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水霉菌的形态及ITS区分子鉴定

水生生物学报 2010年第2期34卷 293-301页

作者：可小丽汪建国顾泽茂李明龚小宁中国科学院水生生物研究所武汉430072 中国科学院研究生院北京100049 华中农业大学水产学院武汉430070 武汉工业学院饲料科学系武汉430023

研究利用形态学和分子生物学相结合的方法,对从患病黄颡鱼病灶处分离的水霉菌株(HSY)的分类地位进行了研究。结果显示,该菌在18-23℃均能形成游动孢子囊,但只在20℃才大量释放游动孢子;在15℃培养约3周出现大量的藏卵器,多数顶生,形态与... 详细信息

研究利用形态学和分子生物学相结合的方法,对从患病黄颡鱼病灶处分离的水霉菌株(HSY)的分类地位进行了研究。结果显示,该菌在18-23℃均能形成游动孢子囊,但只在20℃才大量释放游动孢子;在15℃培养约3周出现大量的藏卵器,多数顶生,形态与Saprolegnia litoralis和Saprolegnia ferax的均非常相似。序列比对分析显示,HSY菌株与***、***、***、***、***、***和***的ITS区(包括5.8S rDNA)序列相似性均高于99%。系统发育分析显示,所选的真菌分为3个群,HSY落于第一个群,MP树显示HSY菌株与***、***、***、***、***以及***枝系均互相平行,而NJ树显示其与***和***更近。综合形态学、ITS区序列及系统发育分析,将HSY菌株暂定为多子水霉(Saprolegnia ferax)。

关键词：卵菌纲水霉分类 itsrdna 系统发育

依据ITS rDNA序列探讨我国盾腹虫属种类的系统发育关系(英文)

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水生生物学报 2010年第2期34卷 312-316页

作者：陈明秀张立强文春根孙军高谦华中农业大学水产学院武汉430070 中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室武汉430072 南昌大学生命科学学院南昌330047 暨南大学水生生物研究所广州510632

盾腹吸虫为寄生扁形动物中一小的类群。我国已报道7种盾腹吸虫,其中5种隶属于盾腹虫属(Aspidogastridae,Aspidogastrinae)。研究测定了在我国采集到的4种盾腹虫属吸虫的核糖体DNA转录内间隔区(itsrdna)序列,并分别采用邻接法和最大似然... 详细信息

盾腹吸虫为寄生扁形动物中一小的类群。我国已报道7种盾腹吸虫,其中5种隶属于盾腹虫属(Aspidogastridae,Aspidogastrinae)。研究测定了在我国采集到的4种盾腹虫属吸虫的核糖体DNA转录内间隔区(itsrdna)序列,并分别采用邻接法和最大似然法构建分子系统发育树。结果显示,这4种盾腹吸虫的ITS-1和ITS-2序列的长度分别在728—877bp和518—645bp之间,其G+C含量分别在50.1%—52.3%和49.2%—52.2%范围内。4种盾腹吸虫的种间遗传距离在0.2%—26.9%之间,其中重庆盾腹吸虫(Aspidogaster chongqingensis)和似螺盾腹吸虫(***)间仅为0.2%。所构建的最大似然树和邻接树具有相同的拓扑结构,均支持重庆盾腹吸虫和似螺盾腹吸虫亲缘关系最近,它们与饭岛盾腹吸虫(***)亲缘关系较近,而与位于系统树基部的贝居盾腹吸虫(***)关系较远。此外,对我国盾腹属种类的宿主特异性进行了讨论。

关键词： itsrdna 盾腹属系统发育关系宿主特异性

微生物菌肥对寒地大豆根际土壤真菌多样性的影响

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大豆科学 2021年第6期40卷 805-812页

作者：胡基华张烨张淑梅陈静宇姜威曹旭李晶吴皓琼黑龙江省科学院微生物研究所黑龙江哈尔滨150010 黑龙江省科学院高技术研究院黑龙江哈尔滨150020

为了解决大豆种植过程中因过量施用化肥带来的土壤问题,从真菌多样性和组成结构角度评估微生物菌肥对大豆根际真菌群落的影响,本研究通过减施化肥配施微生物菌肥等不同处理,采用高通量测序技术研究大豆花期根际土壤真菌多样性和结构组... 详细信息

为了解决大豆种植过程中因过量施用化肥带来的土壤问题,从真菌多样性和组成结构角度评估微生物菌肥对大豆根际真菌群落的影响,本研究通过减施化肥配施微生物菌肥等不同处理,采用高通量测序技术研究大豆花期根际土壤真菌多样性和结构组成的变化。结果表明:子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉菌门(Mortierellomycota)和担子菌门(Basidiomycota)为主要菌门,其中子囊菌门为主要优势菌类群。同一地块不同施肥方式,其根际真菌群落存在差异,减施化肥配施微生物复合菌肥可以有效降低镰刀菌属丰度,单施微生物菌肥可有效提高青霉属(Penicillium)和曲霉科(Aspergillaceae)丰度。综上,微生物菌肥可以增加有益菌丰度,减少病原菌丰度。

关键词：微生物菌肥土壤微生物根际真菌多样性减施化肥 itsrdna

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不同甜酒曲中可培养真菌的多样性分析

中国酿造 2015年第12期34卷 48-54页

作者：姚淑敏闫华文陈璐曲阜师范大学生命科学学院山东曲阜273165

用可培养的方法对6种甜酒曲中的真菌进行分离筛选,共分离得到25株酵母菌和13株霉菌,利用26S r DNA序列分析对酵母菌进行鉴定,结果表明,其分属于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、扣囊复膜酵母(Saccharomycopsis fibuligera)、东方... 详细信息

