检索结果-南通市图书馆

基于ITS2序列及二级结构对紫苏与其变种、紫苏子与其混伪品的鉴别

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食品与生物技术学报 2022年第4期41卷 93-101页

作者：郑梦迪贺紫涵张春汪兴军西安医学院药学院陕西西安710021

采用ITS2一级序列联合其二级结构对紫苏与其变种、紫苏子与其混伪品进行鉴定,为紫苏药材的使用提供更科学的分类方法。收集紫苏与其近缘种、紫苏子混伪品基源植物样本,提取DNA进行PCR扩增;并结合GenBank中的序列获得所有物种的ITS2序列... 详细信息

采用ITS2一级序列联合其二级结构对紫苏与其变种、紫苏子与其混伪品进行鉴定,为紫苏药材的使用提供更科学的分类方法。收集紫苏与其近缘种、紫苏子混伪品基源植物样本,提取DNA进行PCR扩增;并结合GenBank中的序列获得所有物种的ITS2序列。应用MEGA7.0软件进行序列分析、计算种内种间遗传距离、构建NJ树,利用ITS2数据库预测各物种的ITS2二级结构。利用4Sale软件进行一级结构联合二级结构矩阵的比对,运用ProfDistS软件构建PNJ树。ITS2序列的扩增成功率高。除白苏以外,紫苏与其他变种的ITS2序列具有明显的Barcoding gap;NJ树显示,ITS2可将紫苏、白苏与其他变种区分;紫苏和白苏在ITS2二级结构中有差异。紫苏子与其混伪品的ITS2序列差异较大,种间具有显著的遗传距离,NJ树和PNJ树显示紫苏子与各混伪品分别各自聚为一支,且有较高的自展支持率。因此,基于ITS2条形码可以准确鉴别紫苏子与其混伪品,为规范药材市场和保障临床用药安全提供可靠方法;但对于紫苏与其变种白苏的鉴别需要结合ITS2二级结构,或建议将白苏和紫苏合并为一个种,为紫苏属的植物分类提供参考。

关键词：紫苏 ITS2 二级结构分子鉴定

基于开环聚合的聚氨基酸材料的二级结构效应及调控

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科学通报 2021年第18期66卷 2217-2230页

作者：葛成龙刘勇殷黎晨苏州大学功能纳米与软物质研究院江苏省碳基功能材料与器件重点实验室苏州纳米科技协同创新中心苏州215123

聚氨基酸是一类蛋白模拟物,近年来在诸多领域都有着广泛的应用.同天然的蛋白质一样,聚氨基酸的主链氢键作用也赋予其丰富的二级结构,而二级结构的调控对材料的功能以及组装等都有着十分重要的意义.本文结合聚氨基酸近几年的最新研究进展... 详细信息

聚氨基酸是一类蛋白模拟物,近年来在诸多领域都有着广泛的应用.同天然的蛋白质一样,聚氨基酸的主链氢键作用也赋予其丰富的二级结构,而二级结构的调控对材料的功能以及组装等都有着十分重要的意义.本文结合聚氨基酸近几年的最新研究进展,分析了聚氨基酸二级结构的形成机制以及侧基功能化对二级结构的影响,总结了二级结构的影响因素,在此基础上,详细阐述了二级结构的调控方法,并探讨了二级结构的形成对穿膜、基因递送、抗菌性能、自组装行为以及蛋白修饰的影响.

关键词：聚氨基酸二级结构穿膜基因递送抗菌自组装蛋白修饰

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植物体内RNA二级结构探测方法的研究进展

生物技术通报 2023年第2期39卷 51-62页

作者：周晞雯成柯朱鸿亮中国农业大学食品科学与营养工程学院北京100083

生物体内的RNA因氢键等作用配对折叠形成复杂的二级结构及三级结构,并根据环境产生动态变化,由此行使功能。植物中的基因表达调控及配体感应都与RNA的结构相关,RNA结构也被认为是转录后调控的一项影响因素,RNA的结构对与之互作的蛋白的... 详细信息

