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Molecular analysis of Coxsackievirus A24 variant isolates from three outbreaks of acute hemorrhagic conjunctivitis in 1988,1994 and 2007 in Beijing,China

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Virologica Sinica 2022年第2期37卷 168-176页

作者： Junhan Li Fang Huang Yong Zhang Tianjiao Ji Shuangli Zhu Dongyan Wang zhenzhi han Jinbo Xiao Fenfen Si Wenbo Xu Dongmei Yan National Polio Laboratory WHO WPRO Regional Polio Reference LaboratoryNational Health Commission Key Laboratory for BiosecurityNational Health Commission Key Laboratory for Medical VirologyNational Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijing102206China Nanguan District Center for Disease Control and Prevention Changchun130042China Beijing Center for Disease Control and Prevention Beijing100000China Center for Biosafety Mega-Science Chinese Academy of SciencesWuhan430000China

Coxsackievirus A24 variant(CVA24v)is a major pathogen that causes continued outbreaks and pandemics of acute hemorrhagic conjunctivitis(AHC).In China,the first confirmed outbreak of CVA24v-related AHC occurred in Beijing in 1988,followed by another two significant outbreaks respectively in 1994 and 2007,which coincides with the three-stage dynamic distribution of AHC in the world after *** illustrate the genetic characteristics of CVA24v in different periods,a total of 23 strains were isolated from those three outbreaks and the whole genome of those isolations were sequenced and *** with the prototype strain,the 23 strains shared four nucleotide deletions in the 5'UTR except the 0744 strain isolated in *** at the 98th site,one nucleotide insertion was found in all the strains collected from *** 1994 to 2007,amino acid polarity in the VP1 region at the 25th and the 32nd site were *** the 3C and VP1 phylogenetic tree indicated that isolates from 1988 and 1994 belonged to Genotype III(GIII),and 2007 strains to Genotype IV(GIV).According to the Bayesian analysis based on complete genome sequence,the most recent common ancestors for the isolates in1988,1994 and 2007 were respectively estimated around October 1987,February 1993 and December *** evolutionary rate of the CVA24v was estimated to be 7.45×10^(-3) substitutions/site/*** study indicated that the early epidemic of CVA24v in Chinese mainland was the *** mutations and amino acid changes in different genotypes of CVA24v may generate intensity differences of the AHC ***24v has been evolving constantly with a relatively rapid rate.

关键词： Coxsackievirus A24 variant(CVA24v) Acute hemorrhagic conjunctivitis(AHC) Phylogenetic analysis Complete genome sequence

New Simian Enterovirus 19(EV-A122) Strains in China Reveal Large-Scale Inter-Serotype Recombination between Simian EV-As

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Virologica Sinica 2021年第6期36卷 1652-1655页

作者： zhenzhi han Jinbo Xiao Yang Song Shuangli Zhu Dongyan Wang Huanhuan Lu Tianjiao Ji Dongmei Yan Wenbo Xu Yong Zhang WHO WPRO Regional Polio Reference Laboratory NHC Key Laboratory for BiosafetyNHC Key Laboratory for Medical VirologyNational Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijing102206China Center for Biosafety Mega-Science Chinese Academy of SciencesWuhan430071China

Dear Editor,The genus Enterovirus(EV),belonging to the family Picornaviridae,order Picornavirales,comprises 15 species:Enterovirus A–L and rhinovirus A–C(Zell et al.2017).Enterovirus A(EV-A)has 25 serotypes,including several pathogens,such as EV-A71,coxsackievirus A16(CV-A16),and CV-A6 that infect humans,as well as four serotypes(EV-A122,123,124,and 125)isolated from simians(Zell et al.2017).EV genomes share a similar structure with a length of 7.5 kb,and two open reading frames(ORFs)flanked by 5′-and 3′-untranslated regions(UTRs)in some EVs(Oberste et al.2013b;Zell et al.2017;Guo et al.2019;Lulla et al.2019).

