同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构

作     者：周玲玲 张桂蓉 魏开建 邹桂伟 王卫民 梁宏伟 冉玮 ZHOU Ling-ling;ZHANG Gui-rong;WEI Kai-jian;ZOU Gui-wei;WANG Wei-min;LIANG Hong-wei;RAN Wei

作者机构：华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室武汉430070 中国水产科学研究院长江水产研究所/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室武汉430060 

出 版 物：《华中农业大学学报》 (Journal of Huazhong Agricultural University)

年 卷 期：2011年第30卷第5期

页      面：624-630页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 0908[农学-水产] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002) 农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室开放课题(LFBCU0708) 

主　　题：泥鳅 相关序列扩增多态性 线粒体DNA控制区 倍性 遗传变异 单倍型 

摘      要：采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23～40个;各群体的Nei s基因多样性(h)和Shannon s信息指数(I)平均值分别为0.205～0.218和0.324～0.341,4个群体间的h以及I差异不明显;基于Nei s无偏遗传距离构建的UPGMA树显示,洞庭湖二倍体和四倍体泥鳅群体亲缘关系最近,先聚为一支,再与武汉四倍体泥鳅聚为一支,而武汉二倍体泥鳅聚为单独一支。测定了4个泥鳅群体40个个体线粒体DNA控制区序列片段(932～935bp),发现47个变异位点,共计29种单倍型。洞庭湖四倍体和二倍体泥鳅群体的核苷酸多样性(π)分别为0.898%和0.872%,明显大于武汉四倍体(π=0.465%)和二倍体(π=0.675%)。在同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体中,洞庭湖四倍体遗传多样性略大于洞庭湖二倍体,武汉二倍体则明显大于武汉四倍体。AMOVA分析表明,泥鳅群体的遗传变异主要来自群体内(62.68%),群体间的变异达到37.32%;群体间成对固定指数FST及Kimura 2-parameter遗传距离均显示,洞庭湖四倍体与二倍体泥鳅群体无明显分化,其余群体间均存在显著分化。控制区序列单倍型Bayesian系统树与SRAP分析所揭示的4个泥鳅群体的亲缘关系相似。