用可培养的方法对6种甜酒曲中的真菌进行分离筛选,共分离得到25株酵母菌和13株霉菌,利用26S r DNA序列分析对酵母菌进行鉴定,结果表明,其分属于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、扣囊复膜酵母(Saccharomycopsis fibuligera)、东方伊萨酵母(Issatchenkia orientalis)和克鲁维毕赤酵母(Pichia kluyveri)。利用ITS r DNA序列分析对霉菌菌株进行鉴定,结果表明,13株霉菌分别为米根霉(Rhizopus oryzae)、小孢根霉(Rhizopus microsporus)、小孢根霉华变种(Rhizopus microsporus ***)、小孢根霉须状变种(Rhizopus microsporus ***)、印度毛霉(Mucor indicus)和卷枝毛霉(Mucor circinelloides)。

关键词：可培养真菌 26SrDNA itsrdna 甜酒曲

香樟树新病原菌——二年残孔菌的形态学鉴定及ITS序列系统发育分析

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中南林业科技大学学报 2012年第5期32卷 73-75,124页

作者：郑俊娟商圆圆霍存录方英杰贺新生西南科技大学生命科学与工程学院四川绵阳621010

报道了香樟树的一种新病原菌,对采集的标本及其培养物的形态特征进行观察,对其ITS区序列进行测定和系统发育分析,将所测得的序列提交至Genbank获得序列号为JN182923。通过Blast比对获得同属近缘的序列后构建系统发育树并进行同源性分析... 详细信息

报道了香樟树的一种新病原菌,对采集的标本及其培养物的形态特征进行观察,对其ITS区序列进行测定和系统发育分析,将所测得的序列提交至Genbank获得序列号为JN182923。通过Blast比对获得同属近缘的序列后构建系统发育树并进行同源性分析。形态学鉴定和分子鉴定相结合将标本鉴定为二年残孔菌Abortiporus biennis,由系统发育树推断,二年残孔菌是多元进化的。

关键词：二年残孔菌形态特征 itsrdna 系统发育

尖孢镰刀菌高产纤维素酶菌株的筛选鉴定及发酵条件优化

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尖孢镰刀菌高产纤维素酶菌株的筛选鉴定及发酵条件优化

作者：王玮内蒙古大学

学位级别：硕士

本文对实验室保藏的121株尖孢镰刀菌(形态学鉴定)进行了产纤维素酶的研究,通过初筛复筛得到了了5株纤维素酶的高产菌株。对所得菌株进行了[TS序列鉴定和粗酶液酶学性质分析,并进行了发酵产酶条件的优化。通过刚果红染色观察水解圈的方法... 详细信息

本文对实验室保藏的121株尖孢镰刀菌(形态学鉴定)进行了产纤维素酶的研究,通过初筛复筛得到了了5株纤维素酶的高产菌株。对所得菌株进行了[TS序列鉴定和粗酶液酶学性质分析,并进行了发酵产酶条件的优化。通过刚果红染色观察水解圈的方法从121株尖孢镰刀菌(形态学鉴定)中初步筛选出20株酶活较高的菌株。从初筛得到的20株菌种通过粗酶液酶活测定和酶活力计算,筛选出纤维素酶活力最高的5株菌,其中H57-1酶活力达到16.41U/ml。对筛选出的5株菌进行itsrdna序列测定。测序结果利用***. nlm. (？)ih. gov中BALST软件,与Genbank数据库进行序列比对分析,结果显示5株菌均与尖孢镰刀菌(Fusarium Oxysporum Schlech)亲缘关系最近,相似性达99%。对菌株H57-1的粗酶液酶学性质进行了分析。以CMC-Na为底物,其最适反应条件为PH=5.3,62℃。该酶具有良好的pH稳定性和温度稳定性,尤其作为真菌对强碱环境的耐受能力,一定程度上能弥补真菌纤维素酶耐碱性差和细菌纤准素酶酶活低的不足。对菌株57-1最适产酶发酵条件进行了优化。以麸皮48.0g/L、蛋白胨14.0g/L磷酸二氢钠2.0g/L、氯化铵3.9g/L、氯化钠2.0g/L、pH7.0配制发酵培养基,取3mL种龄48h的种子液接种发酵培养基,温度28℃、摇床转速150r/min振荡培养85h,最终酶活力达到23.19U/ml,比初始酶活力提高了41.3%。

关键词：尖孢镰刀菌纤维素酶 CMC-Na itsrdna

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砖红壤微生物总DNA的提取方法比较

热带农业科学 2019年第1期39卷 47-51页

作者：邓大豪邓涛周游汪军杨腊英黄俊生中国热带农业科学院环境与植物保护研究所海南海口571101 海南大学海南海口570228

针对中国南方砖红土壤的特点,通过比较和优化土壤微生物总DNA的提取方法,获得较高质量的DNA,从而进行土壤细菌16S r DNA基因扩增和真菌I TS r DNA基因扩增。结果表明:方法一提取的土壤微生物DNA受到腐殖质等影响无法进行基因扩增;方法... 详细信息

针对中国南方砖红土壤的特点,通过比较和优化土壤微生物总DNA的提取方法,获得较高质量的DNA,从而进行土壤细菌16S r DNA基因扩增和真菌I TS r DNA基因扩增。结果表明:方法一提取的土壤微生物DNA受到腐殖质等影响无法进行基因扩增;方法二提取的DNA可以进行土壤微生物基因组16S r DNA基因扩增,提取时间大大减少,但无法进行I TS r DNA基因扩增;方法三提取的DNA质量最好,可以进行细菌16S r DNA和真菌I TS r DNA基因组扩增。

关键词：土壤微生物 DNA提取 16SrDNA itsrdna