不同产地沙棘种子内生菌群落组成与多样性分析

作     者：李铂 高晓敏 王楠 黄文静 张永生 宋忠兴 LI Bo;GAO Xiaomin;WANG Nan;HUANG Wenjing;ZHANG Yongsheng;SONG Zhongxing

作者机构：陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育)陕西咸阳712083 内蒙古海天制药有限公司内蒙古通辽028000 

出 版 物：《北方园艺》 (Northern Horticulture)

年 卷 期：2024年第8期

页      面：94-101页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：内蒙古自治区2019年度重大科技专项资助项目(2019ZD005) 国家中药材产业技术体系建设专项资助项目(CARS-21) 陕西省高校青年科技创新团队资助项目(陕教90号) 

主　　题：沙棘 种子 内生菌 高通量测序 多样性 

摘      要：以新疆、内蒙古、山西、陕西、甘肃6个产地的沙棘种子为试材,采用高通量测序及生物信息学分析方法,基于16S rRNA和ITS2序列,研究了沙棘种子内生细菌和真菌的菌群结构与多样性,以期为后续研究沙棘种子内生菌的生物活性,探寻沙棘内生功能菌群提供参考依据。结果表明:沙棘种子内生菌组成较为单一,内生细菌主要为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)等,内生真菌为子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)和担子菌门(Basidiomycota);Alpha物种多样性分析结果表明,陕西志丹与新疆阿勒泰样品内生细菌的Shannon指数与Simpson指数存在显著差异;山西吕梁与陕西志丹样品内生真菌的Shannon指数和Chao1指数达到显著差异;NMDS分析显示不同样品的内生菌组成存在一定相似性;KEGG分析内生细菌共获得6个一级代谢系统和26个二级代谢通路。综上,不同产地沙棘种子内生菌多样性与群落组成存在差异性,这可能与其栖息地的环境因子密切相关。