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Whole-genome sequencing in medicinal plants:current progress and prospect

Science China(Life Sciences) 2024年第2期67卷 258-273页

作者： Yifei Pei Liang Leng Wei Sun baocai liu Xue Feng Xiwen Li Shilin Chen Institute of Chinese Materia Medica China Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100700China Institute of Herbgenomics Chengdu University of Traditional Chinese MedicineChengdu 611137China Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy Chengdu University of Traditional Chinese MedicineChengdu 611137China Institute of Agricultural Bioresource Fujian Academy of Agricultural SciencesFuzhou 350003China

Advancements in genomics have dramatically accelerated the research on medicinal plants,and the development of herbgenomics has promoted the“Project of 1K Medicinal Plant Genome”to decipher their genetic ***,it is difficult to obtain their high-quality whole genomes because of the prevalence of polyploidy and/or high genomic *** genomes of 123 medicinal plants were published until September *** published genome sequences were investigated in this review,covering their classification,research teams,ploidy,medicinal functions,and sequencing *** than 1,000 institutes or universities around the world and 50 countries are conducting research on medicinal plant *** species account for a majority of sequenced medicinal *** whole genomes of plants in the Poaceae family are the most *** 40%of the published papers studied species with tonifying,replenishing,and heat-cleaning medicinal *** plants are still in the process of domestication as compared with crops,thereby resulting in unclear genetic backgrounds and the lack of pure lines,thus making their genomes more difficult to *** addition,there is still no clear routine framework for a medicinal plant to obtain a high-quality whole ***,a clear and complete strategy has been originally proposed for creating a high-quality whole genome of medicinal ***,whole genome-based biological studies of medicinal plants,including breeding and biosynthesis,were *** also advocate that a research platform of model medicinal plants should be established to promote the genomics research of medicinal plants.

关键词： herbgenomics whole genome high throughput sequencing research strategy model species application

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福建省山药种质资源品质比较与综合评价

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食品研究与开发 2024年第9期45卷 75-85页

作者：张武君刘保财陈菁瑛黄颖桢赵云青福建省农业科学院作物研究所/福建省农业科学院药用植物研究中心福建福州350013

该研究较为全面地收集福建省6个地市45份山药主栽种质资源,测定块茎的9个品质指标,利用隶属函数法、主成分分析和聚类分析对山药的营养品质、加工品质和综合品质进行评价。结果表明,测定的9个指标中,淀粉含量和可食率的变异系数低于8%,... 详细信息

该研究较为全面地收集福建省6个地市45份山药主栽种质资源,测定块茎的9个品质指标,利用隶属函数法、主成分分析和聚类分析对山药的营养品质、加工品质和综合品质进行评价。结果表明,测定的9个指标中,淀粉含量和可食率的变异系数低于8%,其余7个指标的变异系数大于20%,其中块茎鲜重的变异系数高达59.90%。筛选出可溶性糖含量、淀粉含量、可溶性蛋白含量、尿囊素含量、折干率、可食率、块茎鲜重7项指标,构建营养品质和加工品质相结合的品质综合评价体系。聚类分析将福建山药种质资源聚为4类,第Ⅰ类营养和加工品质较一般;第Ⅱ类适合加工;第Ⅲ类适合鲜食;第Ⅳ类鲜食销售和加工均有优势。

关键词：山药资源营养加工综合评价

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Engineering Shewanella-re duce d graphene oxide aerogel biohybrid to efficiently synthesize Au nanoparticles

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Journal of Materials Science & Technology 2024年第1期168卷 50-61页

作者： baocai Zhang Shulin Shao Huan Yu Qijing liu Sicheng Shi Qingyuan Wu Zijie Wu Yiyu Feng Yifei Wang Xi Sun Deguang Wu Feng Li Hao Song Frontier Science Center for Synthetic Biology and Key Laboratory of Systems Bioengineering(Ministry of Education) Tianjin UniversityTianjin 300072China Collaborative Innovation Center of Chemical Science and Engineering(Tianjin) School of Chemical Engineering and TechnologyTianjin UniversityTianjin 300072China Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering Beijing University of Chemical TechnologyBeijing 100029China School of Materials Science and Engineering Tianjin UniversityTianjin 300350China College of Biological Engineering Tianjin Agricultural UniversityTianjin 300384China Department of Brewing Engineering Moutai InstituteLuban AveRenhuai 564507China

