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Polypeptide analysis for nanopore-based protein identification

Nano Research 2022年第11期15卷 9831-9842页

作者： Mazdak Afshar Bakshloo Safia Yahiaoui fabien Piguet Manuela Pastoriza-Gallego Régis Daniel Jérôme Mathé John J.Kasianowicz Abdelghani Oukhaled CY Cergy Paris Université CNRSLAMBE95000CergyFrance UniversitéParis-Saclay Univ EvryCNRSLAMBE91025Evry-CourcouronnesFrance University of South Florida Dept.of PhysicsTampaFL 33620USA Freiburg Institute for Advanced Studies Universität FreiburgFreiburg 79104Germany

Presently,proteins are identified by cleaving them with proteases,measuring the mass to charge ratio of the fragments with a mass spectrometer,and matching the fragments to segments within known proteins in *** earlier demonstrated that a nanometer-scale pore formed by aerolysin(AeL)can discriminate between,and therefore identify,three similar size proteins from their trypsin-cleaved polypeptide *** this nanopore-protease method,the protein’s identity is instead determined from characteristic ionic current blockade patterns caused by the polypeptide fragments that enter the *** results also suggested that not all of the theoretically expected cleavage products partition into the *** better understand the mechanism by which polypeptide fragments are captured,and how different polypeptides reduce the pore’s ionic current,we studied the effects of 11 identical length polypeptides with different net charges and charge *** show that under certain experimental conditions,negative,positive,and neutral polypeptides are driven into the AeL pore by the same applied voltage *** capture rate and dwell time of polypeptides in the pore depend strongly on the ionic strength,the magnitude of the applied voltage,and the net charge and charge distribution of the *** dwell time distribution depends nonmonotonically on the applied voltage(regardless of the polymer’s net charge),and its maximum value depends on the polypeptide net charge and charge *** maximum dwell time for different polypeptides does not occur at the same applied voltage amplitude,which conceivably might complicate the detection and discrimination of some polypeptide *** additional experiments,computer simulations,and artificial intelligence research are needed to better understand how to optimize the partitioning of enzymatically cleaved fragments into the AeL nanopore,the method is still capable of accurately identifying

关键词： protein identification nanopores trypsin enzymatic degradation

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Reliability and validity of the French version of the Global Physical Activity Questionnaire

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Journal of Sport and Health Science 2018年第3期7卷 339-345页

作者： fabien Rivière Fatima Zahra Widad Elodie Speyer Marie-Line Erpelding Hélène Escalon Anne Vuillemin ea 4360 apemac university of lorraineparis descartes universityNancy 54505France inserm cic-1433 clinical epidemiologyNancy F-5400France university hospital center of nancy pole s2repidemiology and clinical evaluationNancy F-54000France the french public health agency Saint-Maurice 94410France

Background:The Global Physical Activity Questionnaire(GPAQ)has been used to measure physical activity(PA)and sedentary time in France,but no study has assessed its psychometric *** study aimed to compare the reliability as well as criterion and concurrent validity of the French version of the GPAQ with the French International Physical Activity Questionnaire long form(IPAQ-LF)and use of an accelerometer in a general adult ***:We included 92 participants(students or staff)from the Medicine Campus at the University of Lorraine,Nancy(north-eastern France).The French GPAQ was completed twice,7 days apart,to study test-retest *** IPAQ-LF was used to assess concurrent validity of the GPAQ,and participants wore an accelerometer(ActiGraph GT3X+)for 7 days to study criterion *** as well as concurrent and criterion validity of the GPAQ were tested by the intraclass correlation coefficient(ICC),Spearman correlation coefficient for quantitative variables,and Kappa and Phi coefficients for qualitative *** concurrent and criterion validity of GPAQ were assessed by Bland-Altman ***:The GPAQ showed poor to good reliability(ICC=0.37-0.94;Kappa=0.50-0.62)and concurrent validity(Spearman r=0.41-0.86),but only poor criterion validity(Spearman r=-0.22-0.42).Limits of agreement for the GPAQ and accelerometer were wide,with differences between 286.5 min/week and 601.3 min/***:The French version of the GPAQ provides limited but acceptable reliability and validity for the measurement of PA and sedentary *** may be used for assessing PA and sedentary time in a French adult population.

