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Linking key intervention timings to rapid declining effective reproduction number to quantify lessons against COVID-19

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Frontiers of Medicine 2020年第5期14卷 623-629页

作者： Zhihang Peng Wenyu Song zhongxing ding Quanquan Guan Xu Yang Qiaoqiao Xu Xu Wang Yankai Xia Department of Epidemiology and Biostatistics School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China Key Laboratory of Modern Toxicology of Ministry of Education School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China

Coronavirus disease 2019(COVID-19)is currently under a global pandemic *** efficiency of containment measures and epidemic tendency of typical countries should be *** this study,the efficiency of prevention and control measures in China,Italy,Iran,South Korea,and Japan was assessed,and the COVID-19 epidemic tendency among these countries was *** showed that the effective reproduction number(Re)in Wuhan,China increased almost exponentially,reaching a maximum of 3.98 before a lockdown and rapidly decreased to below 1 due to containment and mitigation strategies of the Chinese *** Re in Italy declined at a slower pace than that in China after the implementation of prevention and control *** Re in Iran showed a certain decline after the establishment of a national epidemic control command,and an evident stationary phase occurred because the best window period for the prevention and control of the epidemic was *** epidemic in Japan and South Korea reoccurred several times with the Re fluctuating *** epidemic has hardly rebounded in China due to the implementation of prevention and control strategies and the effective enforcement of *** countries suffering from the epidemic could learn from the Chinese experience in containing COVID-19.

关键词： COVID-19 epidemic control comparison Chinese experience

Estimating the time interval between transmission generations and the presymptomatic period by contact tracing surveillance data from 31 provinces in the mainland of China

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Fundamental Research 2021年第2期1卷 104-110页

作者： zhongxing ding Kai Wang Mingwang Shen Kai Wang Shi Zhao Wenyu Song Rui Li Zhongjie Li Liping Wang Ganzhu Feng Zhiliang Hu Hongxia Wei Yanni Xiao Changjun Bao Jianli Hu Liguo Zhu Yong Li Xufeng Chen Yi Yin Weiming Wang Yongli Cai Zhihang Peng Hongbing Shen Department of Epidemiology and Biostatistics School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China Jiangsu Provincial Key Laboratory of Geriatrics Deparmnent of GerlatricsThe Frst Aflired Hospital of Nanjing Medical UniversityNarnjing 211166China School of Public Health Xi'an Jiaotong University Health Science CenterXi'anShaanxi 710061China Deporiment of Medical Engineering and Technology Xinjiang Medical UniversityUrumqi 830011China JC School of Public Health and Primary Care Chinese University of Hong Kong999077Hong KongChina Division of Infectious Diseases Chinese Center for Disease Control and PreventionBeijing 102206China The Second Affiliated Hospital of Nanjing Medical University Nanjing 211166China The Second Hospital of Nanjing Nanjing University of Chinese MedicineNanjing 210003China Institute for Prevention and Control of Acute Infectious Diseases Jiangsu Provincial Center for Disease Control and PreventionNanjing 210009China Department of Cardiology the First Affiliated Hospital of Nanjing Medical UniversityNanjingChina School of Mathematics Science Huaiyin Normal UniversityHuaian 223300China

The global pandemic of 2019 coronavirus disease(COVID-19)is a great assault to public *** transmission cannot be controlled with measures designed for symptomatic persons,such as *** study aimed to estimate the interval of the transmission generation(TG)and the presymptomatic period of COVID-19,and compare the ftting effects of TG and serial interval(S)based on the SEIHR model incorporating the surveillance data of 3453 cases in 31 *** data were allocated into three distributions and the value of AIC presented that the Weibull distribution fitted *** mean of TG was 5.2 days(95%C:4.6-5.8).The mean of the presymptomatic period was 2.4 days(95%CI:1.5-3.2).The dynamic model using TG as the generation time performed *** provinces exhibited a basic reproduction number from 2.16 to *** should be taken to control presymptomatic transmission in the COVID-19 pandemic.

关键词： COVID-19 Interval Transmission generation Presymptomatic transmission Reproduction number

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HIV抗病毒治疗与疫情关联的研究进展

中华流行病学杂志 2020年第5期41卷 794-798页

作者：丁中兴卢珍珍王璐汪宁彭志行南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 211166 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心北京102206

抗病毒治疗(ART)自实施以来,在HIV/AIDS治疗领域成效显著。然而,当治疗投入到人群水平时,ART对HIV疫情产生何种实际影响成为领域内新的热点话题。本文总结近年来有关ART和HIV疫情的研究,探讨ART所带来的HIV疫情趋势影响,旨在充分发挥其... 详细信息

抗病毒治疗(ART)自实施以来,在HIV/AIDS治疗领域成效显著。然而,当治疗投入到人群水平时,ART对HIV疫情产生何种实际影响成为领域内新的热点话题。本文总结近年来有关ART和HIV疫情的研究,探讨ART所带来的HIV疫情趋势影响,旨在充分发挥其"治疗即预防"的作用。