Biosynthesizing Au nanoparticles(AuNPs)from gold-bearing scraps provides a sustainable method to meet the urgent demand for ***,it remains challenging to efficiently biosynthesize AuNPs of which the diameter is less than 10 nm from a trace amount of Au^(3+)concentration at the level of tens ***,we constructed an exoelectrogenic cell(eCell)-conductive reduced-graphene-oxide aero-gel(rGA)biohybrid by assembling Shewanella sp.S1(SS1)as living biocatalyst and rGA as conductive ad-sorbent,in which Au^(3+)at trace concentrations would be enriched by the adsorption of rGA and reduced to AuNPs through the extracellular electron transfer(EET)of *** regulate the size of the synthe-sized AuNPs to 10 nm,the strain SS1 was engineered to enhance its EET,resulting in strain RS2(pYYD-P tac-ribADEHC&pHG13-P_(bad)-omcC in SS1).Strain RS2 was further assembled with rGA to construct the RS2-rGA biohybrid,which could synthesize AuNPs with the size of 7.62±2.82 nm from 60 ppm Au^(3+)*** eCell-rGA biohybrid integrated Au^(3+)adsorption and reduction,which enabled AuNPs biosyn-thesis from a trace amount of Au^(3+).Thus,the required Au^(3+)ions concentration was reduced by one or two orders of magnitude compared with conventional methods of AuNPs *** work devel-oped an AuNPs size regulation technology via engineering eCell’s EET with synthetic biology methods,providing a feasible approach to synthesize AuNPs with controllable size from trace level of gold ions.

关键词： Au nanoparticles Exoelectrogenic cell(e-Cell) Shewanella Synthesis biology Extracellular electron transfer Reduced graphene oxide aerogel

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Therapeutic　Effect　Observation　On　200　Cases　of　Facial　Paralysis　Treated　by　Needling　Acupoints　on　Yangming　and　Shaoyin　Channel

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中国针灸 1995年第S2期15卷 306-307页

作者： liu baocai(Central Hospital of Buoquanling Medical Bureau)

ＴｈｅｒａｐｅｕｔｉｃＥｆｆｅｃｔＯｂｓｅｒｖａｔｉｏｎＯｎ２００ＣａｓｅｓｏｆＦａｃｉａｌＰａｒａｌｙｓｉｓＴｒｅａｔｅｄｂｙＮｅｅｄｌｉｎｇＡｃｕｐｏｉｎｔｓｏｎＹａｎｇｍｉｎｇａｎｄＳｈａｏｙｉｎＣｈａｎｎｅｌ... 详细信息

ＴｈｅｒａｐｅｕｔｉｃＥｆｆｅｃｔＯｂｓｅｒｖａｔｉｏｎＯｎ２００ＣａｓｅｓｏｆＦａｃｉａｌＰａｒａｌｙｓｉｓＴｒｅａｔｅｄｂｙＮｅｅｄｌｉｎｇＡｃｕｐｏｉｎｔｓｏｎＹａｎｇｍｉｎｇａｎｄＳｈａｏｙｉｎＣｈａｎｎｅｌｓ￥ＬｉｕＢａｏｃａｉ（Ｃｅｎｔｒ...

关键词： Channel

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正六边形造纸法再造烟叶产品分切机的设计及应用

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中国烟草学报 2022年第1期28卷 27-31页

作者：巴云鹏唐蓉唐向阳刘宝才刘海风云南昆船环保技术有限公司昆明市官渡区650051

正六边形再造烟叶产品丝长的均一性较好,但目前国内外尚未有此类产品的分切设备。通过理论分析、分切设备系统结构设计、定刀系统、动刀系统设计、定刀系统与动刀系统的匹配设计,研制出了正六边形产品的分切设备。研制的分切设备连续运... 详细信息