关键词： Enterovirus frames

柯萨奇病毒A10型对利巴韦林耐药性的初步研究

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病毒学报 2024年第2期40卷 337-345页

作者：孙甜甜宗彦君王蕊李冀琛刘莹李晓亮韩振志于力恒刘志军孙强张勇潍坊医学院潍坊261053 传染病溯源预警和智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 国家脊髓灰质炎实验室国家卫生健康委员会实验室生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 山东第一医科大学济南250117 首都儿科研究所病毒学研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020

近年来,全国范围内手足口病(hand, foot, and mouth disease,HFMD)的感染率逐渐上升,其中柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)是主要病原体之一,利巴韦林是临床上治疗儿童手足口病的常用药物之一。为了评价利巴韦林在体外对CV... 详细信息

近年来,全国范围内手足口病(hand, foot, and mouth disease,HFMD)的感染率逐渐上升,其中柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)是主要病原体之一,利巴韦林是临床上治疗儿童手足口病的常用药物之一。为了评价利巴韦林在体外对CVA10的抑制效果,本研究中,我们随机选取了19条2009-2021年的不同地区和不同年代的有代表性的中国内地优势流行基因型C基因型的CVA10毒株,通过细胞毒性实验(Cell counting kit-8,CCK8)来检测利巴韦林在RD细胞上对CVA10的抑制率。将抑制率大于85%的CVA10定义为对利巴韦林敏感组,抑制率小于15%的CVA10定义为对利巴韦林耐药组。结果显示利巴韦林在0.78mmol/L浓度下可以对CVA10产生较好的抑制作用并且对细胞的毒性较低。19株CVA10中有4株表现出对利巴韦林耐药性,2株表现出对利巴韦林敏感性,剩余13株的敏感性在85%~15%之间。通过7日龄ICR乳鼠感染实验比较对利巴韦林敏感组和耐药组毒株的致病力差异,通过观察乳鼠临床评分、生存率、体重及组织取材的滴度测定结果均表明对利巴韦林敏感组CVA10在小鼠上的致病力比耐药组强。进一步使用MEGA 7.0软件对影响CVA10复制和翻译的2C区氨基酸序列进行差异性分析,以分析可能的耐药位点。结果显示对利巴韦林耐药组和敏感组CVA10的2C区的327位和328位氨基酸位点存在差异。本研究发现当前国内流行的CVA10存在广泛对利巴韦林耐药现象,其中部分CVA10对利巴韦林完全耐药。因此,有必要加强对CVA10耐药株的监测,以便更好地指导临床医生正确地选择抗病毒药物,为个体化的治疗提供理论依据。

关键词：柯萨奇病毒A10型利巴韦林耐药性 2C区差异位点

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Antibody Response to COVID-19 Virus--Heilongjiang Province and Gansu Province,China,2020

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China CDC weekly 2020年第34期2卷 645-650页

作者： Naiying Mao Zhen Zhu Shuangli Zhu Deshan Yu Jun Xu Aili Cui Lei Cao Jinyuan Guo Huiling Wang Dongyan Wang Dongmei Yan Yang Song Qian Yang Zhongyi Jiang Hui Zhang Chang Shu Ming Yang Yanhai Wang Jinbo Xiao zhenzhi han Yong Zhang Yan Zhang Wenbo Xu NHC Key Laboratory of Medical Virology and Viral Diseases National Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijingChina Gansu Provincial Center for Disease Control and Prevention LanzhouGansuChina Heilongjiang Provincial Center for Disease Control and Prevention HaerbinHeilongjiangChina

What is already known about this topic?Coronavirus disease 2019(COVID-19)has become a global pandemic,while the profile of antibody response against the COVID-19 virus has not been well *** is added by this report?In this study,210 serum samples from 160 confirmed COVID-19 cases with different disease severities were *** IgM,IgA,IgG,and neutralizing antibodies(NAb)against COVID-19 virus were *** findings indicated that four antibodies could be detectable at low levels within 2 weeks of disease onset,then rapidly increasing and peaking from the 3^(rd) to 5^(th) *** decreased between 5^(th) and 9^(th) Weeks,and a higher IgM/IgA level was observed in the groups with mild/moderate severity within 2 weeks(p<0.05),while all 4 types of antibodies were higher in the group with severe/critical severity after 4 weeks(p<0.05).What are the implications for public health practice?Our study on the dynamics of serological antibody responses against COVID-19 virus among COVID-19 patients complements the recognition regarding the humoral immune response to COVID-19 virus *** findings will help in the interpretation of antibody detection results for COVID-19 patients and be beneficial for the evaluation of vaccination effects.