生物体内的RNA因氢键等作用配对折叠形成复杂的二级结构及三级结构,并根据环境产生动态变化,由此行使功能。植物中的基因表达调控及配体感应都与RNA的结构相关,RNA结构也被认为是转录后调控的一项影响因素,RNA的结构对与之互作的蛋白的结构和功能产生影响,因此研究RNA功能过程中解析RNA结构尤为关键。目前,RNA二级结构的探测实验方法从X-射线经过酶切及化学探针标记,发展至结合高通量测序即可建构模型。此外,机器学习等方法也为RNA结构的探测提供了新的思路。本文综述了影响体内RNA结构的因素及近年来用于植物体内RNA结构预测的方法,讨论了现有方法的应用限制下对RNA二级结构预测新方法开发的意义及存在的问题,展望计算机预测方法与实验方法未来的发展趋势,旨为后续RNA结构相关研究提供方法参考。

关键词： RNA结构二级结构探测方法植物生理

基于ITS2序列及其二级结构对矩镰荚苜蓿和近缘种的分子鉴定

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西北农业学报 2024年第3期33卷 397-405页

作者：王霞刘艳贾秀秀方强恩甘肃农业大学草业学院草业生态系统教育部重点实验室中-美草地畜牧业可持续发展研究中心兰州730070

为准确鉴定矩镰荚苜蓿(Medicagoarchiducis-nicolai)及其近缘种花苜蓿(M.ruthenica)、阔荚苜蓿(M.platycarpos)和毛荚苜蓿(M.edgeworthii),利用DNA条形码技术对4个物种的ITS2序列进行注释、比对、检验,计算种内种间遗传距离,邻接法(neighbor-joining, NJ)构建系统发育树,通过RNAfoldwebserver预测4个近缘种的ITS2二级结构。结果显示,矩镰荚苜蓿及其近缘种的ITS2序列长度为220~221 bp,稳定性好;种间遗传距离(0.004 55~0.022 73)明显大于种内遗传距离(均为0),存在明显的“BarcodingGap”区域;NJ系统发育树显示,毛荚苜蓿聚为一支,矩镰荚苜蓿、花苜蓿和阔荚苜蓿聚为另一支,然后矩镰荚苜蓿与阔荚苜蓿又各自形成单系;在二级结构中,矩镰荚苜蓿与阔荚苜蓿、毛荚苜蓿存在明显差异,但与花苜蓿极为相似,难以区分。分析表明:除花苜蓿外,以ITS2序列作为条形码并辅以二级结构,可以达到对矩镰荚苜蓿、阔荚苜蓿和毛荚苜蓿准确、快速鉴定的目的。

关键词：矩镰荚苜蓿 ITS2序列二级结构分子鉴定

CaCl_(2)对小麦粉面筋蛋白聚集特性及二级结构的影响

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河南工业大学学报（自然科学版） 2022年第5期43卷 29-34,44页

作者：王小花梁赢贾峰王琦王金水河南工业大学生物工程学院河南郑州450001

为了从分子水平上探究CaCl_(2)对小麦粉面筋蛋白聚集及结构特性的影响机制,以中筋小麦粉为原料,研究CaCl_(2)不同添加量对小麦粉面筋蛋白聚集特性、二级结构及面团质构特性的影响。结果表明:随着CaCl_(2)添加量的增加,小麦粉面筋蛋白的... 详细信息

为了从分子水平上探究CaCl_(2)对小麦粉面筋蛋白聚集及结构特性的影响机制,以中筋小麦粉为原料,研究CaCl_(2)不同添加量对小麦粉面筋蛋白聚集特性、二级结构及面团质构特性的影响。结果表明:随着CaCl_(2)添加量的增加,小麦粉面筋蛋白的峰值最大时间显著缩短,峰值扭矩增加;面团的硬度、弹性和咀嚼性随CaCl_(2)添加量的增加而显著降低,回复性随CaCl_(2)添加量的增加变化不显著,黏附性随CaCl_(2)添加量的增加先显著增加再降低之后趋于平缓;面筋蛋白的二级结构中无规则卷曲和β-转角含量增加,β-折叠含量降低,α-螺旋含量无显著性变化。整体来看,添加CaCl_(2)能加快面筋的形成,缩短面筋的聚集时间,弱化面团的质构特性,降低面筋结构的稳定性,从而导致面制品品质下降。