关键词： Measurement Physical activity Psychometric analysis Questionnaire Reliability Self-report Sitting time Validity

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用超模理论分析光栅耦合器型滤波器的特性

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光电子．激光 2004年第10期15卷 1153-1157页

作者：罗爱平 fabien Bayle Emmanuel Marin Jean Pierre Meunier 方祖捷中科院上海光学精密机械研究所信息光学实验室 Laboratoire TSI of Université Jean Monnet Saint-EtienneFrance42000

从实际测量的耦合器的形状出发,运用耦合的超模理论分析了在普通2×2光纤耦合器的熔锥区写入光栅制作滤波器的特性,并对不同类型的耦合器进行了比较。研究表明,即使在普通的耦合器上写入布拉格光栅,同样可以获得波长选择滤波器,并且存... 详细信息

从实际测量的耦合器的形状出发,运用耦合的超模理论分析了在普通2×2光纤耦合器的熔锥区写入光栅制作滤波器的特性,并对不同类型的耦合器进行了比较。研究表明,即使在普通的耦合器上写入布拉格光栅,同样可以获得波长选择滤波器,并且存在最佳光栅位置和光栅长度。同时提出了获得窄线宽、边带抑制的滤波器的新方法,即在熔锥区写入非线性啁啾光栅。

关键词：超模滤波器光纤耦合器光栅耦合啁啾光栅窄线宽布拉格光栅光栅制作波长选择非线性

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镧助剂对模拟生物沼气重整制备合成气中Ni/SBA-15催化剂结构和性能的影响

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物理化学学报 2009年第8期25卷 1611-1617页

作者：郎宝李秀金季生福 fabien Habimana 李成岳北京化工大学化工资源有效利用国家重点实验室北京100029 北京化工大学化学工程学院环境工程系北京100029

以介孔分子筛SBA-15为载体,采用浸渍法制备了镍质量分数(w)为12.5%,并且分别添加质量分数(w)为2.5%的镧、铈、镁、钙、锶等助剂的系列Ni基催化剂.以CH4/CO2体积比为2∶1的模拟生物沼气和适量氧气作为原料气,在常压固定床反应器上评价了... 详细信息

以介孔分子筛SBA-15为载体,采用浸渍法制备了镍质量分数(w)为12.5%,并且分别添加质量分数(w)为2.5%的镧、铈、镁、钙、锶等助剂的系列Ni基催化剂.以CH4/CO2体积比为2∶1的模拟生物沼气和适量氧气作为原料气,在常压固定床反应器上评价了催化剂对模拟生物沼气重整制合成气的反应性能.采用X射线粉末衍射(XRD)、N2吸附/脱附、透射电子显微镜(TEM)、X射线光电子能谱(XPS)及H2程序升温还原(H2-TPR)等对催化剂的结构进行了表征.催化活性评价显示,添加镧助剂的2.5%La/12.5%Ni/SBA-15催化剂比添加铈、镁、钙、锶等助剂的催化剂具有更高的催化活性,并且具有很好的稳定性.因此,文中着重研究了镧助剂对催化剂结构和模拟生物沼气重整制合成气的反应性能的影响.结果表明,镧能明显提高Ni/SBA-15催化剂的表面镍含量,同时还具有很好的抗积炭作用,在850℃的温度下反应820h没有发现积炭生成,这些可能是提高催化剂性能和稳定性的重要因素.

关键词：镍镧助剂 SBA-15 生物沼气重整合成气

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Starch Metabolism in Plant and Its Applications in Food Industry

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Advances in Biological Chemistry 2023年第4期13卷 111-127页

作者： fabien Nsanzabera Evangeline Irakoze Alexis Manishimwe Aimable Mwiseneza Jean Bosco Nsengiyumva fabien Nkurikiyimana Department of Education in Sciences Faculty of Education University of Technology and Arts of Byumba (UTAB) Byumba Rwanda African Center of Excellence in Innovative Teaching and Learning Mathematics and Science (ACE-ITLMS) College of Education University of Rwanda Kayonza Rwanda

Starch, a polymer of sugars in plants, is widely used in various industries due to its properties. It is synthesized through ADP-glucose formation and enzyme-mediated processes. Starch is formed during the day and broken down into sugars at night, which are then transported and converted back to starch in storage tissues. This review explores starch metabolism pathways and its role in the food industry, providing valuable insights on energy storage in plants.

关键词： Starch Metabolism Gelatinization Retrogradation Starch Biosynthesis Starch Degradation

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Laparoscopic sleeve gastrectomy and gastroesophageal reflux

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World Journal of Gastroenterology 2015年第36期21卷 10348-10357页

作者： fabien Stenard Antonio Iannelli Digestive and Oncology Unit Mutualiste Hospital Digestive Unit Archet 2 HospitalUniversity Hospital of Nice Inserm U1065Team 8 "Hepatic complications of obesity" University of Nice Sophia-Antipolis

Bariatric surgery is the only effective procedure that provides long-term sustained weight loss. Sleeve gastrectomy(SG) has emerged over the last few years to be an ideal bariatric procedure because it has several advantages compared to more complex bariatric procedures,including avoiding an intestinal bypass. However,several published follow-up studies report an increased rate of gastroesophageal reflux(GERD) after a SG. GERD is described as either de novo or as being caused by aggravation of preexisting symptoms. However,the literature on this topic is ambivalent despite the potentially increased rate of GERDs that may occur after this common bariatric procedure. This article reviews the mechanisms responsible for GERD in obese subjects as well as the results after a SG with respect to GERD. Future directions for clinical research are discussed along with the current surgical options for morbidly obese patients with GERD and undergoing bariatric surgery.