关键词： COV finding fir

基于层次分析法的穿透性制空作战飞机威胁评估

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现代防御技术 2024年第1期52卷 8-15页

作者：鲍俊臣韩道文程立王双宇宋振之国防科技大学电子对抗学院安徽合肥230000 中国人民解放军31649部队广东汕尾516600

针对美空军穿透性制空作战概念,为满足抗穿透性制空作战目标分析的需求,提出了穿透性制空作战飞机威胁评估方法。根据穿透性制空作战特点,设置穿透性制空作战飞机威胁评估指标,构建穿透性制空作战飞机威胁评估指标体系;基于层次分析法... 详细信息

针对美空军穿透性制空作战概念,为满足抗穿透性制空作战目标分析的需求,提出了穿透性制空作战飞机威胁评估方法。根据穿透性制空作战特点,设置穿透性制空作战飞机威胁评估指标,构建穿透性制空作战飞机威胁评估指标体系;基于层次分析法建立穿透性制空作战飞机威胁评估模型,从而得出穿透性制空作战飞机威胁排序。通过实例计算,验证了所提出威胁评估方法的有效性和合理性,能够为抗穿透性制空作战目标分析和策略研究提供依据。

关键词：穿透性制空层次分析法作战飞机威胁评估威胁排序目标分析

两株西藏CV-B3的全基因组特征及溯源分析

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病毒学报 2018年第6期34卷 828-838页

作者：韩振志张勇红梅黄克强宋洋杨倩严冬梅祝双利许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所脊髓灰质炎室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 西藏自治区疾病预防控制中心拉萨850000

肠道病毒是一种常见的引起婴幼儿急性传染病的病毒,它引起的疾病包括急性弛缓性麻痹、手足口病、无菌性脑膜炎和心肌炎等,甚至死亡。柯萨奇病毒B组3型(CV-B3)是引起急性心肌炎常见的病原体之一,并且也经常引起无菌性脑膜炎的暴发。本研... 详细信息

肠道病毒是一种常见的引起婴幼儿急性传染病的病毒,它引起的疾病包括急性弛缓性麻痹、手足口病、无菌性脑膜炎和心肌炎等,甚至死亡。柯萨奇病毒B组3型(CV-B3)是引起急性心肌炎常见的病原体之一,并且也经常引起无菌性脑膜炎的暴发。本研究对在西藏自治区分离的两株CV-B3进行全基因组序列测定和分析,结果表明与原型株相比,核苷酸相似性仅为80.6%。通过系统进化分析,中国大陆流行的CV-B3可以分为三个传播链(lineage1～3),从20世纪lineage1便开始在中国传播,现在倾向于消失,目前lineage2和lineage3替代lineage1成为主要的传播链,现在在中国大陆地区传播。本研究的两株CV-B3也被发现可能与江苏省的一株CV-B5(2009-148-4株)在P3编码区发生了重组,且最大似然进化树的拓扑结构的改变也印证这一重组事件的可能性。频繁的重组活动为肠道病毒的进化提供了原始的基因材料,这也成为肠道病毒频繁暴发的原因之一。本研究分析了西藏两株CV-B3的全基因组序列特征,阐明了CV-B3在中国大陆的传播模式,为CV-B3的防控工作提供了基础资料。

关键词：柯萨奇病毒B组3型(CV-B3) 系统进化分析重组溯源分析

手足口病相关柯萨奇病毒A组8型全基因组序列特征分析

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中华流行病学杂志 2021年第8期42卷 1487-1492页

作者：王东艳宋洋韩振志肖金波路环环严冬梅冀天娇杨倩祝双利许文波张勇中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/国家脊髓灰质炎实验室/世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室/国家卫生健康委生物安全重点实验室/国家卫生健康委医学病毒与病毒病重点实验室北京102206

目的研究中国2013-2018年手足口病病例分离的柯萨奇病毒A组8型(CV-A8)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析。方法对我国不同地区手足口病患者分离的11株CV-A8的全基因组序列,采用Sequencher 5.0、MEGA 7.0等软件对获... 详细信息

