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Phyton-International Journal of Experimental Botany 2023年第2期92卷 369-382页

作者： Wei Tian Lingdi Liu zhongxing song Zhishu Tang Chunxiu Wen Tao Jiang Institute of Cash Crops Hebei Academy of Agricultural and Forestry SciencesShijiazhuang050051China State Key Laboratory of Research&Development of Characteristic Qin Medicine Resources(Cultivation) Shaanxi University of Chinese MedicineXianyang712046China

The extract from Semen Ziziphi Spinosae(SZS)contains many secondary metabolites(flavonoids,alkaloids,and terpenoids),widely reported for their high medicinal value.In order to know the number and type of flavonoids and the regulating mechanism of flavonoid biosynthesis during the growth and development of SZS,we identified and analyzed the flavonoid metabolites and genes in SZS using metabolomic and transcriptomic.A total of 13,232 differentially expressed genes and 83 flavonoid metabolites were identified at three different growth and development stages(T1,T2,and T3)of SZS.The main flavonoid metabolic components of SZS were catechin,L-epicatechin,(–)-epigallocatechin,(+)-gallocatechin,spinosin and its derivatives.A total of 53 unigenes encoding 15 enzymes were identified as candidate genes involved in flavonoid biosynthesis in SZS.Among,PAL,C4H,4CL,CHS,CHI,FLS,FNS,ANS,ANR,LAR,and UFGT genes were all downregulated in T3 than in T1.The expression levels of these genes influence the accumulation of flavonoids in SZS.Our results should provide valuable information for flavonoid metabolites and candidate genes involved in flavonoid biosynthesis on SZS .

关键词： Spinosin secondary metabolites transcriptomic metabolomic gene expression

不同产地沙棘种子内生菌群落组成与多样性分析

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北方园艺 2024年第8期 94-101页

作者：李铂高晓敏王楠黄文静张永生宋忠兴陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育)陕西咸阳712083 内蒙古海天制药有限公司内蒙古通辽028000

以新疆、内蒙古、山西、陕西、甘肃6个产地的沙棘种子为试材,采用高通量测序及生物信息学分析方法,基于16S rRNA和ITS2序列,研究了沙棘种子内生细菌和真菌的菌群结构与多样性,以期为后续研究沙棘种子内生菌的生物活性,探寻沙棘内生功能... 详细信息

以新疆、内蒙古、山西、陕西、甘肃6个产地的沙棘种子为试材,采用高通量测序及生物信息学分析方法,基于16S rRNA和ITS2序列,研究了沙棘种子内生细菌和真菌的菌群结构与多样性,以期为后续研究沙棘种子内生菌的生物活性,探寻沙棘内生功能菌群提供参考依据。结果表明:沙棘种子内生菌组成较为单一,内生细菌主要为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)等,内生真菌为子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)和担子菌门(Basidiomycota);Alpha物种多样性分析结果表明,陕西志丹与新疆阿勒泰样品内生细菌的Shannon指数与Simpson指数存在显著差异;山西吕梁与陕西志丹样品内生真菌的Shannon指数和Chao1指数达到显著差异;NMDS分析显示不同样品的内生菌组成存在一定相似性;KEGG分析内生细菌共获得6个一级代谢系统和26个二级代谢通路。综上,不同产地沙棘种子内生菌多样性与群落组成存在差异性,这可能与其栖息地的环境因子密切相关。

关键词：沙棘种子内生菌高通量测序多样性

不同生长时期酸枣果肉多糖相对分子质量分布和单糖组成及抗氧化活性研究

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食品工业科技 2024年第7期45卷 1-7页

作者：王磊李国龙唐志书宋忠兴袁书会刘红波史鑫波陈佳昕长春中医药大学药学院吉林长春130117 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究开发国家重点实验室(培育)陕西咸阳712083 中国中医科学院研究生院北京100700

为了探究不同生长时期酸枣果肉中多糖含量、相对分子质量、单糖组成及抗氧化活性变化规律,以野生型和种植型酸枣为研究对象,分别采用苯酚-硫酸比色法、高效凝胶色谱法、高效离子色谱法和DPPH自由基清除实验研究其不同生长时期的果肉多... 详细信息

