检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

鄱阳湖老爷庙水域细菌群落组成分析

长江流域资源与环境 2011年第8期20卷 963-969页

作者：吴兰葛刚龚世杰万金保南昌大学生命科学与食品工程学院江西南昌330031 南昌大学环境科学与化学工程学院江西南昌330031

通过提取鄱阳湖老爷庙水域水体细菌总DNA,构建细菌16srrna基因文库和序列测定等手段,以期揭示鄱阳湖老爷庙水域的细菌群落组成并探讨细菌多样性与湖泊水体理化参数之间的关系。研究结果认为:来自老爷庙水域的2006年10月(PN06-10)和2007... 详细信息

通过提取鄱阳湖老爷庙水域水体细菌总DNA,构建细菌16srrna基因文库和序列测定等手段,以期揭示鄱阳湖老爷庙水域的细菌群落组成并探讨细菌多样性与湖泊水体理化参数之间的关系。研究结果认为:来自老爷庙水域的2006年10月(PN06-10)和2007年5月(PN07-5)的细菌文库中的180个阳性克隆产生了66个细菌分类操作单位(OTUs),这些细菌主要分属于:变形菌Alpha-纲,Beta-纲,Gamma-纲,Epsilon-纲,拟杆菌门,放线菌门,浮霉菌门,酸杆菌门和OP10等9大类型。2006年10月老爷庙水域的优势菌群为Beta-变形菌;2007年5月优势菌群为Gamma-变形菌和拟杆菌,表明鄱阳湖细菌组成在不同的季节显著不同。进一步系统发育分析表明:大部分细菌的最相似序列来源于淡水,湖泊和土壤的未培养细菌,且部分细菌与环境污染物降解有关。

关键词：鄱阳湖 16srrna基因文库细菌群落组成系统发育分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

可可西里土壤样品中细菌多样性的分析

微生物学通报 2011年第7期38卷 1132-1139页

作者：苏进进张玉琴孙莹靳蓉赵莉莉王宇陈杰苏静余利岩中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所北京100050

采用纯培养和免培养相结合的方法对来源于可可西里的一份土壤样品中的细菌多样性进行了初步研究。纯培养实验使用了6种分离培养基,共得到细菌19株,其中放线菌7株,非放线菌细菌12株。这些菌株分别属于叶杆菌属(Phyllobacterium)、贪食菌... 详细信息

采用纯培养和免培养相结合的方法对来源于可可西里的一份土壤样品中的细菌多样性进行了初步研究。纯培养实验使用了6种分离培养基,共得到细菌19株,其中放线菌7株,非放线菌细菌12株。这些菌株分别属于叶杆菌属(Phyllobacterium)、贪食菌属(Variovorax)、假单胞菌属(Pseudomonas)、链霉菌属(Streptomyces)、小月菌属(Microlunatus)、原小单胞菌属(Promicromonospora)、韩国生工菌属(Kribbella)和芽孢杆菌属(Bacillus)8个属。免培养分析采用基于通用引物PCR扩增的细菌16S rRNA基因文库的方法以及变性梯度凝胶电泳(DGGE)。16S rRNA基因文库分析结果表明,该土壤样品细菌群落可划分为19个OTUs,分属于5个不同纲,优势顺序为β-Proteobacteria(75%),α-Proteobacteria(9%),γ-Proteobacteria(7%),Actinobacteria(7%),Firmicutes(2%)。变性梯度凝胶电泳分析表明,该样品细菌多样性指数Shannon-wiener index为2.68,表明其中微生物多样性较低,这可能和其所处的极端环境有一定关系。比较纯培养和免培养的实验结果发现,土壤中的一些优势细菌并没有被有效地分离,需要在针对特定微生物设计特定培养基及培养条件进行选择性分离上做更多的探索研究。

关键词：可可西里纯培养免培养 ARDRA 16srrna基因文库 DGGE

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

清香型大曲细菌群落结构的比较分析

食品与机械 2015年第3期31卷 11-15,73页

作者：叶光斌王彩虹王毅甄攀王勇罗惠波四川理工学院生物工程学院四川自贡643000 酿酒生物技术及应用四川省重点实验室四川自贡643000 五粮液集团质量检测中心四川宜宾644000 山西杏花村汾酒厂股份有限公司山西汾阳032200

通过构建细菌16srrna基因文库、RFLP指纹图谱分析、测序和系统发育学分析,分别对汾酒清茬曲、后火曲和红心曲的细菌群落结构进行比较。结果表明,清香型3种大曲细菌均分属于芽孢杆菌纲、放线菌纲及变形菌纲,但具体种属组成存在一定差异,... 详细信息

