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耕地质量评价缺失数据填充方法研究

农业资源与环境学报 2021年第6期38卷 1132-1141页

作者：陈宇周悟胡月明谢健文华南农业大学资源环境学院广州510642 广东省土地信息工程技术研究中心广州510642 广东省土地利用与整治重点实验室广州510642 自然资源部建设用地再开发重点实验室广州510642 青海大学农牧学院西宁810016 青海-广东自然资源监测与评价联合重点实验室西宁810016

在耕地质量数据调查与采集过程中会由于人为、环境等因素造成数据缺失,而目前数据缺失填充方法都存在适用性不足的问题,为完善耕地质量数据库从而提高耕地质量评价精度,对耕地质量评价缺失数据填充方法的研究是十分重要的。本研究以广... 详细信息

在耕地质量数据调查与采集过程中会由于人为、环境等因素造成数据缺失,而目前数据缺失填充方法都存在适用性不足的问题,为完善耕地质量数据库从而提高耕地质量评价精度,对耕地质量评价缺失数据填充方法的研究是十分重要的。本研究以广州市从化区耕地质量数据库为样本集,根据空间相关性和空间分布将数据集划分为空间关联性数据集和非空间关联性数据集,利用多种填充方法对其进行缺失填充模拟,采用十字交叉法进行精度验证。结果表明:选取数据整体异常值比例不足1.2%,且高程、气温、有效锌等25组因素具有空间相关性。对空间关联性数据填充精度最高的是四象最近邻算法,在缺失率20%以下时精度仍高达80%,精度随缺失率增大而降低,其次为K最邻近(KNN)算法、期望最大化法、多重填充法、回归模型算法,四象最近邻算法相较于KNN算法在数据密集时精度更好。对非空间关联性数据填充精度最高的是相似聚集填充算法,在缺失率25%以下时精度超过80%,其次为期望最大化法、多重填充法、回归模型算法。综上,本研究提出的四象最近邻算法和相似聚集填充算法相比其他算法在耕地质量评价缺失数据填充中精度更高,效果更稳定,且实用性更广。

关键词：耕地质量评价缺失数据填充从化区精度

Glu-1位点缺失对小麦麦谷蛋白聚合体粒度分布及面团特性的影响

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作物学报 2015年第1期41卷 22-30页

作者：张平平马鸿翔姚金保 Joseph M.AWIKA 江苏省农业科学院/江苏省农业生物学重点实验室江苏南京210014 Cereal Quality Laboratory Department of Soil and Crop Sciences Texas A&M University College Station

以Glu-1位点正常和部分缺失的小麦品系为材料,探讨HMW-GS和LMW-GS组成与谷蛋白聚合体粒度分布和面团特性的关系,为利用HMW-GS缺失系改良小麦品质提供理论依据。在20个供试硬白冬麦品系中,1个品系为Glu-A1位点缺失,5个品系为Glu-D1缺失,... 详细信息

以Glu-1位点正常和部分缺失的小麦品系为材料,探讨HMW-GS和LMW-GS组成与谷蛋白聚合体粒度分布和面团特性的关系,为利用HMW-GS缺失系改良小麦品质提供理论依据。在20个供试硬白冬麦品系中,1个品系为Glu-A1位点缺失,5个品系为Glu-D1缺失,3个品系为Glu-A1和Glu-D1双缺失。所有品系的蛋白质含量皆较高（13.39%~14.12%）,品系间无显著差异,缺失系与非缺失系间也无显著差异。Glu-1位点缺失显著降低了高分子量谷蛋白/低分子量谷蛋白比（HMW/LMW）、不溶性谷蛋白大聚体的含量和百分比。谷蛋白/醇溶蛋白比（GLU/GLI）在基因型间变幅较小,且在缺失系和非缺失系间无显著差异。Glu-1位点缺失显著降低了面团弹性,但显著提高了面团的延展性。部分Glu-1位点缺失系仍具有较高的面团强度和突出的延展性,谷蛋白聚合体粒度分布和面团特性受谷蛋白亚基组成和表达量的共同影响。研究结果表明,利用Glu-1位点亚基缺失可能是改善面筋延展性,提高食品加工品质的方法之一。