为了探究不同生长时期酸枣果肉中多糖含量、相对分子质量、单糖组成及抗氧化活性变化规律,以野生型和种植型酸枣为研究对象,分别采用苯酚-硫酸比色法、高效凝胶色谱法、高效离子色谱法和DPPH自由基清除实验研究其不同生长时期的果肉多糖含量、相对分子质量、单糖组成和自由基清除能力。研究发现野生型和种植型的酸枣果肉中多糖含量均表现出先下降后上升的趋势;两种类型的酸枣果肉多糖的相对分子质量均随着酸枣的发育逐渐降低;两种类型酸枣果实发育前期果肉多糖中单糖鼠李糖含量最高可达46.14 mg/g,半乳糖次之可达33.10 mg/g;果实发育后期,两种类型的酸枣果肉多糖中单糖含量最高的为阿拉伯糖可达60.30 mg/g,半乳糖醛酸次之可达45.02 mg/g;两种类型酸枣果肉多糖的DPPH自由基清除能力变化趋势与其果肉中多糖含量变化趋势基本相同;种植型酸枣与野生型酸枣在多糖含量、多糖相对分子质量、单糖组成和自由基清除能力方面均表现为相同的趋势,且均属于还原糖积累类型果实。研究结果为酸枣果肉资源进一步开发与利用提供参考。

关键词：酸枣果肉多糖相对分子质量单糖组成抗氧化活性

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酸枣仁油的脂质组成与功能特性初步分析

中国粮油学报 2024年第6期39卷 141-145页

作者：李国龙陈佳昕史鑫波刘红波宋忠兴唐志书陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心秦药特色资源研究开发国家重点实验室(培育) 咸阳 712083 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心秦药特色资源研究开发国家重点实验室(培育) 咸阳 712083 中国中医科学院研究生院北京 100700

本研究通过脂质组学对酸枣仁油的脂质组成进行分析,并进一步对功能特性进行初步分析.从酸枣仁油中共获得了 5大类19个亚类384种脂质成分,其脂质分子中碳链长度为35～54的中长链脂质约占66.60％,不饱和脂质约占95.70％.与目前报道的植物... 详细信息

本研究通过脂质组学对酸枣仁油的脂质组成进行分析,并进一步对功能特性进行初步分析.从酸枣仁油中共获得了 5大类19个亚类384种脂质成分,其脂质分子中碳链长度为35～54的中长链脂质约占66.60％,不饱和脂质约占95.70％.与目前报道的植物油脂相比,酸枣仁油中甘油脂类(GL)的亚类有292种,是目前报道GL数量最多的植物油脂,其中甘油二酯(DG)含量可达1 090 607.62 nmol/g.功能特性初步分析表明酸枣仁油具有降血脂的活性可能与其含有大量的DG相关.

关键词：酸枣仁油脂质组学甘油脂类

基于“初生-次生代谢产物”互作途径的大果沙棘和中华沙棘差异性研究

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中草药 2024年第7期55卷 2383-2396页

作者：杨兴晶刘妍如唐志书宋忠兴周篷常百金赵艳婷刘长乐陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心陕西咸阳712083 长春中医药大学吉林长春130117 中国中医科学院北京100700

目的分析大果沙棘Hippophae rhamnoides vat.sp L.与中华沙棘H.rhamnoides初生/次生代谢物的差异,并对其生物合成途径变化进行分析。方法采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)法对2个种属的沙棘进行初生及次生代... 详细信息

目的分析大果沙棘Hippophae rhamnoides vat.sp L.与中华沙棘H.rhamnoides初生/次生代谢物的差异,并对其生物合成途径变化进行分析。方法采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)法对2个种属的沙棘进行初生及次生代谢产物表征,基于二水平析因-星点设计法(plackett burman-central composite design,PB-CCD)设计对沙棘UPLC-DAD指纹图谱进行研究,优化液相方法,指认共有峰;以偏最小二乘-判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)、聚类分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析对大果沙棘、中华沙棘进行差异初生代谢物筛选及相关代谢通路富集;进一步采用质谱多反应检测(multiple reaction monitoring,MRM)对筛选得到具有差异的初生代谢物和次生代谢物进行定量分析;最后,对2个品种沙棘的差异性成分进行分析并对其进行生物合成途径的关联和阐释。结果基于成分表征和PLS-DA初步鉴定出中华、大果沙棘含量差异较大的成分有11个,其中包括2个氨基酸类初生代谢物和9个黄酮类次生代谢物。结论建立的方法能鉴定出中华沙棘、大果沙棘中的差异性成分。分析结果显示,总黄酮在中华沙棘中含量较高,说明中华沙棘在药用功效上可能强于大果沙棘;其次异鼠李素在大果沙棘中含量较高,说明其对临床的质控和应用可能不太适用。