关键词： Gastroesophageal reflux Sleeve gastrectomy Morbid

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Response of C and N cycles to N fertilization in Sphagnum and Molinia-dominated peat mesocosms

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Journal of Environmental Sciences 2019年第3期31卷 264-272页

作者： fabien Leroy Sébastien Gogo Christophe Guimbaud André-Jean Francez Renata Zocatelli Christian Défarge Léonard Bernard-Jannin Zhen Hu Fatima Laggoun-Défarge University of Orleans ISTO CNRS ISTO BRGM ISTO University of Orleans LPC2E CNRS LPC2E UMR CNRS 6553 ECOBIO University of Rennes 1 University of Orleans Cellule R&D CETRAHE School of Environmental Science and Engineering Shandong University

Plant communities play an important role in the C-sink function of peatlands. However,global change and local perturbations are expected to modify peatland plant communities,leading to a shift from Sphagnum mosses to vascular plants. Most studies have focused on the direct effects of modification in plant communities or of global change(such as climate warming, N fertilization) in peatlands without considering interactions between these disturbances that may alter peatlands' C function. We set up a mesocosm experiment to investigate how Greenhouse Gas(CO_2, CH_4, N_2O) fluxes, and dissolved organic carbon(DOC)and total dissolved N(TN) contents are affected by a shift from Sphagnum mosses to Molinia caerulea dominated peatlands combined with N fertilization. Increasing N deposition did not alter the C fluxes(CO_2 exchanges, CH_4 emissions) or DOC content. The lack of N effect on the C cycle seems due to the capacity of Sphagnum to efficiently immobilize N. Nevertheless, N supply increased the N_2O emissions, which were also controlled by the plant communities with the presence of Molinia caerulea reducing N_2O emissions in the Sphagnum mesocosms. Our study highlights the role of the vegetation composition on the C and N fluxes in peatlands and their responses to the N deposition. Future research should now consider the climate change in interaction to plants community modifications due to their controls of peatland sensitivity to environmental conditions.

关键词： CO2 and CH4 N2O Peatland Plant community composition Sphagnum moss Graminoid

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Influence of Swimming Pool Design on Hydraulic Behavior: A Numerical and Experimental Study

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Engineering（科研） 2013年第5期5卷 511-524页

作者： Anaelle Cloteaux fabien Gerardin Noel Midoux Department of Process Engineering National Institute of Research and Safety(INRS)VandoeuvreFrance Laboratory of Reactions and Process Engineering(LRGP) National Center of Scientific Research(CNRS)University of LorraineNancyFrance

A swimming pool can be considered as a chemical reactor with specific hydraulic and macro-mixing characteristics. The nature of flow into the pool depends on various characteristics, such as water inlets and outlets (number and position), pool geometry, and flow rate. This study investigates how swimming pool design affects hydraulic behavior based on experimental and computational fluid dynamics studies (CFD). This paper does not describe the hydraulic behavior of all existing swimming pools, however the cases studied here are representative of pool designs widely used in Europe and the United States. The model developed, based on the principle of a stirred reactor, could be used as a first approach in describing the hydraulic behavior of regular pools. This model is suitable for the study of physical and chemical phenomena with long characteristic times. Other, more advanced, models were shown to be more suitable to the case of fast chemical processes.

关键词： Computational Fluid Dynamics (CFD) Hydraulic Model Residence Time Distribution (RTD) Swimming Pool Velocity Field Tracer

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开源软件在中国的传播机制研究

开源软件在中国的传播机制研究

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作者： Richardeau fabien 上海交通大学

学位级别：硕士

源代码公开的开源软件已经成为软件产业中最重要的经济模型之一。开源软件允许用户使用、修改软件源代码并且可以自由地再次传播修改后的软件。近年来,开源软件在中国的发展和运用已经达到了一定的规模和成效,本文希望从经济的角度来分... 详细信息