通过构建细菌16srrna基因文库、RFLP指纹图谱分析、测序和系统发育学分析,分别对汾酒清茬曲、后火曲和红心曲的细菌群落结构进行比较。结果表明,清香型3种大曲细菌均分属于芽孢杆菌纲、放线菌纲及变形菌纲,但具体种属组成存在一定差异,其中清茬曲的优势细菌菌群为乳杆菌属和葡萄球菌属(占全部克隆子的比例分别为37.78%,22.22%);后火曲的优势细菌菌群为乳杆菌属、葡萄球菌属、芽孢杆菌属、魏斯氏菌属(占全部克隆子的比例分别为35%,16.67%%,16.67%,13.33%);红心曲的优势细菌菌群为乳杆菌属、芽孢杆菌属、高温放线菌属(占全部克隆子的比例分别为26.67%,28.89%,17.78%)。

关键词：清香型大曲清茬曲后火曲红心曲 16srrna基因文库细菌群落结构

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

鄱阳湖水体细菌群落组成及遗传多样性

环境科学研究 2009年第10期22卷 1145-1149页

作者：吴兰葛刚龚世杰朱国锋万金宝南昌大学分子生物学重点实验室江西南昌330031 南昌大学环境与化学工程学院江西南昌330031

利用建立细菌16S rRNA基因文库和限制性内切酶长度多态性（RFLP）分析的方法,对鄱阳湖南、北湖区水体的细菌多样性进行了研究.结果表明,鄱阳湖水体细菌多样性较高,且南湖区2007年水体的细菌多样性明显高于其2006年水体和北湖区水体.主... 详细信息

利用建立细菌16S rRNA基因文库和限制性内切酶长度多态性（RFLP）分析的方法,对鄱阳湖南、北湖区水体的细菌多样性进行了研究.结果表明,鄱阳湖水体细菌多样性较高,且南湖区2007年水体的细菌多样性明显高于其2006年水体和北湖区水体.主要细菌组成分析表明,鄱阳湖水体中的349个阳性克隆代表的167种基因型分别属于十大细菌类群,变形菌门（Proteobacteria）在4个克隆文库中占据了47%-81%,数量极其丰富,尤其是亚型的β-变形菌为优势菌群;拟杆菌门（Bacteroidetes）和放线菌门（Actinobacteria）也广泛分布,且有2.9%-17.1%的克隆数属于未分类细菌.研究结果进一步提示鄱阳湖水体有一定程度的富营养化.

关键词：鄱阳湖限制性内切酶长度多态性 16srrna基因文库细菌多样性

纤维素降解混合培养物的16S rRNA基因序列分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

安徽大学学报（自然科学版） 2013年第4期37卷 93-98页

作者：张科贵於蝶杨景艳王顺昌淮南师范学院生命科学系安徽淮南232001

以牦牛瘤胃内容物为接种物,以滤纸为唯一碳源富集到一个降解纤维素的混合培养物.构建混合培养物的16S rRNA基因文库,共获得49个序列,分为7个OTU.其中19个序列与已培养细菌的16S rRNA基因相似性>97%,占总序列的38.8%;2个古菌的序列与甲... 详细信息

以牦牛瘤胃内容物为接种物,以滤纸为唯一碳源富集到一个降解纤维素的混合培养物.构建混合培养物的16S rRNA基因文库,共获得49个序列,分为7个OTU.其中19个序列与已培养细菌的16S rRNA基因相似性>97%,占总序列的38.8%;2个古菌的序列与甲烷菌的16S rRNA基因相似性分别为99%和98%,占总序列的4.1%;28个序列属于未培养细菌,占总序列的57.1%.未培养的序列形成4个独立的系统发育分支,其中3个未培养分支与在其他环境中的黏附在纤维素上的瘤胃细菌的16S rRNA基因序列相似性>97%,推测这3类微生物可能与纤维素降解相关.

关键词：牦牛瘤胃纤维素降解 16srrna基因文库未培养微生物

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

河西走廊盐碱土细菌种群结构多样性的研究

西北师范大学学报（自然科学版） 2013年第2期49卷 90-95页

作者：牛世全景彩虹廖世齐朱学泰韩建山西北师范大学生命科学学院甘肃兰州730070 甘肃省肿瘤医院分子生物学实验室甘肃兰州730050

土壤盐碱化是引起土壤生态环境恶化的主要原因之一,盐碱土的改良利用是目前研究的热点.本文采用构建16srrna基因文库,研究了位于中国西北部的河西走廊盐碱土中细菌群落结构多样性.结果表明,原生盐碱土、次生盐碱土和农田土三种不同类型... 详细信息

土壤盐碱化是引起土壤生态环境恶化的主要原因之一,盐碱土的改良利用是目前研究的热点.本文采用构建16srrna基因文库,研究了位于中国西北部的河西走廊盐碱土中细菌群落结构多样性.结果表明,原生盐碱土、次生盐碱土和农田土三种不同类型的土壤中细菌种群结构的组成和丰度具有明显差异.作为对照的农田土中存在3大细菌类群,其中Firmicutes为优势菌群;原生盐碱土中存在9大细菌类群,Firmicutes和γ-proteobacteria为优势菌群;三个次生盐碱土样品存在很大差异,γ-proteobacteria为其共同优势菌群.Marinobacter,Halomonas和Pseudomonas这些嗜盐菌普遍存在于盐碱土中.