关键词：沙棘中华沙棘大果沙棘 L-酪氨酸 L-苯丙氨酸水仙苷异鼠李素-3-O-葡萄糖苷槲皮素木犀草素柚皮素山柰酚异鼠李素鼠李素二水槲皮素

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大黄蒽醌类物质药理作用研究进展

陕西中医 2024年第6期45卷 863-864,F0003页

作者：赵源刘红波唐志书宋忠兴袁洪超陕西中医药大学陕西咸阳712046 陕西中医药大学附属医院陕西咸阳712083 中国中医科学院北京100700 陕西金慧方中药科技有限公司陕西汉中723600

大黄为常用的传统大宗中药材,临床应用广泛,具有清热泻火、凉血解毒、逐瘀通经、利湿退黄之功效。大黄具有多种药效成分,其中蒽醌为主要药效成分之一,具有抗肿瘤、抗炎、抑菌、抗氧化等多种药理作用,广泛应用于肝癌、肺癌、鳞癌、胰腺... 详细信息

大黄为常用的传统大宗中药材,临床应用广泛,具有清热泻火、凉血解毒、逐瘀通经、利湿退黄之功效。大黄具有多种药效成分,其中蒽醌为主要药效成分之一,具有抗肿瘤、抗炎、抑菌、抗氧化等多种药理作用,广泛应用于肝癌、肺癌、鳞癌、胰腺炎、结肠炎等疾病的治疗,针对不同疾病,此类物质具有不同的作用机制和作用靶点。本文在查阅国内外有关大黄蒽醌类物质文献资料的基础上对该物质的药理作用及作用机制的相关研究进展进行了归纳总结,以期为大黄蒽醌类物质的研究与开发利用提供参考。

关键词：大黄蒽醌类物质药理作用抗肿瘤抗炎抑菌

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生血宝合剂药渣对新西兰兔饲喂效果的研究

中国饲料 2024年第3期 59-68页

作者：贺宇于金高宋忠兴唐志书段金廒朱华旭刘红娜周建平曹兆军陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心秦药特色资源研究开发国家重点实验室(培育) 陕西咸阳712046 中国中医科学院北京100700 南京中医药大学江苏省植物药深加工工程研究中心江苏省中药资源产业化过程协同创新中心江苏南京210023 清华德人西安幸福制药有限公司陕西西安710043

本研究首先对生血宝合剂药渣(SXBR)从营养物质和药用活性成分两方面进行成分表征,然后将0%(SXBRc组)、5%(SXBRl组)、10%(SXBRm组)和20%(SXBRh组)比例的SXBR添加到新西兰兔的基础饲粮中,对新西兰兔的生产性能、抗氧化应激功能、骨髓造血... 详细信息

本研究首先对生血宝合剂药渣(SXBR)从营养物质和药用活性成分两方面进行成分表征,然后将0%(SXBRc组)、5%(SXBRl组)、10%(SXBRm组)和20%(SXBRh组)比例的SXBR添加到新西兰兔的基础饲粮中,对新西兰兔的生产性能、抗氧化应激功能、骨髓造血功能和肠道菌群进行考察,并表征其潜在毒性。研究结果表明:SXBR含有丰富的碳水化合物、粗脂肪等营养物质,且含有大量三萜类和黄酮类等活性成分。相比SXBRc组,SXBRh组在第44、54、57天的体重增量增加了60%以上,60 d料重比降低了43.85%,且SXBR各添加组屠宰率均增加了6%以上。以上结果差异均具有统计学意义(P<0.05),表明SXBR生产性能良好。SXBRh组血清超氧化物歧化酶(SOD)活性相比SXBRc组显著增强了91.70%(P=0.003),丙二醛(MDA)含量显著降低了80.62%(P=0.010)。此外,SXBR可抑制骨髓细胞凋亡,改善肠道菌群结构,具有良好的安全性。可见,SXBR是生产食草动物饲料的良好原料,也可开发为抗氧化应激、调节肠道微生态、促生长的饲料添加剂。本研究对实现SXBR饲料化应用,促进中药渣循环利用具有现实意义。

关键词：药渣循环利用饲料氧化应激微生态

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间作黄芪对当归根际土壤微生物的影响

中国野生植物资源 2024年第1期43卷 79-86,92页

作者：李媛媛谢丰璞王楠高静黄文静李铂孙晓春宋忠兴唐志书王二欢马存德陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育) 陕西咸阳712083 陕西中医药大学药学院陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西西安712046 陕西步长制药有限公司陕西咸阳712000