目的研究中国2013-2018年手足口病病例分离的柯萨奇病毒A组8型(CV-A8)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析。方法对我国不同地区手足口病患者分离的11株CV-A8的全基因组序列,采用Sequencher 5.0、MEGA 7.0等软件对获取的全基因组序列进行比对和遗传进化分析。结果序列比对显示11株CV-A8基因组长度在7393-7400 bp之间,与原型株比较,在编码区无碱基插入或缺失,在非编码区存在个别碱基的插入或缺失。11株CV-A8毒株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为78.3%-98.6%和92.6%-99.7%;与CV-A8原型株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78.3%-98.2%和92.6%-99.7%。对CV-A8的VP1区序列进行了系统发育分析,可将CV-A8分为5个基因型:A、B、C、D和E,本研究11株CV-A8分属于C(1株)、D(2株)、E(8株)3个基因型。11株CV-A8毒株全基因组序列核苷酸和氨基酸同源性分别为81.3%%-98.8%和95.9%-99.5%,P2区进化树图显示,本研究的8株E基因型CV-A8和CV-A4、CV-A14和CV-A16原型株进化距离最近,P3区进化树图显示,本研究8株E基因型CV-A8和CV-A5、CV-A16、CV-A14和CV-A4进化距离最近。结论本研究中11株CV-A8其衣壳区呈现基因多样性,非衣壳区呈现重组多样性,提示CV-A8正在经历变异动态变化;CV-A8有可能成为手足口病的重要病原体,因此需要进一步加强监测CV-A8。

关键词：手足口病柯萨奇病毒A组8型分子进化重组

广东省2020年首次报道E基因型柯萨奇病毒B组3型的鉴定及基因特征分析

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病毒学报 2022年第1期38卷 57-63页

作者：杨倩曾汉日郑焕英严冬梅祝双利宋洋王东艳韩振志李冀琛张勇许文波世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生和健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 广东省疾病预防控制中心广州511430 潍坊医学院医学微生物教研室潍坊261053

柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus B3,CVB3)是肠道病毒中流行较为广泛的血清型之一,在全球多个国家和地区曾报道儿童急性心肌炎、无菌性脑膜炎、手足口病等的暴发流行,严重威胁儿童健康和公共卫生安全。本研究对广东省2020年手足口病患... 详细信息

柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus B3,CVB3)是肠道病毒中流行较为广泛的血清型之一,在全球多个国家和地区曾报道儿童急性心肌炎、无菌性脑膜炎、手足口病等的暴发流行,严重威胁儿童健康和公共卫生安全。本研究对广东省2020年手足口病患者标本中分离到的8株CVB3进行基因特征和进化分析,结果显示分离到的8株CVB3 VP1区核苷酸序列相似性为98.2%~99.5%,与原型株Nancy的核苷酸序列相似性在77.9%~78.5%之间,与其他CVB3中国大陆流行株的核苷酸序列相似性为79.6%~82.2%。8株CVB3均为E基因型,为广东省首次报道。8株CVB3分离株在进化树上聚集,提示病毒发生了局部传播。全基因组序列分析提示2株广东CVB3分离株在非结构蛋白区有重组现象的发生。本研究为E基因型CVB3在我国的流行传播和疾病防控提供基础资料。

关键词：柯萨奇病毒B组3型基因特征手足口病 E基因型

云南省2016年输入性B5基因亚型EV-A71的鉴定和基因特征分析

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病毒学报 2018年第3期34卷 328-333页

作者：黄克强寸建萍韩振志姜黎黎宋洋周晓芳杨倩冀天娇许文波徐闻张勇中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所脊髓灰质炎室、世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 云南省疾病预防控制中心急性传染病防治所昆明650034

手足口病是一种发病率较高,易发生传播的传染病,居我国丙类报告传染病发病数首位。本研究对云南省2016年手足口病患儿的临床标本随机抽取1%进行病毒分离和核酸检测,分子分型结果显示134株为EV-A71,占比36.91%,包含C4（130株）和B5（4株... 详细信息

手足口病是一种发病率较高,易发生传播的传染病,居我国丙类报告传染病发病数首位。本研究对云南省2016年手足口病患儿的临床标本随机抽取1%进行病毒分离和核酸检测,分子分型结果显示134株为EV-A71,占比36.91%,包含C4（130株）和B5（4株）两个基因亚型。其中所有C4基因亚型EV-A71序列均属于C4a进化分支,为中国大陆目前流行的优势基因型,而4株B5基因亚型EV-A71是云南省首次报道,属于输入基因型。从进化关系上4株云南输入性B5基因亚型EV-A71与越南流行株同源关系较近,并且其中3株在进化树上簇集,不排除省内局限性传播的可能性。因此,非本土流行的输入基因型EV-A71可能已成为一个影响我国手足口病预防控制的重要挑战。

关键词：手足口病(HFMD) 肠道病毒A71型(EV-A71) 输入性基因型云南省