科云南省检验医学重点实验室云南省实验诊断研究所昆明6500

心力衰竭(HF)是各种心脏疾病的严重表现或晚期阶段,死亡率和再住院率居高不下.生物标志物的检测在HF的精准诊疗和临床管理中发挥着重要作用,除了传统生物标志物外,mirna、circrna和lncrna等非编码rna在HF的诊断与鉴别诊断;病情严重程度... 详细信息

心力衰竭(HF)是各种心脏疾病的严重表现或晚期阶段,死亡率和再住院率居高不下.生物标志物的检测在HF的精准诊疗和临床管理中发挥着重要作用,除了传统生物标志物外,mirna、circrna和lncrna等非编码rna在HF的诊断与鉴别诊断;病情严重程度及预后评估;评估心衰患者出院后的心血管事件风险等方面显示出良好的应用前景,并将有助于HF患者的个体化管理.

关键词：心力衰竭 rna,未翻译微rnas rna,长链非编码生物标记

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支气管肺发育不良的表观遗传学机制研究进展

中华围产医学杂志 2020年第1期23卷 56-60页

作者：陈佩娟万致婷蔡保欢李文斌华中科技大学同济医学院附属同济医院儿科武汉430030 湖北省咸宁市中心医院湖北科技学院附属第一医院新生儿科437100

支气管肺发育不良是早产儿常见的慢性呼吸系统并发症,其发病机制尚未完全阐明,且暂无有效防治措施,严重影响早产儿存活率及预后。已有研究证实,组蛋白修饰、非编码rna和DNA甲基化等表观遗传学机制在支气管肺发育不良的发生、发展过程中... 详细信息

支气管肺发育不良是早产儿常见的慢性呼吸系统并发症,其发病机制尚未完全阐明,且暂无有效防治措施,严重影响早产儿存活率及预后。已有研究证实,组蛋白修饰、非编码rna和DNA甲基化等表观遗传学机制在支气管肺发育不良的发生、发展过程中发挥重要作用,且相关表观遗传变化多为可逆性改变,可能为临床治疗提供重要靶点。因此,表观遗传学研究将为进一步认识支气管肺发育不良的发病机制及防治支气管肺发育不良提供新方向和思路。

关键词：支气管肺发育不良表观基因组学组蛋白密码 rna,未翻译 DNA甲基化

HULC rna在肝癌细胞中的表达及其对邻近基因SLC35B3表达的影响

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中华医学杂志 2010年第44期90卷 3156-3159页

作者：李丹宋咏梅詹启敏中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肿瘤研究所分子肿瘤学国家重点实验室 100021

目的探讨长片段非编码rna--肝癌高表达基因（HULC）rna在不同的肿瘤细胞系中的表达情况以及对其邻近基因表达的影响.方法应用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）方法在不同来源的肿瘤细胞系中检测HULC rna的表达情况,并通过生物信息学的... 详细信息

目的探讨长片段非编码rna--肝癌高表达基因（HULC）rna在不同的肿瘤细胞系中的表达情况以及对其邻近基因表达的影响.方法应用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）方法在不同来源的肿瘤细胞系中检测HULC rna的表达情况,并通过生物信息学的方法寻找与其邻近的基因,再通过实时PCR技术检测HULC对邻近基因的表达情况的影响.结果在检测的8株细胞系：人胚肾细胞系293T,食管癌细胞系EC9706、KYSE150,结肠癌细胞系HCT116,肝癌细胞系SMMC7721、HepG2以及肺癌细胞系H446、H1229中,非编码rna HULC在HepG2细胞中的表达量特异性升高.HULC基因的附近（＜1000 bp）没有编码基因存在,与其距离最近的基因是SLC35B3,且间距在约200 000 bp.与HULC rna表达量较低的SMMC-7721细胞相比,内源性高表达HULC rna的HepG2细胞中SLC35B3的转录更高[（0.477±0.040）%比（0.129±0.004）%,P＜0.01].在SMMC7721细胞中转染pcDNA3.1-HULC质粒后,其邻近基因SLC35B3表达略微升高.而通过rna干扰的方法敲降HULC rna后,SLC35B3基因的表达也随之下降.HepG2细胞转染2条小干扰rna（sirna）后,SLC35B3基因的表达分别为[（0.283±0.007）%和（0.387±0.015）%],并且第1条sirna转染后与阴性对照[（0.477±0.042）%]比较差异有统计学意义（P＜0.01）.结论肝癌细胞HepG2中特异性高表达的非编码rna HULC对其邻近基因SLC35B3的表达有一定影响作用.