源代码公开的开源软件已经成为软件产业中最重要的经济模型之一。开源软件允许用户使用、修改软件源代码并且可以自由地再次传播修改后的软件。近年来,开源软件在中国的发展和运用已经达到了一定的规模和成效,本文希望从经济的角度来分析研究这种开源现象。本文首先讨论开源现象产生的起因及其在使用兼开发者用户群之外的传播。指出开源软件推崇的合作生产并非一种新的生产模式,早在我们今天所熟悉的软件商业化之前,软件就是以合作生产的方式开发出来的。近年来软件产业的组织变革源自技术的进步,尤其是因特网的出现使软件市场需求发生了转变,而开源软件正是在这种转变中应运而生,迎合了市场新需求。通过研究开源软件的运作模式,突出开源生产体系的可行性。将开源软件生产体系与公共产品生产体系相类比,讨论它是否能与现有的专有性质的商业体系和研究性质的非商业体系共存。通过讨论,我们得出结论,无论从短期还是长远的角度来看,开源软件的生产体系都是一个协调稳健的生产组织,相比专有软件能更好地回应用户需求,给予用户重新选择软件的动力,从而改变目前专有软件对软件市场的绝对主导格局。文章第二部分探讨中国软件市场性征对开源软件传播的影响。运用收益递增机制来分析企业、产业以及环境这三者之间的相互作用,并从社会政治、认知和经济这三个正反馈体系来论证中国Linux产业的发展具有收益递增效应。研究结果表明,相比专有技术,中国市场为Linux的传播提供了更有利的环境和条件。但是目前Linux的用户数据还不足以用来分析其传播行为,因此文章最后一个部分通过运用一个经济模型来展开更深层次的分析。文章最后通过Windows与Linux这两个分别代表专有软件与开源软件的操作系统之间的竞争模型来模拟软件传播过程中用户选择的演变。设置多种初始用户分布和场景,进一步确定对软件传播发挥重要作用的因素。模拟结果证明技术“拥护者”用户对局部范围内利基用户的产生起到决定性作用,而开源软件在大众用户市场上的传播起源于这些利基用户群的形成和发展。根据进一步推动开源软件传播的需要,提出了相关的政策建议。

关键词：开源软件合作生产收益递增传播网络外部性

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职业安全卫生与人力成本对外资并购的影响研究

职业安全卫生与人力成本对外资并购的影响研究

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作者： fabien Han 东华大学

学位级别：硕士

中国改革开放40多年以来取得了举世瞩目的成就,人们的经济收入得到了大幅度提高,生活发生了翻天覆地的变化。在改革开放初期,职业安全卫生和人力成本比较低,对外资企业具有较大的吸引力,但随着人们生活水平的提高,职安卫和人力成本在外... 详细信息

中国改革开放40多年以来取得了举世瞩目的成就,人们的经济收入得到了大幅度提高,生活发生了翻天覆地的变化。在改革开放初期,职业安全卫生和人力成本比较低,对外资企业具有较大的吸引力,但随着人们生活水平的提高,职安卫和人力成本在外资投资的占比逐渐提高,因此,在中国的投资环境发生很大的变化的情况下,深入研究中国企业职安卫和人力成本对外资并购的影响具有重要的意义。通过对职安卫及人力成本的研究现状及外资企业进行调研和分析,发现国家对外资企业的政策以及人力资源等是对外资并购成本的主要影响因素。本文采用跨学科分析、对比以及案例分析等方法,形成以下研究结论:(1)职安卫政策使外资并购有效保障人力资源。通过调研发现一些外资企业由于违反了中国的职安卫政策,而影响了劳资关系,进而影响企业运营。我国在环境健康安全政策的规范化方面仍面临挑战,职业病呈逐年快速增长趋势。一方面职安卫政策保护工人的基本权利,另一方面,如果职安卫成本太高会给企业造成很大的运营压力,导致并购失败或者外资撤资。因此,充分了解外资企业的运营环境,制定可行的职安卫政策将对劳资关系、外资持续投入具有良好的促进作用。(2)人力成本是企业经营的重要因素。文化差异是外资企业并购失败的主要原因,大量外资企业过于注重短期利润,忽视了长远规划的重要性。人力资本管理对跨国公司管理具有重要意义,拥有高水平人力资本的公司更具竞争力,并购失败大多与人力资本管理不当有关。在经营工程中,国外企业缺乏对员工绩效评价的方法。中国近年来正在失去人口红利,因此,充分利用通过外资企业并购给中国企业带来的技术和管理技能,发挥跨文化管理优势,是外资企业的一个增长点。(3)本文以浙江锆谷为例进行并购成本分析。作为化工企业,浙江锆谷对职业安全卫生要求较高,对该企业的职安卫研究将对其他外资并购企业具有示范意义。该企业是中国最好的氧化锆生产商之一,由于2012年以来,受全球经济低迷的影响,市场对氧化锆的需求有所下降。在被Imerys Group并购后,通过制定战略目标,更好地做好人力资本与职安卫工作,保持员工的积极性,浙江锆谷重获繁荣。(4)通过对人力资本和环境、职安卫理论及案例的分析,总结了相关外资并购对策与建议,包括中国投资环境、外资并购企业人力成本管理以及提高并购企业的国际竞争力等。对中国在人力成本和职安卫成本不断上升的背景下,对外资并购仍有吸引力,为中国进一步加强改革开放提供参考。

关键词：职安卫企业并购人力成本外资企业

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