关键词： Glu-1位点缺失麦谷蛋白聚合体面团特性

缺失与干预:民族地区文化自觉的实证研究——基于广西GZ仫佬族乡的调查

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广西民族研究 2017年第3期 151-159页

作者：陈小玉秦永芳河海大学公共管理学院博士研究生南京210098 桂林电子科技大学马克思主义学院副教授硕士生导师桂林541004

文化自觉是生活在特定文化中的人们对其文化的过去、现在及将来发展的理解、认同及创新的状态,文化自觉本质上是对文化价值的自信与觉醒,是文化自信的前提与基础。文化自觉是全球化下对后发国家与民族提出的一个重大挑战。少数民族文化... 详细信息

文化自觉是生活在特定文化中的人们对其文化的过去、现在及将来发展的理解、认同及创新的状态,文化自觉本质上是对文化价值的自信与觉醒,是文化自信的前提与基础。文化自觉是全球化下对后发国家与民族提出的一个重大挑战。少数民族文化是中华文化的重要组成部分,亦面临文化自觉与文化自信的问题。基于GZ仫佬族乡的调查发现,文化自觉的缺失源于生存与文化冲突中的主动放弃、现代文明冲击的无奈应对及现代学校教育的潜移默化。由此提出政府—市场—村庄三位一体的导引文化自觉的动力机制,即作为推动文化自觉主导力量的地方政府、以资本下乡形式的市场力量和以村规民约为主要形式的村庄力量共同作用以实现少数民族地区的文化自觉。

关键词：缺失干预民族地区文化自觉仫佬族

欧内斯特·盖恩斯小说中黑人父性的缺失与回归

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外国文学研究 2010年第3期32卷 123-130页

作者：隋红升浙江大学外语学院浙江大学人文学院

黑人父性的缺失是黑人文学中的一个重大主题。对此有着亲身经历的盖恩斯在他的小说中真实地再现了黑人家庭中父性缺失这一社会现象,揭示了父性缺失给黑人男性身份的建构所带来的严重危机以及给他们的子女所带来的巨大伤害,深刻地剖析了... 详细信息

黑人父性的缺失是黑人文学中的一个重大主题。对此有着亲身经历的盖恩斯在他的小说中真实地再现了黑人家庭中父性缺失这一社会现象,揭示了父性缺失给黑人男性身份的建构所带来的严重危机以及给他们的子女所带来的巨大伤害,深刻地剖析了造成父性缺失的外在与内在原因,并在此基础上强调了黑人父性的回归对黑人男性个体伦理道德及其男性身份建构的重大意义。

关键词：欧内斯特·盖恩斯父性缺失回归

抗体基因点突变、插入和缺失体外检测方法的建立及应用

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上海交通大学学报（医学版） 2022年第4期42卷 518-527页

作者：罗思敏叶菱秀郝茜上海交通大学基础医学院免疫学与微生物学系上海市免疫学研究所上海200025

目的·建立由激活诱导胞苷脱氨酶(activation-induced cytidine deaminase,AID)引起的体细胞高频突变过程中,快速检测抗体基因可变(variable,V)、多样(diversity,D)、连接(joining,J)区发生突变(包括点突变、插入和缺失事件)的体外方法... 详细信息