目的:探讨根际土壤微生物对中药材种植模式的响应方式。方法:以间作黄芪及单作下当归根际土壤为研究对象,基于高通量测序技术,分析土壤微生物在不同季节及种植模式下群落组成及功能的差异。结果:间作下Chao1指数、ACE指数高于单作,变形... 详细信息

目的:探讨根际土壤微生物对中药材种植模式的响应方式。方法:以间作黄芪及单作下当归根际土壤为研究对象,基于高通量测序技术,分析土壤微生物在不同季节及种植模式下群落组成及功能的差异。结果:间作下Chao1指数、ACE指数高于单作,变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、绿弯菌门和芽单胞菌门为间作下的优势菌门,芽单胞菌门的相对丰度在间作下高于单作。11月间作下γ变形菌纲、7月间作下全噬菌纲的丰度显著高于单作。KEGG功能预测表明,在不同时间及间作下根际土壤细菌与细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、代谢功能下属的23类二级功能基因的相对丰度存在显著差异;参与氮循环的功能基因K00371(narH/narY/nxrB)、(K00374 narI/narV)等OTU数在间作下显著高于单作;不同门、纲在间作下的共生网络比单作下连接紧密且更复杂。结论:当归间作黄芪影响土壤细菌群落组成,增加其丰富度及功能的丰富性,影响土壤氮循环能力,促进土壤微生物间的交互作用。

关键词：土壤微生物根际高通量测序多样性种植方式

Linking key intervention timings to rapid declining effective reproduction number to quantify lessons against COVID-19

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Frontiers of Medicine 2020年第5期14卷 623-629页

作者： Zhihang Peng Wenyu song zhongxing Ding Quanquan Guan Xu Yang Qiaoqiao Xu Xu Wang Yankai Xia Department of Epidemiology and Biostatistics School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China Key Laboratory of Modern Toxicology of Ministry of Education School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China

Coronavirus disease 2019(COVID-19)is currently under a global pandemic trend.The efficiency of containment measures and epidemic tendency of typical countries should be assessed.In this study,the efficiency of prevention and control measures in China,Italy,Iran,South Korea,and Japan was assessed,and the COVID-19 epidemic tendency among these countries was compared.Results showed that the effective reproduction number(Re)in Wuhan,China increased almost exponentially,reaching a maximum of 3.98 before a lockdown and rapidly decreased to below 1 due to containment and mitigation strategies of the Chinese government.The Re in Italy declined at a slower pace than that in China after the implementation of prevention and control measures.The Re in Iran showed a certain decline after the establishment of a national epidemic control command,and an evident stationary phase occurred because the best window period for the prevention and control of the epidemic was missed.The epidemic in Japan and South Korea reoccurred several times with the Re fluctuating greatly.The epidemic has hardly rebounded in China due to the implementation of prevention and control strategies and the effective enforcement of policies.Other countries suffering from the epidemic could learn from the Chinese experience in containing COVID-19.

关键词： COVID-19 epidemic control comparison Chinese experience

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融合自注意力的关系抽取级联标记框架研究

计算机工程与应用 2023年第3期59卷 77-83页

作者：肖立中臧中兴宋赛赛上海应用技术大学计算机科学与信息工程学院上海201418

命名实体识别和关系抽取是自然语言处理和知识图谱构建中两个十分重要的子任务。针对关系抽取过程中容易出现的错误传递和实体共享的缺陷,提出了一种融合自注意力机制的实体关系抽取级联标记框架AttCasRel,不仅解决了级联错误,还能够解... 详细信息

命名实体识别和关系抽取是自然语言处理和知识图谱构建中两个十分重要的子任务。针对关系抽取过程中容易出现的错误传递和实体共享的缺陷,提出了一种融合自注意力机制的实体关系抽取级联标记框架AttCasRel,不仅解决了级联错误,还能够解决同一个句子中多个关系三元组共享相同实体的问题。在Bert模型的基础上,使用CMeIE数据集的文本进行再训练得到适用于中文医疗领域的CB-Bert,并在尾实体识别阶段融入自注意力机制来增强头实体编码向量的特征表达,提高了模型的特征提取能力。在CMeIE数据集上的实验结果表明,该标记框架相较于独立抽取的模型以及其他联合抽取模型取得了更好的效果。

关键词：自然语言处理关系抽取自注意力机制知识图谱 Bert