关键词：盐碱土 16srrna基因文库细菌种群结构多样性

砾石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及主要功能

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

砾石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及主要功能

作者：金玉花东北师范大学

学位级别：硕士

剩余污泥的处理与处置是目前生物法处理生活污水和工业废水的主要难题,新型剩余污泥减量化处理技术—生物砾间接触氧化反应工艺可在高效处理废水的同时达到无剩余污泥排出。本文通过对碎石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及其主... 详细信息

剩余污泥的处理与处置是目前生物法处理生活污水和工业废水的主要难题,新型剩余污泥减量化处理技术—生物砾间接触氧化反应工艺可在高效处理废水的同时达到无剩余污泥排出。本文通过对碎石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及其主要功能的研究,从微观分析生物碎石球工艺的污泥减量机理。实验首先使反应器启动、挂膜、正常运行,经过长时间的稳定运行,结果证明反应器在5个月的连续运行期间无剩余污泥排出且处理效果良好,出水各项指标均达标(污水综合排放标准一级,GB 8987-1996)。在反应器的稳定运行期间,还对反应器内的生物膜及沉淀污泥进行了显微镜镜检,发现在反应器内有丰富的原生动物和微小后生动物。这些微型动物使系统内食物链增长、变复杂,增加了能量在食物连内的损失,减少了用于合成生物体的能量,进而降低污泥的产量,同时微型动物对细菌和有机颗粒的大量吞噬也为系统的污泥减量做出了贡献。实验采用分子生物学手段,对反应器(GCOR)中原核生物多样性建立了16srrna基因文库,进行了系统发育分析,并讨论了多种原核生物共存对剩余污泥减量化的贡献.结果表明,系统内的原核生物可分为好氧呼吸菌群与厌氧水解发酵菌群两大类。其中,优势菌群分别是以呼吸代谢为主的假单胞菌属和以发酵为主要代谢方式的拟杆菌/噬纤维菌菌属,它们的16srrna序列各占文库的17%。此外,好氧菌群中还发育有α蛋白菌、β蛋白菌、γ蛋白菌、硝化螺菌属、土壤杆菌属、衣原体属、葡萄糖杆菌属及褐色高温单孢菌属细菌;厌氧菌群中则发育属于螺旋体属、δ蛋白菌、反硝化菌、乳杆菌属、真杆菌属的原核生物。反应系统中两大相反环境多种原核生物的共存,为在降解污水有机物的同时,达到剩余污泥减量化做出巨大贡献。

关键词：生物砾间接触氧化反应器原核生物多样性 16srrna基因文库系统发育分析

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

新蚜虫疠霉（虫霉目）共生细菌多样性研究

新蚜虫疠霉（虫霉目）共生细菌多样性研究

作者：陈相波中国计量学院

学位级别：硕士

与共生细菌相关的科学研究受到越来越多的关注，大量证据显示在农林环境、食品药物等领域的诸多科学问题都与细菌和真菌的互作有非常密切的关系。而且细菌与真菌共生不是一种偶然的生态现象，而是经历了长期的协同共进化，最终两者能够... 详细信息