关键词：抗病毒治疗 HIV/AIDS 病毒载量耐药性

武汉交通管制和集中隔离对新型冠状病毒肺炎疫情影响的动力学模型研究

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山东大学学报（医学版） 2020年第10期58卷 25-31页

作者：金新叶卢珍珍丁中兴陈峰彭志行南京医科大学公共卫生学院江苏南京211166

目的定量评价武汉市采取交通管制和集中隔离措施对新型冠状病毒肺炎疫情的控制作用,为疫情防控提供科学依据。方法基于SEIR动力学模型,考虑无症状感染者和未确诊隔离患者的特征,构建SEIAHR模型。基于防控措施的实施时间,将疫情分为三阶... 详细信息

目的定量评价武汉市采取交通管制和集中隔离措施对新型冠状病毒肺炎疫情的控制作用,为疫情防控提供科学依据。方法基于SEIR动力学模型,考虑无症状感染者和未确诊隔离患者的特征,构建SEIAHR模型。基于防控措施的实施时间,将疫情分为三阶段,并分别进行参数拟合和计算基本再生数,并对疫情的发展趋势进行预测。结果交通管制和集中隔离实施后,R0显著降低,三阶段的R0分别为3.6841(95%CI:3.1061~4.0480)、2.1788(95%CI:1.7258~3.5776)、0.3625(95%CI:0.3499~0.3676),发病高峰也发生前移,从交通管制前的2020年4月19日前移至2020年3月14日,疫情规模也在防控措施的作用下减小。结论武汉交通管制和集中隔离措施对于疫情控制具有相当良好的作用,可以为其他国家疫情防控提供参考。

关键词：新型冠状病毒肺炎 SEIAHR传染病动力学模型交通管制定点医院基本再生数

新型冠状病毒疫情防控中的理论流行病学模型研究进展

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中华预防医学杂志 2021年第10期55卷 1256-1262页

作者：张恒之丁中兴沈明望肖燕妮彭志行沈洪兵南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 211166 南京医科大学国际联合研究中心 210029 西安交通大学医学部公共卫生学院中澳传染病联合研究中心 710061 西安交通大学数学与统计学院数学与生命科学交叉中心 710049

新型冠状病毒肺炎疫情的暴发给全球卫生体系带来巨大冲击,也为科学研究带来了机遇与挑战。理论流行病学模型可通过数学手段定量模拟不同情境和干预下的疫情发展动态,研究分析疫情流行趋势,并评估各类防控措施与疫苗策略的效果。理论流... 详细信息

新型冠状病毒肺炎疫情的暴发给全球卫生体系带来巨大冲击,也为科学研究带来了机遇与挑战。理论流行病学模型可通过数学手段定量模拟不同情境和干预下的疫情发展动态,研究分析疫情流行趋势,并评估各类防控措施与疫苗策略的效果。理论流行病学模型研究为疫情防控提供科学理论依据,在这一年多的疫情防控中发挥了巨大作用。本研究对国内外针对新冠疫情开展的理论流行病学模型研究工作进行综述,总结理论流行病学模型在疫情防控应用方面的研究进展,为理论建模与疫情防控相结合提供参考。

关键词：新型冠状病毒肺炎理论流行病学动力学模型趋势研判分析风险预警

基于SEIAQR动力学模型预测湖北省武汉市新型冠状病毒肺炎疫情趋势

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中国卫生统计 2020年第3期37卷 327-330,334页

作者：丁中兴宋文煜方欣玉王凯鲍倡俊陈峰沈洪兵武鸣彭志行南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 211166 新疆医科大学医学工程技术学院数学教研室江苏省疾病预防控制中心

目的基于新型冠状病毒传播特点,使用实际数据拟合并预测武汉市疫情发展趋势。方法考虑新型冠状病毒肺炎传播规律及采取的隔离措施,构建SEIAQR动力学模型;研究使用2020年1月10日至1月31日武汉市累积发病人数及死亡人数数据对模型进行拟合... 详细信息

目的基于新型冠状病毒传播特点,使用实际数据拟合并预测武汉市疫情发展趋势。方法考虑新型冠状病毒肺炎传播规律及采取的隔离措施,构建SEIAQR动力学模型;研究使用2020年1月10日至1月31日武汉市累积发病人数及死亡人数数据对模型进行拟合,并使用2月1日至2月10日的实时数据对模型结果进行验证;最后,研究通过模型拟合结果评价现有抗疫防控措施的效果。结果武汉市发病人数在2月4日左右达到峰值,随后持续下降,2月14日至2月16日出现一个短暂的反弹期,直至5月疫情将基本结束流行。防控措施不变的情况下,疫情结束时预计50780人感染,2449人死亡,粗死亡率约为4.82%;及时有效的防控措施降低了75.08%的感染率和72.40%的因病死亡率;模型拟合偏差约为4.08%。结论 SEIAQR模型拟合效果良好,可以较为准确地预测疾病流行趋势。

