检索结果-南通市图书馆

安徽农业科学 2011年第23期39卷 13960-13961,14011页

作者：王芳华慧颖李晓静耿风华中州大学实验管理中心河南郑州450044 中州大学化工食品学院河南郑州450044 中国地质大学长城学院河北保定071000

在阐述相关序列扩增多态性(SRAP)的原理和流程后,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传多样性分析、遗传图谱构建、绘制基因组转录图谱、重要性状基因标记、标记测序与基因克隆等方面的研究进展及应用前景。

关键词：相关序列扩增多态性分子标记基因克隆

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基于相关序列扩增多态性分子标记的桂花栽培品种演化分析

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2017年第4期43卷 404-415页

作者：邱帅吴光洪陈徐平郭娟魏建芬沈柏春胡绍庆杭州市园林绿化股份有限公司杭州310020 浙江理工大学建筑工程学院杭州310018

为了进一步揭示桂花栽培品种的演化历程,为桂花育种工作提供借鉴,采用相关序列扩增多态性分子标记技术和毛细管电泳技术,对45份桂花材料进行遗传多样性和群体结构分析,以木犀属中最为原始的牛矢果(Osmanthus matsumuranus)为外部群体,... 详细信息

为了进一步揭示桂花栽培品种的演化历程,为桂花育种工作提供借鉴,采用相关序列扩增多态性分子标记技术和毛细管电泳技术,对45份桂花材料进行遗传多样性和群体结构分析,以木犀属中最为原始的牛矢果(Osmanthus matsumuranus)为外部群体,构建桂花栽培品种系统发生树,计算不同演化水平两性花品种的比例,分析桂花性别系统进化情况。结果显示:10对高多态性引物共检测到137个多态性位点,平均每对引物13.7个位点,多态性信息含量为0.202 8~0.302 7;Nei遗传多样性指数为0.220 3~0.350 2;Shannon多样性信息指数为0.348 3~0.519 3。45份桂花材料分为7个亚群和1个混合群体,亚群间遗传分化明显,基因交流较少。系统发生树表明,桂花栽培品种演化历程大致分为10个阶段,大部分银桂品种和四季桂品种最先形成,雄性丹桂品种最晚形成,其他品种处于演化的中间阶段。两性花品种比例随着演化水平的增高呈现逐渐降低的趋势,证明桂花的雄全异株性别系统是雌雄同花演化为雌雄异株的中间状态。此外,桂花花色连续变异可能受到多个CCDs家族同源基因突变的影响,而遗传漂变导致新等位基因丢失,这可能是野生桂花罕见橙红色个体的原因。

关键词：桂花相关序列扩增多态性群体结构演化

相关序列扩增多态性(SRAP)一种新的分子标记技术

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中国农学通报 2004年第6期20卷 11-13,22页

作者：任羽王得元张银东热带作物生物技术国家重点实验室海南海口571101 广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省果蔬新技术研究重点实验室广州510640

SRAP是一种新的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术,其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区... 详细信息

SRAP是一种新的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术,其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区域、启动子区域进行特异扩增,因个体不同以及物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。扩增产物用变性的聚丙烯酰胺凝胶分离,然后用放射自显影检测。本文在阐述SRAP的原理和流程后,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传图谱构建、遗传多样性、基因定位、比较基因组学、杂种优势预测等方面的研究进展及应用前景。

关键词：相关序列扩增多态性 SRAP 分子标记技术原理遗传图谱遗传多样性基因定位比较基因组学杂种优势预测

相关序列扩增多态性标记技术(SRAP)及其在植物中的应用

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廊坊师范学院学报（自然科学版） 2008年第4期8卷 10-12页

作者：孙瑞李袁郑州铁路职业技术学院河南郑州450052

相关序列扩增多态性(Sequence-Related Amplified Polymorphism,SRAP)是最近发展起来的新型分子标记,具有简便、可靠、易于测序等优点。主要介绍了相关序列扩增多态性标记技术的概念、原理、特点及该技术在植物中的应用。

关键词：相关序列扩增多态性植物优点应用

红花cDNA相关序列扩增多态性的扩增体系优化

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药学服务与研究 2009年第5期9卷 348-351页

作者：唐洁李亚葵王章建郭美丽第二军医大学药学院生药学教研室上海200433 山西农业大学生命科学院太谷030801

目的:建立一种适合以红花cDNA为模板进行相关序列扩增多态性(SRAP)扩增的体系,筛选最佳的SRAP-PCR反应条件。方法:提取红花RNA并反转录成cDNA,以此为模板,使用正交设计表设计PCR反应中的3个重要因素Taq酶、三磷酸脱氧核苷(dNTPs)、引物... 详细信息