关键词：小麦粉 CaCl_(2) 面筋蛋白聚集特性质构特性二级结构

粗柄羊肚菌rDNA ITS序列分析及二级结构预测

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分子植物育种 2024年

作者：张跃新陈爱华梁凤山么宏伟黑龙江省林业科学院牡丹江分院

为了探究中国粗柄羊肚菌(Morchella crassipes)的遗传多样性，本研究对采集自黑龙江地区的2株野生粗柄羊肚菌样本以及来自GeneBank的其他国内省份的12份粗柄羊肚菌样本进行了rDNA ITS序列分析和二级结构预测。通过这一分析获得了有关粗... 详细信息

为了探究中国粗柄羊肚菌(Morchella crassipes)的遗传多样性，本研究对采集自黑龙江地区的2株野生粗柄羊肚菌样本以及来自GeneBank的其他国内省份的12份粗柄羊肚菌样本进行了rDNA ITS序列分析和二级结构预测。通过这一分析获得了有关粗柄羊肚菌遗传信息的重要数据，尤其是ITS1基因序列在不同地区之间的变异和二级结构特征的差异。本研究中成功对14个粗柄羊肚菌样本的ITS1-5.8S-ITS2基因序列进行了对齐，并发现ITS1序列的平均长度、变异位点数量以及总体平均差异均远大于ITS2序列，这表明ITS1序列在不同样本之间存在显著的遗传多样性。与此同时还构建了粗柄羊肚菌的系统发育树，该树基本上反映出了不同样本之间的地缘关系，特别是地理分布较近的样本之间的亲缘关系较近，这为进一步的种内遗传多样性研究提供了重要的参考依据。此外，还对来自不同地区的6个粗柄羊肚菌样本的ITS1序列进行了二级结构分析，结果显示，不同地区的粗柄羊肚菌具有明显的二级结构特征差异，这进一步强调了ITS1基因序列在遗传多样性研究中的重要性。本研究的结果为粗柄羊肚菌遗传多样性研究提供了重要的基础数据，并强调了ITS1基因序列的潜在应用价值。尽管还需要进一步的研究来深入探究这些结果对该领域的具体启示和实际应用，但本研究为粗柄羊肚菌遗传多样性的理解提供了有益的见解。

关键词：粗柄羊肚菌 rDNA ITS序列序列分析二级结构

大豆分离蛋白组成及二级结构对表面疏水性的影响

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同方期刊数据库

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中国食品学报 2018年第5期18卷 288-293页

作者：齐宝坤赵城彬江连洲王中江李杨东北农业大学食品学院哈尔滨150030 吉林农业大学食品科学与工程学院长春130118

测定不同品种大豆分离蛋白(SPI)的表面疏水性和游离巯基含量,同时采用SDS-PAGE法和圆二色谱法分析SPI的蛋白质组成及二级结构,探讨它们对SPI表面疏水性的影响。SPI表面疏水性随着游离巯基含量的增加而增大,这与蛋白分子的解折叠和疏水... 详细信息

测定不同品种大豆分离蛋白(SPI)的表面疏水性和游离巯基含量,同时采用SDS-PAGE法和圆二色谱法分析SPI的蛋白质组成及二级结构,探讨它们对SPI表面疏水性的影响。SPI表面疏水性随着游离巯基含量的增加而增大,这与蛋白分子的解折叠和疏水性残基的暴露有关。品种差异对SPI的蛋白质组成和表面疏水性有一定影响,7S/11S比值越大,表面疏水性越高。不同品种SPI的二级结构含量存在差异,当蛋白质分子中α-螺旋含量较低,β-折叠及无规卷曲含量较高时,蛋白质分子的无序性增加,分子结构趋于暴露式,使埋藏在内部的疏水性残基更多地暴露在蛋白质分子表面,导致表面疏水性的增加。

关键词：大豆分离蛋白二级结构圆二色谱表面疏水性

pH对中国人乳β-酪蛋白二级结构的圆二色和拉曼特征影响

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光谱学与光谱分析 2015年第2期35卷 384-389页