正六边形再造烟叶产品丝长的均一性较好,但目前国内外尚未有此类产品的分切设备。通过理论分析、分切设备系统结构设计、定刀系统、动刀系统设计、定刀系统与动刀系统的匹配设计,研制出了正六边形产品的分切设备。研制的分切设备连续运行结果表明该设备工作稳定,生产的产品外形规则统一,尺寸满足生产工艺要求,正六边形再造烟叶产品成型率为93.68%,碎片率为2.02%,大片率为4.3%。

关键词：造纸法再造烟叶六边形分切机成型率碎片率

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THE HIDDEN DANGERS IN CITY CONSTRUCTION AND THEIR PREVENTION STRATEGIES

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Natural Disaster Reduction in China 1996年第2期 82-84页

作者： liu baocai and Zhao Zhilin (The Construction Commission of Hebai Province)

ＴＨＥＨＩＤＤＥＮＤＡＮＧＥＲＳＩＮＣＩＴＹＣＯＮＳＴＲＵＣＴＩＯＮＡＮＤＴＨＥＩＲＰＲＥＶＥＮＴＩＯＮＳＴＲＡＴＥＧＩＥＳＬｉｕＢａｏｃａｉａｎｄＺｈａｏＺｈｉｌｉｎ（ＴｈｅＣｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎＣｏｍｍｉｓｓｉ...

ＴＨＥＨＩＤＤＥＮＤＡＮＧＥＲＳＩＮＣＩＴＹＣＯＮＳＴＲＵＣＴＩＯＮＡＮＤＴＨＥＩＲＰＲＥＶＥＮＴＩＯＮＳＴＲＡＴＥＧＩＥＳＬｉｕＢａｏｃａｉａｎｄＺｈａｏＺｈｉｌｉｎ（ＴｈｅＣｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎＣｏｍｍｉｓｓｉｏｎｏｆＨｅｂａｉＰｒｏｖｉｎｃｅ...

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传统发酵肉制品中乳酸菌的筛选及其在萨拉米中的初步应用

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现代食品科技 2024年第1期40卷 67-75页

作者：王淳玉徐宝才杨柳孙芸南京工业大学食品与轻工学院江苏南京211816 合肥工业大学食品与生物工程学院安徽合肥230009

为筛选出具有优良发酵特性的乳酸菌菌株,对具有代表性的传统发酵肉制品中的微生物进行选择性分离,并研究其在萨拉米发酵过程中的适应性。通过不同菌株发酵特性分析,筛选出两株不产黏性和色素、不产H2O_(2)和H2S、发酵葡萄糖不产气、无... 详细信息

为筛选出具有优良发酵特性的乳酸菌菌株,对具有代表性的传统发酵肉制品中的微生物进行选择性分离,并研究其在萨拉米发酵过程中的适应性。通过不同菌株发酵特性分析,筛选出两株不产黏性和色素、不产H2O_(2)和H2S、发酵葡萄糖不产气、无氨基酸脱羧酶和溶血性、不分解精氨酸产氨、发酵性能优良的菌株YR07和L.48。通过糖发酵试验和16S rRNA序列分析,确定菌种YR07为植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum),L.48为清酒乳杆菌(Latilactobacillus sakei)。菌株YR07和L.48对质量分数6.0%NaCl、150 mg/kg NaNO_(2)及pH值4.0的耐受性良好,可有效抑制金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌等食源性致病、致腐菌,对红霉素、氯霉素等常用抗生素无耐药性。两株菌分别应用于萨拉米发酵阶段,接菌组香肠pH值在24h内可快速降至4.71和4.82,杂菌生长受到抑制,产品质地、感官风味得到提升。综上,YR07和L.48符合发酵剂特性,生产适应性强、安全性高,可用于肉制品发酵。

关键词：传统发酵肉制品乳酸菌萨拉米植物乳杆菌清酒乳杆菌

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基于层次结构图的多跳知识图谱问答模型

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计算机工程 2024年第1期50卷 101-109页

作者：刘昀抒申彦明齐恒尹宝才大连理工大学计算机科学与技术学院辽宁大连116024 北京工业大学人工智能与自动化学院北京100124

知识图谱问答(KBQA)旨在理解用户的自然语言问句,在结构化的知识图谱中通过检索、推理等手段来获取答案实体。近年来,多跳KBQA备受关注,然而,复杂问句中通常存在多个关系意图,已有KBQA方法大多忽视了推理关系链的关系顺序问题。为此,提... 详细信息