关键词： rna,未翻译计算生物学肝癌高表达基因rna 基因,SLC35B3

长链非编码rna TP73-AS1调控miR-181b及其靶基因HMGB1的表达以及对非小细胞肺癌细胞生物学行为的影响

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肿瘤 2021年第4期41卷 225-237页

作者：李超何淼杨桄权何小艳陈兆红德阳市人民医院肿瘤科四川德阳618000

目的:探讨长链非编码rna TP73-AS1通过调控微rna(microrna,mirna,miR)-181b及其靶基因高迁移率族蛋白B1(high-mobility group box-1,HMGB1)对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)增殖、侵袭、迁移和凋亡的影响。方法:采用实时荧光定量PCR法检测42例癌组织及其对应的癌旁组织,以及人正常肺上皮细胞BEAS-2B和人NSCLC细胞(A549和NCI-H1299)中TP73-AS1的表达水平,并分析TP73-AS1表达与患者总生存期的相关性。采用脂质体法将shrna-TP73-AS1(shTP73-AS1)和shrna-NC(shNC)转入A549和NCI-H1299细胞,分别采用CCK-8法、Transwell小室实验、划痕愈合实验及FCM法检测敲减TP73-AS1表达对NSCLC细胞增殖、侵袭、迁移和凋亡的影响。采用双荧光素酶报告基因验证TP73-AS1、miR-181b和HMGB1间的靶向关系。A549和NCI-H1299细胞中分别转入shTP73-AS1、shTP73-AS1+miR-181b-抑制子(inhibitor)和shTP73-AS1+pcDNA-HMGB1,再用CCK-8法、Transwell小室实验、划痕愈合实验及FCM法检测敲低TP73-AS表达后再沉默miR-181b表达或使HMGB1过表达对A549和NCI-H1299细胞增殖、侵袭、迁移和凋亡的影响。结果:TP73-AS1 mrna在癌组织中的相对表达量明显高于癌旁组织(Prna和蛋白的表达水平(P值均rna和蛋白的表达水平较仅转染shTP73-AS1明显上调(P值均<0.05),细胞增殖、侵袭和迁移能力也明显升高,而凋亡水平明显下降(P值均<0.05)。结论:TP73-AS1在NSCLC组织和细胞中高表达,可通过调控miR-181b/HMGB1轴促进癌细胞增殖、侵袭、迁移,并促进凋亡。

关键词：癌,非小细胞肺 rna,未翻译 HMGB1蛋白质细胞增殖细胞运动细胞凋亡

外泌体及其携带的非编码rna在卵巢癌诊疗中的研究进展

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肿瘤 2021年第3期41卷 206-214页

作者：陈其臻傅夏燕焦雨帆尹喆纪亚忠王炎秋同济大学附属同济医院妇产科生殖医学中心上海200065

卵巢癌为3大妇科恶性肿瘤之一,其发病率逐年上升,病死率位居妇科肿瘤首位,由于其早期诊断率低、复发率高和易产生化疗耐药,卵巢癌临床治疗效果较局限,预后较差。研究发现,外泌体(exosomes)携带有细胞来源的DNA、rna和蛋白质等物质,可参... 详细信息

卵巢癌为3大妇科恶性肿瘤之一,其发病率逐年上升,病死率位居妇科肿瘤首位,由于其早期诊断率低、复发率高和易产生化疗耐药,卵巢癌临床治疗效果较局限,预后较差。研究发现,外泌体(exosomes)携带有细胞来源的DNA、rna和蛋白质等物质,可参与调节肿瘤细胞与肿瘤微环境之间的细胞间通讯,其携带的非编码rna在转录、转录后及表观遗传学水平上调控基因的表达,并在肿瘤的发生与进展中发挥重要作用。因此,外泌体非编码rna有望作为卵巢癌的诊断标志物或治疗靶点,本文将就外泌体非编码rna在卵巢癌发生、发展及治疗过程中的研究进展作一综述。

关键词：卵巢肿瘤外泌体 rna,未翻译微rnas rna,环状

缺氧诱导的外泌体非编码rna在肿瘤进展中的作用

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肿瘤 2020年第11期40卷 793-800,808页

作者：闵静宇王慧之李非凡刘雅雯龚爱华徐岷江苏大学附属医院消化内科江苏镇江212001 江苏大学医学院江苏镇江212013

缺氧是肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的一个重要特征。为了应对缺氧所造成的生存压力,肿瘤细胞及其周围的基质细胞都会分泌大量含有非编码rna(non-coding rna,ncrna)的外泌体。这些外泌体能够介导肿瘤细胞与基质细胞间的相互... 详细信息

缺氧是肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的一个重要特征。为了应对缺氧所造成的生存压力,肿瘤细胞及其周围的基质细胞都会分泌大量含有非编码rna(non-coding rna,ncrna)的外泌体。这些外泌体能够介导肿瘤细胞与基质细胞间的相互作用,从而促进肿瘤的血管生成、侵袭、迁移、免疫逃逸以及治疗耐药。随着第二代测序(next generation sequencing,NGS)技术的飞速发展,大量受缺氧调节的外泌体ncrna被不断挖掘出来。在临床应用方面,外泌体作为一种内源性的细胞衍生出的纳米载体,可用于非侵入性液体活检。此外,基于外泌体的癌症治疗药物递送系统的研究也日益增多。本文将重点以缺氧诱导的肿瘤源性外泌体ncrna在肿瘤进展中的关键作用进行综述。

关键词：肿瘤微环境外泌体 rna,未翻译低氧

虫媒黄病毒rna元件在病毒复制中的调控功能

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解放军医学杂志 2010年第3期35卷 339-341页

作者：刘然秦成峰秦鄂德军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

rna病毒的复制主要在细胞质中完成,包括病毒rna的亚细胞定位、病毒复制相关蛋白的翻译与加工、病毒复制复合体(replication complex,RC)的组装、基因组子代rna的合成等一系列紧密偶联的过程。为利于自身复制,rna病毒从进化中获得了多种... 详细信息

rna病毒的复制主要在细胞质中完成,包括病毒rna的亚细胞定位、病毒复制相关蛋白的翻译与加工、病毒复制复合体(replication complex,RC)的组装、基因组子代rna的合成等一系列紧密偶联的过程。为利于自身复制,rna病毒从进化中获得了多种rna顺式作用元件(cis-acting element)。通过这些元件的调控作用,rna病毒不但能以病毒特有的策略进行复制,[第一段]

关键词：虫媒黄病毒 rna,未翻译环化病毒复制