茄科植物叶绿体基因组插入、缺失和核苷酸替代的发生方式及影响

作     者：唐萍 王强 陈建群 TANG Ping;WANG Qiang;CHEN Jian-Qun

作者机构：南京大学生命科学学院生物系南京210093 

出 版 物：《遗传》 (Hereditas（Beijing))

年 卷 期：2008年第30卷第11期

页      面：1506-1512页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(编号:30570987)资助~~ 

主　　题：茄科植物 叶绿体 插入 缺失 核苷酸替代 

摘      要：核苷酸替代和indels(插入、缺失统称)发生是进化的重要动力。以茄科植物为研究对象,探讨茄属中番茄和马铃薯、烟草属中绒毛状烟草和普通烟草分化时叶绿体基因组indels和核苷酸替代的发生方式,以及这两种突变对基因组造成的影响。结果显示:indels和核苷酸替代的发生都不是随意的。indels发生在A+T丰富的区域,1 bp indels占据总数的30%以上,大部分indels都为低于10bp的较短片段。核苷酸替代表现出Ts(转换)/Tv(颠换)偏差,但T→G,A→C颠换频率却明显增加。Ts/Tv比值出现种属特异性,番茄和马铃薯比较时替代的Ts/Tv比值低于绒毛状烟草和普通烟草比较时Ts/Tv比值。不同物种替代的(A+T)/(G+C)比值有一定差异,从而影响基因组的(G+C)%,此比值的差异与形成物种的生长习性有一定的关系。