作者：任皓威张婉舒李相怡刘宁国家乳业工程技术研究中心黑龙江省乳品工业技术开发中心黑龙江哈尔滨150028 东北农业大学食品学院乳品科学教育部重点实验室(东北农业大学) 黑龙江哈尔滨150030 食品安全与营养协同创新中心黑龙江哈尔滨150028

人乳中β-酪蛋白为婴儿的快速生长提供了最适宜的氨基酸、钙磷等。以往的研究均是对牛乳的β-酪蛋白二级结构进行分析,而牛乳β-酪蛋白对婴儿配方乳的指导意义不如人乳β-酪蛋白,且人乳β-酪蛋白难以获得合适的蛋白晶体,其三级结构不清... 详细信息

人乳中β-酪蛋白为婴儿的快速生长提供了最适宜的氨基酸、钙磷等。以往的研究均是对牛乳的β-酪蛋白二级结构进行分析,而牛乳β-酪蛋白对婴儿配方乳的指导意义不如人乳β-酪蛋白,且人乳β-酪蛋白难以获得合适的蛋白晶体,其三级结构不清楚。为了获得中国人乳β-酪蛋白二级结构的相关基础信息,采用圆二色光谱（CD）法和拉曼光谱（Raman）法分析在不同pH条件下其二级结构的变化,结果表明：pH值的改变能够诱导中国人乳β-酪蛋白二级结构的改变,CD分析表明β-酪蛋白各部分的二级结构分别是：0.5%~2%α-螺旋,16%~18%β-折叠,30%~34%β-转角,49%~51%无规则卷曲;随着pH的增加,部分结构发生了变化,α-螺旋在pH 8处含量增加,而在pH 10处含量减小。拉曼光谱分析表明：β-酪蛋白在酰胺I的特征峰在1 662cm-1处,分析出β-酪蛋白的无规则卷曲含量较高。同时,根据I850/I830的比值计算出β-酪蛋白的酪氨酸残基趋向于＂暴露式＂。圆二色光谱和拉曼光谱都证明了人乳β-酪蛋白二级结构中无规则卷曲的含量最高,而β-折叠和β-转角含量保持相对的稳定。并且,在pH 8条件下,α-螺旋含量高于在其他pH条件下的含量。

关键词：圆二色光谱拉曼光谱人乳β-酪蛋白二级结构 pH值

体外模拟消化对大豆蛋白组成及二级结构的影响

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中国食品学报 2018年第11期18卷 44-49页

作者：齐宝坤赵城彬檀政朱建宇孙禹凡钟明明江连洲李杨东北农业大学食品学院哈尔滨150030 吉林农业大学食品科学与工程学院长春130118

采用胃蛋白酶在37℃和pH 1.2条件下对大豆分离蛋白(SPI)进行体外模拟消化,探究体外模拟消化对SPI组成及二级结构的影响。随着消化时间的延长,蛋白质的消化程度逐渐增大,当消化反应超过2 h后,蛋白质的消化速率减慢。在整个消化过程中,SP... 详细信息

采用胃蛋白酶在37℃和pH 1.2条件下对大豆分离蛋白(SPI)进行体外模拟消化,探究体外模拟消化对SPI组成及二级结构的影响。随着消化时间的延长,蛋白质的消化程度逐渐增大,当消化反应超过2 h后,蛋白质的消化速率减慢。在整个消化过程中,SPI的不同亚基受胃蛋白酶的消化或降解行为的影响存在明显的差异。7S比11S更难被胃蛋白酶消化降解,11S蛋白中B亚基较A亚基更难且更慢被消化,这与亚基的空间结构紧密度及疏水基团的暴露有关。红外光谱中酰胺I带处具有强吸收峰,对酰胺I带的拟合分析表明,经胃蛋白酶的消化后,SPI的二级结构发生显著改变。总体上看,随着消化时间的延长,α-螺旋含量增加,β-折叠和β-转角含量下降,而无规卷曲含量先增加后降低,且有部分平行式β-折叠结构向反平行式β-折叠结构转变。

关键词：体外模拟消化大豆蛋白蛋白组成二级结构