与共生细菌相关的科学研究受到越来越多的关注，大量证据显示在农林环境、食品药物等领域的诸多科学问题都与细菌和真菌的互作有非常密切的关系。而且细菌与真菌共生不是一种偶然的生态现象，而是经历了长期的协同共进化，最终两者能够相互适应和相互依存，这样的科学观点得到许多学者的认同。虫霉目(Entomophthorales)真菌是许多昆虫的专性病原真菌，通过引起寄主高强度的流行病而达到控制害虫的作用，是重要的生防真菌和科学研究对象。然而虫霉目昆虫病原真菌是否存在共生细菌这一观点一直没有得到关注和科学的证明，本文从虫霉目真菌是否存在共生菌这个假设出发，以在蚜群中广泛流行的专性病原真菌新蚜虫疠霉（Pandora neoaphidis）为研究对象，通过16S rRNA技术构建基因文库，获得新蚜虫疠霉共生细菌的种群多样性信息，同时通过常规方法对可培养共生菌进行分离、鉴定来确定共生菌的种类，运用荧光原位杂交技术（FISH）确定共生菌在新蚜虫疠霉菌丝中的位置;通过对不同来源虫霉样品的共生细菌进行16S rRNA基因文库构建，来验证细菌共生在虫霉目真菌中的普遍性;另外通过生物测定来验证共生细菌的多样性与新蚜虫疠霉对桃蚜毒力的相关性，为研究共生细菌和虫霉目真菌的互作机制提供新的思路。一、新蚜虫疠霉共生细菌16S rRNA基因文库构建通过构建新蚜虫疠霉共生细菌16S rRNA基因文库，共获得9个种属的细菌，这些共生细菌主要隶属于Proteobacteria变形菌门，其中比例最高的为γ-变形菌纲共占了62.0%，α-变形菌纲和β-变形菌纲分别为14.3%和2.4%，同时硬壁菌门Firmicutes和拟杆菌门Bacteroidetes分别占了4.8%和16.7%。在这些共生菌群中，不动杆菌属以42.9%的比例为最高。由此确定了新蚜虫疠霉存在共生细菌的假设，且这些共生细菌具有比较丰富的种群多态性。二、新蚜虫疠霉共生细菌的分离、鉴定和荧光原位杂交验证通过对新蚜虫疠霉液体菌丝中共生细菌在常规培养基上进行分离和培养，获得了一株可培养的新蚜虫疠霉共生细菌，对该共生细菌进行16S rRNA和Biolog生理生化鉴定，初步确定该共生细菌为醋酸钙不动杆菌（Acinetobactercalcoaceticus），而且以新蚜虫疠霉总DNA作为模板，用不动杆菌特异性引物P-rA1和P-rA2进行扩增，同样获得了425bp的具有特异性的目的条带，这与我们前面16S rRNA基因文库构建中的结果相符。根据获得的共生细菌16S序列设计特异性的杂交探针，对新蚜虫疠霉菌丝切片进行荧光原位杂交，激光共聚焦显微镜观察后获取的图像可以明显地证明共生细菌不动杆菌（A. calcoaceticus）存在于新蚜虫疠霉菌丝体内，确定了不动杆菌是新蚜虫疠霉中可培养的内共生细菌之一。三、不同虫霉样品共生细菌16S rRNA基因文库构建及其相关功能分析分别对不同地域寄主来源的新蚜虫疠霉ARSEF5403菌株、努利虫疠霉ARSEF8931菌株，分离过程中未经抗生素处理的F98028菌株和经PSN抗生素处理的新蚜虫疠霉F98028+菌株及其分生孢子F98028+pc进行共生细菌的16srrna基因文库构建，总共获得了21个属的25种共生细菌。通过对不同样品中共生细菌之间的种群关系进化分析发现，它们分别属于Alphaproteobacteria、Betaproteobacteria、 Gammaproteobacteria、 Firmicutes、 Actinobacteria以及Bacteroidetes共六个系统类群。上述研究表明细菌共生现象在虫疠霉属的真菌中普遍存在，而且具有较高的多样性。在比较新蚜虫疠霉菌株F98028+及其分生孢子的共生菌群后发现，新蚜虫疠霉可以将部分类群的共生细菌垂直传播至其弹射的分生孢子中。在新蚜虫疠霉F98028复壮分离时，通过分析使用PSN抗生素对共生菌群的影响发现，γ-变形菌纲对抗生素具有很强的抗性。分别对新蚜虫疠霉F98028+菌株（分离时使用抗生素）和复壮后的新蚜虫疠霉F98028菌株（分离时未使用抗生素）进行生测，结果发现，前者的LC50值显著高于后者，说明新蚜虫疠霉在经过复壮后对寄主桃蚜的毒力呈上升趋势;而且共生菌群的多样性指数也和毒力成正相关。可能是由于新蚜虫疠霉中的一部分共生细菌需要通过对蚜虫寄主的侵染而获得，进而恢复因传代或者抗生素处理而减弱的毒力。四、结论与意义本研究通过对重要的虫霉目真菌—新蚜虫疠霉的共生细菌现象进行了系统的研究，上述的研究结果表明，新蚜虫疠霉存在共生细菌这一假设成立，而且在虫霉目真菌中具有一定的共生普适性。这一发现将对深入研究虫霉目真菌生物学功能的内在机制提供了一条崭新的思路。

关键词：虫霉目真菌新蚜虫疠霉共生细菌荧光原位杂交 16srrna基因文库

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

土壤样品中细菌多样性的分析

微生物学通报 2011年第7期38卷 1131-1131页

作者：邱并生 <微生物学通报>编委会北京100101

微生物分子生态学的研究表明,自然界中只有很小部分的微生物得到了纯培养,绝大多数微生物是未被开发的和未知的,因此探索和培养那些未知的微生物物种可以发掘微生物新的菌种资源[1-2]。

关键词：可可西里纯培养免培养 ARDRA 16srrna基因文库 DGGE