目的·建立由激活诱导胞苷脱氨酶(activation-induced cytidine deaminase,AID)引起的体细胞高频突变过程中,快速检测抗体基因可变(variable,V)、多样(diversity,D)、连接(joining,J)区发生突变(包括点突变、插入和缺失事件)的体外方法。应用该方法检测经2种DNA聚合酶β(polymeraseβ,Polβ)抑制剂处理的细胞中抗体基因VDJ片段的突变情况。方法·用慢病毒感染法处理CH12F3细胞(即处理组),感染前的CH12F3细胞为对照组。采用蛋白质印迹法(Western blotting)检测2组细胞中AID的表达水平。构建高通量测序文库,应用生物信息学的方法分析处理组和对照组细胞中抗体基因VDJ片段的点突变、插入及缺失频率。采用不同浓度的Polβ抑制剂[扎西他滨(2’,3’-dideoxycytidine,DDC)、5-甲氧基黄铜(5-methoxyflavone,5-MF)]处理CH12F3细胞,并采用台盼蓝拒染法测定该2种抑制剂对细胞增殖的影响。分别以筛选得到的DDC浓度、5-MF浓度处理CH12F3细胞(即实验组),以0.9%NaCl处理的细胞及DMSO处理的细胞依次记为上述实验组的对照组,使用上述已建立的方法进行处理,最终行高通量测序,分析该2种抑制剂对抗体基因VDJ片段中点突变、插入及缺失频率的影响。结果·Western blotting结果显示,和CH12F3细胞对照组相比,CH12F3细胞处理组中AID表达较高;且高通量测序结果显示,该组在抗体基因VDJ片段上存在大量的点突变,且插入和缺失的频率均较高(均P=0.000)。台盼蓝拒染法检测显示,处理CH12F3细胞最适宜的DDC浓度为100μmol/L、5-MF浓度为25μmol/L。最终的高通量测序结果显示,和0.9%NaCl对照组相比,经100μmol/L DDC处理的细胞在抗体基因VDJ片段的点突变频率较低(P=0.000),长度为1 bp的缺失频率亦较低(P=0.009);和DMSO对照组相比,经25μmol/L 5-MF处理的细胞在抗体基因VDJ片段的点突变频率较低(P=0.000),长度大于1 bp的插入和缺失频率亦有所下降(均P=0.000)。结论·该研究建立的体外检测方法可用于分析AID引起的抗体基因VDJ片段的突变事件。Polβ抑制剂DDC和5-MF对由AID引起的抗体基因VDJ片段的突变事件具有抑制作用。

关键词：激活诱导胞苷脱氨酶点突变插入缺失

HPI毒力岛缺失的EAggEC17-2突变菌株的构建及其功能研究

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中华微生物学和免疫学杂志 2005年第8期25卷 691-696页

作者：胡静俞守义阚飙刘志华南方医科大学流行病学教研室广州510515 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所南方医科大学南方医院感染内科

目的构建HPI毒力岛缺失的EAggEC172突变株,初步研究EAggEC菌株携带的耶尔森菌HPI毒力岛合成铁载体Ybt的功能。方法以EAggEC172为出发菌株,irp8基因部分序列作为同源重组的一侧序列,irp5基因序列作为同源重组的另一侧序列,中间插入有氯霉... 详细信息

目的构建HPI毒力岛缺失的EAggEC172突变株,初步研究EAggEC菌株携带的耶尔森菌HPI毒力岛合成铁载体Ybt的功能。方法以EAggEC172为出发菌株,irp8基因部分序列作为同源重组的一侧序列,irp5基因序列作为同源重组的另一侧序列,中间插入有氯霉素(Cm)抗性基因(cat基因)标记。通过接合转移和同源重组,构建了缺失约24kb的HPI毒力岛功能核心区区域EAggEC172的全岛缺失株EA85。应用流式细胞技术(FACS)检测指示菌株WACSirp1::KN(pCJG3.3N)荧光强度的变化情况,对EA85缺失株和出发菌株进行了合成Ybt的功能比较研究。结果成功构建了EAggEC172HPI全岛缺失株EA85。EAggEC172菌株具有表达Ybt的功能,而缺失株EA85丧失了合成Ybt的能力。结论EAggEC172HPI毒力岛的缺失,使Ybt的合成彻底阻断。EAggEC172具有的合成Ybt的功能是由其染色体携带的HPI毒力岛所决定的。

关键词： EAggEC HPI毒力岛耶尔森杆菌素缺失耶尔森菌HPI毒力岛突变菌株功能研究基因序列同源重组流式细胞技术

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缺失风浪数据补足的神经网络模型

海洋科学 2009年第2期33卷 60-67页

作者：蒋学炼李炎保天津大学建筑工程学院天津300072 天津城市建设学院天津市软土特性与工程环境重点实验室天津300384

基于波浪数据的完备性对于海岸海洋工程设计而言非常关键,详细阐述了风浪观测数据补足神经网络模型的建立方法,构建了两个网络模型,以已有观测资料为样本进行了验证。结果表明,两个网络的训练效果均很好,且单输出目标的分层模拟要优于... 详细信息