目的:建立一种适合以红花cDNA为模板进行相关序列扩增多态性(SRAP)扩增的体系,筛选最佳的SRAP-PCR反应条件。方法:提取红花RNA并反转录成cDNA,以此为模板,使用正交设计表设计PCR反应中的3个重要因素Taq酶、三磷酸脱氧核苷(dNTPs)、引物的反应浓度。随后设计Mg2+的反应浓度以及模板含量,分别进行单因素试验。结果:本研究建立的红花cDNA-SRAP扩增条件为:25μL反应体系中含模板cDNA 20 ng,1×PCR缓冲液2.5 mmol/L,Mg2+2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶0.04 U/μL,dNTPs 0.2 mmol/L,引物0.2μmol/L。优化后扩增结果稳定性好,条带清晰,多态性好。结论:该体系为红花功能基因的研究奠定了基础。

关键词：红花 cDNA 相关序列扩增多态性分子标记逆转录聚合酶链反应

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中国水稻科学 2007年第5期21卷 464-468页

作者：姜树坤钟鸣徐正进张丽张喜娟马慧陈丽静郭志富沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室辽宁沈阳110161 沈阳农业大学辽宁省北方粳稻育种重点实验室辽宁沈阳110161

建立了一套完整、稳定、高效的水稻相关序列扩增多态性(SRAP)反应体系,同时利用110对SRAP引物对水稻品种沈农606和丽江新团黑谷进行比较扩增,其中35对引物可以检测到多态性,约占所用引物的31.82%。用该35对引物进一步对上述两个品种配... 详细信息

建立了一套完整、稳定、高效的水稻相关序列扩增多态性(SRAP)反应体系,同时利用110对SRAP引物对水稻品种沈农606和丽江新团黑谷进行比较扩增,其中35对引物可以检测到多态性,约占所用引物的31.82%。用该35对引物进一步对上述两个品种配制的杂交后代的F2进行检测,共扩增出1683条带,平均每对引物48条带,其中多态性条带143条,平均每对引物4.09条多态性条带。有24个多态性位点在F2群体中的分离显著或极显著地偏离了理论比值而表现异常分离,比率为16.78%。这些偏分离位点中偏向沈农606基因型的有11个;偏向丽江新团黑谷基因型的有12个;仅有1个偏杂合体类型。卡方检验说明,标记位点的偏分离是配子体和合子体选择共同作用的结果。

关键词：水稻相关序列扩增多态性扩增体系偏分离

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栽培黄连群体遗传关系的SRAP分析

中草药 2008年第10期39卷 1552-1556页

作者：陈大霞李隆云瞿显友彭锐钟国跃重庆市中药研究院重庆400065

目的揭示栽培黄连Coptis chinensis群体的遗传关系。方法以24个不同来源地的栽培黄连群体为试材，采用SRAP分子标记技术，用Treeconw软件分析遗传相似系数，UPGMA方法聚类，构建遗传系统树。结果36对引物共得到276条扩增条带，其中有... 详细信息

目的揭示栽培黄连Coptis chinensis群体的遗传关系。方法以24个不同来源地的栽培黄连群体为试材，采用SRAP分子标记技术，用Treeconw软件分析遗传相似系数，UPGMA方法聚类，构建遗传系统树。结果36对引物共得到276条扩增条带，其中有120条呈现多态性，占43．48％，从DNA分子水平显示出供试种质遗传多样性并不丰富。遗传相似系数变化范围在0．8770～0．9519。聚类结果显示栽培黄连群体遗传关系与来源地无明显相关性，仅在小分支中表现出一定的地域相关性。结论栽培黄连群体的遗传多样性水平较低，显示遗传背景较为单一。

关键词：黄连相关序列扩增多态性遗传关系

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同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构

华中农业大学学报 2011年第5期30卷 624-630页

作者：周玲玲张桂蓉魏开建邹桂伟王卫民梁宏伟冉玮华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室武汉430070 中国水产科学研究院长江水产研究所/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室武汉430060