关键词：新型冠状病毒肺炎传染病动力学模型疫情预测

城市无尺度网络模型构建及其在新型冠状病毒肺炎疫情防控中的流行病学意义

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中华预防医学杂志 2020年第8期54卷 817-821页

作者：宋文煜丁中兴胡建利鲍倡俊武鸣靳桢彭志行沈洪兵南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 211166 山西大学复杂系统研究所太原030006 江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所南京210009 南京医科大学全球健康中心 210029

新型冠状病毒肺炎是当下重要的公共卫生问题。本文利用2020年农历春节前15天各城市流动人口数据建立无尺度网络模型,动态剪切树算法实现城市聚类,得到黑色、红色和青色三大城市模块。黑色模块内城市疫情最为严重,红色其次,青色最轻。黑... 详细信息

新型冠状病毒肺炎是当下重要的公共卫生问题。本文利用2020年农历春节前15天各城市流动人口数据建立无尺度网络模型,动态剪切树算法实现城市聚类,得到黑色、红色和青色三大城市模块。黑色模块内城市疫情最为严重,红色其次,青色最轻。黑色模块包含浙江省9座城市,广东省8座城市,且绝大部分位于东南沿海经济带,应作为疫情防控的重点城市。

关键词：新型冠状病毒肺炎流动人口无尺度网络模型城市聚类

microRNA合成通路基因SNP与头颈鳞癌发病风险的关联研究

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中华流行病学杂志 2016年第8期37卷 1069-1073页

作者：袁雯雯杭栋王礼华陈苏虹丁中兴胡志斌马红霞南京医科大学公共卫生学院流行病学系 211166 江苏省恶性肿瘤生物标志物与防治重点实验室、肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166

目的探讨microRNA合成通路基因单核苷酸多态性（SNP）与头颈鳞癌发病风险的关联。方法采用病例对照研究设计，纳入年龄（±5岁）、性别频数匹配的576例头颈鳞癌患者和1 552名健康对照。应用Illumina Infinium BeadChip平台检测microRN... 详细信息

目的探讨microRNA合成通路基因单核苷酸多态性（SNP）与头颈鳞癌发病风险的关联。方法采用病例对照研究设计，纳入年龄（±5岁）、性别频数匹配的576例头颈鳞癌患者和1 552名健康对照。应用Illumina Infinium BeadChip平台检测microRNA合成通路上DICER1、GEMIN3、PIWIL1的8个潜在功能性SNP位点。通过单因素和多因素logistic回归模型分析不同基因型与头颈鳞癌间的关联。结果 PIWIL1 rs1106042（G〉A）的等位基因频率在病例组和对照组中的差异有统计学意义（P=0.011）；在调整年龄、性别、吸烟和饮酒等因素后，携带rs1106042 A等位基因的基因型个体发生头颈鳞癌的风险降低（相加模型：aOR=0.73，95% CI：0.57～0.93， P=0.011）；分层分析显示，rs1106042 A等位基因在年龄≥60岁、女性、非吸烟、非饮酒、口腔癌亚组中具有降低肿瘤发病风险的效应（P〈0.05）。结论 PIWIL1基因的潜在功能SNP位点可能与中国人群头颈鳞癌的发病风险相关。

关键词：头颈鳞癌微小RNA 单核苷酸多态性 PIWIL1 病例对照研究

Integrated circulating tumor DNA and T cell repertoire predict radiotherapeutic response and outcome in non-small cell lung cancer patients with brain metastasis

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Cancer Communications 2023年第5期43卷 625-629页

作者： Ling Peng Yawen Bin Peng ding Lingjuan Chen Hao Zeng Zelong Xu Liyan Ji Xuan Gao Pian Liu Ye Wang Sheng Zhang zhongxing Liao Xuefeng Xia Ruiguang Zhang Fan Tong Xiaorong Dong Cancer Center Union HospitalTongji Medical CollegeHuazhong University of Science and TechnologyWuhanHubeiP.R.China Geneplus-Beijing BeijingP.R.China State Key Laboratory of Microbial Resources Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesBeijingP.R.China GenePlus-Shenzhen Clinical Laboratory ShenzhenGuangdongP.R.China Department of Radiation Oncology The University of Texas MD Anderson Cancer CenterHoustonTXUSA

Dear editor,The scarcity of routinemetastatic biopsies or resection limits the finding of biomarkers of diagnosis and prognosis in patients with brain *** from necrosis,apoptosis,and secretion of tumor cells,circulating tumor DNA(ctDNA)is widely distributed in various body fluids,including peripheral blood and cerebrospinal fluid(CSF),as an alternative biomarker for tumor-associated analysis[1].Fortunately,genomic alterations of blood ctDNA and CSF ctDNA have been proven as prognostic markers in non-small cell lung cancer(NSCLC)patients with brain metastasis[2,3].

关键词： metastasis patients routine