基于波浪数据的完备性对于海岸海洋工程设计而言非常关键,详细阐述了风浪观测数据补足神经网络模型的建立方法,构建了两个网络模型,以已有观测资料为样本进行了验证。结果表明,两个网络的训练效果均很好,且单输出目标的分层模拟要优于多输出目标的单层模拟。表明了利用人工神经网络推导缺失波浪条件的可行性。

关键词：波浪观测缺失补足人工神经网络

禽致病性大肠杆菌gspL基因缺失株构建及生物学特性

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微生物学报 2015年第1期55卷 89-95页

作者：范国博韩月张宇曦韩先干王少辉白灏孟庆美祁克宗丁铲于圣青中国农业科学院上海兽医研究所上海200241 安徽农业大学动物科技学院安徽合肥230036

【目的】研究gsp L基因缺失对禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)生物学特性的影响。【方法】利用Red重组方法构建禽致病性大肠杆菌DE17株的gsp L缺失株;分析野生株与缺失株的生长特性、黏附和入侵DF1细胞的差异... 详细信息

【目的】研究gsp L基因缺失对禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)生物学特性的影响。【方法】利用Red重组方法构建禽致病性大肠杆菌DE17株的gsp L缺失株;分析野生株与缺失株的生长特性、黏附和入侵DF1细胞的差异;采用荧光定量PCR的方法比较野生株和缺失株毒力基因转录水平的变化;比较野生株与缺失株的半数致死量(LD50)差异。【结果】gsp L缺失不影响DE17的生长特性,但其黏附和入侵DF1细胞能力显著下调。荧光定量PCR检测结果表明,缺失株毒力基因lux S,pfs,fyu A和iss转录水平明显上调,tsh的转录水平明显下调,而vat,ibe A,stx2f和omp A的转录水平无显著变化;LD50检测结果表明,缺失株比野生株毒力增强了12倍。【结论】gsp L基因的缺失不影响禽致病性大肠杆菌的生长特性,但能减弱其黏附和入侵能力,且可以正调控禽致病性大肠杆菌部分毒力基因的转录水平,推测gsp L基因可能与APEC对宿主的致病性有关。

关键词：禽致病性大肠杆菌 gspL基因缺失毒力检测

茄科植物叶绿体基因组插入、缺失和核苷酸替代的发生方式及影响

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遗传 2008年第11期30卷 1506-1512页

作者：唐萍王强陈建群南京大学生命科学学院生物系南京210093

核苷酸替代和indels(插入、缺失统称)发生是进化的重要动力。以茄科植物为研究对象,探讨茄属中番茄和马铃薯、烟草属中绒毛状烟草和普通烟草分化时叶绿体基因组indels和核苷酸替代的发生方式,以及这两种突变对基因组造成的影响。结果显... 详细信息

核苷酸替代和indels(插入、缺失统称)发生是进化的重要动力。以茄科植物为研究对象,探讨茄属中番茄和马铃薯、烟草属中绒毛状烟草和普通烟草分化时叶绿体基因组indels和核苷酸替代的发生方式,以及这两种突变对基因组造成的影响。结果显示:indels和核苷酸替代的发生都不是随意的。indels发生在A+T丰富的区域,1 bp indels占据总数的30%以上,大部分indels都为低于10bp的较短片段。核苷酸替代表现出Ts(转换)/Tv(颠换)偏差,但T→G,A→C颠换频率却明显增加。Ts/Tv比值出现种属特异性,番茄和马铃薯比较时替代的Ts/Tv比值低于绒毛状烟草和普通烟草比较时Ts/Tv比值。不同物种替代的(A+T)/(G+C)比值有一定差异,从而影响基因组的(G+C)%,此比值的差异与形成物种的生长习性有一定的关系。

关键词：茄科植物叶绿体插入缺失核苷酸替代