采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23～40个;... 详细信息

采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23～40个;各群体的Nei's基因多样性(h)和Shannon's信息指数(I)平均值分别为0.205～0.218和0.324～0.341,4个群体间的h以及I差异不明显;基于Nei's无偏遗传距离构建的UPGMA树显示,洞庭湖二倍体和四倍体泥鳅群体亲缘关系最近,先聚为一支,再与武汉四倍体泥鳅聚为一支,而武汉二倍体泥鳅聚为单独一支。测定了4个泥鳅群体40个个体线粒体DNA控制区序列片段(932～935bp),发现47个变异位点,共计29种单倍型。洞庭湖四倍体和二倍体泥鳅群体的核苷酸多样性(π)分别为0.898%和0.872%,明显大于武汉四倍体(π=0.465%)和二倍体(π=0.675%)。在同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体中,洞庭湖四倍体遗传多样性略大于洞庭湖二倍体,武汉二倍体则明显大于武汉四倍体。AMOVA分析表明,泥鳅群体的遗传变异主要来自群体内(62.68%),群体间的变异达到37.32%;群体间成对固定指数FST及Kimura 2-parameter遗传距离均显示,洞庭湖四倍体与二倍体泥鳅群体无明显分化,其余群体间均存在显著分化。控制区序列单倍型Bayesian系统树与SRAP分析所揭示的4个泥鳅群体的亲缘关系相似。

关键词：泥鳅相关序列扩增多态性线粒体DNA控制区倍性遗传变异单倍型

万寿菊雄性不育系SRAP-PCR体系建立与优化

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分子植物育种 2015年第6期13卷 1388-1395页

作者：牟丹唐道城唐楠青海大学高原花卉研究中心西宁810016

本研究以万寿菊雄性不育系2-2基因组DNA为试验材料,采用单因素和L16(45)正交设计对SRAPPCR反应体系的Mg2+、d NTPs、Taq酶、引物和模板DNA浓度进行优化,以得到最佳的SRAP-PCR反应体系。结果表明最佳反应体系为:20μL体系中Mg2+2.0 mmol/... 详细信息

本研究以万寿菊雄性不育系2-2基因组DNA为试验材料,采用单因素和L16(45)正交设计对SRAPPCR反应体系的Mg2+、d NTPs、Taq酶、引物和模板DNA浓度进行优化,以得到最佳的SRAP-PCR反应体系。结果表明最佳反应体系为:20μL体系中Mg2+2.0 mmol/L、d NTPs 0.3 mmol/L、Taq酶0.75 U、引物0.2μmol/L、模板DNA 80 ng。应用建立的反应体系对退火温度进行优化,得到两步退火温度分别为35℃和50.2℃。最后用9个万寿菊雄性不育两用系材料组对所得PCR体系进行验证,证明该体系具有较高的稳定性和重复性,可为筛选与万寿菊雄性不育基因连锁的特异性标记奠定基础。

关键词：万寿菊雄性不育系分子标记相关序列扩增多态性体系优化

利用SRAP分子标记分析47份杂草稻样品遗传多样性

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中国水稻科学 2012年第1期26卷 70-76页

作者：刘丹孙健马殿荣王嘉宇唐亮苗微陈温福沈阳农业大学水稻研究所/农业部东北水稻生物学与遗传育种重点实验室/教育部与辽宁省共建北方粳稻遗传育种重点实验室辽宁沈阳110866

利用SRAP分子标记分析了采集于杂草稻多发地区的47份样本的遗传多样性,旨在从基因的开放式阅读框区域(ORFs)深入研究杂草稻的遗传背景,为进一步揭示其来源提供依据。结果表明,参试的我国杂草稻材料在110对引物组合中共扩增出845种类型... 详细信息

利用SRAP分子标记分析了采集于杂草稻多发地区的47份样本的遗传多样性,旨在从基因的开放式阅读框区域(ORFs)深入研究杂草稻的遗传背景,为进一步揭示其来源提供依据。结果表明,参试的我国杂草稻材料在110对引物组合中共扩增出845种类型的谱带,多态性谱带590种,多态率为69.82%,平均每对引物可以检测到5.4条多态性谱带。说明SRAP分子标记对于杂草稻基因组开放式阅读框区域序列的多态性具有很高的检测效率,适用于遗传多样性研究。我国杂草稻材料Shannon-Weaver多样性指数(I)为0.63,且南北方杂草稻多样性指数(I)相当,分别为0.63和0.62。聚类分析结果表明,南方收集的杂草稻与北方收集杂草稻群体间遗传分化较大,遗传差异明显。程氏指数判定结果也表明杂草稻呈南籼北粳的分布状态。

关键词：杂草稻开放式阅读框相关序列扩增多态性遗传多样性