知识图谱问答(KBQA)旨在理解用户的自然语言问句,在结构化的知识图谱中通过检索、推理等手段来获取答案实体。近年来,多跳KBQA备受关注,然而,复杂问句中通常存在多个关系意图,已有KBQA方法大多忽视了推理关系链的关系顺序问题。为此,提出一种基于层次结构图的多跳知识图谱问答模型(HSG-KBQA),建模自然语言问句的关系层次顺序,指导模型在每个推理步选择合理的关系意图。设计一种层次结构图,显式地体现问句中关系的层次距离,利用LSTM-BiGCN编码层将词语间的依存信息编码到问句中;提出虚拟节点的概念,利用图池化技术过滤不重要的节点,学习推理过程中知识图谱的状态;设计基于注意力机制和层次权重的解码器来优化指令生成,使推理指令更匹配问句中的关系链顺序。实验结果表明,HSG-KBQA在WebQuestionsSP数据集上取得了71.3%的Hits@1分数,在PathQuestions数据集上取得了97.3%(PQ-2H)和89.7%(PQ-3H)的Hits@1分数,均优于对照基准模型,表明HSG-KBQA模型在KBQA任务中具有更好的性能。

关键词：知识图谱问答问答系统多跳问答图神经网络动态推理

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拂子茅生物量分配及土壤微生物对干旱胁迫的响应

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北方园艺 2024年第11期 79-87页

作者：刘玮冯康安朱宝才山西林业职业技术学院园林系山西太原030009 山西农业大学林学院山西太原030031

以拂子茅(Calamagrostis acutiflora)为试材,采用盆栽控水法,研究了不同程度干旱胁迫对拂子茅生物量分配以及土壤微生物的影响,以期为干旱地区拂子茅的培育和种植提供参考依据。结果表明:地上生物量和地下生物量均随着干旱胁迫程度的加... 详细信息

以拂子茅(Calamagrostis acutiflora)为试材,采用盆栽控水法,研究了不同程度干旱胁迫对拂子茅生物量分配以及土壤微生物的影响,以期为干旱地区拂子茅的培育和种植提供参考依据。结果表明:地上生物量和地下生物量均随着干旱胁迫程度的加重表现出先增加后降低的趋势,分别在轻度干旱和中度干旱达到峰值。根冠比和细根生物量占比随着干旱胁迫程度的加深而持续增加,而粗根生物量占比降低。高通量测序的结果表明,土壤微生物多样性几乎不受干旱胁迫的影响,而微生物群落组成受干旱胁迫的影响较大。考虑到细根生物量和根冠较能反映植物水分吸收和抵抗逆境的能力,认为细菌中的WS3、SAR406、变形菌门(Proteobacteria)和GN04以及真菌中的卵菌门(Oomycota)和球囊菌门(Glomeromycota)在协助拂子茅抵抗干旱胁迫方面起重要的作用。

关键词：拂子茅干旱胁迫生物量微生物

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STUDY ON THE PREPARATION OF DECORATIVE CEMENT FOR NATURAL COLOR MINERAL

STUDY ON THE PREPARATION OF DECORATIVE CEMENT FOR NATURAL CO...

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第三届北京国际水泥与混凝土学术会议

作者： liu Xiaohe, liu baocai, Lan Wenguang and Qu Qilin (Yanmei Special Building Materials Inaustry Corporation of Sanhe County) China

INTRODUCTION In China and abroad raw materials containing color-metallic oxide, slag and inorganic pure coloring agent, and the method of direct-burning or indirect-mixing are generally applied in the production process of decorative cement. In order to make the two types of production process obtain decorative cement with bright color and good durability, some expensive multi-functional chemical admixtures are added to the cement in the grinding process. The addition of the admixtures raises the cost of decorative cement. Sometimes the improper use of admixture may have bad effect on the properties of decorative cement. Meanwhile, no matter which production process is used, in the two kinds of color cement their surface would appear more or less efforesence. Therefore, in the last 20 years "natural color rock" has been used to manufacture decorative cement again at home and abroad. "Natural

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